Mariniflexile sp. TRM1-10: CJ739_3987
Help
Entry
CJ739_3987 CDS
T05592
Name
(GenBank) Muramidase-2 precursor
Organism
marf
Mariniflexile sp. TRM1-10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
ANF_receptor
LysM1_NFP_LYK
Peripla_BP_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXP83045
UniProt:
A0A385BV46
LinkDB
All DBs
Position
complement(4768455..4770377)
Genome browser
AA seq
640 aa
AA seq
DB search
MIKFFSVLCFVFIFGINAVTAQNFSTHQVKKGETIHGIAARYGVTISDIYAFNPDAKKEL
KANTVLIIPISKAKMTPVATTKELQGFKVHRTSKKETLYSIAKRYDITEDEIKKHNTFLY
ANTLQKGDKLQIPVFKITKEAPKATTKPYLVKAKEGKWRIAYKFGITVQELEDLNPGMGE
TLQEGQQIYVPNMDGDVVKEVDEKYSYYNVLPKEGFYRLKLKLGLDQETLETLNPELKST
GLKEGMVLKIPYSNKMTDSSETATEKTHLESRITNFDTKHIAVMLPFRLNRVDFDSISDI
KGSIKKDPYLDASLDFYTGVLSALDSLKSLGISLKVDVYDTKYQVSEVLRIINENNFKDV
DAVIGPLTSETFDKAASELRAYNVPVVSPIGTNLTLYDNVFQSRPSDDLLKDRIVNFVKA
DSLVKNIVIVSDTKNESVANSIKSEFNYAKLIYSRKNKQGKDENFLYVEDIRSTLKPGRN
IVFLETQSEGFASNVTSILGSLTQRTEGNPNAIEIVLVTTNFNAAFEGDQVSNEHLSKLQ
FHFATASKSYSDTENNSFVKRYTQTYGITPSKRAVKGFDLTMDVVLRLATAEDLYLSANS
APLTEYVENKFAYKKKLLGGYYNDATYIVKYKDLEIVEVK
NT seq
1923 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaattcttttccgttttatgtttcgtattcatcttcggcataaatgctgtaaca
gcccaaaactttagtacgcatcaagttaaaaaaggagagactattcacggtattgcagca
cgttatggcgtgacgatttccgatatttatgcctttaatccggatgctaaaaaagaatta
aaagccaatacggtcttaataattcctatttctaaagcaaaaatgacgccagttgctact
acaaaagaattacaagggtttaaagtacatagaaccagtaagaaagaaaccttatatagt
atagcgaagcgctacgatattactgaagatgagataaaaaagcacaacacttttttatat
gccaatactttgcaaaagggcgataagcttcaaatacctgtttttaaaataactaaagaa
gcacctaaagccaccactaaaccatatttggtgaaagctaaagaagggaagtggcgcata
gcctataaatttggtattacagtacaagaacttgaagatctaaacccgggcatgggcgaa
acactacaggaaggacaacaaatttatgtgcctaatatggatggcgacgttgttaaagaa
gttgatgaaaaatacagttattacaatgtattgccaaaagaaggattttaccgtttaaaa
cttaaattagggttagaccaagaaacattggaaactttaaaccctgagttgaaaagcact
ggtttaaaggaaggcatggttttgaaaataccgtattcgaataaaatgaccgatagtagt
gaaacagccactgaaaaaacacatttagaaagcagaatcaccaatttcgataccaaacac
attgcggttatgttgccttttagattaaatcgtgtcgatttcgattctatttcagatata
aaaggcagtataaaaaaggatccttatttagatgcctctctcgatttttataccggtgtt
ttgtctgcattagattccttaaaatcattaggcatatcacttaaagtagatgtttacgat
accaaatatcaagtaagtgaagtgttaagaataattaatgaaaacaattttaaagatgtt
gatgcggttatcggaccgttaacatctgaaaccttcgataaagccgcatccgaattacgc
gcttataatgtacctgtagtgtcaccaataggcactaatttaacattatatgacaacgtg
tttcaatcacgaccatcagacgacttgttaaaagacagaattgtaaattttgtaaaagca
gattcgttggtaaaaaacattgttattgtttcagacacaaaaaatgaatcggtagccaac
agtattaaaagcgaatttaattatgcgaaattgatctactcccgaaaaaataaacaaggt
aaggatgaaaatttcctgtatgtagaagatataagaagcaccttgaaaccaggaagaaat
atcgtgtttttagaaacacagagcgaaggttttgcttcgaatgttaccagtattttggga
tctttaacgcaacgaacagaaggaaatcccaatgctatcgaaatcgtattggtaacaacc
aattttaatgccgcttttgaaggtgatcaagtatctaacgagcacttgtctaaacttcag
tttcattttgcaacagcttcaaaatcatatagcgatacagaaaacaattcgtttgttaaa
cgctatacacaaacctatggcataacaccaagtaagcgtgccgttaaaggtttcgatttg
accatggatgttgtgttgcgtttagcaactgctgaagatttgtatctatctgcaaatagc
gcccctcttacagagtatgttgaaaataaatttgcttataaaaagaaattgttgggaggt
tattataacgatgctacctatattgtaaagtacaaagatttggaaattgttgaagtaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
