Mycoplasmopsis arginini: MARG145_0468
Help
Entry
MARG145_0468 CDS
T04176
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
marg
Mycoplasmopsis arginini
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
marg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
marg03016
]
MARG145_0468 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
marg03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
MARG145_0468 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
MARG145_0468 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Dynamin_N
Roc
GCV_T
Ras
GTP_EFTU
ABC_tran
RsgA_GTPase
DUF6517
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ54472
UniProt:
A0AA43QXD6
LinkDB
All DBs
Position
complement(389616..390959)
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MNNHYNDTIVAISSGNINQAISIIRISGPEAIEIIKKIYTGKIGKDKTITYGYIKDPNNS
KIVDEVLINFFIGNKNYVGEDTIEINAHGGIIVTNKILNLIIANGARLASRGEFSRRAFL
NGKISLEKAEAINSLIHAKTNIQAEIAIKQFDNKDNEIIEQLEQQLLTIISIIEINIDYS
DYNDIEQMDKTKLIKLVSNLKNNIDLVIKKSESASDVYNGIKVALVGQPNTGKSSILNLL
LNKEKAIVTDIAGTTRDIVEGEYEINGIPFKIIDTAGIRKTEDKVESIGIDRSINAIKEA
KIVVHLFNPNQIQTEEDNLIKELSNDKIYIPVLNKSDLIKDKKNINFVLTSAKEKNVWEL
KNSLIKNYLNLDYEDPELIYNTRRLGLLKQCNNELNTALESLNNGFGPEVVILDINKAWT
ILREILNKEHDNEALLDNIFNKFCLGK
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatcattataacgataccattgttgctatttcttcaggaaatattaatcaagct
atttctattattagaatttctggcccagaagctattgaaataattaaaaaaatatataca
ggaaaaatcggtaaagataaaacaataacatatggttatataaaagatcctaacaattct
aaaatagttgatgaagtattaataaatttctttattggtaataaaaattatgtaggtgaa
gatacaatagaaattaatgcacacggcggcattatagtaactaataaaattttaaattta
ataatcgcaaatggtgcaagattagcttccagaggcgaattttcgcgaagagctttttta
aatggaaaaattagtttagaaaaagctgaggcaataaattcattaattcacgcaaaaact
aatattcaagcagaaattgctattaaacaatttgataataaagataacgaaataatcgaa
caattagagcaacaattattaacaattatttcaattattgaaatcaatattgattattca
gattataacgatatcgaacaaatggataaaactaaattaattaaattagtttcgaattta
aagaataatattgatttggtaattaaaaaatctgaaagtgctagcgatgtttataatggg
attaaagttgcattagttggtcaacctaatacgggaaaatcatcaattttaaacttactc
ttaaataaagaaaaagcaatagttacagatatagcaggaacaacgagagatatagttgaa
ggtgagtatgaaattaatggaataccttttaaaataatagatacagcaggaattagaaaa
acagaagataaagttgaatcaatcggtattgatcgttctattaatgctatcaaagaagca
aaaatagttgttcatttatttaaccctaatcaaattcaaactgaagaagataatttaata
aaagaattatctaatgataaaatatatatcccagttttaaataaatctgacttaataaaa
gataaaaaaaatataaactttgttttaacatccgcaaaagaaaaaaatgtttgagagtta
aagaatagtttgattaagaattatttaaatttagattatgaagaccctgagttaatttat
aataccagacgtttaggtcttttgaaacaatgtaataatgaattaaatactgctttagaa
agtttgaataatggttttggaccagaagttgtaatattagatataaataaggcttgaacc
attttaagagaaattttaaataaagaacatgataatgaagctttattagataatatattt
aataaattttgtttaggaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
