Marinobacterium sp. LSUCC0821: HH196_05320
Help
Entry
HH196_05320 CDS
T08388
Name
(GenBank) DUF4347 domain-containing protein
Organism
marl
Marinobacterium sp. LSUCC0821
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
DUF4347
DUF7029
FlaG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJD71152
UniProt:
A0A858QXY8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1104559..1113597)
Genome browser
AA seq
3012 aa
AA seq
DB search
MSENTKQNLKRNRSFALEARTLFDGSAIFDMALNLDNVDGPDVVASESVSSHVIQSAEAA
VSAVESNLLSANRDDIFASFSGGQTVITAEWNSALDQLQSDMADGKVSVALGFLGDSSME
GNTGLFSAEGPDGNPVIYLNQDWIDGGASNSDIEAVISEKLGEFVDSRLTPTAREVYFID
ASLADVQTLINAVPTDAEIFMVEAGVDGFAFMAETLANESGISAIHVLGHGSVGEAQLGS
VTLSDSNLDSYSAQLAAIGQSLTAEGDILLYGCNVAASGDGEAFIQEIATLTQADVAASD
DVTGAGGDWELEVASGSVESVGFSLVSYKDNLAISNAGFETDLSSWSSNDAAVITGSQTI
NAGSNTWVVTGSDSKMIKLEPSGSWSELSNDFQSLSGVSNDTMTYINDTFYSSSYMTPTN
MAYVTQTFSATAGETYTVAWNYISTDYEPYNDGSILTLVDKSDPSKLAILDGVKAEITLL
GATNPGTGNYTTGSYGSTGWQESTIQITESGTYTISLAVFNLGDTILSPHLYIDNIAGTT
TKNGTPFDPVPEDPNAPEPAGDPVENLQVDVTEDTTLTIDVDGSDAIFKLGNDPAGEIKF
ATLPDSSIGIFKYNGAAVSADTAYDLTGSNVLTFEPASNANGSGSFSWTGRVSVGSGYWS
STGLGTITVSEVNDAPTISAITYTGALVEVEGTGNGAEEASSGSASGTITVTDPDSGDSV
TLSETYNNDMVWVSGGATQTLQLSQSNVDAIVNGFVLGANSSSSTWTYSTNEDLNFLGAG
DTLTFSYNVKATDGSGVNSSVQTVTITITGAAEPVPITISDITVKETDTYAQFEVNGTAS
KTLAMDLSGGTATGGGTDYGTGFEYSLDGGSNWVTYTTPFSVGSGVSAVLVRVPIVNDSV
DDDGETFDLNVYEVATSMASTSVYDAEYKTIDISGLTLVSGTANSEGAVYRAANAVTINS
QSIDVLVSITGMSNVSSFTLDNDGSNSSRFQPEINSTSSSGSAVDFTFSFVKDYTGPSSY
TAVALENFYVSGVDVDGSSNYQEYAEISGFSSYQVDKTSKLDITEDYRDGFTRFSGITSN
LSGITFEDTASYQTTFDVARTSVDVRLGVTGQTSGKRLFSLTMGAPVGTFTNTGSSTSTE
AVTATATILQPDGLSISDATVNEGAGKIAFTVIRDSGSGTASVNYSVVGNTATVGTSGKD
ITPDDDLSGTVIFADGDTTKTITLNVTNDNVFEGSENFYVNLSNAVNLTLDDTQAVGTIL
DNGSGSGGVDDDRPSFSVNDVSVNESAGTLTFTVSKTEHYDTLLGSTVYYTLESSSATAG
EDFVHKSGTLDFSASDLTKTVTVTLSNDSIYEGSEQFFIKLSNPTNAIISDEKGVATIWD
DGTSDGTTSASDDDRPSFSIGDVTVNEEAGYAIFTVTKSGNTAVSASVQYATTNNGTADS
GDYVSKADTLNFAKNETTKIISVAINDDAIYEGSETFGVVLSNASGATISDANGVGTIKD
DGTGSANSGGNGSGSDDDRPTFTIGDATEDEGGTLVFDATLSNATKSNVEVAFTLSDVNT
EGVDDYGSMTVEYYNSKSSTWIELTASSGKYTLPAGYTQMRVSVTAENDSIFEGVETFTL
SAAVTDSAITDTDTGTGTIYDDGSNVGDDSDTDTTADDDRPSFSVDDVDVNEDAGTITFT
VTKTGTTSVASSVNYQISSNSAAVGSSAATGTDVYGTLSGTLSFAAGVSTQTVVLNVTDD
SVYEGEETFYIDLSSASQATISDAQGVGAVWDNGTSDGSTSATDDDRPSFSVDDVTVNEG
AGTITFAVVKTGATTQVTTLDWIANSGTGVDAATVGSGGDITGTANGSLSFAAGETTKYI
TLTVANDTVFEDTETFTLDLSNVSSSATISDAQAIGTIEDDGTGNGGSDDDRARFTISDE
IETEGNTFTFTVSRSGDTSVEQTIQYATSIESGDTAETEDFTAASGTLTFAAGSNSETFT
VSTVSDSTVDEGNESLTVTLSNNSGGTSLIDDAVGEGIISDGTARRTLAISDAAEDEGGT
LSFDVTLDGDIASDVEVGFSLVDITTEGSADINNMVVSYNNGSEWIVLTPTAGKYTLPAG
GDEMRVTVDAVENSTYEGTETFRLVADFPNEFVIDTDYGTGTIYDDGTDDGDDNDGTADN
DKPSFSINDVTVNEASGTATFTVTKSGNTELASSVEYSTSDGTAESASNSDYTAIASTQL
NFAAGETEKTVTVTITNDSPAVYEGSETFNVVLANASGAVISDATGVGTIKDDGTGNASN
GGSGAGSDDDRPTLTIGNATEDEGGTLTFDATLSNATQADVEVEFTLTDVTTEGSADYGS
MTVKYNNGGTLTTLTATDGKYILPAGNTQLQVSVTAVDDSTFEGVETFTLSADVTDSAIT
ATDTGTGSIYDDGTNDGDDNDGSAADDRPSFSVNDVDVNEGAGTITFTVTKTGATAVTST
VNYAISSNSAIVGSTAASGTDASGTLNGTLQFAANVATQTVTLNIANDNIYEGNEQFYID
LSSATQATISDSQGIGEIWDNGTSNGTTSASDDDRPSFSINDVTVNETDGTATFTITKTG
NTEETSTVSYSTADVSAVDPADYTTISTTQLTFAANETEKFVTVSIIDDETGEVAGVWEG
TETFNVNLSNVSSNAVIGDGTGVGTILDPEDRTVQVSGIGPINENSTYAVFEIDAVGGNY
QDLTFEVFNKTATLVNIEGSQDASVSFIAPGDGTKFYVGVTIANEDDNNYEGLENFGLKA
YYTDDPNIQDTGYNLIVDDGTGVRYDYANVPNLADSLNLYELDNDLTGVDSGGKPLPKEG
GEDFKEVVVQKTVIDYSDAFKEVKESLDAYGLADAIATEAQSQIDKLSGKIALYVLPAVA
EARSDTVSLFRRLASDDGNAYMGSSVVRSSLAMDSLAPISELSAPVFDDGEELQQGFFGE
ELTEASFFDSLDDETEEFFVANVTEVDSEHQEFTAQLLAAAKTNNGAGISRSSAHVLNSV
EPVNSNLKDSNS
NT seq
9039 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagagaacactaagcaaaacctaaagcgcaatcgttcgttcgctttggaagctcgt
acactttttgatggttccgctatatttgatatggcgctgaatctggataatgttgatggg
cctgatgtagttgctagtgagtctgtttcaagtcacgtaattcaatcggcagaagcagca
gtcagtgctgtagagtcaaatttactgagtgccaatcgtgacgatatttttgcttcattt
agcggtgggcaaactgttattacagcagagtggaatagtgctttagatcagcttcaatct
gacatggctgatgggaaagtctccgttgcacttggtttcctaggtgactcctctatggag
ggtaacacaggtcttttctctgctgaggggccagatggcaaccctgttatctatttgaac
caagattggatagatggtggtgcttcaaattctgacatagaagcagtgatttctgaaaaa
ctaggtgaatttgtagattctcgcctaacacctactgctcgagaagtttacttcatagat
gcttcgctggcagatgttcaaaccttgattaatgctgtaccaactgatgctgaaatcttt
atggtcgaagcgggtgtggatggttttgcattcatggccgaaaccttggctaacgaaagt
ggtatctctgctattcatgttttgggtcacggttctgtgggtgaagcgcaacttggatcg
gtaacactgtctgattccaatctagattcatactcagctcaactagctgctatcgggcaa
tcactgacagctgagggggatattcttctatacggttgtaacgtggctgcttcaggtgat
ggcgaagcctttatccaagagatcgcaactttgactcaagctgatgtggctgcttcggat
gatgttacaggtgctggtggagactgggagctagaggtcgcttctggttctgtagagagt
gttggattttcacttgttagttataaagacaatcttgctataagtaatgctggtttcgaa
actgatctgtctagttggtcatcaaatgatgcagcggtcataacagggtcgcaaactata
aacgcagggtctaatacttgggtcgtaactggttctgactcgaaaatgattaagctggaa
ccatctggtagttggtcagagttaagtaacgattttcagtcgctatcaggtgtgtctaat
gacaccatgacctacataaatgataccttttactccagttcttacatgacgccaactaac
atggcttatgtaactcagacattcagtgcaacagctggggagacttatacggttgcttgg
aactacatctctacagattacgagccctacaatgacggttctattcttacgcttgttgac
aaaagtgatcctagtaaacttgctattctagatggtgtaaaagctgaaataacccttcta
ggggcaacgaatccaggaacgggtaattatactactggttcttacggtagtactggctgg
caagaatcaacaattcagataactgaaagtgggacctacactatttcactagctgtattt
aatctgggcgatacaattttaagtccacacctttatatagataatatagcgggtaccacc
actaaaaacggcactccgttcgatccagttccggaagatcctaatgccccagaacctgca
ggtgatccggtagaaaatcttcaagttgacgttactgaagatactactctcacaattgat
gttgatggttctgatgcgatttttaagctaggcaatgaccctgcaggcgaaattaagttt
gccacattgccagactcgtcgatcggaatttttaaatacaatggtgctgcggtatcagct
gatacggcttatgatttaacaggcagtaatgttttaaccttcgagccagcatcaaatgcg
aacggttcaggaagcttttcttggactgggagggtttctgttggttcaggttattggagc
agtacaggcttagggactataaccgtctctgaagttaatgatgcaccaacaatcagtgcg
attacttatacaggtgccttagttgaagttgagggcacaggaaatggtgctgaagaagct
agctctggaagtgcaagcggtactattacagttacagatccagatagtggtgactcagta
actctttcggaaacatacaataatgatatggtttgggtgtcaggtggtgctacccaaaca
ttgcagctaagtcaatctaatgtcgatgctattgttaatggttttgtcttaggtgcaaac
tcttcgagtagtacctggacatacagcactaatgaagatttaaacttcctcggagcgggt
gataccctgacattcagctacaatgttaaagctactgatggcagtggtgttaattcatca
gttcagactgtaacgatcacaatcactggtgccgctgaacctgtacccattactattagt
gatattactgtcaaagaaacagatacgtacgcacagtttgaagtcaacggcactgctagt
aaaacgcttgcaatggatctttctggtggtactgctacaggtggtggtacagattacggt
actggatttgaatatagcctagatggtgggtcaaattgggttacgtacactacacccttc
tcagtaggtagtggtgtttcagctgttttagtcagggttcctatcgttaatgatagtgta
gatgatgatggtgaaacctttgatttaaatgtatatgaagttgctacatcaatggctagc
acaagcgtttatgacgctgaatataaaactattgatataagtggattaactttagtatca
ggtacagctaatagtgagggtgcagtgtatcgagctgcaaatgctgtcaccattaactct
caatcgatcgatgtacttgtttctattactggtatgtcgaatgtttcaagttttactctt
gataatgatggtagtaactcttcacgattccagcctgaaattaactctaccagtagtagt
ggaagtgcagttgattttacgttctcctttgttaaagactatacagggcctagttcctac
actgctgttgccctagagaacttctatgtgagtggggtggacgtagatggtagtagcaat
tatcaagagtatgctgaaataagcggcttctcctcttaccaagtagataaaactagtaag
ctagatattactgaagattaccgagatggctttacacgctttagtggtattacttcgaac
ttgagcggtattacatttgaagatactgcttcctaccagacaactttcgatgttgcacgt
acaagtgttgatgttcgtttaggtgttactgggcagactagtggtaaacgactcttctct
ctaactatgggggcgccagttggtacatttaccaatacaggctcttctacatcaactgaa
gcagtaactgctacagcaacaatacttcagccagatggtttgtctatctctgatgcaaca
gtgaatgaaggcgcaggtaaaattgcgtttactgtgattcgtgattctggttctggaact
gcctctgttaattactcggttgtaggtaataccgcgacggttggtaccagtggtaaggat
attactccagacgatgatctaagtggaactgtaatttttgctgatggggatacaacaaaa
actattacattaaacgttactaatgataatgtttttgagggttctgaaaatttctatgta
aatttaagtaacgcagtcaacctaacactcgatgatactcaggctgtaggaacaattctc
gacaatggctctggatcgggcggagttgatgatgaccgtccatcattctctgtgaatgat
gtgtcagttaacgaatcggcaggaacgttaacttttactgttagtaaaactgaacactac
gatacccttttgggatcaacggtttattacacccttgaaagttcatcagccactgcaggt
gaggactttgttcataaatctgggacgctagatttctccgcatcagatctcactaaaaca
gtgaccgttacgctctcgaatgattcaatctatgaaggttcagagcagttctttattaag
ttaagtaatcctaccaacgcgattatttccgacgagaagggcgttgcaaccatttgggat
gatgggacttctgatggcactacatcagcgagtgatgatgaccgtccatcgttcagtatt
ggtgacgtgactgtcaatgaggaagctggatacgcaatctttactgtaactaagtcaggt
aacacagctgtatcagcttcggttcagtatgcaactacgaataatggtacagctgatagt
ggagactatgtatccaaagctgacactttaaattttgctaagaacgagaccactaaaatt
attagtgtagctattaatgatgatgcaatttatgagggctctgaaacctttggtgttgta
ttatcaaatgcttccggcgcaacaatcagcgatgcgaatggtgtaggtactattaaagat
gatggtacaggtagtgccaatagcggaggcaatggtagtgggtctgatgatgaccgacca
actttcaccattggggatgctactgaggatgaaggcggtacattagtttttgatgccact
ctttcaaatgcaactaaatcaaatgttgaagttgcgtttactctttctgatgtcaataca
gagggtgttgacgattatggcagcatgacagttgagtattacaactccaaaagttcgaca
tggattgaacttacagcgtcttctggcaaatatacgttgccagctggttacacacaaatg
cgtgtcagcgtaactgcagaaaacgactcaatatttgaaggtgtagaaaccttcactttg
tctgcagctgtaaccgattcagcaattactgacacagataccggtaccggtactatttat
gacgatggtagtaacgttggtgatgattctgataccgatacaaccgcggatgacgaccgc
cctagctttagcgtagatgatgtcgacgttaatgaagatgccggaacaatcacatttaca
gtgactaaaactggtactacgtcggttgcttcttccgttaactatcagatcagcagtaac
agtgctgcggtaggtagttctgcggctaccggaacagatgtttatggtacattgagtggc
acgttgtcgtttgccgccggtgtctctactcaaactgttgtacttaatgtcactgatgac
agcgtttacgagggtgaagagacattctatattgatctttcgtctgcatcacaagcgaca
atatcagacgcccagggtgttggtgctgtttgggataatggtacttcagatggttctact
tcagcgaccgatgacgatcgaccaagtttcagtgttgatgatgtaacagtgaacgaaggt
gcaggaactattacttttgctgttgtgaaaacaggtgctacaacccaagttactacactt
gactggatagctaatagcggtacgggtgttgatgctgcaactgttggatcaggtggtgat
ataactggcactgcgaatggctcactatcttttgccgcaggtgagacaactaaatacatt
accctcaccgtagctaatgatacggtatttgaagatactgaaacttttacgctagatctc
tctaatgtgagcagttcagctactatcagcgatgctcaagctatcggtaccattgaagat
gatggtaccggtaatggtggttcagacgacgatagagcccgtttcactatttcggatgag
attgaaactgaaggtaatacttttacttttactgtttcacgttcaggtgacacatccgtt
gagcaaactattcaatacgctacttctatagaatctggtgatacagctgaaacagaggat
ttcactgccgctagtggtactttaacatttgctgctggtagcaactccgaaacatttact
gtttcaacagtaagtgactctactgttgatgaaggtaatgagtctctaacagtcacacta
tctaataactctggtggaaccagtcttattgatgatgctgttggggaaggtatcatttca
gatggaacggctaggcgcacacttgctatctctgatgcagcagaagatgagggcggcaca
ctctcattcgatgtgacactagacggtgacatcgcatcggatgttgaagttgggttttca
ttagttgatatcactactgaaggctcagcagatatcaacaacatggttgttagctacaac
aatggttctgaatggattgttcttacaccaactgccggtaaatatacattaccagcagga
ggcgacgagatgcgagtaactgttgatgctgttgaaaactctacttacgaaggaactgaa
acgttcaggctcgtggcagacttccctaatgaatttgttatcgataccgattacggtacc
ggcaccatttatgatgatggtactgacgacggcgacgataatgacggtactgcagataat
gacaagccaagctttagtattaacgatgtaacggttaacgaagcttcaggtacagcaacc
tttaccgtaactaaatcaggtaataccgagctagcctcatctgttgaatacagtacttcg
gatggtacagctgaatcagccagtaactctgattacactgcaatagcaagtactcagctg
aattttgctgcgggtgaaaccgagaaaacggttacagtgacaatcactaatgattcgcct
gctgtttacgaaggtagtgaaacatttaacgtagtacttgcgaacgcctcaggtgctgtt
atcagtgatgctacgggtgtgggtactattaaagatgatggtactggtaacgcatccaat
ggtggatcgggtgctggtagtgatgatgatcgcccaacgttgaccattggtaatgcgact
gaagatgaaggtggtacgctcacatttgatgcaaccttgtctaatgcgactcaagctgat
gttgaagtagaattcactttaacggatgtgacaactgagggcagtgctgactatggcagc
atgactgttaagtacaataacggtggcaccttgaccacattgacagctacagatggtaaa
tacatccttccagctggaaatactcaacttcaagtgagtgttaccgcagtagatgactct
acatttgaaggtgttgaaacatttaccctttcagctgacgttacggactccgcaatcacc
gctactgataccggcactggctctatctacgatgacggtactaatgatggtgatgataat
gatggatctgctgccgatgaccgtccaagctttagcgtcaatgatgttgatgttaatgaa
ggcgcgggcactatcacctttacggttactaagacaggtgctaccgccgttacatcaaca
gtcaattacgccattagcagtaattcagcgatagtcggtagcacagcggcatctggtaca
gatgcgtctggaaccttaaatggaacactgcagtttgcggcaaatgttgcaactcaaact
gttacgttaaatatcgcaaacgacaatatctatgaaggtaacgagcagttctacattgat
ctatcatctgctacacaggcgactatttcagatagccagggtattggtgagatttgggac
aatggtacttctaacggtactacgtcagccagtgatgacgatcgtccaagcttcagcatc
aatgacgttactgttaatgaaacagatggtacagctacattcaccattactaaaacaggt
aatactgaagagacttcaacagtttcatacagcaccgctgatgtctctgctgttgaccct
gctgactacactacaatctctacgactcaattaacatttgcagccaatgaaactgaaaag
ttcgttaccgttagcatcattgatgatgaaacgggtgaggttgcaggtgtttgggaagga
acagagacctttaacgttaacctaagcaacgtaagttccaatgctgtcataggcgatgga
acaggtgtaggtactattcttgatcccgaagaccgtaccgttcaggtatcgggtattggt
cctatcaatgaaaactcaacctacgcagtttttgaaattgatgctgttggtggtaactac
caagacctgacgttcgaagtcttcaataaaaccgctactttagtgaacattgaaggttct
caagatgcttcagtctccttcattgctcctggagatggtactaagttttatgtaggtgta
accattgctaatgaagatgataataactatgaaggtttagaaaactttggccttaaagct
tattacacagacgatccaaatatccaagacacgggttacaacctaatcgttgatgatggt
acgggtgtgcgttacgactacgctaacgttccaaatcttgctgactctttgaatctttac
gaacttgataacgacttaactggcgttgattctggtggcaagccacttcctaaagagggc
ggtgaagattttaaagaggtagtcgttcagaaaacagtaatcgactacagcgatgctttt
aaagaagtgaaagagagcctggatgcctatggacttgctgatgcaattgcgacagaagct
caatcgcagatcgataagctctctggcaaaatagcactctatgtactgccagctgtggcg
gaggcgcgttctgatacagtaagtctgttccgtcgtctagcctctgatgacggcaatgct
tacatgggctcatcagttgttcgatcaagtcttgcaatggactctttggctccaatatca
gagctttctgcccctgtatttgatgacggtgaagagctacagcaaggcttctttggtgag
gagcttactgaagcaagcttttttgattcacttgatgatgagactgaagagtttttcgtt
gcaaacgtcacagaggtggatagtgagcatcaagaatttacagcacagcttttagctgca
gctaaaactaataacggggcgggtatatctcgtagttcagctcatgtgctgaattcggtt
gaaccagttaactctaacctcaaagattctaatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system