Mya arenaria (softshell): 128228192
Help
Entry
128228192 CDS
T09995
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
maea
Mya arenaria (softshell)
Pathway
maea04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
maea00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
128228192
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
maea00536
]
128228192
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
maea00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
128228192
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128228192
NCBI-ProteinID:
XP_052795314
LinkDB
All DBs
Position
3:79400867..79445823
Genome browser
AA seq
2833 aa
AA seq
DB search
MTFHNTWITFILWTCIVVIWTTVDCEGRRSQQYQADGQVTSLKGANVCGSANRRRCCRGW
SIPQGSTKCVLPKCSGNCGGAGNCMRPGLCLCFTGELASYCGSSGGGGSLLSLCEPACQN
GGVCVARNLCRCPSGFSGGSCENDQRTGPCYTNLENNMCRGQIPNVVCTKHLCCATEGMA
WGDPCEACPANPHPCRRGYVLNLAKNTCQDIDECKYIPGLCVSGTCINTVGSYMCDCQPG
QRLNTITGVCEDINECLEQRDICNGGRCTNTEGSYFCTCGPDFETTPDRSSCIAVRKNYC
FQRVVNGKCTSGLPTKTSLSDCCCGVGKGWGSEDLCQLCPDRNTDAYERLCLRPEPIGTD
ECSYFSNLCKNGRCVDTTYSYRCECYDGYRYSESQGECVDEDECAIQTGLCHNGQCVNLP
GSYECKCKEGFVLAPGGRYCTDMNECEETNMCPNGKCINMDGSYKCQCYRGYKQSPNQQV
CIDIDDCNENGRLCLNGQCLNTPGSYKCICNQGYRISPDGAFCLDDNECEKSGMCSNGLC
KNMDGSYVCICSPGYQLSLAGNVCIDIDECSSQSGVCRDGQCINNQGSFRCECPRGFTLG
PDRRSCLDTRKDLCFLHYSRGVCSSPSPMIVTKSTCCCMVDSMDAPGIAWGAGCEPCPSM
ADLEFKTLCKHGSGTDFNGGSINHCALMPDICENGACENTPRSYRCVCNPGYRPDSSGKK
CVNIDECVSNARLCEGGQCRDTPGSFVCVCPSGTRLDPDNHMCEDIDECASSPCEGGTCV
NTAGSFRCRCGYGYTLDATGLVCIDDRQGACWLEIRDGQCESNVKRPMLKAECCNTIGKA
WGSPCEPCASTFSDKCQRGFMYRGDGCVDINECAVMAGLCRGGGVCVNTEGSFTCQCPAG
MDIDAAGTTCLDKRTSTCYLDYQRGQCSRGLDGLYTRSYCCCSVGRAWSQLCEPCPAKDS
ADYKALCPSGGHGGDPDFPIDINECREIPGICTNGQCRNTQGSFTCTCDRGFALDNRGLN
CTDIDECRISFGVCANGVCVNTEGGFRCDCDTGYNPVMMAQMCMDVDECADDRSLCRGGT
CTNLPGSFSCDCPDGLELSEDGTKCVDIDECGSSSSICSNGYCENYMGGYHCTCLPGFQP
NTDRTSCVDINECAANNGGCEMLCVNSPGSFSCGCEVGFTLMPNGRSCKDYNECRENGDI
CNGGKCQNIPGGYRCTCTGGLRPSDDMKQCIDIDECQENRLLCRNGVCENTLGSFRCNCD
NGYEVDGSRCIDVDECSTGKNNCDESALCYNSPGSYRCQCKIGYEGDGITCRDINECRRD
GICSPSAVCINEPGSYSCVCEEGFTGDGIVCRDVNECELNADICRNGQCYNFLGGYRCSC
DMGFERAPDEKSCIDINECDIPNLCVNGVCENTDGGYQCLCKQGFKLDVYGGNCTDINEC
ENLENCLYGVCVNTIGDYYCECPPNFQLNSAGTGCVDVRKGSCYLDISQQRLTGVCSHVI
SQSVGRAGCCCSVGRGWGETPGYCEPCPRNNTQEYKELCVADSGFRPDPDSLLPMDIDEC
REIPGICKNGDCQNTFGSYKCICPDGYRLNLYTQECIDIDECAEYPGYCGLGTCVNTAGN
FSCLCPDGYMPMPGEGCMDMRKDVCYAAFFNTTVPGRPPRCEHELSSLVTLRQCCCVGVV
GQGWGTPCQPCPVKNSREYLDLCKPLPIREDTNECSIYQFLCENGRCIDTNTEEGFLCEC
GVGYTYNPLSKRCEDVDECRERRNPCHQNSICINTLGSFHCECIPGYQLSSGGRRCLDIN
ECEDVSGICANGECRNLDGSYQCICKQGFRLAPSRDSCLDVNECELQPDVCRNGTCENRI
GGHQCHCSPGFVLTDNGDCEDTDECRDFLGICMNARCRNSPGSFECICLPGYTQSSDRMN
CRDMDECTEIRGLCRNGFCLNTDGSYQCNCFDGYRLSRNADSCEDINECRTVDGLCANGQ
CVNEDGSFRCVCPAGYILTNDGRSCIDLRQGNCYRTFERGQCLNPRPVNHTLAQCCCTGG
SAWSFIGSELCEVCPIPGEQRFEEVCGSDPGRHRGPSGEQDLNECMLDPDLCRNGRCINT
DGSFRCECSPGFVLDSSGRTCVDNDECRVRNMCGEGRCTNTIGSFRCECRPGFLPGPNEV
CEDIDECATGDNNCAFRCANIRGSFRCVCPMGYQLADDGMHCEDVDECASGGHNCRYACK
NLVGTFMCICPEGYREAGRDQCVDIDECREQAGLCEPGRCRNIQGGFRCDCPRGYTTSQD
GKYCLDQREDYCYLELVSRRCVTTADVRVTTQASCCCSGAAAWGRRCETCPRRGTAAFDR
LCPSGGGYDVDGNDIDECRVLANVCQNGRCLNTMGSYRCICNNGYKPDTSGSQCIDVDEC
VEGRAPCDGTCQNLEGSFLCTCSAGYVLNMDARTCKDIDECSTGQHNCQHECVNTEGSYT
CGCPPGFNQARDGQCLDINECILESHLCSPNGQCRNTQGSFQCVCDHGYKLDSTGRLCID
VNECEGGECENLCENSAGGFYCGCPEGYTEYWNQCIEIDVCSGTPCVYECMPTGQQFQCG
CPPGYQMIGEGHCIQTISPSEYKNMFPPGVELPHESSLGVGELPPGEGCYSCNIGDTPLD
VPLSKRMKRSTGIVQDGESSQYSTGIAANMGDVVIEDLHSQQARFRPKILRITKREAMRQ
KGKNRRHASKKEREGGYMELKAANETTVDITHPLPVYVDLSDVSRKTKLVKIVPALSALQ
GNVDYKIINRNDKLFFIREKRGVSSLHAKRKKLSPGMSYHLDIEALPMHEEAEIAGHNVH
IGKTVFRFFVNVL
NT seq
8502 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattccataatacttggattacttttatattatggacttgcattgtggtcatatgg
acgactgtggactgcgaagggcgacgttcccagcaataccaggcggacggacaggtcacg
tcgttaaagggagcaaacgtttgtgggtctgcaaaccgtcggcggtgttgtaggggctgg
tccataccacagggcagtacaaagtgcgttttgccaaaatgcagtggaaactgtggaggt
gcaggaaattgcatgaggccaggtctttgtttgtgcttcaccggggagctcgcctcttac
tgcggatcatctggtggaggaggaagcctgttatccttgtgtgagccagcgtgtcaaaat
ggtggagtatgtgtagccagaaacctgtgtcgttgtccaagtggcttctcgggtggaagt
tgtgaaaatgaccagcgaacgggaccatgttataccaaccttgaaaacaacatgtgtcga
ggccagatccctaatgttgtgtgcacaaagcatctgtgttgtgctacagagggcatggca
tggggtgatccatgcgaagcgtgccccgcaaacccccatccctgccgcaggggctacgtt
cttaaccttgccaagaacacttgccaagacatagatgagtgcaagtacataccgggtctg
tgtgtgagcggcacctgtatcaacactgtgggctcctatatgtgtgactgccagcccgga
cagaggcttaacaccatcactggcgtctgtgaagacatcaatgagtgtttggagcagcga
gacatctgtaacgggggccgttgtacgaacacagagggcagctacttctgtacatgcgga
ccagactttgagaccacgcccgataggtccagttgtattgctgtgaggaagaactactgt
ttccaacgtgtggtgaatggaaagtgtacaagtggcctgccaaccaagacatctttgtct
gactgctgctgtggggtgggcaagggctggggatccgaagacttgtgtcagctctgtccg
gacagaaatacagatgcctatgaaagactgtgccttagaccggagcccattggcacagat
gagtgttcatacttcagcaatctctgtaagaatggtcgatgtgttgacaccacatattcg
tacagatgtgagtgctacgatggctacaggtactccgagtcacagggagaatgtgtcgat
gaggatgagtgtgctatccagacaggcctttgtcataacggccagtgtgtcaaccttcca
ggcagctatgaatgcaaatgtaaagagggctttgtcctcgcccctgggggaagatattgc
acagacatgaatgaatgtgaagagacaaacatgtgtcccaatgggaagtgtatcaacatg
gatggctcatacaagtgtcagtgttacagaggatacaagcagtcacccaaccagcaagtc
tgtattgacatagatgattgcaatgagaatgggagactgtgtttgaatgggcagtgtctg
aacaccccaggtagttacaaatgtatctgcaaccagggataccgaatctcaccagacggc
gctttctgcctggatgacaatgagtgtgagaagagtggcatgtgttccaacggtctgtgt
aagaacatggatggcagctacgtgtgcatatgtagccccggataccagctctcacttgcg
ggcaatgtctgcattgatatagatgagtgtagcagccagtctggcgtctgtagggacggt
cagtgtatcaacaaccagggtagtttcagatgtgagtgtcccagaggcttcaccctgggg
cctgacaggaggtcatgtcttgacacccgtaaggacctgtgtttcctgcactacagtcgt
ggcgtgtgcagcagtccctccccgatgattgtgaccaagtccacctgttgctgcatggtc
gactccatggatgccccagggatcgcctggggagcgggttgtgaaccctgcccctccatg
gctgacctagagtttaagaccctctgtaaacatggctctggcacggacttcaatggagga
tctatcaaccactgcgctctgatgcctgatatatgtgaaaatggagcatgtgagaacaca
ccacgctcctaccgatgtgtgtgtaacccgggatacaggccagattcttccggcaagaag
tgtgtcaacatagatgaatgtgtgagtaacgcacggctgtgtgagggtggccagtgtcgg
gacacaccaggatcctttgtgtgtgtatgcccctccggcactcgcctcgacccagacaac
cacatgtgtgaggacatagatgagtgtgcgtcctccccgtgtgaaggaggcacttgtgtt
aacacagctggaagctttaggtgcaggtgtggttatggctacacacttgatgccactgga
cttgtctgcattgatgatcgacagggtgcatgctggctagagattagggatggtcagtgt
gagtcgaatgtgaaacgccccatgttgaaggctgagtgctgtaacaccatcggcaaggcc
tggggaagcccctgtgaaccatgtgcctccacattttcagacaaatgccaaaggggattc
atgtacagaggcgatggttgtgttgatatcaatgagtgtgcggtgatggcgggtctgtgt
cggggtgggggagtgtgtgtcaacactgaggggtctttcacctgtcagtgccccgcaggc
atggatattgatgctgcaggaacaacatgccttgacaagagaacgtctacatgttacctg
gactaccagcgtgggcagtgttcccgggggcttgatggtctctatactcggtcttactgc
tgctgctctgtggggcgtgcttggagccagctgtgtgaaccctgtccagctaaggactca
gctgactataaagctctctgcccttctggaggtcacggtggagatcctgattttcccatt
gacatcaacgagtgccgggagattccgggtatctgcaccaatggccagtgcaggaacacc
cagggcagcttcacctgcacatgtgaccgtggatttgcccttgacaacaggggacttaac
tgtactgacatagatgagtgtcgaatatcatttggtgtgtgtgcaaatggtgtgtgtgtt
aacacagagggtgggttccgctgtgactgtgacacgggatacaaccctgtcatgatggca
cagatgtgtatggatgttgatgagtgtgcggatgaccggtcgttgtgtcgcgggggaacc
tgcaccaacctgcccgggtcattcagctgtgactgccctgatggccttgaactttcagag
gatggcaccaagtgtgttgacatagatgaatgtggctctagcagcagcatctgttccaat
ggttactgtgagaactacatgggtggctaccactgcacctgtctccctggcttccaaccc
aacactgacaggacttcatgtgttgacataaacgagtgtgcagcgaacaacggtggttgt
gagatgttgtgtgtgaacagccccggcagtttctcatgtggatgtgaggtcggcttcact
ctcatgcccaatggcaggtcttgtaaagactacaatgagtgtcgtgagaatggagacatc
tgtaatggtgggaagtgccagaacatcccgggaggatacagatgcacgtgcactggggga
ctgagaccttccgatgacatgaaacagtgcatagacatagatgagtgccaggagaaccgg
ctgttgtgtcgtaatggtgtgtgtgaaaacaccctgggatccttccgctgtaactgtgac
aatgggtacgaggtggacggcagtagatgcattgatgtagatgagtgtagtacagggaag
aacaactgtgatgagagtgcactgtgttacaactctccgggctcctatcgctgccagtgc
aagatagggtatgaaggagacggaattacttgcagagacatcaatgagtgtcgtcgtgat
ggcatctgctctcccagcgcggtgtgtattaacgagccaggcagctactcttgcgtctgt
gaggagggcttcaccggagatggaattgtatgtagagatgtgaacgagtgtgagcttaat
gctgacatctgtaggaatggccagtgctacaacttcctgggaggttatcggtgctcctgt
gatatgggctttgaacgagctccagatgagaaatcttgcattgacatcaatgagtgcgac
atcccgaacctgtgtgtaaatggtgtatgtgagaacacggacggcggttaccaatgtctg
tgtaaacagggattcaaactggatgtatatggtggaaattgtactgatatcaatgaatgt
gagaacctggagaactgcctgtatggtgtgtgtgtaaacaccatcggtgactactactgc
gagtgtccaccaaacttccaactcaactctgcaggcactggatgtgtggacgtgcgtaaa
gggagttgttacctggacatctctcagcagagattgacaggtgtatgtagccatgtgatc
tcccagagtgtggggcgagcgggctgctgctgcagtgtgggacggggctggggcgagacc
ccgggctactgtgagccttgcccccgcaacaacacccaggaatacaaggagctgtgtgtg
gcagactctggctttaggcctgaccctgactctctgctgcctatggacattgatgagtgt
agagagatacctggaatatgtaagaatggagattgtcagaacacgtttggaagctacaaa
tgcatctgtccggatggctacagactcaacctgtacacacaagaatgcattgacatagat
gagtgtgcggagtacccaggctattgtggactgggcacatgtgtcaacaccgcgggcaac
ttctcctgcctctgtcctgatggatacatgcccatgcctggggagggatgcatggatatg
cgtaaggatgtatgctatgcagccttcttcaacaccacagttccaggccgtcctccacga
tgtgagcacgagctctcgagcctggtgacgctccgacagtgctgctgcgttggagtagtt
ggccagggctggggcactccatgtcaaccatgcccagtgaaaaactcaagggaatacctg
gacttatgcaaaccacttcctattagagaggacacaaatgagtgttccatctaccagttt
ctatgtgagaatggccgatgtattgacacaaacacggaggagggcttcctgtgtgaatgt
ggggttggctacacatacaatcccctcagcaaacgatgtgaagatgttgatgagtgtcgt
gagaggagaaacccgtgtcaccagaactccatctgtatcaacacgctcggcagtttccac
tgtgagtgcattcctggataccagctctcttccggtggacgcaggtgccttgatatcaat
gagtgcgaggatgtgtctggtatctgtgcaaatggtgaatgtcggaacctagatggctcc
taccagtgcatctgtaagcagggattcaggcttgctccatccagggactcttgtcttgat
gtaaatgagtgtgaactgcagcctgatgtgtgtcgtaatgggacgtgtgagaacaggatc
gggggccaccagtgtcactgctccccgggcttcgttctcactgacaacggtgactgtgaa
gatactgatgaatgccgtgacttcctgggtatctgtatgaacgcccgctgcaggaattcc
ccaggcagcttcgaatgtatctgtctcccgggctatacacagtcttcagaccgcatgaac
tgcagagacatggatgagtgtacagagatcagaggcctgtgcaggaacgggttctgcctc
aacacagatggctcgtatcagtgtaactgctttgatggctacaggctctcccgtaatgct
gacagctgtgaggacatcaatgagtgtcgtacagtagatggtctgtgtgccaatggtcag
tgtgtcaatgaggacggtagtttccgatgtgtgtgtcctgctggctacatcctcactaac
gatggacgcagctgcatagacttgcggcagggtaattgttaccgaacatttgagcgaggc
cagtgcctaaacccgcggcctgtgaaccacaccctggcccagtgctgctgtactggggga
tctgcctggtccttcattggatccgagctctgtgaagtctgcccaataccaggagaacag
agatttgaggaggtgtgtggatcggatcccggcagacataggggacccagtggggaacaa
gacctgaatgagtgtatgttggaccctgatctatgcaggaatggccgttgtatcaataca
gatggctcgttccgctgtgagtgctcacccggctttgtccttgactcctctggaaggacg
tgtgtagataacgatgagtgtcgcgtgaggaacatgtgtggggagggaaggtgtacaaac
actattggcagtttccgctgtgaatgcaggcctggattcctccccggaccaaatgaagtc
tgtgaagacatagatgagtgtgcgacaggtgacaacaactgtgcattccgctgtgccaac
atacgaggctcattcagatgtgtttgtcccatgggctatcagctggctgatgacggcatg
cattgtgaagatgttgatgaatgtgctagtggcgggcataactgccgttacgcatgtaag
aacctggtgggaacattcatgtgtatctgtcctgagggctacagggaagccggcagggac
cagtgtgtcgacatagatgagtgtcgggagcaggctggcttgtgtgagcctgggaggtgc
aggaacatccagggtggcttcaggtgtgattgtccccgtggatacacaacctcacaggac
ggaaaatactgccttgaccagcgcgaggactactgttacctggagctagtgtcaaggcgg
tgtgtgaccacagcagatgtgcgggtgacaactcaggccagctgctgttgctctggggca
gcggcctggggacgaaggtgtgaaacatgcccacggagaggcacagctgcctttgacaga
ttgtgcccatctggaggaggttatgacgttgatggaaatgacatagatgagtgccgagtg
ttggccaatgtgtgccagaatggccgctgtctgaacaccatggggtcatacaggtgtatc
tgcaacaatggctacaagcctgacacctcaggatcacagtgtatagacgtggatgagtgt
gtggagggccgcgctccatgtgatggcacctgtcagaacctggaaggctcgttcctctgt
acatgctctgccggttacgtcctcaacatggacgccaggacatgcaaggacatagatgag
tgcagtaccggccagcacaactgccagcatgaatgtgttaacacagagggtagctacaca
tgtggctgtccaccaggcttcaaccaggccagggatggacagtgcttagacattaatgag
tgtatattagagtctcacctttgttccccgaatggccagtgcaggaacacccagggcagc
ttccagtgtgtgtgtgaccatggttataagcttgactccactggcaggctgtgcatagat
gtaaatgagtgtgaaggtggcgagtgtgagaatttgtgtgaaaacagtgcgggtggcttc
tactgtggctgtcccgagggctacaccgaatactggaaccagtgtatagagatagatgtg
tgttcaggcaccccatgcgtgtatgagtgtatgccgactgggcagcagttccagtgtgga
tgtcccccaggctaccagatgataggagaggggcattgtatccagacaatatcgccctca
gagtacaagaacatgttcccaccgggtgtggagctcccccacgagtcatctctaggggtg
ggggagttacccccaggggagggatgctactcctgcaatattggtgatactccacttgac
gtgccactgtccaagaggatgaaaagaagtacaggtatagtacaagacggtgagtcctcc
cagtacagcactggtatcgcagctaacatgggggatgtggtgattgaagaccttcattca
cagcaagcaagattccgacccaagatactcaggatcaccaagagagaggccatgcgacag
aagggtaaaaacagacgccacgcttctaaaaaggagagagagggaggatacatggagttg
aaggcagctaatgagaccacagttgatattacccatcctttgccagtatatgtcgatctc
tcagacgtcagcagaaaaaccaagctcgtgaaaatagttccagctctctccgctctacaa
ggcaatgtggattataaaatcatcaatcgaaatgacaaactcttctttatacgggaaaaa
cgaggagtgagctccctgcatgccaagcgcaagaagctttccccagggatgtcatatcat
ctagatattgaggccctgccaatgcatgaggaggcggaaatagctggacacaatgttcat
atcggaaaaactgtctttagattttttgttaacgtgttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system