Marinomonas arctica: IBG28_13240
Help
Entry
IBG28_13240 CDS
T06902
Name
(GenBank) cadherin domain-containing protein
Organism
mard
Marinomonas arctica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
PATR
DUF4347
Cadherin_CELSR2_9th
He_PIG
Big_9
RibLong
Cadherin_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNT04675
UniProt:
A0A7H1J2F9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2844522..2854028)
Genome browser
AA seq
3168 aa
AA seq
DB search
MKSKPENTRQARKPLISALEPRLLLDGAAVATAVDVLTDSQFHDAFQTDASQQDTDTSVV
MAPTEVRAADPTLNNGKKEVVFIEDNVADYQTLIDGIGAGVEVVLLDSTQDGLAQMALWA
QSNSDYDAIHIISHGAEGQVNLGGFSLDNITVNTRSADLAQLGAALNEDGDLLLYGCGVA
SGEGQEFITALAQATQADVAASDDLTGAAVLGGDWILEKRSGVIETTDLSVGLADNYAYT
LETVSFTSADANYTADTVTKTVESKQFTFSTSNTSTLGFDGGGLYGLVGPNSETQITIDV
ETGYSFDLTGVTELGGSSTVMVSYTNADGSTGGATAFDSAFPLNDVKQVVLTSTDYATFN
DFLISDVKAIPVNNAPTITGAPADITVIEDTASNVDLSGVAFADSDGDNLTVTLTASAGT
LTASSGGSVTVSNSGTGTLTLSGSAADINSYLDTTSNVQYTGASNASGDNAATLTIKAND
GKTDSSISTVNIDITAVNDAPTAVSPTTGTVSTFDSANAVVATVGATDVDDSTLKYSIQS
ITLDSASQANDGSLFNFATAANTLTATNALRATTPSGLTAGTYIVTVVATDEAELSTTQE
ITITVTDTLMVTTANDTSENSDDAYNGTGYAAELADGGGLSLREALGLAEAGGKTIAFDT
SLNGADISLDSNITVADGTVFQLADGTSFTISGSDLYLDGALTIDSGVGTTLTLSANLTD
EDDGVSTLNKTGTGTLVLSGTNNTEVKGLDIISVTAGTLQISADANLGTGDVILSGGAIF
DTLNNVLTAENAVDNIFSIEIGGATFNQTGSGHLELSDTVGGSGLLTKAGAGSMTFSAIN
EGFHGGVQINNGTVNAASEDESLGYAGTVTLNGGTLVISNDESFTNEIAVNADATISNST
NVTLNKVISGSGALTKAGAGTMTWSGINTHSGDLIVSAGALAVSGGSSIGDDSAVTVNSG
ATLSLIGGNETIGSLAGSGAVALTYGLTVGNAISTEFSGTISSTNASGITKVGTGKLTLS
GENNYTGTTTVSAGTLSISRDSNLGSGQLILNGGILNLNAFSSTLDNAIVLGASVGTVSV
TNGGTAVISGVISGDGNLSKIGGVNLTLSGNNTYTGTTSISGANGLSITGDSNLGSGQVI
LQTADTVLTITGATTIDNEILFNQNATISAANAVALNGVITGTGALTKSGAGVLTLSGNN
ADYSGDIFLSQGVIIAAHNNALGNTAGSTTVSSGSTLRVGNGLTLAENLTISGVGIDSSY
GALKINEGTGSATVTGDITLAADSLIGAFNTGDSLTLSGVISGDFDLTKVGSGTLTLSGS
NTHTGAVTVSGGTLALLGGSSIGDDSAVTVNSGTTLSLTGGNETIGSLSGSGAVALTYGL
TVGNAINTAFTGVISSTNTSGITKVGSGTLALSGANTYTGATTVSAGKLLLQNGSAIADS
SAVTISSGAELELRDSETVGSLAGAGSLTLNGGSLTTGGNNSDTTFSGVIEDGGNGGGLT
KTGSGDFTLSGSNSYAGDTAVFGGSLSVSSDSNLGAGVLTLNGGTLNLIADGVHIDNAIS
VFSNNGQINVGASLTATLSGVVSGSGSLTKVGDGTLALSGTQTGTGEMSIIAGTLSVAGD
ANLLAGALTLNGGNLSVTGATTIDNAIDLSSAGSITNLDAVSLSGIISGVGDLTKLGVGT
LTLSGTQTGTGAMTVSAGTLAVSGDANLLAGGLTLNNGTLTVTGSGVTIDNALTLGSSGG
TVSNSNAVTLSGAITGTGDLSKTGAGVLTLSNTGNEAAWSGDISVTAGTLTVINDDVLSS
GSINVTGGTLELGNSVNLDNAVTLGAGGVLLPASGKTATLSGNLALTSDATFNLGVNTNL
TISGVISGDYGITKSGSASLHLTGNNTYTGATVINAGLVTAGTNTALGATESGTTVNSGG
TLSFANGVNVAENLTIAGTGSSLNGALVMRSSGTATLTGAVTLSGDATVKASSSAYTLVL
AGVISDGNNGYALSKTGTGTVTLSGINTYTGATNVSLGTLLVTGALNGTSAVTVSYDATL
GASGNGNTGTIFAANSSNTVTVESGGTLSPGLTSSVGLMTINGNLDLQSGSTLRVDIAGT
TAGSLYDVVDVRGSVSLAGALTVNHNYTPGNGDTYRIITNDSADAITGTFTGLAEAGTLT
AGGNATVLTGYYAASDVAATTGGNDFMLRAPANEAPVITSGATGSVNENADVATVIYTAA
ATDADNNALSYSLTGDDVALLTIDSSTGVVTLKSSANYESKNTYSFNVVVTDNGTGNLTD
TIAITVSVNDLNDNTPVITSSASGSVNENADTSTVIYTATGTDADGTAANNTLRYSLSGD
DADHLTIDTTTGVVTLKAAADYETKSSYSFNVIATDNGAGNFNSGSLSVSKAIVVSVNDL
NDNTPVMTSGASGSVNENADTSTVIYTATGTDADGTAANSTLVYSLSGDDADKLNINATT
GEVTLKASADYETQTSYSFNVVATDNGAGNFNSGSLSTTQAVTVSVNDLNDNTPVITSGA
TGAVNENAATSTVIYTVTASDADGTTANNTLTYSLTGTDASLLDINASTGVVTLKASANF
ETKSSYSFNVVATDNGTGNLMDTQAVTVSVNDLNDNTPVITSGATGNVDENAATSTVIYT
VTGTDADGTSTNNTLTYSLTGTDASLLDINASTGVVTLKASANFETKSSYSFNVVATDNG
AGNFNSGSLSVSKAVTVSVNDLNDNVPVVTSATAGSVNENATTSTVIYTVTATDADGTTA
NNTLTYSLTGTDASLLDINASTGVVTLKASANFETKSSYSFNVVATDNGTGNLMDTQAVT
VSVNDVNEAPIITGVLVNMSGTSGQIFTPVTLPANLFTDVDAGDQLVWSIENLPTGLVFN
AVTRTISGTPQGGFEGTNRLQVVATDRSGSQVKVPVTLTLNPAPVSAPVSPVADAAPTVP
VPTQSTSFTAPDVTTTSTALPTGVVETSGGSRGFTEVTASAGVSQIQPVAEAPVNNAPSV
GQTAGSNTVVVSESRVAVNVGANGQVQVSEASGVSTNTTGLTVATIVPQGERVSITIADT
STVARYSGTLADGTQLPDWVEINPTTGEVTMTPPSGQGTITLKVNAVDADGNVRILEIEV
DLESLPQTAPADTVTNVSPVFMSLDDQLAVAAEQYDDYGSGLMKLLAS
NT seq
9507 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagcaaaccagaaaatacgagacaagcacgtaagccgcttatttctgcgctagaa
cctcgactgttattggatggtgccgcggtcgctacggcggtggatgtattgaccgattct
caatttcatgatgcctttcaaacagatgcaagtcagcaagatacagatacctctgtggtg
atggctcccactgaagtgagagccgctgatcccaccttgaataatggcaaaaaagaagtc
gtctttattgaagacaacgtggcggattaccagaccctaatagacggtattggcgctgga
gttgaagtggtattgcttgattctacccaagatggcctcgcgcagatggcactatgggcg
cagagtaacagtgactacgatgcgattcacatcatcagccatggtgccgaagggcaggtt
aacctagggggctttagtttagataatattaccgtcaatacccgttctgctgatttagcc
caactgggtgcggcattaaatgaagacggtgatttgctgctttacggttgtggagtcgcc
agcggagaagggcaagaatttattactgctttagcacaagccacccaagcggacgtggcg
gcgtcggacgacttgactggcgcggctgtattaggcggggattggatactggaaaaacga
tctggtgttattgaaacaacggatctgagtgttgggctggctgataattatgcgtacacc
ctagaaactgtttcatttactagtgcagatgcgaattatactgctgatacagtgaccaaa
acagttgaaagcaagcaatttacctttagtactagtaatacatcaacacttggatttgat
ggtggtggtttgtatggtcttgttggacctaacagtgaaacgcaaataactatagacgtt
gagacgggctattcctttgatttgactggtgttactgaattaggtgggtctagcacagtt
atggtatcttacaccaatgcagatggctccacagggggggcaactgcatttgattctgct
tttccgctgaatgatgttaagcaagtcgttttaacatcaaccgattatgccacttttaat
gattttttgattagcgatgtcaaagcgattcctgtcaacaacgcccccaccatcactggc
gcacctgcagatattaccgtcatcgaagacaccgcttccaatgtagatttgtctggcgtt
gcctttgctgacagcgatggggataatcttacggtcaccctgaccgcatcggccggaaca
ctgactgcttcttctggtggtagtgtgacagtgagtaactccggtacgggaacgttgaca
ctttctggctccgccgccgatattaatagctatttagatacgacctcaaatgtccaatat
acaggtgcgagcaacgccagtggcgacaatgcggcgaccttaacgattaaggcgaatgac
ggcaagacggactctagtatttctaccgtcaatattgatattacggcggttaacgatgcg
ccgacggctgtatcaccgacgactggcaccgtaagcacctttgacagtgcaaacgctgtg
gttgccactgtcggtgctaccgatgtcgatgacagtacgttgaagtacagtattcaatct
attaccttggacagtgcctctcaggccaatgacggttcattgtttaactttgccactgct
gcgaataccttaacggcaaccaatgcactgcgagctaccacgccttctggcttgacggca
ggcacctatattgtgaccgttgtcgcaacggatgaagcagagctttctacaactcaagag
ataaccattacggtgacagacaccttgatggtgaccacagccaacgacacctcagaaaat
tctgacgacgcttataatggtactggctacgccgctgagttggcggatggcggtggtttg
tcgttgcgtgaagcgctaggtttggccgaggctggtggtaagaccattgcctttgatacc
agcttgaatggtgctgacatttcgttagattcaaatattacggtggcagatggcactgtt
ttccaactcgccgacggcaccagcttcaccatcagcggtagtgatttgtacctagatggt
gcgcttactatcgacagcggcgttggcactaccctgaccttgtctgccaacttgaccgat
gaggacgacggtgtctcaacactgaataagaccggtaccggcacactggtgctaagcggt
accaacaatactgaggtaaaaggtctcgacattattagtgtaaccgctggcacactgcag
attagtgccgatgctaaccttggtacaggtgacgttatcctgagtggcggtgccattttt
gacacattaaataatgtactgactgcagagaacgctgtagataacattttttcgattgaa
atcggcggtgccactttcaaccagactggcagcgggcatctggagctttccgacacagtt
ggcggtagtgggctattgactaaggcgggtgccggtagcatgaccttctcagccatcaac
gaagggttccacggtggtgtgcaaatcaacaacggtacggtcaatgcggcgtcagaagac
gagagccttggctatgcaggaacggttacactgaacggtggcacattggttatcagtaat
gacgaaagctttactaatgaaattgctgttaacgcagatgcaacgatttctaatagtacg
aatgtcactctgaataaggtgatttctggctcaggagcgttaaccaaagccggtgcgggt
acgatgacctggtcaggcattaatactcatagtggcgacctgatcgtttcagcaggcgca
ctggcggtttcaggcggcagctctattggcgatgacagtgcggtaaccgtcaacagtggt
gcgactttgagtctgataggtggtaacgagaccataggctccttggcgggatcgggtgca
gtcgcgctgacctatgggttaacagtgggcaatgccatcagcacggagttctccggtacc
atctcttctacgaatgccagtggtataaccaaagttggtacgggcaagctgactttaagt
ggtgaaaataactacactggaacaacgacagtctcggccggtactttgtccatttccaga
gatagtaacctaggtagcggtcaattaatcctcaatggcggcatcttaaacttaaatgca
tttagcagcactctggataatgccattgttctgggagcgtctgtcggaacagtaagtgtt
accaatggcggtacggcggtgatatccggtgtgattagtggtgatggcaaccttagtaaa
atcggtggtgtaaatctcaccttgtctggcaacaacacgtatacaggcacgacttcaatt
tctggtgctaatggtttgagtattaccggtgatagcaatctaggcagcggtcaggtgatt
ctgcaaacggcagacactgtactcacgattacaggtgctaccacgattgataatgaaata
ctcttcaatcagaacgccactatttcagccgctaatgccgttgccctcaatggcgtcatc
actggcaccggtgcgttgacgaaatcgggtgcaggcgtactgaccttatctggtaataat
gccgattattccggtgatattttccttagtcagggtgtgattattgccgcacacaataat
gctttgggtaacaccgctggttcgactacggtttccagtggtagcactttgcgtgttggt
aacggcttaacattggcagaaaaccttactattagcggtgtcggtatcgattcttcttat
ggtgctttaaaaatcaatgaagggacgggttcagcgacagtgaccggtgatattactctg
gccgctgatagtctgatcggtgcctttaacacaggtgatagtctgacgttgagtggtgtc
attagcggtgattttgacttaaccaaagtaggtagcggaacactgacattatcaggaagc
aatacccatactggtgccgtgacggtttctggaggaacgttagctttattaggtggcagc
tctattggtgatgatagcgctgtgacagtgaatagtggcactacgttaagtttgactggt
ggtaatgaaaccattgggtcattgtctggatcgggtgcggttgcgctgacctatggacta
acagtggggaatgccatcaataccgctttcactggtgtgatttcttcaacgaacaccagc
ggtatcactaaagtcggttcaggaacactggccttatcaggagcaaatacctacactggc
gcgactaccgtctctgcaggtaagctcttattgcaaaatggttcagctattgcagatagc
agtgcggtgactatcagtagcggtgcagaattagagctgcgcgatagcgagactgtaggc
agtctggctggtgcaggtagcctgacgttgaatggcggcagcctgaccaccggtggcaat
aatagcgataccacattctctggtgtgatcgaggatggtggcaatggtggcgggttaaca
aagacaggttcaggcgactttaccctgtcgggtagcaatagctacgcaggggacactgca
gtctttggcgggtcattgtcagtcagttccgattcgaatttgggtgcaggtgttttgacg
ctaaatggcggaaccctgaacttgattgcagatggtgttcatattgataacgctatctca
gtattttccaacaatgggcagatcaatgttggcgcaagtttgacggcaactttgtcgggt
gtggtgtcaggcagtggttcattgacgaaagtcggtgatggtactttggcgttaagcgga
actcagactggcacgggtgagatgagcattattgcaggcactctgtcggttgcgggcgat
gctaacctgctggctggtgcattgacgcttaatggcggtaatctgagcgttaccggtgct
accactatagataatgcaatagatttatcctctgcaggcagtatcaccaaccttgacgca
gttagcctgtcgggcatcatctccggtgtgggcgacttgacgaagttgggggttggcact
ctgaccctgtcgggtacacaaaccgggaccggtgctatgacggtgtctgctggtacgctg
gcggtttcgggtgatgccaatctgctggctggtggtttgactctgaacaacggcacgttg
acggtgacaggcagtggtgtcaccatcgataacgcgctgacactgggtagtagcggcggc
acagtgagcaatagtaatgcagttacgttgtcgggcgccatcactggtacgggcgacctg
agcaagacgggcgctggtgtcctgaccttgtcgaatacaggcaacgaagccgcatggagc
ggtgacatcagcgtgacagctggcactttaacggtcatcaatgatgacgtgttgtcttcg
ggttccatcaatgtaactggcgggactttggagctaggtaatagtgttaatttagacaat
gcggtcaccttaggtgctggtggcgtgctgctacctgcctcaggtaaaacagcgaccctg
tcgggcaaccttgctctgacgtcggatgcgacgttcaacctaggcgtcaatactaacttg
accatcagtggtgtgatcagcggcgattatggcatcactaaatcaggctctgcctccctg
cacttgacgggtaacaatacttatactggggcaacggttatcaatgctggtttggtcaca
gctggcaccaatacagcgttgggtgccacagagagcggcacgacggtcaattccggcggc
acgttaagttttgcgaatggtgttaatgttgctgagaacttgacgattgctggcaccggt
tcttcattaaatggtgcgctagtcatgcgctcctcaggtacggcgactcttaccggcgcg
gtaaccctgtcaggcgatgccacggtcaaagcgtcttccagcgcctacaccttggtgtta
gctggtgtgatctcagacgggaataatggttatgctttgagcaagacgggaactggcact
gtcaccttatcaggtattaatacttatactggtgcgacgaatgtgtcgctaggtacgtta
ttggtaactggtgcattgaatggaacatcggctgtgactgtttcttatgatgcgacttta
ggcgcgtctgggaatggaaataccggtactatttttgcggcaaattcctctaatactgtg
acggttgaaagtggtggtaccttgtctcctggcctcacaagtagtgtcggtcttatgacg
atcaatggtaaccttgatcttcagtcaggtagtacgttaagggtggacattgcagggacg
actgcgggtagcctgtatgatgtggtggatgttcgaggttcggtttcattggcaggagcg
ttgacggtgaaccacaactatacgcccggcaatggtgacacgtatcgtattatcaccaat
gacagtgcagatgccatcactggaacctttactgggcttgccgaagctggaaccttgacg
gcaggtggtaacgccactgtcttaactgggtattacgcagcaagtgacgtcgcagccacc
acaggtggcaatgatttcatgttgagggcacctgcgaatgaagcccctgtaatcacgtcc
ggagccaccggtagtgtgaatgaaaatgcagatgtggcgacggtgatttacaccgcggcc
gcaacggatgcggataacaatgccttgagttacagccttacgggcgatgatgtggccttg
ttgactattgattccagcacgggcgtggtaacactgaaaagttctgccaactacgaaagc
aaaaacacctacagtttcaacgtggtggtgaccgataatggtacgggaaatctgacagat
accatagccatcacggtgagtgtcaatgacttgaacgacaatacgccggtgattacctca
agtgcgagtggcagtgtcaatgaaaatgccgatacctcgaccgtgatttatacggctaca
ggtaccgatgcagacggcacggcagcgaacaacaccttgcgttatagtctgtctggcgac
gatgccgaccatttaaccatcgatacgaccacgggtgtggtgacgcttaaagccgctgcg
gattacgaaaccaagtccagctacagttttaacgttatcgctacggacaatggtgcgggt
aactttaattctggcagcttgagtgtcagcaaagcgattgtcgtgagtgtgaatgacttg
aacgacaacacgccagtgatgacgtctggtgcgagtggcagcgtcaatgaaaatgcggat
acttcgaccgtgatttacacggccacaggtaccgatgcagacggcacggcagcgaacagt
accttggtgtatagtttgtcaggcgacgatgcggataagttaaacatcaatgcgacaacg
ggcgaagtgacgttgaaagcctcagcggattatgaaactcaaaccagctacagctttaat
gtggtcgcgacggataacggcgcaggtaatttcaattctggtagtttgagtaccacgcaa
gccgtgacggtgagtgttaatgacctgaacgacaacacgccagtgattacctctggtgcg
actggtgcagtcaatgaaaatgcggcaacgagtaccgtgatttacaccgtcacagcaagc
gatgcagatggtacgaccgccaacaacacgttgacttacagtcttactggtaccgatgcg
tctttattagacattaatgccagcacgggtgtggtaaccctaaaagcgtcggcgaatttt
gaaaccaagtctagttacagtttcaacgtcgtcgcgaccgataacggcacagggaacctg
atggacacccaagctgtcactgttagtgttaatgatctcaatgacaacaccccggtcatt
acttctggggcaacgggcaatgtggatgaaaacgcagcgactagtacggtgatttatact
gtaacaggcacggatgcggatggtacatcgaccaacaatacgctgacttacagcttaacg
gggaccgatgcgtctttgttagacattaatgccagcaccggggtggtgacattaaaagcg
tctgcgaattttgaaaccaagtctagttacagcttcaatgtagtggctacggataatggc
gctggtaactttaactcaggcagtttgagtgttagcaaagccgttacggttagtgttaat
gatcttaacgacaacgtgccagtggtcacttccgcaacagcgggcagcgtgaatgaaaat
gcgacaacgagtaccgtgatttacaccgtcaccgcgacggatgcagatggtacaaccgcc
aacaacacgttgacttacagtcttactggtaccgatgcgtctttattagacattaatgcc
agcacgggtgtggtaaccctaaaagcgtcggcgaattttgaaaccaagtctagttacagt
ttcaacgtcgtcgcgaccgataacggcacagggaacctgatggacacccaagctgtcact
gttagtgttaatgatgtgaatgaggctcctattattactggtgtccttgtgaatatgtca
ggaacatcaggtcaaatatttacccctgttaccttgcctgctaacttatttacggatgtg
gatgccggtgatcagctggtatggagtattgagaatctgccaacgggtctggtttttaac
gcggtgactcgcactatatctggaacgccgcagggtggtttcgaaggcacgaatagattg
caggtggttgcgacagatcgcagtggtagtcaggttaaagtaccagtgacgcttactttg
aaccctgctcctgtctccgcgcctgttagcccagtggctgatgcagcaccgactgtgcca
gtgccgactcaaagcaccagttttacggcgccggatgtcacgaccacgtctacggctttg
ccaacgggtgtggtggaaacatctggaggctcaaggggctttactgaggtgacagcatcg
gctggcgttagtcagattcagcccgtcgctgaagcgccagtaaataatgcaccgagcgta
ggacaaactgctggctcaaatacggttgtggtgtctgaatccagagtggccgtgaatgtg
ggtgccaatgggcaggttcaggtctcagaagccagtggcgtatcgaccaatacgacaggc
ttaaccgtggcaaccattgtgccgcagggggagcgagtgtctattaccattgcggatacc
tccaccgttgctcgatacagtggtaccttggcagacgggacacagcttccagattgggtt
gaaatcaaccctacgacgggtgaagtcacgatgacaccaccatcaggacaaggcacgatt
acgttaaaagtgaacgcggtggatgctgatggcaatgtgcggatattggaaatagaagtg
gatttagagagtttaccgcaaacagcaccagcggacacagtgactaatgtcagtcctgta
ttcatgtcgttggatgatcaattggccgttgctgcggagcagtatgacgattatgggagc
ggcttaatgaagctgttggcttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system