Mycoplasmopsis arginini: MARG145_0354
Help
Entry
MARG145_0354 CDS
T04176
Symbol
valS
Name
(GenBank) fusion of oligopeptide transport protein OppF and Valyl-tRNA synthetase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
marg
Mycoplasmopsis arginini
Pathway
marg00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
marg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
MARG145_0354 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
marg01007
]
MARG145_0354 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
marg03016
]
MARG145_0354 (valS)
Enzymes [BR:
marg01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
MARG145_0354 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
marg01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
MARG145_0354 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
marg03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
MARG145_0354 (valS)
Prokaryotic type
MARG145_0354 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
Inhibitor_I69
Val_tRNA-synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ54396
LinkDB
All DBs
Position
complement(287191..292062)
Genome browser
AA seq
1623 aa
AA seq
DB search
MNKKITGLRVLELKKRIKIKEDNKLYFKYLIHNLNFKLSKSSILGIFSSDSETKKMIFDL
LVNNKIQENEYQGFIEFNQEDNKYFLVSGNDNYKRNLAYGFDDNNLFENKTKETLFSYLE
KYIKNNKSKGLFSNIFSKNWKDIYQDSEYHFKLEYARLNHNLQLNIEPLLDEIKIILDDN
SDCDLDKFDRNDQILFIQKLLIAIRKIVKIIQNSEQSFFDFVESTIKDYESGNSLMKYKE
YKEAKTKYNEIYNKKNIIKHRVAKNDLWYKIKNSLEILKLKNFKKEEVRKYFIKLKQDFL
NEKKFNHFYLKNNFNPESFVHYYSRYYISKIYYKFFRKYYSQIQLLNHKNFIDLVSEIYD
LRDNTILEINSLATVGTKYQLKKQIQYVANSILSNTTKMYFDRFRLFKQELEEQTQEIVL
KSQELEFTKVDDYINISQLKNYEYDLAQKQAEYHWNVDNLGKEIRNETKNLISKSNSTFF
SNIEKSKLIYKRINQILGKLFDIHKEEFSKDKQLELILLNPFFKSYFDLKELNYLVNNLF
LQFIDYKKIFEVTDYEDFLSKFFLKSNIYKILLNSDISLDKLAMNLSYLTIDEKISLEFN
KILINNPSLIIIGNNIDKLSEENQFKILNKINSYILANEAIGIYFLNNINVASKLTTDIN
IIMNSKTIEQGKTNIIVDNPINPVVKRLLNKEDEKSKTLYDDFLSKIDDFENIFKYEIEP
DHFVWCKWYQLTKWINSKNTQNKKFRDLFSFDENNKIKKNEFVDKRNYTDQTIIDFSLEE
SKQKGDAMEKNFDHKIVEEGRNQKWIDMQAFSTHDISKPPFTIILPPPNVTGKLHIGHAL
DTYIQDTVIRYKKIKGFDVMWVAGKDHAGIATQAVVEKKLAQSNINKYQLGREKFVEEIW
KWKDEYSNNITSQWAKLGLALDYTSERFTLDKQANEAVLKVFVDMYNNGLIYRDTKAIIW
DTKLKTALSNIEVIPNETKQKMYYIKYPIKDSKEQYLLVATTRVETMFSDVALALNPTDK
RYNELKDKLIVHPLTKREIPIISSESIDPSFGTGVMKVSAHAIEDIEIIKANKLEVIECI
DDEGKMNSFANQFEGMDRFEARIEVANFLKSKGFIERIEDVISNVGYSERSKEPIEILVK
PQWFVKMKSLSEKLLKNLESSEGVKIIPYRFKDNLVNWMENVHDWTISRQIWWGHRIPAW
YRDNEVLVQVEKPGDGWIQESDVLDTWFSSALAPFVFLGWPQSTEKVKRYFPTSLLVTGY
DIIFFWVSRMYFQSLEFMDEIPFKEVLLHGLVRDSQGRKMSKSLGNGIDPIKVIDQYGSD
VLKMSLIFNCTPGLDINFGDEKIQAARLFINKIWNIARLVKNVPINLEEKIDYTKLDEFD
NWILSEFNNMVDNIDSAMEKYEFTVVYKHIQDFIINKFSSWYLEFLKFKNNNYFIHYLFR
EILIALHPYMPFVTDYLFQELYKEELLEYEPTVYKNQENFDLSNANSLIELITVLRKYRE
DKQISKNQTLNYFAENIDLSEAIQLIIFKLANYTLNQNNDFSIATSFGKVYIKQRQEDKE
NEIIELKKLIEKTKKEISFNEQFINNPKFMANADASKIKEKQDKLEFHKNNLLHYEEELA
KKQ
NT seq
4872 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaaataactggattaagggttttagaacttaaaaaaagaatcaagattaaa
gaagacaataaactttattttaaatatttaattcacaacttaaattttaaattatctaaa
agtagtattttgggtatttttagtagtgattctgaaactaaaaaaatgatttttgatctt
ttggttaataataagattcaagaaaatgagtatcaagggtttattgaatttaatcaagaa
gataataaatattttctagttagtgggaatgacaattataaaagaaacttagcttatggt
tttgacgataataatttattcgaaaataaaacaaaggaaacacttttttcttatttagaa
aaatatattaaaaataataaatctaaaggtttatttagcaatatttttagtaaaaattga
aaagatatttatcaagattcagaataccattttaaattagaatatgctagattaaatcat
aatttacaattaaatattgaacctttattagatgaaattaaaataattttagatgataat
agtgattgtgatttagataaatttgatcgtaatgatcaaatactttttattcaaaaatta
ttgattgccattagaaaaattgtaaaaataattcagaatagcgaacaaagtttttttgat
tttgttgaatcaactataaaggattatgaatctggcaattcattaatgaaatacaaagaa
tataaggaagctaaaactaaatacaacgaaatttataataagaaaaatataattaagcat
cgtgtagcaaaaaacgatttatggtacaaaattaagaattctcttgaaattttaaagttg
aaaaattttaaaaaagaagaagttagaaaatactttattaaattgaagcaagatttttta
aatgagaaaaagtttaatcatttttatttaaaaaataattttaatcccgagtcttttgtt
cactattattcaagatattacattagcaaaatttattataaatttttcagaaaatattat
tcacaaattcaattattaaaccataaaaactttatagatttagttagtgaaatatacgat
cttcgcgataatactatattagaaattaattcattagcgacagttggaacaaaatatcaa
ttaaaaaaacaaattcaatatgttgctaattcgatactttcaaatacaacaaaaatgtat
tttgatcgttttcgattatttaaacaagaattagaagaacaaactcaagaaatagtttta
aaatctcaagaacttgaatttacaaaagttgatgattacataaacatttcacaattaaag
aattacgaatatgaccttgcgcaaaagcaagcagaatatcattgaaacgttgataattta
ggtaaagaaataagaaatgaaactaagaatttaattagtaaatcaaatagcacttttttt
tcaaatattgaaaaatcaaaattaatttataaaagaattaatcaaattttaggcaaactt
tttgatattcataaagaagaatttagtaaagataaacaactagaattaattttattaaat
cctttttttaaatcatattttgatcttaaggaattgaattatttagttaataatcttttt
ttacaatttatcgattacaaaaagatttttgaggtaacagattatgaagactttttatct
aaattctttttaaaatcaaatatttataaaatattattaaattcagatatttcattagat
aagctagcaatgaatctttcttatttaaccatagatgaaaaaatatcattagaatttaac
aaaattttaattaataatccaagtttaataattattggtaataatattgacaaacttagt
gaggaaaatcaatttaaaattttgaataagattaattcatatattttagctaatgaagct
attggaatatatttcttaaataatataaatgttgcttccaaattaacaacagacattaat
attattatgaactcgaaaacaattgaacaaggcaagacaaatataatcgttgataatcct
attaatcctgttgttaaaagacttttaaataaagaggacgaaaaaagtaaaactctttat
gatgattttttaagcaaaattgatgactttgaaaatatatttaaatatgaaattgaacct
gatcattttgtatgatgtaaatgatatcaactaacaaaatgaataaatagtaaaaatacg
caaaacaagaaatttagagacttattttctttcgatgaaaataacaaaatcaaaaaaaat
gagtttgttgataaaagaaactatactgatcaaacaataattgattttagtttagaagaa
agcaaacagaaaggagatgctatggagaaaaattttgatcataaaattgtagaagaaggc
agaaatcaaaaatgaatagatatgcaagcgttttctactcatgatattagtaaaccgcca
tttacaattattttaccgccacctaatgttactggtaaattacatattggccatgctttg
gatacatatattcaagatacagttataagatacaaaaaaattaaaggttttgatgttatg
tgagtagcgggaaaagatcatgccggaattgctactcaagctgtagttgaaaaaaaatta
gcacaatcaaatatcaataaatatcaactcggtcgtgaaaaatttgttgaagaaatttga
aaatgaaaagatgaatattcaaataatataacatcacagtgagctaaattaggtttagca
ctagattatacaagtgaacgtttcacattagacaaacaagcaaacgaagcagtcttaaaa
gtttttgttgatatgtataataacggattaatttatcgtgatacaaaagcaattatttga
gatactaaattaaaaactgctctatctaatattgaagttattccgaatgaaactaagcaa
aaaatgtattatattaagtatccaataaaagatagtaaagagcaatatttattagttgca
actacaagggttgaaacaatgttttctgatgttgctttagctttaaacccaacagataaa
cgttataatgaattgaaagataaattaattgttcacccgttaacaaaaagagaaatacca
ataatttcgtctgaaagtatcgacccttcatttggaactggtgttatgaaagtttcagcc
catgctattgaggatattgaaataatcaaagctaataaattagaagttattgaatgtatc
gatgatgaaggaaaaatgaattcctttgcaaatcagtttgaaggaatggatcgttttgaa
gcaagaatcgaagttgctaactttttaaaatctaaaggttttatcgaaagaatcgaagat
gttatttctaatgttggttatagcgaaagatctaaggaaccaattgaaatattagttaaa
cctcaatgatttgttaaaatgaaatcattatcggaaaaattactaaaaaaccttgaatct
tcagaaggagttaaaattattccttatcgtttcaaagacaacttagttaattgaatggaa
aatgtccacgattgaactattagtagacaaatttgatgaggacatagaattcccgcttga
tatcgtgataacgaagttttagtacaagttgaaaaacctggtgatggatgaattcaagaa
agcgatgttttagatacctgatttagttctgctctagcaccatttgtattcttaggctga
ccccaaagcactgagaaagtaaaaagatattttccgacaagtttactagtaactggttat
gatattattttcttctgagtttcaagaatgtatttccaaagtttagaatttatggatgaa
ataccttttaaagaagttttattacacggtttagttcgtgattctcaaggaagaaaaatg
tctaaatcattaggtaacggtattgatccaattaaggttatcgatcaatacggttctgat
gttttaaaaatgtctttaatttttaattgtacccccggtttagatatcaattttggtgat
gaaaaaattcaagctgcaagattattcattaataaaatttgaaacattgcgagattagtt
aaaaatgtccctattaatttagaagaaaaaatagattacactaaattagatgaatttgat
aattgaatattatctgaatttaataatatggttgataatatagactcagcaatggaaaaa
tatgaatttaccgttgtgtacaaacatattcaagattttattattaataaattttcatct
tggtatttggaatttctaaagtttaaaaataataattattttattcattatttatttaga
gagattttaattgctcttcatccatatatgccatttgtaactgattatttatttcaagaa
ttatataaagaagaattactagaatacgaaccaacagtttacaaaaaccaagaaaacttt
gatttatcaaatgcaaatagtttaattgaattaattactgttttaagaaaataccgtgaa
gataaacaaatttctaaaaatcaaacattaaattattttgctgaaaatattgatttatct
gaagctattcaattaattatttttaaattggctaattatactttaaatcaaaataacgac
ttttcaattgctacttcttttggcaaggtttatattaagcaaagacaagaagataaagaa
aatgaaattattgaattaaagaaattaattgaaaaaacaaagaaagaaatttcatttaat
gaacaatttattaataaccctaaatttatggctaatgctgatgcttcaaagatcaaagaa
aaacaagacaaactagagtttcataaaaataacttgctacattatgaagaagaactagca
aaaaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
