Megalobrama amblycephala (Wuchang bream): 125255244
Help
Entry
125255244 CDS
T08212
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
mamb
Megalobrama amblycephala (Wuchang bream)
Pathway
mamb04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mamb00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
125255244
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mamb00536
]
125255244
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mamb00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
125255244
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
DUF5825
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125255244
NCBI-ProteinID:
XP_048026253
LinkDB
All DBs
Position
LG2:31328893..31473112
Genome browser
AA seq
2853 aa
AA seq
DB search
MSSQGDLRCLVGFVALLGILMGNISGIYGKATVHMDGSQRREKQESLRGPNVCGSRLQSY
CCPGWKTLPGGNQCVVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCPGGQIAPTCATKSSQQCNIRCMNG
GVCEDDHCQCLKGYTGSFCGQPVCEKTCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPC
FIQVRDRKCAGQSSGFVCSKALCCATVGQAWGHTCELCLPLSLSCSRGFIPNTRTGACQD
VDECKFVPDLCKGGRCINTVGSYQCQCPAGYQQHMSSLKCEDVDECSIIQHVCDGGRCIN
SAGSFSCVCPPGYVPSVDRTRCLDQHTGVCFASVVNGRCAQEIRGRFSKIQCCCDRGRCW
SQRTALQMCPVPGSDEYVSICLVGSALSGYRKDDPDMNPQHRSSFNPTTNDQILHPLNDN
GHMIPQIHQTLQISQIPQIPGNDNRFKTQQPGFVSVNETMNRCRLFPDLCLNGRCVAMGS
DYRCDCNTGYREDNRGECSDVDECVFEPCSNGHCINTPGSFYCRCHTGFLRVPGKQTCID
IDECIQNGVLCKNGRCLNTEGSFQCICNAGFKLTPDGRNCIDNDECVATNMCLNGMCINE
DGSFKCVCNPGFTLNSSGRYCTDIDECQTPGVCMNGRCVNTQGSFRCECFAGLTVGVSGR
ICVDTHMRSTCYGAVKRVLCLRPFQRAVTKSQCCCANPDYAFGEPCHPCPGKNSVEFQAL
CASGVGFSADGKDINECALDPDICSNGVCENLRGTFHCVCNSGYESDQTGRNCLDIDECV
MNSLLCDNGLCRNVPGSYSCTCPDGYNFRHDTETCEDVNECASGPCVNGVCKNSVGSFSC
ECSLGSKLDSTGLLCVDSLKGSCWLTLRDGRCEVNINGATLRSQCCATLGKAWGSPCEPC
QTDPVCEQGFARPRGASCEDVNECEVFPGVCHNGQCVNTRGSFKCQCPESLTLDVTGRLC
VDVRSEPCFLTYDEDMCTQPVPGRFRMDVCCCTVGLAWGKDCDLCPEPGTRQFDALCPRG
PGFANKGDMLTGRAVYKDINECKVFQSICIHGKCRNTIGSFRCRCDSGFALDTNEQNCTD
IDECKISPDVCGHGMCMNSLGSFQCDCFPGYESGFMMMKNCMDIDECERNLSLCNGGTCE
NTDGSYKCVCPPGHQLSVDGSACEDVNECDLSSTLCHNGRCVNVVGTYQCSCNSGYQTTP
DRKECTDIDECTIENGGCELYCSNSEGSYFCSCGQGYALTPDQRTCADVNECEEDVGICE
GGQCINVPGTYHCLCFEGFVTSADTRTCIDVNECELNSNICMFGECENTKGFYICHCEMG
YAVKKGTSGCTDVNECEMNTHNCDTHATCVNTAGLYRCSCQDGWSGDGVKCADVDECVNR
TNICSADAECVNTAGSYRCECSDGFTGDGFTCSDMDECAEDVDLCENGQCLNVPGSYRCE
CEMGFTHTPNSKTCRDIDECSFQNICVFGTCQNIPGMFRCICDKGYELDRTGGNCTDMDE
CLDPISCVNGHCENTVGSYQCNCPIDFELNPTGIGCVDTRIGNCFLEVAYPRRGGLACSG
EVGFGVSRSSCCCSKGRAWGNPCDLCPPFNTSEYNTLCPGGEGFKPNPITIILEDIDECQ
ELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCPSGYYLNTDSHICEDIDECVLSSGVCGPGTCYNTLGNY
TCVCPQDYMQVSGGHSCMDMRKRLCYRNYSGSTCEHQLKFNTTQRLCCCAYNVGKAWNKP
CQACPSPGTGDYRSLCGSVTGFRIDFETGKPKDIDECHEIPGVCAHGVCINHMGSFHCEC
PSGFIYNDLLLICEDIDECSSAEHVCQRNADCINRPGGYQCECADGYRLTPDGACADRNE
CVETPSVCRHGDCVDIPGGYECVCHTGFTATLNRRMCVDVNECSHQPCGNGTCKNSIGSF
NCICHQGFDLTSNNYCTDIDECVVFHSQLCRNGRCVNNVGSFQCLCREGYELSLDGKTCI
DVNECIMIPGICAPGTCLNLDGSFRCVCPDGYIVHNEHCVDVNECSEEPGICAYGSCFNS
LGSFECVCKHGFVLSEDRRRCYDTRESFCFTRFENGKCSVPQAFNTSKAKCCCSVMAKEG
WGDPCELCPKEQDAAFQDLCPFGHGIIPGVGDTRVDLNECVENPEVCVNGRCINMDGSFR
CECPAGYTLDYTGTRCDDIDECSVENPCGNGTCSNVIGSFECLCEEGFEPGPMMSCEDVN
ECGQNPLLCAFRCINTFGAYECSCPSGYTLREDGRMCQDVDECAEDLHNCDSRGMECNNL
IGTFMCVCPAGMIRRMNDDVCQDENECLTQPGVCENGRCVNTVGSYTCECGTGFKTDSTA
KQCLDYRKGFCFTEVLHTMCQMSSSSRVPVSRSQCCCNRGRGWGEQCELCPLPSTASYKK
LCPYGHGYATDGTDIDECKLIPGVCVNGVCINTVGSYRCHCKPGYIASTAGTSCVDVDEC
GMSPKPCNFICKNTEGSYACSCPRGYMLQDDSRTCKDVDECQSRQHNCQFSCVNTIGGFT
CKCPAGFSQHHTACRDINECLSELSPCGLRGICLNSVGSFSCECPKGFRLDSLGLNCDDI
DECARDHRCQFGCQNVAGGFHCSCPQGYTQHQEWNQCVDDNECLNPGNCGSASCFNTLGS
FKCGCPSGFTFDPVSTSCEDVDECVSSTSPCRYGCSNTQGGFVCGCPAGYYRAGQGHCVS
AAGFGGDGLGSEENALSHKTCYGCKTNGHQKKSVRRHTSNFTLDAVSLASVDVDQPLKLF
LNRSQLKPKAAILELLPAVRPLIQNVMYTITAGNHDGFFQIRQRAGVSYLHSTHRTSSMR
HYILQIRSSALFDTDRDERPASDLHMTLHITVQ
NT seq
8562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatctcaaggggatctgaggtgtttagttggatttgttgctctactgggaatttta
atggggaatatctcaggaatttatggaaaagcgactgttcatatggatggatcccagaga
cgagaaaaacaagagtccctgagaggacctaatgtgtgtggatctcgtctgcagtcctac
tgctgtccaggctggaagactctacccggggggaaccagtgtgttgtgcctatttgccgg
aacagctgtggtgatggtttctgctccagacccaacatgtgcacatgtcctggtggccag
atagccccaacctgtgccaccaaatcatcccaacaatgcaatatcagatgtatgaatgga
ggggtgtgtgaagatgaccattgccagtgtctaaagggatatacaggaagcttttgtggt
cagcctgtctgtgagaagacctgtcagaatggtggacgctgcattggaccaaaccgctgt
gcgtgtgtatacggcttcactgggccgcagtgtgagagagattaccgaacaggcccgtgc
ttcatccaggtccgcgacaggaagtgtgcaggtcagagcagtggatttgtatgcagtaag
gcactgtgctgtgccacagtgggtcaagcatggggtcacacgtgtgagctgtgcctacct
ctcagcttgtcctgcagcagagggttcatcccaaacacccgcacaggagcctgccaagat
gttgatgaatgtaagtttgtgcctgacctgtgtaaaggaggaaggtgcatcaacacagtg
ggttcatatcagtgccagtgtccagcgggttaccagcagcacatgagctcgctgaagtgt
gaggatgtggatgaatgctccatcatccagcatgtgtgtgatggcggacgctgcattaat
tcagcgggcagtttctcctgtgtgtgtcctcctggatacgtgccatctgtagaccggaca
cgctgccttgaccagcacacgggcgtctgttttgcgtcagttgtgaatggacgctgtgct
caggaaatcagaggacgcttcagtaaaatccagtgctgttgtgaccgtggccgctgctgg
agtcaaagaacagctcttcaaatgtgtcctgtaccaggatcagatgaatacgtcagcatc
tgtctggtgggctctgctctgagtggttataggaaagatgatcctgatatgaaccctcaa
caccgcagcagcttcaatcctaccactaatgaccagatacttcacccacttaatgacaat
gggcatatgatacctcagattcaccagactcttcaaatttcccaaatacctcagatccca
gggaatgataatagatttaaaacacaacaacctggttttgttagtgtaaatgagaccatg
aacaggtgtcgcctgtttccagatctgtgtctaaatggacgctgtgtagccatggggtct
gactaccgttgtgactgtaacaccggatacagagaggacaacagaggagagtgctcagat
gtagatgagtgtgtgtttgaaccctgcagtaatggacactgtatcaacactcctggttcc
ttctactgcagatgccacacaggctttctcagagttccaggaaaacagacctgcattgac
attgacgaatgtattcagaatggggtgctgtgtaagaacggccgctgtctgaatacagag
ggcagttttcagtgcatctgtaacgcaggattcaagctcacacctgatgggagaaactgc
atagataatgatgaatgtgtcgccacaaacatgtgccttaacggaatgtgcattaatgaa
gacggcagctttaaatgtgtatgtaatcctggattcaccctcaactccagtggccgatac
tgtacagatatcgatgagtgccagactccaggtgtgtgtatgaatgggaggtgtgtaaac
acacagggctctttcaggtgtgagtgttttgctggtcttactgtaggagtaagtggccgc
atatgtgtagacacacacatgcgcagcacctgttatggagctgtaaaaagagtcttatgt
ttacggcccttccagcgagctgtcaccaagtcacagtgctgctgtgccaaccctgactat
gcctttggtgagccgtgccatccctgccctggcaaaaactcagttgagtttcaggccctg
tgtgcgagcggtgttggattttctgctgatggcaaagacattaatgagtgtgctctggat
cctgatatatgctcaaatggagtgtgtgagaatctcagaggaactttccactgtgtctgt
aacagcggctatgaaagtgaccagactggcagaaactgtctggatattgatgaatgtgta
atgaacagtctcctctgtgataacggcctgtgccggaatgttcccggcagctacagctgc
acctgcccagacggatacaacttcagacacgacacagagacgtgtgaggacgtgaatgag
tgtgcgagcggcccgtgtgttaatggagtctgtaagaacagtgtgggttccttctcctgt
gagtgctcactaggaagtaaactggactccactggacttttatgtgttgacagcctgaag
ggctcgtgctggttgaccctccgggacggccgctgtgaagtgaacattaatggagctaca
ctgaggtcacagtgctgtgccacgctgggaaaagcctggggcagcccatgtgaaccatgc
caaaccgatcctgtatgtgaacaaggatttgctcggccaagaggggcttcctgtgaagat
gtgaatgagtgtgaggtgtttcctggtgtgtgtcataatggacagtgtgtgaacactaga
ggttcctttaaatgtcagtgtccagagagtcttacactggatgtcactggacgtctctgt
gtggatgttcgttcagaaccctgtttcctaacctacgatgaagacatgtgtacgcagccg
gtaccaggacggttccgtatggatgtgtgttgctgtacagtaggtttagcctggggcaaa
gattgtgacttatgccctgagcctggcacacggcagtttgacgctctgtgcccaagagga
ccaggcttcgccaacaaaggcgacatgctcactggcagagctgtttataaagatataaat
gagtgtaaagttttccaaagcatctgtattcatggaaaatgtcggaacaccattggaagc
ttcagatgtcgttgcgacagtgggtttgcactggataccaatgagcaaaactgcacagat
attgacgagtgtaagatctctcctgatgtttgtggtcatggcatgtgtatgaattcactg
ggcagttttcagtgcgattgtttccctggctatgagagtggatttatgatgatgaagaac
tgcatggatattgatgagtgtgaaagaaacctctcactgtgcaatggaggcacttgtgaa
aacactgatggcagctacaagtgtgtgtgtccaccgggtcatcagctgtctgtggatggc
agtgcctgtgaagatgtgaatgagtgtgatctgagtagcacgttgtgtcataacggcagg
tgtgtgaatgtggtggggacctaccagtgctcctgcaactctggttaccagacaacacct
gataggaaagagtgcacagacatagatgagtgtacgatagagaatggaggatgtgagctg
tactgtagtaattcagagggaagctacttctgcagctgtggtcagggttacgctctgacg
ccagaccaacggacatgtgcagatgtgaatgaatgtgaagaggatgttggcatctgtgaa
ggtggtcagtgcattaatgtccctggaacatatcattgtctgtgttttgaaggattcgtg
acttctgcagacacgaggacatgcatcgatgtgaatgagtgtgaactcaacagcaacatc
tgtatgtttggggagtgtgagaacaccaagggtttttacatctgtcattgtgagatgggt
tacgctgtgaagaaaggaacctctggttgcaccgatgttaatgagtgtgagatgaacact
cataactgtgacacacacgccacctgtgtcaacacagcaggactttaccgctgctcctgc
caggacgggtggtctggtgatggagtcaaatgtgctgatgtggatgagtgcgtgaacagg
actaacatctgcagtgctgatgccgagtgtgtgaacacagcaggctcgtatcgctgtgaa
tgttcagacggctttactggtgacggatttacctgctcagatatggacgagtgtgctgaa
gatgtggatctgtgtgaaaatggccagtgtctcaatgttcccggcagctatcgctgtgaa
tgtgagatgggcttcacacacactccgaacagcaagacctgtcgagatatagacgagtgt
tccttccagaacatctgtgtgtttggcacatgtcagaatattccaggaatgtttcgctgt
atttgtgataaggggtatgagctggacaggacaggtggaaactgcacagacatggacgag
tgtcttgatcccatcagctgtgttaatggtcactgcgagaacacagtcggctcgtaccag
tgcaactgtcccattgactttgagctcaaccccactggaattggctgcgttgacacgcga
atagggaactgttttctggaggtggcatatcctagacgtggtgggctggcctgtagcggt
gaggtggggtttggagtcagtcgttcgtcatgctgctgttctaaaggacgggcatggggt
aacccatgtgacctttgccctccgttcaacacctcggagtataacacactgtgtcctgga
ggagaggggttcaaacccaaccccatcaccatcatcctggaagatattgatgaatgtcag
gagctgcccggcctgtgccagggtggaaactgcatcaatacatttggaagtttccagtgc
gattgcccgtctggatactacctcaacacagacagccatatctgtgaggatattgatgaa
tgtgtgctcagttcaggggtttgtggtccgggcacctgctacaacacactgggaaactac
acatgtgtctgtccacaggattacatgcaagtgagcggaggacacagctgcatggatatg
aggaaacgtctgtgttaccgtaactacagtggaagtacctgtgaacaccagctcaaattt
aacaccacacagagattgtgctgctgtgcctacaatgtgggaaaagcctggaacaaacca
tgccaggcctgtccgagccctggcacaggtgactatagaagtctttgtggcagtgtgacc
ggattcaggattgattttgaaactggaaaaccaaaagatattgatgaatgtcatgaaatc
ccaggcgtctgtgctcatggtgtgtgtataaaccacatgggcagtttccactgcgagtgt
ccctcaggcttcatttataatgacctgctgctcatctgtgaagacattgacgaatgcagc
agtgcagagcatgtgtgtcagagaaatgcagactgcatcaaccgtccgggcggctatcag
tgtgaatgtgctgatgggtatagactcacacctgacggggcctgcgctgaccggaatgag
tgtgtggagacgcccagtgtgtgtcgtcatggtgactgtgtggacattccaggaggatac
gagtgtgtgtgtcacaccggctttacagccacactaaaccgcaggatgtgtgtagatgtt
aatgagtgttcacatcagccatgtgggaatggcacatgtaaaaactctattggctctttt
aactgtatctgtcatcaaggatttgatctcactagtaataactactgtacagatattgac
gagtgtgtagtttttcactctcagctctgcaggaacggccggtgtgttaataacgtaggg
tccttccagtgcctctgtagagagggttatgaactcagtcttgacggcaagacctgtata
gatgttaatgagtgtatcatgattcctggcatatgtgctcctggaacttgtctgaatctg
gatggttctttcagatgtgtctgtcctgatgggtatattgttcacaatgagcactgtgta
gatgtgaacgagtgttcagaagagcccggcatctgtgcgtatggctcctgtttcaacagt
ctgggcagctttgagtgcgtgtgtaaacatggatttgtgctgtcagaagatagacgcaga
tgttacgacactagagagagcttctgtttcacacgctttgagaacggcaagtgctctgtc
ccgcaggcattcaacaccagcaaagccaagtgctgctgtagtgtcatggccaaagagggc
tggggtgacccctgtgagctgtgccctaaagaacaggatgctgcatttcaggatctgtgt
ccatttggccatgggatcattcctggtgttggggacacacgtgtagacttaaatgagtgt
gtggagaatccagaggtctgtgtgaacggccgctgcatcaacatggacggctccttccgc
tgcgagtgtcccgcgggatacacgctcgactacacaggaacacgttgtgatgatattgat
gagtgttcagtggaaaacccgtgtggaaacggcacatgctcaaatgtgattggatctttt
gagtgtctgtgtgaggagggatttgagcctggaccaatgatgagctgtgaagatgtgaat
gaatgtggtcagaatcctctgctctgtgcatttcgctgcattaacactttcggggcatat
gaatgcagctgtccgtctggttacactctacgggaggatggacgcatgtgtcaggatgta
gatgagtgtgcagaggatcttcataactgtgactccagaggaatggagtgtaacaactta
atcggcaccttcatgtgtgtttgtccggctgggatgatccgcaggatgaatgatgatgtg
tgtcaagatgaaaatgaatgcttgactcagcctggggtttgtgagaacggccgatgtgtg
aacactgtcggcagttacacatgcgaatgtggcactgggttcaaaactgactctacagcc
aagcaatgtctcgattacaggaaaggcttttgtttcactgaagttctgcacaccatgtgt
cagatgtcctccagcagtcgtgttcctgtcagcaggtctcagtgctgttgtaacagaggc
cgtggctggggggagcagtgtgagctctgccctctgccttccactgccagctacaagaaa
ctctgcccatatggccatggctatgccactgacggaacagatatagatgagtgtaagctg
attccaggagtttgtgtcaacggcgtgtgtatcaacaccgtgggctcttacagatgccac
tgcaaaccaggatacattgcctcaactgcaggaacctcatgtgtcgatgttgatgaatgt
ggtatgtccccaaaaccctgtaacttcatatgtaagaacacggagggcagctatgcgtgt
tcctgtccccgcggttacatgctgcaggatgacagcaggacatgtaaagatgtagatgaa
tgtcagagcagacaacacaactgccagttctcatgtgtcaacaccattggtggatttacc
tgcaagtgtccagcaggcttcagccaacatcatacggcctgcagagatattaatgaatgt
ttgtcagagctgagtccatgtggcctgcggggcatctgtctgaattcagtgggaagcttc
agctgtgagtgtccaaagggcttcagactggactctctcggtctcaactgtgatgatata
gatgagtgtgcacgtgatcacaggtgtcagtttggttgtcagaatgttgcaggtggtttc
cattgcagctgtccacagggatatacacaacaccaggagtggaaccagtgtgtggatgac
aatgagtgcttgaaccctggcaactgtggttcagcttcctgttttaacacgttgggcagt
tttaagtgtggctgtccatctggcttcacctttgaccccgtgtccacgagttgtgaagat
gtggatgagtgcgtgtcctccacgagcccctgcagatacggatgctcaaacacacagggt
ggatttgtgtgcggatgtcctgcaggatattacagagcaggacaggggcattgtgtatct
gctgctggttttgggggtgatgggcttggatcagaagaaaacgctctttctcataaaacc
tgctacggctgcaaaacaaatggacaccagaagaaaagtgtcagaagacatacttcaaac
ttcacactggatgcagttagtctggccagtgtggatgtggatcagccactgaagttattt
ctcaatcgctcacaactcaaacccaaagcagccatactggagctgctgcctgctgtcaga
cccctcatccagaatgtcatgtacaccatcacagctggcaaccatgatggattcttccaa
atcagacagcgtgcaggtgtcagttacctgcacagcacacacaggacgtcctcaatgaga
cactacatactgcagatcagaagctctgctctctttgacacagacagagatgagcgacct
gcttcagacctgcacatgacactccacattacagttcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
