Marixanthomonas sp. SCSIO 43207: INR76_05060
Help
Entry
INR76_05060 CDS
T07485
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
marx
Marixanthomonas sp. SCSIO 43207
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
marx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
marx02000
]
INR76_05060
Transporters [BR:
marx02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
INR76_05060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAB82129
LinkDB
All DBs
Position
1095023..1097197
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MKSLFISAALLTTTIAAIAQETEQDSTKVESLEEVFIQAVRVDADSPITHSNLDEKEIET
RNLGQDVPYLLNYLPSVVTTSDAGAGVGYTYIRVRGSDASRVNVTLNGIPYNDSESQGTF
WVNLPDFASSIQNLQLQRGVGTSSNGSGAFGASLNILTDEVSEEAYGEISNSFGSFNTRK
HNVKFSTGLMKDRVEIAGRLSKIESDGYIDRARSDLKSYFLQGAYKDRNTLVKVLTFGGQ
EETYQAWNGIDAETLENDRTFNPSGMYTDEDGNTQFYDNEVDNYAQDHYQIFWNQRYNNN
WSSNVALNYTYGRGYFEQYKEDEDFDTYGFAPIEIGGETVNTTDLIRRRWLDNDFYAVNA
NINYKDEALNISAGAFFSTYKGDHYGEVIWARYASDSEIRDRYYFSDATKNEFTTFAKAT
YRFNDQWQVFGDLQGRFISYKTDGITSDVVPIDVDETYSFFNPKAGVSFQLNESNQFYAS
YGRAQREPTRNDFEENITTAEKLDDFELGWRFASEKAQVNTNLFYMDYKDQLVLSGELND
VGAPLRTTSGESYRLGLEIDANVILTEKVSIRPNIALSSNKNVDFVASQDGELVNLGKTN
ISFSPDIVAGNMLEYRPTRNFQVALLSKYVGEQYMGNIDSEVSKLDSYFINNFNIVYRWE
NVPFVNEIVFTGLINNIFNVEYVSNGYFFTFDDVDNQGNTTTFEGAGYYPQAKTNFLLGA
TIKL
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgttatttatttcggctgctttattaacaacaaccattgcagccattgcacaa
gaaacagaacaagattcaacaaaagttgaaagcttggaagaagtttttattcaagcagtt
cgtgtagacgcagattcgccaattacacactcaaacctggatgaaaaagaaattgaaacc
agaaacctaggacaagacgttccgtatttacttaactatttaccgtctgtagtaaccacc
agtgatgccggtgccggtgttggctacacgtacattcgagtaagaggtagtgatgcttct
cgagtgaatgttacattaaatggtattccatataacgactctgaaagtcaaggaaccttt
tgggtaaatttaccagattttgcttcttccattcaaaatttacaattacagagaggagtt
ggcacctctagtaacggttccggggcatttggagctagtttgaatattttgaccgatgag
gtttcagaagaagcatatggcgaaatttcaaattcattcggttcatttaatacccgaaaa
cacaatgtgaaattcagtaccggattaatgaaagatcgagtagaaattgccggacgattg
tcaaaaatagaatctgatggatatatagatagagctcgttcagacttaaagtcctatttc
ttacaaggagcttataaagacagaaacacacttgtaaaagtattgacctttggagggcaa
gaagaaacctatcaagcttggaacggtattgatgctgaaactttagaaaacgacagaacg
tttaacccttcagggatgtacaccgatgaagacggaaacactcaattttatgacaacgaa
gtagataattatgcacaagatcactatcaaatattttggaatcaacgttacaacaataac
tggagtagcaatgttgcattaaattacacctacggaagagggtactttgagcaatacaaa
gaagatgaagattttgatacctacggttttgctcctattgagataggtggtgagactgtt
aatactacagacttaatacgccgtcgttggttggataacgatttttatgctgtaaatgcc
aatataaactacaaagatgaggcgcttaatatttctgcaggagcattttttagcacctat
aaaggcgatcattacggtgaggtaatttgggctcggtatgcaagtgattctgaaatacgc
gacagatactattttagtgatgccacaaaaaatgaatttaccacatttgcaaaagctacc
tatcgctttaacgatcaatggcaggtgtttggtgatttacaaggacgttttataagttat
aaaaccgacggaatcacatcagacgtagtgcctatagatgtagatgaaacctatagtttt
ttcaatcccaaagcaggtgtttcgtttcagttaaacgagtcaaatcaattttatgcctcc
tacggaagagcccaacgcgaacccaccagaaacgactttgaagagaacattaccactgct
gaaaagttagatgattttgagttaggatggcgctttgcttcagaaaaagctcaagtaaac
accaatctgttttatatggattataaagatcaattggtgctttctggtgagcttaatgat
gtaggcgctccgttacgtactacaagtggtgaaagttaccgtttgggactagaaatagat
gccaatgtaatactaactgagaaagtaagcataagacctaatattgctttgagttcaaat
aaaaatgttgattttgtagcatctcaagatggtgaattggtcaacttaggtaaaaccaat
atttctttttcaccagatatagtggcaggtaatatgctagagtataggccaacgagaaac
tttcaagttgctttattatcaaaatatgtaggcgaacaatatatgggaaatattgatagt
gaggtttcaaaacttgatagctattttattaataacttcaatattgtatatcgttgggaa
aacgttccgtttgtaaatgaaatagtatttaccggattgataaataatatttttaatgta
gaatatgtgtcaaatggatattttttcacctttgatgatgttgataaccaaggcaacacc
actacatttgaaggagctggatactatccgcaagcaaaaaccaactttctattaggcgca
acaattaagttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
