Mycoplasmopsis agalactiae PG2: MAG6110
Help
Entry
MAG6110 CDS
T00536
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA directed RNA polymerase beta' chain
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
maa
Mycoplasmopsis agalactiae PG2
Pathway
maa03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
maa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MAG6110 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
maa03021
]
MAG6110 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
maa03400
]
MAG6110 (rpoC)
Enzymes [BR:
maa01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MAG6110 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
maa03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MAG6110 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
maa03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MAG6110 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL59311
UniProt:
A5IZ52
LinkDB
All DBs
Position
complement(720132..724568)
Genome browser
AA seq
1478 aa
AA seq
DB search
MSSFNKKIAKDIKKIKISLAAQDDVKNWSCGEVTKPETINYKSYKPERDGLFDELIFGPT
TDFKCPICGTKYKKSDENTICEKTPMCQKYQPVILPKMVRRSRMGHIHLENPVVHFWFFK
IDHSIISKLLGLRIANSNKTVSKGDLEKLIYYKSHIVLEDGGLKKLQKNAIIDISDAAII
YADALEELKERFEKDTEEYEIISEALAELESYAVSQTGQDYGIDFYEYNEIIHEFSKAKI
STGSKAIEYLLENIDLKAEAEFIESEIEKINQHFDNNPTASIKAQERSKLYKRLAVVNAF
IHSGQDPKSMLIYDLPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDVNELYRRIIIRNNRLKKWEETDA
PMLIKQNEFRMIQEAVDALIDNSRKKPAPVTSKDNRPLKSISDTLTRKKGRFRQNLLGKR
VDYSGRSVIVVGPELKMHQVGVPREMAAKLFEPWIIKELINGDSHINSIKAGKKAIENLD
PIIWPYVEKAIEGKVVLLNRAPTLHRLSIQAYEPVLIRGKAIKLHPLSCTPFNADFDGDQ
MAIHVPISEEAVREARELMLASKNILGPKDGEPIINPAQDIILGLYYLTMEKAAAIDGDK
VVGEGKFFATYDEMLLAYENKLVSLHARIALPISEINKKRLNYSPENKYIISTVGKFIFN
RAFPESFEFIFGKHVEYVNKTDANGEVKLSEKEVVYTSNNKNQLEQFLLPYGQNFAEVIA
KMPLNLPLSKKDVAKIVRRVYDKYVAIVTKSDVASVINQINANEINQIFDLCAELKDFNG
KPIDVNHVEILEKIIVEEYKAISQEIIVRERTEEPIWTVNDYTKLLEIVWFKYTNIVANV
LDNIKELGYKFSTISGTTISISDVITHQDTKSRIAEGDKYIELLKDYFDQGLMTDDERYN
ATIAKWAAIKDDIEKDLKKLTKLYPDNSLFMMFNSGARGNSSNFVQLAGMRGLMNNNTKV
LKADAENERVVRSTVEIPVKSSFLNGLTAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRL
VDVAQGITVREDDCGTDYGFQVKDILDTKTNTVIEALYDRIEGRFTNKAIYDKNGKLIVD
ADELITPEIATEIVENGIKKVEIRSVLSCYTPNGVCKKCYGKDLALNRVVNIGEAVGVIA
AQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDSPWGRPAVIANYYGRITD
IKRVKEGSESVEYDVITQEYKTRDGKVNTVEYKTRAGRKIRVKINDKVTPGQKIVEGPIV
LNNLLRVGDTRLVQNYILKEVQKLYRLQGITISDKYIEIIIRQMLSKILITDSGDSDFFN
GSLVDIHVYQKESARLISEGKKPPFGEVKIKGAKQIPLLSDSFLAAASYQETPKILVNAS
IKAQVDRLKGLKENIILGHKIPAGTNSNFEENGKYDLRNPKSYFADKYDPDIKTVKFVAD
ENEILNMEHRVEIQHIFDEFQSEAFNANVIEFTDDSDN
NT seq
4437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagttttaataaaaaaatagctaaagacattaagaaaattaaaatatcattagca
gctcaagacgatgttaaaaattgatcatgtggtgaagtaactaagcctgagacaattaac
tataagagctataaaccagaacgtgatggtttatttgatgagcttatttttggccctaca
actgactttaaatgtccaatttgtggtactaaatataagaaaagtgacgaaaacactata
tgtgaaaagacccctatgtgtcaaaaataccaacctgttattttgccaaaaatggtaaga
agaagcagaatgggtcacatacatttagaaaatccagttgtgcacttttgatttttcaaa
attgaccactcaattatttctaagttattaggactaagaattgctaattccaataagact
gtttcaaagggagatttggaaaaattaatctactacaagagtcatattgttttagaagat
ggtggtcttaaaaaattgcaaaagaatgcaattattgacatttcagatgctgctattatt
tatgctgatgctcttgaagaactaaaagaaagatttgaaaaagacactgaagagtatgaa
ataattagcgaagcattagctgaattagaatcatatgctgtttcacaaactggtcaagac
tatggtattgacttttatgaatacaatgaaattattcatgaattttctaaggctaaaatt
tcaactggttctaaggctattgaatatcttttagaaaatattgacctaaaagctgaagct
gaatttatcgaaagtgaaattgaaaaaattaatcaacactttgataataatccaaccgca
tcaattaaagcacaagagagatctaaactatacaaacgtttagcagttgttaatgccttt
attcactcaggacaagatcctaagtcaatgcttatttatgatcttcctgttattccagca
gatttgcgtccattagtgcaattagatggtggccgtcactcaactagtgatgttaatgaa
ctttaccgtcgtatcattattagaaacaatcgtttgaaaaaatgagaagaaactgatgct
cctatgcttattaagcaaaatgaatttagaatgattcaagaagcagttgatgctttaatt
gataattctagaaaaaaaccagcaccggttacttcaaaagataaccgtccactgaagtca
ataagtgacacattaacccgaaaaaaaggtagatttagacaaaaccttttaggtaagcgt
gttgactattctggtcgttcagttattgttgttggtcctgaattaaaaatgcatcaagtt
ggtgtgccacgtgaaatggcagcgaaattgtttgaaccttgaattattaaagaattaatt
aatggcgatagccacattaattcaattaaagcaggtaaaaaagcaattgaaaacttagat
ccaattatttgaccttatgtagaaaaagctatagagggcaaagttgtgcttttaaaccgt
gcaccaacattacaccgtctatcaattcaagcttatgaacctgtgcttattcgtggtaaa
gcaattaagcttcaccctctttcatgtactccatttaacgccgactttgacggtgaccaa
atggcaatccatgtacctattagtgaagaagcagttcgtgaggctagagaattaatgtta
gcttctaaaaacattttaggtcctaaagatggtgaacctatcattaaccctgcacaagat
attattcttggtctttactacctaacaatggaaaaagcagctgctattgatggtgataaa
gttgttggtgaaggtaagttcttcgcaacttatgatgagatgctattagcttatgaaaat
aagttagtttctcttcatgcgcgtatagcacttcctattagtgaaattaataaaaagaga
cttaattattcacctgaaaataaatacattatttcaactgttggtaaatttattttcaac
agagcattccctgaaagttttgaatttatttttggtaaacatgtcgaatatgtcaataaa
acagacgcaaacggcgaagttaagctaagtgaaaaagaagttgtttacacttcaaataat
aagaatcaattagaacaattcttgcttccttatggtcaaaattttgctgaagtaattgca
aaaatgccacttaatttaccactaagcaaaaaagacgttgctaaaattgtacgtagagtt
tatgacaaatatgtcgctattgtaactaagagcgatgtagctagtgttataaaccaaatt
aatgccaacgaaataaatcaaatttttgacttatgcgccgaattaaaagactttaacggc
aaacctattgatgtaaatcatgttgaaattcttgaaaaaattattgttgaagaatacaag
gctatttcacaagaaattattgttagagaaagaactgaagaacctatttgaacagttaat
gactacactaaattattagaaattgtttgatttaaatacacaaacattgttgctaatgtt
ttagataacattaaagaattaggttacaaattctcaacaatttcaggtacaacaatttca
attagtgacgttattactcaccaagatactaagagcagaattgctgaaggtgataaatac
atcgagctgttaaaagactactttgatcaaggtttaatgactgacgatgaaagatataat
gctactatcgctaagtgagctgctattaaggacgatattgaaaaagaccttaagaaacta
accaagctttatccagataactcattgttcatgatgtttaattctggtgcccgtggtaac
tcaagtaacttcgtgcaattagctggtatgcgtggacttatgaacaacaacactaaggtg
cttaaagctgatgctgaaaacgaacgtgtggttcgttcaactgttgaaattccagttaag
tcgtcatttttaaatggtcttacagcttatgagttttactcatcaactcacggtgctcgt
aaaggtcttaccgatacagcacttaacacagctaaatcaggttacttaactagaaggtta
gttgacgttgcgcaaggaattacagtaagagaagacgactgtggtactgattatggcttc
caagttaaagacattttagacacaaaaaccaacactgttattgaagctttatatgacaga
attgaaggaagattcactaacaaagctatttatgataaaaatggcaaattaatcgttgat
gctgatgaattaattacacctgaaatagctactgaaattgtcgaaaacggtattaaaaaa
gtagaaattcgttcagtgctttcatgttacacacctaatggtgtatgtaaaaaatgttac
ggtaaagacttagctcttaaccgtgtagttaacattggtgaagcagttggtgttattgcg
gctcaatcaattggtgaacctggtactcagcttaccatgcgtacattccatactggtggt
gttgctggtgttgaagatattactggcggttttggtagattaattgagttaattgacgcc
tatgattcaccttgaggtcgtccagctgttatagctaattactatggacgtattactgac
attaaacgtgttaaagaaggctctgaatcagttgaatatgatgttattacacaagagtac
aaaactcgtgatggcaaagttaatacagtcgagtataaaactagagctggtagaaaaatt
agagttaaaatcaatgacaaagttactcctggtcaaaagattgtggaaggcccaattgtc
cttaacaaccttttaagagttggtgacacacgtttagtgcaaaattacattcttaaagaa
gtacaaaagctataccgtttacaaggtattactattagcgataaatacattgaaataatt
attcgccaaatgctttctaagattctaattacagattcaggtgattcagatttctttaat
ggatcattagttgatattcatgtgtatcaaaaagaaagtgctcgtttaatttctgaaggt
aaaaagcctccttttggtgaagtaaaaattaaaggtgctaaacaaattccattactttca
gattcattcctagcagctgcttcatatcaagaaactccaaagattttagttaacgcttct
attaaagcgcaagttgacagacttaaaggactaaaagaaaacattattttaggccacaaa
atacctgccggaactaactcaaactttgaagagaacggaaaatatgacttgcgtaatcct
aaatcatattttgctgataaatatgatccagatattaaaacagtcaagtttgtagctgat
gaaaacgaaattttaaacatggaacacagagtagaaattcaacatattttcgatgaattt
caatcagaagcctttaatgcaaatgtaattgaatttactgacgattctgataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
