Marinitoga sp. 1137: LN42_04275
Help
Entry
LN42_04275 CDS
T04633
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
marn
Marinitoga sp. 1137
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Ig_Rha78A_N
Pur_ac_phosph_N
FN3_DSCAM-DSCAML_C
CRLF2-like_D2
Fn3_VIN3
Ig_J
Big_10
Cadherin_CELSR2_9th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APT75689
LinkDB
All DBs
Position
complement(839974..845133)
Genome browser
AA seq
1719 aa
AA seq
DB search
MGKIFKKKILYIFLIVVILFLLNGCFFVKPPKAILDYPSQRDNLPTSFLLSWHLEGNASS
DEFTFEVYYGKSKDNFTGTISTQNTSINIEGLEDNSTYYFKIRTVKKGQFTDSDIYELKT
SDIPKIEFLMEDNVIETTEYEVKWKVSDNNGIKKIMLYFSEDPDFPEDKTQINEFNASVN
SFLLKNLDYGKTYYLKLVAYDTNDIWSYKTYEFSVKSYVFQIISPAPGSKSVNINNIKLQ
WKYSKPSKFEVVYSPNNSIDNNDVVRVSTSNSYYIIDNLPPGLEFSWYVIDTVKNVESPI
ATFTTSYKPEIEITYPENNEVGVPEGFSITWKATDVDNDSLSFNIKIKKINESDILKYVD
FDNGCIYETTTNQKSLDTSNIPLEKGMWYGILLKANDGKGNEVEERIKFRMNVDPQEPYD
LKPESGTIDYPTKNATLSWKTYDPDGNLTFIVHPFEKSASSKDYDENKGVYYYVLNILEY
NKEYSWWVEAVDNTGASTISSVATFMTNAKPVFKDATPVNNENNISLLPELEWEFEDSNL
SYYQVYLAKSSEDFTLIATVTDTKYKIEDLLDSDSKYKWKVIAYDTCGDFTDSGELYFET
TKKPDISQMSPADGAHNISLKPILSWSAEDPDNNDEDMSYKVVVKDSEENVVLTEETTDT
NISVNLLLQPDSEYKWYIEVEDSKFATNVSDEFSFTTSQEPTVSNLDPSGVEGVAASENL
SWNASDPDGDSLLYYVYLNDTLEGTTTEKEYSLEEVKDLEPDTEYSWYVVAEDSKFATAV
SDVATFITAQAPENSPDIIDIYDYYEPDKKYTFNESKYPSKLKLIWNPSSDPYNGSIKYR
IVGEYLDEKEILADNLTSNSAIVEFKDGKTYTVYVEAINDKGMVLKGKSINLKINANPKV
MDYSPRSDDNNVKLNPTIMWIAEDNDSSYVDVYIYYGKDENNLNNSVKIERQSMNGEYTI
TEDLDPGEKYYWKLKLEDEMYGVTETDIRSFTTTHAPVFKSITGITDGSTNEAVNDVEIS
WDFEDPDGDLLEYQIEVYKNGEGTPYYTKDLGTLNYIKLDFEVNTEYKFVITAEDNKSAK
TTKEISFKTTRSPVIYNDSLYPDSTVNHFTNGSKFTWTAFDPDDDDLTYKIYLGESSNSL
KYFGETENNELVVNNLDSNKTYYWKVKAIDSKGAEVESNVVSFKTNALPQFDKTAFSPQN
NEVGINKNVTLKWKCSDSDAVSGELTYEIWFGDAIDSLLKLADQSLAYYNHSNLENGKTY
YWKIIAKDKYGGETSSEILKFTVNRPPVTPEIENIDEDLLEFNLKWSSRDPENQSITYDV
LKKEEGASDYSTVAYNISDTEYFMERLTPAKTYSFKVRAIDDKGDISESTYEYNTPTVDT
NIYTKESGDSDKVEEILDMIELSDGNFVYLEKIDSSYELKKVDSNGNSIDTYNVNLSEPC
KLFENTSNHIVVVGKDSNDKISFEEVASDLSGTTNPPATNPYSTTVDISEVQSIYINSDN
KIDIVGTYNSDSILVEFNEDYSISIAATTISDTTLYDVIKITDEDGNERYIVAGSKSSKG
YIAKLDNAFSEIIFEKEFDDMDKIVSIVDTDPDFWIFGYKDTNIVLKQISYRGNELYSPI
IENSYGSENGNLLKSNNGFVILLNTTDGDIEVLKTDDSMNIEKQVIFGRTGEDVANGIIE
SSDDGYIIFGKTKSFDDKTNGNSYIIKTDSNLLGWSTPE
NT seq
5160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaaaatatttaagaaaaaaattctttatatatttttaatagtagtaattttattt
ttgctaaatggctgtttttttgttaaaccgcctaaagccattctggattatccttcacaa
cgggataatttgccgacgagttttttgttgtcgtggcatcttgaaggtaatgcgtcatca
gatgaatttacatttgaagtttattatggtaaatcaaaagataattttacagggactatt
tcaacacagaatacatctataaatattgaaggtcttgaggataattcaacctattatttt
aagattagaacggtaaagaaaggtcaatttacagattctgatatatatgagcttaaaact
tctgatattccaaaaattgaatttttaatggaagataatgttattgaaacaacggagtat
gaagtgaaatggaaggttagtgataataacggtataaaaaaaattatgttgtatttttca
gaggatccagattttccagaagataaaacacagattaatgaatttaatgcatctgttaat
agttttttattaaaaaatctcgattatgggaaaacatattatttaaagcttgttgcctat
gataccaatgatatttggtcatataaaacatatgaattttctgtaaagtcatatgttttt
caaattatttccccagctccaggaagtaaaagcgttaatattaacaatataaagttacag
tggaaatattcaaagccttcaaagtttgaagttgtttattctccaaataattctattgat
aataatgatgttgtaagagtttcaacatcaaattcgtactatataatagataatcttccg
ccggggttagaattttcatggtatgttattgatacagtgaaaaatgttgagagtccaata
gcaacatttacaacatcgtataaacctgaaatagaaattacatatccagaaaataatgaa
gtaggtgttccagaaggattttcaataacctggaaggctacagatgtggataatgattct
ctttcgtttaatataaaaataaagaagataaatgaaagcgatattttaaaatatgttgat
tttgataatggatgtatatatgagacaacaacaaatcaaaaatcattggatacatctaac
attcctctggaaaaaggaatgtggtatggtattttgttaaaagcaaatgatggtaaagga
aatgaggttgaagagagaataaaatttagaatgaatgttgatccgcaggaaccgtatgat
ttaaaaccagaatctggaacaatagattatccaactaaaaatgcaacgttatcctggaaa
acatatgatccagacggtaatttaacctttattgttcatccgtttgagaaatcagcatct
tcaaaggattatgatgaaaataaaggtgtgtattattatgttttgaatattcttgaatat
aataaggaatattcatggtgggttgaagcagttgataatacaggagcatctactataagt
tctgtagcaacatttatgacaaatgcaaaacctgtttttaaggatgcaactcctgtaaat
aatgaaaataatatttctttattacctgagcttgaatgggaatttgaagattccaatctt
tcatattaccaggtatatctggctaaaagttcggaagattttacattaatagctactgtt
acagatacaaaatataaaatagaagatttattggattctgattctaaatataaatggaaa
gtaatagcctatgacacatgtggtgattttactgattcaggggaattgtattttgaaaca
actaaaaagcctgatatttcccaaatgtctcctgccgatggagctcataacatttcttta
aaaccaatattgtcatggtctgcagaagatcctgataataatgatgaagatatgagttat
aaggttgttgtaaaggattcagaggaaaatgttgtattaaccgaagaaactacagataca
aatatatctgtaaacttgttattgcaacctgatagtgaatataaatggtatattgaggtg
gaggatagcaaatttgcaacaaatgtttctgatgagttttcatttaccacatctcaagaa
ccaacagtatcaaatcttgatccatctggagttgaaggtgtagccgcatcagaaaattta
agctggaatgcttctgatcctgatggtgattctttgttatattatgtgtatcttaatgac
actctggaaggtaccacaactgaaaaagagtatagtcttgaagaggttaaggatcttgaa
ccagatacagaatattcctggtatgttgtggctgaggatagtaaatttgctacagcagtt
tctgatgtagcaacatttataacagctcaggctccagaaaactctcctgatattatagat
atttatgattattatgaaccagataaaaaatatacatttaatgaaagtaaatatccatca
aaattaaagttgatatggaatccaagtagcgatccatataatggttctattaaatacaga
atagtgggtgaatatttagatgaaaaagaaatattagcagataatttaacatcaaatagc
gcaattgttgagtttaaagatggaaaaacatatacagtttatgtggaagcaattaatgat
aaaggaatggtattaaaaggtaagagtattaatttaaaaataaatgctaatcctaaagtt
atggattattctccgcgatcggatgataataatgttaagttgaatccaacaataatgtgg
atagctgaagataatgattcttcgtatgttgatgtttatatttattatggaaaagatgaa
aataatctcaataattctgtgaagatagagagacaatcaatgaatggagaatatacaata
acagaagatttagatccaggtgaaaaatattactggaaattaaaacttgaagatgaaatg
tatggtgtaacagaaactgatattagaagttttaccaccacacatgctcctgtatttaag
agtataacaggaattacagatggttcaacaaatgaggctgttaatgatgttgaaataagc
tgggattttgaggatccagacggggatttgcttgaatatcaaattgaggtatataagaat
ggcgaaggaacgccttattatacaaaagatcttggaacgttaaattatataaaactggat
tttgaagtgaataccgaatataaatttgtaattacagcagaggacaataaatcagcaaaa
accactaaggagatttcatttaaaactacaagaagtcctgttatttataatgattcatta
tatcctgatagcacagttaatcattttacaaatggtagcaaatttacatggactgctttt
gatccagatgatgatgatttaacatataaaatttatctcggcgaaagttcaaattcttta
aagtattttggcgaaacggaaaataatgagttagttgttaataatcttgattccaataaa
acatattattggaaagttaaggcaatagattcaaaaggagcagaggttgaatctaatgtt
gtttcatttaaaactaatgcattgcctcaatttgataaaacagcatttagtcctcagaat
aatgaggttggaattaataaaaatgtaacattaaaatggaaatgtagtgatagtgatgct
gtttctggagaattgacatatgaaatatggtttggtgatgcaatagattctctattaaag
ttagcagatcaaagtttagcatattataatcattctaatcttgaaaacggaaagacatat
tactggaagataattgcaaaggataaatatggtggagaaacatcatcagaaattttgaaa
tttacggtaaatcgtcctccagtaacaccggaaatcgaaaatatagatgaagatttactg
gaatttaatttaaaatggtcttcaagagatcctgaaaatcaaagtataacatatgatgta
ttgaaaaaggaagagggagcaagtgattatagcacagttgcatataatattagcgatact
gaatattttatggaaagattaactccagctaagacttatagtttcaaagttagagctata
gatgataaaggagatataagtgaaagtacatatgagtataatacaccaactgttgataca
aatatatacacaaaagaatctggtgattcagataaagtagaagaaatacttgatatgatt
gaattaagcgatggaaatttcgtttatttagagaaaatagattcctcgtatgaattaaag
aaagtagattctaatggtaatagtatagatacttataatgtgaatttatcagagccgtgt
aagttatttgaaaatacttcaaatcatatagttgttgttggtaaagatagtaatgataaa
ataagttttgaagaggttgcatcagatctttcaggaactacaaatccgccagcaactaat
ccatattccacaactgtggatatttcagaagttcagagtatttatattaattctgataat
aaaatagatatcgtaggaacatataattctgactctatattggtggaattcaacgaagat
tattcaatatctattgctgctacaacaattagcgatacaacattatatgatgttattaaa
attaccgatgaagatggtaatgaaagatatatagtagctggaagtaaaagcagcaaagga
tatatagcaaagttagataatgcgtttagtgagataatatttgaaaaagaatttgatgat
atggataaaatagtatctattgtggatacagatccagatttctggatttttgggtataag
gatacgaatattgttcttaaacagataagttataggggaaatgagttgtacagtccaatt
atagaaaatagttatggttctgagaatggaaatcttttaaagagtaataatggttttgtt
atattgttaaatacaacagatggtgatatagaagtactaaaaacagacgattcaatgaat
atagaaaaacaggttatttttggaagaacaggagaagatgtggctaatggaattatagaa
tcttctgatgacggatatattatatttggaaaaacgaagtcttttgatgataagactaac
ggaaattcatatattataaagacagattccaatttgttaggttggagcactcccgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
