KEGG   Methanococcus aeolicus: Maeo_0711
Entry
Maeo_0711         CDS       T00552                                 
Name
(GenBank) SMC domain protein
  KO
K03546  DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
mae  Methanococcus aeolicus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mae00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mae03400]
    Maeo_0711
DNA repair and recombination proteins [BR:mae03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     Maeo_0711
    Archaeal homologous recombinant proteins
     Maeo_0711
SSDB
Motif
Pfam: AAA_23 SMC_N AAA_15 Rad50_zn_hook AAA_29 SbcC_Walker_B AAA_21 AAA_27 DASH_Spc19 Ntox28 Nuf2_DHR10-like MCPsignal ABC_tran AAA_22 HsbA
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABR56294
UniProt: A6UUX2
LinkDB
Position
complement(727844..730828)
AA seq 994 aa
MIIKNINIKNFRSHSNTDISFKQGITTIIGENGSGKSSIFEAMNYALFAPRRIKLSDAIK
RGTDFFSISFEFEINGKRYKVIRGRGKKNINYLYENDKPYSENNDEVNNKIKEILNMDDE
VFSNAIYIKQGDISSLIQITPAERKKLIGKLLGIERYEQVWDKLKTPLKNMELDLKKIEG
ELIQKEDINTNINNLKENMEKNSKILKELQDKFNHAVELRDRKEKLLKKWEKKEIENNNL
QNNLKELKYGVETSENNIKILISDLGAINTHNNILNSNYLNYSKYKEIENKLKKLANELL
QYKKYYDKFNELNGEMKGLEKTIKEIDKKLIDKNPKNKSNSEIEQEINDINKELNKLDDI
LNKLKDLELLNKELTKIENSKKELNKNKENYLKYLELSKKSKELNNKLMELSGIKEKEND
LKQQIKSTEYKIKQLKQDLKDFNNIDIEINKEKEIKTKYEDIVNKIDLLKEKIAQNNAEI
NQTKDAIEKLKGTTEDKCPVCQSNIDGLKKQELLKQYNQLIEERKQKSNKLQIKYNKYLS
EKKDIKDKLDKINNLKNKYGQLKEKNNNLIEEENKLIKLNNDLNVIGKDLEEYNKIIENI
KTKENKLKELEQYYKKYEYCENFLKDSNEQELVDNKNKLLDIIGNNTNKSILNTKKELNN
KVGELNELLNLIRNKEQNMKKLNVVNKEIDNLKDKVATNSQLEIEKNSNEKELIKYKDGY
NQYNDSYAVLKNYADKYAVSIEEIRNKVNELLKKENNNLNNLNNEIQNIKLSIEKLQYNI
EEFEDIKKDYNKINNKVNEINEDIIKLDTTIKNENKLLSEFENKLKQLEKLESKKEQLNN
AIHNLANIREAVFSKNGFQQYLRQKYIPIIQRHTNEVFNEFELPYSHIEIKNDYDITVDD
NPVKTLSGGEQIAVALAIRIGIAKAVCSDLNCIILDEPTAFLDENRRHNLLRVFRNIKSL
SQIFVISHHSELEQVANNTITVEKNMGNSIIRSS
NT seq 2985 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattataaaaaatattaatattaaaaattttaggagccatagtaataccgacatatca
tttaaacagggaattaccacaataataggagaaaatggaagtggaaaatcatctatattt
gaagctatgaattacgccttatttgcacctcgtagaattaaattgagtgatgcaataaaa
agaggcaccgattttttttcaatatcgtttgaatttgaaataaatggtaaaagatataaa
gttattaggggcaggggcaagaaaaatataaattatctttacgaaaatgataaaccatat
tctgaaaacaacgatgaagtcaataataaaataaaggaaatactcaatatggacgacgag
gtattttcaaatgccatatatataaaacagggagatatatcttcacttattcaaattacg
cccgcggaaagaaaaaaattaataggaaaattattgggtattgaaagatatgagcaagta
tgggacaaactcaaaacaccattaaaaaatatggaattagatttaaaaaagattgaaggg
gaattaatacaaaaagaggacataaataccaatataaataatttaaaagaaaatatggaa
aaaaattcaaaaattttaaaggagctccaagataaatttaatcatgctgtggagctccga
gacaggaaggaaaaattgctaaaaaaatgggaaaaaaaggaaatagaaaataataattta
caaaataatttaaaagaattaaaatatggggtcgaaacttctgaaaataatattaaaatt
ttaataagtgatttgggagccataaatacccacaataatattttaaatagtaactattta
aattactccaaatacaaggaaatagaaaataaattaaaaaagttggcaaatgaactattg
caatacaaaaaatattacgataaattcaatgagttaaatggggaaatgaaaggtttagaa
aaaaccattaaagaaatcgataaaaaattaattgataaaaatccaaaaaataaatcaaat
agtgaaatagaacaggaaattaatgatataaacaaagaattaaataaattagatgatata
ttaaataaattaaaagatttggaattattaaataaagaactgactaaaattgaaaacagt
aaaaaggaattaaataaaaataaagaaaattatttaaaatatttggaattgtcaaagaaa
tccaaggaattaaataataaattaatggaattaagcggaataaaagaaaaggaaaacgac
ttaaaacaacaaattaaatctactgaatataaaataaaacaacttaaacaggatttaaaa
gattttaataatattgatatagagataaataaggaaaaagaaattaaaacaaaatatgag
gatattgttaataaaatagacctgttaaaagagaaaatagcacaaaataatgcagaaata
aaccaaacaaaagacgccatagaaaaacttaaaggaacaacagaggataaatgtccagta
tgtcaatcaaatattgatgggttgaaaaaacaggagctcctaaaacaatacaatcaatta
atagaggaaagaaaacaaaaatcaaataaactacaaataaaatataacaaatatttatct
gaaaaaaaagacataaaggacaaattagataaaataaataatttaaaaaataaatatgga
caattaaaagaaaaaaacaataatttaatagaagaagaaaataaattaattaagttaaat
aatgatttaaatgttattggaaaagatttagaagaatataacaaaataatagaaaatatt
aaaacaaaagaaaataaattaaaagaattagaacaatattataaaaaatatgaatactgt
gagaattttttaaaagatagcaatgagcaggaactggtagacaataaaaacaaattatta
gatataattggaaacaatacaaataaatccatattaaatacaaaaaaagagttaaataat
aaggtaggggaattaaatgagctgttaaatttaattagaaataaagaacaaaacatgaaa
aaattaaatgtcgtaaataaagaaatagataatttaaaagataaggttgcaacgaattcc
caattagaaattgaaaaaaacagcaacgaaaaagagctaataaaatataaagacggatat
aatcaatataatgattcttatgcagtgttaaagaattatgccgataaatatgccgtatct
attgaagaaataagaaataaagttaatgagttattgaaaaaagaaaacaataatttaaac
aatttaaacaacgaaatacaaaatattaaattatcaattgaaaaactacaatacaatata
gaggaatttgaagatattaaaaaggattataataaaataaataacaaagttaatgaaatt
aatgaggatattattaaattagatacaacaattaaaaatgaaaataaattattatctgaa
tttgaaaataaattaaaacaattggaaaaattagaatctaaaaaggaacagctaaacaat
gctatacataatttagctaacataagagaagccgttttctcaaaaaatggatttcaacaa
tatttaaggcaaaaatatatacctattattcaaagacataccaatgaagtatttaatgaa
tttgaattaccatatagccacatagaaattaaaaatgattatgatattacagtagatgat
aatccagtaaagacgctaagtggaggggagcaaatagccgtggctcttgcaattagaatt
ggaattgcaaaagccgtttgtagtgatttgaattgtataatattggatgaaccaacagcg
ttccttgatgaaaataggagacataatttgttaagggtatttagaaatataaagtctctc
tcccagatatttgtaatatctcatcattcagaattagaacaggtggcaaataacacgata
actgttgaaaaaaatatgggaaattcaataataaggagctcctaa

DBGET integrated database retrieval system