Misgurnus anguillicaudatus (oriental weatherfish): 129420804
Help
Entry
129420804 CDS
T09481
Name
(RefSeq) scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein DMBT1 isoform X1
KO
K13912
deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
manu
Misgurnus anguillicaudatus (oriental weatherfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SRCR
SRCR_2
Zona_pellucida
ZP-N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129420804
NCBI-ProteinID:
XP_073723247
LinkDB
All DBs
Position
4:31074829..31108484
Genome browser
AA seq
1942 aa
AA seq
DB search
MRFLILLYVSLLLMTNVVWTLTIPPSTDIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDYWDL
SDAAVVCRQLGCGYATEAKSNAYFGEGSGQIWMDDVQCAGDETTLTNCSSTPRGIHNCAH
GEDAGVICQFGGTQTTATPSTSTQEISNTPISGFKDIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGT
VCDDFWDLSDAAVVCRQLGCGVATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDVQCAGNETTLTNCTATP
RGTHNCVHGEDAGVICQNIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDGWDLSDAAVVCRQL
GCGNATEAKSDAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETTLTNCTATPRGIHNCGHNEDAGVICQI
GRTQTTATPRTATQYILNTSISEFKDIRLVNGDNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDGWDLSD
AAVVCRQLGCGVATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETTLTNCTATPRGTHNCVHGE
DAGVICQNIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDGWDLSDAAVVCRQLGCGNATEAKS
NAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNENTLTNCTATPRGTHDCGHHEDAGVICLFGRTQTTATPR
TATQYILNTSISEFKDIRLVNGDNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDYWDLSDAAVVCQQLGC
GVATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETKLTNCTATPRGTHNCVHGEDAGVICQNIR
LVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDYWDLSDAAVVCRQLGCGNATEAKSNAYFGQGSGQ
IWMDDVQCTGNETTLTNCSSTPRGIHNCGHHEDAGVICLFGRTQTTATPSTSTQEILNTT
ISGFNATQKISNTSIPGFKDIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDFWDLSDAAVVCR
QLGCGNATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETTLTNCSSRPIGTHDCGHHEDAGVIC
QFGRTQTTATPSTSTPEILNTTISGFKDIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDYWDL
SDAAVVCRQLGCGNATQATSNAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETTLTNCSSRPIGTHDCGH
HEDAGVICQFVRSQTTATPSTSTQNISNTSISGFKDIRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGT
VCDDGWDLSDAAVVCRQLGCGVATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDVQCTGNETTLTNCSSRP
IGTHDCGHHEDAGVICQFGRTQTTATPSTSTPEIFNITISGFKDIRLVNGGNLCSGRVEV
LYNGVWGTVCDDGWDLSDAAVVCRQLGCGVATEAKSNAYFGQGSEQIWMDDVQCTGNETT
LTNCSSTPRGTHNCGHHEDAGVICQFGRTQTTTTASTSTPEIFNITISGFKDIRLVNGGN
LCSGRVEVLYNGVWGTVCDDGWDLSDAAVVCRQLGCGVATEAKSNAYFGQGSGQIWMDDV
QCTGNETTLTNCTATPRGTHDCGHHEDAGVICQFGRTQTTATPNTSTPETLNTTISGFKD
IRLVNGGNLCSGRVEVLYNGVWGTVCDDGWDLSDAAVVCRQLGCGVATEAKSDAYFGQGS
GQIWMDDVQCTGNETTLTNCSSRSIGTHDCGHHEDAGVICQFGWTTPAQSTVVRDSCSEL
NCTKDEWCGEQNGVYGCFCNGDHPTYDPDTFDVYETCESSSAFVSLSRCQLFEAGFPADL
LHLNDPSCKGTVRNGRVEFGFDNNEHICGTSLMANGTHFIYENFIRGEPDLTSHEGPISR
QRILSLHFSCIYQQTQSVSLDMHPLGSIVNRNLEGQGTYQVRMVPYLDAEFSKPFNGSVD
VVVDEKIFVEVGVGGVDSHQFVSVIDGCWATPVNDPLSSLRWDLITGGCPNPHDNTVELL
QNGNSTSSRFSFRMFVFTADSNKVYLHCNIHLCLLSQNDCSSHCNPGHQARRRRSVNFHD
TASISMGPLVWSKGNSEVRGLQ
NT seq
5829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtttctaatcttattgtatgtgtcgctattgctgatgactaatgttgtctggaca
ctaactataccaccaagtacagacatcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctgga
agagtggaggttctttataatggagtttgggggaccgtctgtgatgattattgggatcta
tcagatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgtggttatgctacagaggcaaagagc
aatgcttattttggtgaaggatcaggacaaatatggatggatgatgtacagtgtgcagga
gatgaaactacactgacaaactgttcatcaacaccaagaggaattcacaactgtgcacac
ggtgaagatgctggagttatctgccaatttggcgggacacaaacaactgcaacaccaagt
acatctacacaagagatatcaaacacacccatctcaggattcaaagacatcagattggtg
aatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttgggggacc
gtctgtgatgatttttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgt
ggtgttgctacagaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatgg
atggatgatgtacaatgtgcagggaatgaaactacactgacaaactgtacagcaacacca
agaggaactcacaactgtgtgcacggtgaagatgctggagtcatctgccaaaacatcaga
ttggtgaatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttgg
ggaactgtctgtgatgatggttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcgacagctg
ggctgtggtaatgctacagaggcaaagagcgatgcttattttggtcaaggatcaggacaa
atatggatggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactacactgacaaactgtacagca
acaccaagaggaattcacaactgtggacataatgaagatgctggagtcatctgccaaatt
ggcaggacacaaacaactgcaacaccgaggacagcaacacaatatatattgaacacatcc
atctcagaattcaaagacatcagattggtgaatggagacaatttgtgttctggaagagtg
gaggttctttataatggagtttggggaactgtctgtgatgatggttgggatctatccgat
gctgcagtggtttgtcgacagctgggctgtggtgttgctacagaggcaaagagcaatgct
tattttggtcaaggatcaggacaaatatggatggatgatgtacagtgtacagggaatgaa
actacactgacaaactgtacagcaacaccaagaggaactcacaactgtgtgcacggtgaa
gatgctggagtcatctgccaaaacatcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctgga
agagtggaggttctttataatggagtttggggaactgtctgtgatgatggttgggatcta
tccgatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgtggtaatgctacagaggcaaagagc
aatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatggatggatgatgtacagtgtacaggg
aatgaaaatacactgacaaactgtacagcaacaccaagaggaactcacgactgtggacac
catgaagatgctggagtcatctgcctatttggcaggacacaaacaactgcaacaccgagg
acagcaacacaatatatattgaacacatccatctcagaattcaaagacatcagattggtg
aatggagacaatttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttggggaact
gtctgtgatgattattgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcaacagctgggctgt
ggtgttgctacagaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatgg
atggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactaaattgacaaactgtacagcaacacca
agaggaactcacaactgtgttcatggtgaagatgctggagtcatctgccaaaacatcaga
ttggtgaatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttgg
ggaactgtctgtgatgattattgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcgacagctg
ggatgtggtaatgctacagaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatcaggacaa
atatggatggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactacactgacaaactgttcatca
acaccaagaggaattcacaactgtggacaccatgaagatgctggagtcatctgcctattt
ggcaggacacaaacaacggcaacaccaagtacatctacacaagagatattgaatacaacc
atctccggattcaacgctacacaaaagatttcaaacacatccataccaggattcaaagac
atcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatgga
gtttgggggaccgtctgtgatgatttttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcga
cagctgggctgtggtaatgctacagaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatca
ggacaaatatggatggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactacattgacaaactgt
tcatcaagaccaataggaactcacgactgtggacaccatgaagatgctggagttatctgc
caatttggcaggacacaaacaactgcaacaccaagtacatctacaccagaaatattaaac
acaaccatctcaggattcaaagacatcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctgga
agagtggaggttctttataatggagtttggggaactgtctgtgatgattattgggatcta
tcagatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgtggtaatgctacacaggcaacaagc
aatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatggatggatgatgtacagtgtacaggg
aatgaaactacattgacaaactgttcatcaagaccaataggaactcacgactgtggacac
catgaagatgctggagtcatctgtcaatttgtcaggtcacaaacaactgcaacaccaagt
acatctacacaaaatatatcaaacacatccatttcaggattcaaagacatcagattggtg
aatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttggggaact
gtctgtgatgatggttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgt
ggtgttgctacagaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatgg
atggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactacattgacaaactgttcatcaagacca
ataggaactcacgactgtggacaccatgaagatgctggagtcatatgccaatttggcagg
acacaaacaactgcaacaccaagtacatctacaccagagatatttaacataaccatctca
ggattcaaagacatcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggtt
ctttataatggagtttgggggaccgtctgtgatgatggttgggatctatcagatgctgca
gtggtttgtcgacagctgggctgtggtgttgctacagaggcaaagagcaatgcttatttt
ggtcaaggatcagaacaaatatggatggatgatgtacagtgtacagggaatgaaactaca
ttgacaaactgttcatcaacaccaagaggaactcacaactgtggacaccatgaagatgct
ggagtcatctgtcaatttggcaggacacaaacaactacaacagcaagtacatctacacca
gagatatttaacataaccatctcaggattcaaagacatcagattggtgaatggtggcaac
ttgtgttctggaagagtggaggttctttataatggagtttgggggaccgtctgtgatgat
ggttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcgacagctgggctgtggtgttgctaca
gaggcaaagagcaatgcttattttggtcaaggatcaggacaaatatggatggatgatgta
cagtgtacagggaatgaaactacattgacaaactgtacagcaacaccaagaggaactcac
gactgtggacaccatgaagatgctggagttatctgccaatttggcaggacacaaacaact
gcaacaccaaatacatctacaccagagacattgaacacaaccatctcgggattcaaagac
atcagattggtgaatggtggcaacttgtgttctggaagagtggaggttctttataatgga
gtttggggaactgtctgtgatgatggttgggatctatcagatgctgcagtggtttgtcga
cagctgggctgtggtgttgctacagaggcaaaaagcgatgcttattttggtcaaggatca
ggacaaatatggatggatgatgtacagtgtacaggaaatgaaactacattgacaaactgt
tcatcaagatcaataggaactcacgactgtggacaccatgaagatgctggagtcatctgt
caatttggctggacaactccagcacaaagtacagttgttagagattcctgctctgaactc
aactgtactaaggatgagtggtgtggagaacagaatggcgtttacgggtgtttctgtaac
ggagatcaccccacatacgaccctgacacttttgatgtatatgagacgtgtgaaagcagt
tctgcgttcgtgtctttgtcgcgctgtcagctctttgaagctggttttcctgctgatctc
ttacacctgaatgatcccagctgtaaaggaactgtccgaaatggcagagtggaattcggt
tttgataacaatgaacacatttgtggtacaagtcttatggccaatggtactcacttcatc
tatgaaaactttattcgcggtgagccagacttaacatcccatgaaggtccaatcagcaga
cagagaattctgagcttgcatttcagctgtatttaccaacaaacccaatcggtttccctg
gacatgcaccctctggggagtatcgtgaacagaaatcttgaaggtcaaggaacgtatcag
gtcaggatggttccatatctggatgctgaattctccaaacccttcaatggaagtgttgat
gtggtggtggatgagaagatttttgttgaagttggtgttggtggagttgacagtcatcag
tttgtctcagtgattgacggatgttgggctacacctgtgaatgatcctctgtcatctctc
cgctgggatctcatcactggagggtgtccaaatccacatgacaacacagtcgagcttttg
cagaatggcaactctacatccagccgtttctccttcaggatgttcgtctttactgcagac
tccaataaagtttacctgcactgtaacattcatctttgtcttttgagccaaaacgactgc
tcatcgcattgtaaccctggacatcaagcgagacggcgcagatctgtgaactttcatgac
actgcctccatatctatgggtccactggtttggtctaaaggaaactcagaggttagaggt
ctccaatga
DBGET
integrated database retrieval system
