Mariniflexile rhizosphaerae: CJ739_1659
Help
Entry
CJ739_1659 CDS
T05592
Name
(GenBank) Outer membrane porin F precursor
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
marf
Mariniflexile rhizosphaerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
marf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
marf02000
]
CJ739_1659
Transporters [BR:
marf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CJ739_1659
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
DUF748
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXP80745
LinkDB
All DBs
Position
1891831..1893207
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MKNLSRLLFAMLLILGYSNANAQDKNNPWQITIGANAVDAYPSGDGGLFSETFGDELFNV
TDHWNILPSLSTISVSKYVGDGFSFGIGGSLNKIEKWGDISSNPDQTNEVDDWSYYGVDG
TIKYNFLEGTTLDPYVGVGGGYTWVDEIGAGTLNGTIGLNVWFSDNVGLTLQTAYKHAFE
DYLNTHFQHTAGISIKFGGTDTDGDGIFDKDDACPDVAGIAAFNGCPDTDGDGIEDSKDS
CPNEAGTAELNGCPDSDGDGIADKDDKCPTVAGLKALSGCPDGDGDGVTDADDKCPTVAG
PAANQGCPWPDTDGDGVLDKDDKCPSVKGTVANNGCPEVSEEVQKTLNAYAKTILFDTGK
SSIKSQSETVLADIIKILNEYPNSKFTVEGHTDSVGSDKLNQDLSDARALAVKDYLVKNG
IDEFRLSSKGYGESKPIDKNTTAAGRANNRRVEINLAK
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatcttagcagattattgttcgcaatgttgcttatacttggttatagcaacgct
aatgcgcaagacaaaaacaatccttggcaaattactattggggcaaatgctgtagacgct
taccctagtggagatggaggcctttttagtgaaacttttggtgacgaattattcaatgta
actgatcattggaatattttaccatcattatcaactatctctgtatctaaatatgtagga
gatggtttctctttcggtattggaggttctttgaataaaatagaaaaatggggtgatatt
agctcgaatccagatcaaacaaacgaagtagatgattggtcatactacggtgtagatggt
actattaagtataacttcttagaaggaacaactcttgatccttatgtaggtgttggtggt
ggttacacttgggttgacgaaattggtgctggaactttaaacggaactataggtttaaac
gtttggtttagtgataatgttggtttaacattacaaactgcttacaaacatgcttttgaa
gattatttaaacactcatttccaacatactgctggtatctctattaaatttggtggtact
gatactgatggtgatggtatttttgacaaagatgatgcttgtccagacgtagctggtatt
gctgcatttaacggatgtcctgatactgatggtgatggtattgaagatagcaaagattct
tgtcctaacgaagctggtactgctgaacttaacggatgtcctgattctgacggtgatggt
attgctgataaagatgacaaatgtcctactgttgctggtttaaaagctttatctggttgt
cctgatggtgacggtgacggtgtaactgacgctgatgataaatgtcctactgttgctggt
cctgctgcaaaccaaggatgtccttggccagatactgatggtgatggtgtattagataaa
gatgataaatgtccatctgtaaaaggtactgttgcaaacaatggttgtcctgaagtttca
gaagaagttcaaaaaactttaaatgcttacgctaaaacgattttatttgatacaggtaaa
tcttctatcaaatctcaatctgagactgtattagctgatatcattaaaatccttaacgaa
taccctaactctaaatttactgtagagggtcatactgatagtgttggtagcgataaatta
aatcaagatttatctgatgctagagcacttgcggttaaagattacttagtgaaaaacggt
attgatgaatttagactttcttctaaaggttatggtgagtctaaaccaattgacaaaaac
actacagctgcaggtagagctaacaacagacgtgttgaaattaacttagctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system