Marivirga arenosa: QYS47_31445
Help
Entry
QYS47_31445 CDS
T10278
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
marp Marivirga arenosa
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNB18812
UniProt:
A0AA51ZY08
LinkDB
All DBs
Position
1895513..1901326
Genome browser
AA seq
1937 aa
AA seq
DB search
MKKFLFSILFFVGLTSISFSQSVGDFQTRQSGNWNDSDTWEEWTGSSWDNTANTPTSADG
VISILNSHIITISASVTTDQTYIKSGGQITINSGNVFTAAAGPGDDLTIESGGILQNNGT
LTIQRIVSPPPPRLGLIRVLGTLIQNSGASISNAATSSLLFGANSIYRHNQDAGTIPTST
WNISSTVEITGVVNVKPSGLGQSFGNFRWDCSSQGAFVDLEGALTTVNGDFTMLDNAFWG
VYLSSVTDYTMNVGGDFRVSGGTAYLGFNSANIGNLVIGGDLIFENGAFIDHSFDGDINF
DISGNVLYNNASVNIGYGGSSTVTYNINGDLTISSSTISNQSASNGLINFIGSGNQNISG
VIDFGNFDFIIGSNSNVIIPDGSYLSGAVSLTTNTGGKLTVGSVAANGAIQTGTTSGNIR
VSGTRTFNSGSTIEYNGTATQALGNGFPSSGVNLIVNNTGGGVNMNSDVTIASGRTLTLT
EGTLNIGDGNLLTLNGNVVTTNGGISGGALSDLTIGGTGAFGTLGFVGTQELRNFTINRT
SSGTIILGGDLTVLGDLTQTDGDLLLNGNQLTINSNYSQAGGSLISNSASSLIVNGAGTL
PTSLSFSGDINTITLNRALATLNTGASGFTLSNLNLYSGTLDGTAISIADGGFVERRASG
SLTNALIPTGTYSLLYNNSSLMTSGPELHPTAINDLTKTGTSTLTVASDFDVNGVLTLSN
GAFDAGANIISLNGDFVSNAASTLTSATVTFDGTTNLSGGTAPTFGNITVNGVFNPTSNL
NVNGDITNNGTLNSSGGLLTLNGTSILGGANPITINDLTIGASGDVTANAAADLQINGNF
TNNGLFDGNSGTVVFGGTTTISGSVPNFASIRVDGTLNAPASLNINGDFTVNGTFNDNDG
IINLTDGNIAGGSAFNIHTLNANGAINNNNTGGVNIEDGITIGASTTFDLDGGGSGVMTL
LSTPSKDAFIGEVPSGSSISGNINIQRAIYTVGGDGRGYHIVGFPATGVTVADIQEEISI
TGPFTGSSACPTAGCTYSIYAYNEAAAGAGVFDDGYTGFPASGNGESFTNGEGYYIFNYA
GEPSSGIIEGNGAVFSGNFSTTLSRGASADAGWHMVSNPYPAATDWSQWDASNIAGGTAY
LYNPGSGNYIALDGLTQQLIGQGQGFFVRAISNGVSLSTTEASKVTGTTPTYYRTLPQER
FEIILKTPDYDDITIVSFNQNATDNYEPKYDAVRLLNTYETISTLTEDNEMVKVNRLAPV
TNSSNCSRSIKLNLEQMVVGDDYALDFTGISTVSTQELILKDNFLATESIITDNLVYNFQ
VADEVASKGSDRFEIILNSNQPSQISTVSDDVCPQQNATIVLQNTESFVNYLISKGDEVV
ASVEGNGADANVDISTELLASSINDFTIQAFVSGCDTTNVGNAQVQVYDELILNQEVSGS
SICSYDNQASFSIKTQLGANYYILDGQDTLQSVNGTGGIYDGFISVKDLNSGLNEFTIAA
EKDACQSGTLQSTLEIKYQDLVIDENIAFESNDICIDNSASIDFTGQSGVTYSVFQNGSL
ITNIEGDGTNQSIIIDKTELSSGSNEFTMKASYGSCSEFEFSDKVIINVEEEIVPDLDIT
NANSCGSGVASVIINNAQNGKTYTFVSGEEAIVSKQASQDGELIIEVPVTSLTTGLNQFD
ILIEGQNCTSLNANQVASVNYVESAIIDQVDDYSICLNETLTIDLSANVDMDNYQLFLGD
ELLAETNEARISISPEETTTYTLTGSTTNSCEVNSINFTVEVTNISKPGILAFNNVLESS
IEGDSYQWYLNGESLEDETNKLIVVSEKGDYEVVVTQVNCSATSDVYTFDQEILKANELL
ENSINLYPNPVSEKIFIDLNTINSVNITIFTLEGKFIDSFKLEKSQTELDMTKYSNGTYL
MQFESDKGSITKRIIKQ
NT seq
5814 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaatttttattttctatattgttttttgttgggcttacttcaatatcgttttct
caaagtgtaggagatttccaaactcgccaatcaggaaattggaatgatagcgatacttgg
gaagagtggacgggctctagttgggataatacagctaatacgcctacaagtgctgatggt
gttatatctattttgaactctcatataattacaatatcagcttctgttacaacagatcaa
acatatattaagtctggtggccaaattacaataaattcaggcaatgtattcacagcagct
gctggtcctggagatgacttaacaatagaatctggaggaatacttcaaaacaatggaaca
ttgacaattcaaaggattgttagccctccaccaccaagacttgggttaataagggtttta
ggtacgttaattcaaaactcgggagcttcaatctctaatgcagctacatcttctttatta
tttggtgccaatagtatttatcgacataatcaagatgctggaactatcccaacatccaca
tggaacatttcttcaacagttgaaattactggagtcgtaaatgttaaaccatcaggatta
ggacagtctttcggtaatttcagatgggactgctcttctcaaggagcatttgttgattta
gaaggggcattgaccacggtaaatggtgattttacaatgttggataacgctttttggggc
gtttatttatcatcggtgactgactacacaatgaatgttggaggagattttagagtaagt
ggtggtactgcatatttaggatttaatagtgcaaatattggtaatttagttataggtggg
gatttgatttttgaaaatggtgcatttatagatcatagtttcgatggagatataaatttt
gatatatctggaaatgttctttataataatgcatctgttaatattggctatggtggatct
tctacagtgacatataatattaatggcgatctaaccatatcttcaagtactatttcaaat
caatctgcaagtaatggattaattaattttattggttcgggtaatcaaaatattagcgga
gtaattgattttggtaattttgattttattattggaagtaattcaaatgtaataatacca
gatggtagttatttaagcggtgcagtaagtttgactactaatacaggtggaaaactaact
gtagggtctgttgctgctaacggtgcaatacaaactggaacaacttcgggaaatatcaga
gtctcaggaactagaactttcaattcgggttctacaatcgaatacaatggaacagcaact
caagctctgggtaatggctttccatcctcaggagtaaatttaattgttaataacacagga
ggcggagtaaacatgaattcagatgtaaccattgcttcaggccgaactttaacactcaca
gaaggaacccttaatattggcgatggaaatttattaacacttaatggtaatgtagtcact
acaaatggaggtatatccgggggagctctttctgatttaaccatcggtggtacaggagca
tttggaaccttaggatttgtaggtactcaagaattaagaaatttcactatcaatagaact
tcatctggtacaattatactaggaggagatttaacggttttaggtgatttaactcaaaca
gatggagacttattacttaatgggaatcaattaacgattaatagtaattattctcaagcg
ggtggcagcttaatatccaattctgcttcttccttgatcgtgaatggtgctgggacatta
ccaactagcttatcattttcaggtgatattaatacaattactttaaatagagctttagct
actcttaatacgggtgcttcaggttttaccttatctaacttgaacttatattctggtacg
cttgatggaacagccataagcatagcggatggcggatttgttgaaagaagagcttcagga
tcactaactaatgcccttattccaacaggaacttacagtttgctatataataatagtagt
ttgatgacctcaggacctgaattacatcccacggctattaacgatttgacaaaaacagga
acatctaccttaacagttgctagtgattttgatgtaaatggtgtacttacattatcaaat
ggagcattcgatgcaggtgctaacataatttcattaaatggagactttgtatctaatgca
gcttcaaccttgactagtgctactgttacctttgatgggactacaaatttatcgggtggt
acagctccaacttttggtaatattacagttaatggagtatttaaccctacttcaaactta
aatgttaatggtgatataacgaataatggcactttaaatagttcaggaggtttattgaca
cttaatggaacttcaattttaggtggtgctaatccaattactataaatgatttaacaata
ggagcgagtggagatgtaactgcaaatgcagctgctgatttacaaatcaatggtaatttt
accaataatggtttgtttgatggtaattctggtactgttgtctttgggggtacaaccact
atatctggatcagttcctaattttgctagcattcgggttgatggcactttaaatgcacca
gcttccttaaatattaacggtgattttactgttaatggtactttcaatgataatgatgga
attattaatttaacagatggcaatattgcgggcggttctgcttttaatatccatacatta
aatgcaaatggagctataaacaataataatactggaggagtaaatattgaagatggtatt
acaattggggcaagcacaacttttgacctagatggaggaggttcaggtgtgatgacatta
ttatcaactccttctaaagatgcttttataggtgaggtaccaagtggttcaagtatatca
ggtaatatcaatatccaaagagcaatttacacagttggaggagatggaagaggttatcat
attgtgggctttcctgccactggagttactgttgctgatatccaggaagaaatatctatt
acgggcccttttaccggttctagtgcttgtccaaccgcaggatgtacgtattctatttat
gcgtataatgaggcagcggcaggggctggtgtttttgatgatgggtatactggttttccc
gcttctggaaacggagaatcgtttacgaatggagaaggatattatatatttaattatgca
ggagaaccttcgtctggaatcatagaaggtaatggtgctgttttctcaggtaatttctcc
accaccctatctagaggagcatcggcagatgcaggttggcatatggtttctaatccttat
ccagcggcaactgattggtcccaatgggatgcctcaaatatagctggtggaactgcatat
ttatataaccctggttctgggaattatattgctttggatggtttaactcagcaattaata
gggcaaggtcaaggattctttgtaagagccattagcaatggtgttagtttaagtacaaca
gaggcatccaaagtaacgggtacaacacctacttactatagaactttacctcaagaaaga
tttgagattatcttaaagacacctgattatgatgatataactattgtttcatttaatcag
aatgcgacagacaattacgaaccgaaatacgatgcagttaggttattaaatacatatgag
acaatttctactttaacagaagataatgaaatggttaaagtaaatagattagctccggta
accaattcttcaaattgtagcagatcaataaaactgaacttggaacaaatggtagtagga
gatgactatgcattagatttcactggaattagtactgtaagtactcaagaattgatttta
aaagataactttcttgctactgaaagcattattaccgataatttagtctataactttcag
gtagcggatgaggtagcttcaaaaggttctgatagatttgaaattatattaaattctaat
caaccgtcacaaatatcaactgttagtgatgatgtttgtcctcagcaaaatgctaccatt
gtactacaaaatactgaatcctttgtaaactatttgatttcaaaaggggatgaagttgta
gcttctgttgaaggaaacggtgctgatgcaaatgttgacatatcaactgaattattagca
agttcaattaatgattttacaattcaagcctttgtaagtggttgtgatactaccaatgtt
ggaaacgctcaagttcaagtttatgatgaattgattttaaatcaagaagtaagtggttct
tcaatttgtagttatgataatcaagcttctttcagtattaagactcaattaggagctaat
tattatattcttgatgggcaagatacactgcaatcagtaaatgggacaggtggtatttac
gatggctttatttcagttaaagatcttaactcaggtcttaatgaatttacgatagctgct
gaaaaggatgcttgtcaaagcggtactttacaatcaacattagaaattaaatatcaagat
ttagtaattgatgagaatattgcttttgaatcaaatgatatttgtattgataattctgct
tccatagatttcactggtcaatcaggtgttacttatagtgtgtttcaaaatggatcatta
ataaccaatattgaaggagatggtacgaatcaatctataataattgataaaacagaattg
agttcaggatctaatgaatttacaatgaaagcttcctatggtagctgttcagagttcgaa
tttagtgataaagtaatcattaatgttgaggaagaaattgttccagatctagatatcacc
aatgcgaatagctgtggtagtggagtggcatctgtcataattaataacgcacagaacggt
aaaacctatacctttgtatcaggagaagaagccattgtttcaaagcaagcttcccaagat
ggtgaattaatcattgaagtacctgtcactagtttaactacaggcttgaatcaattcgat
attttaattgaaggacaaaattgtacatccttaaatgcaaatcaggtagcttcggtaaat
tatgttgaatctgctattattgatcaagttgatgattacagtatatgtttaaatgaaacc
ttaaccattgatttgtcggctaatgtggacatggataattatcagttatttttaggtgat
gaattattagctgaaacaaatgaagctagaatatctatatctccagaggaaacaactact
tataccttaacgggttctacaacaaatagctgtgaagtaaattcaataaacttcacagtt
gaagtgactaatatttctaaaccaggtattttagctttcaataatgttttagaaagctca
atagaaggagattcctatcaatggtacctgaatggagaatcattagaggatgaaaccaac
aaattgatagtagtttcagaaaaaggtgattatgaggtagtagtaacgcaagttaattgt
tctgctacaagtgatgtttatactttcgatcaggaaattttaaaagctaatgaattgctg
gaaaattcaatcaatctttacccgaatccagtaagtgaaaaaatctttattgatttaaat
actattaattcagtaaatattactattttcacccttgaaggtaagtttattgatagtttt
aaattagaaaaatctcaaactgaattggatatgactaaatattcaaatggtacttattta
atgcagtttgaatccgataaagggagtatcacgaaaagaataattaagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
