Marixanthomonas sp. SCSIO 43207: INR76_12335
Help
Entry
INR76_12335 CDS
T07485
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
marx
Marixanthomonas sp. SCSIO 43207
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAB80885
LinkDB
All DBs
Position
complement(2619248..2626786)
Genome browser
AA seq
2512 aa
AA seq
DB search
MTKTITRNYLLLVSMLFVTALSFGQVVTNNNDAGPGSLRQAVIDANATAGPDVITFDANY
TITLTSGQIVVNDDLTITGNGIGNTIIDGSSNGTARLIGASSISNLTIEGITFQNANASV
DGGAVGIQNVTNAAIVDCSFINNSTNGVNGAGALGSQDSNLTVSGSFFDGNNATNAMSSS
GGAIGQASSGTLTVINSEFTNNTTNRAGGAIEVNSPDLITITDSNFDGNSAVGPPGNGGS
LHITGSADATITGSTFTNNVAALEGGALWNGLGTMTVSNCTIDNNEAQGAAADDGGGGIF
NNGGTLLVNTQTTITNNIASGASGSGGGIFSTAGTVEITDPGTTVNLNRANRAGGGIEIV
DGSLTLTDVSLNQNNAGVAPAVAAPGNGGGIHVSNVATVIINGGNIQANVAANQGGGLWN
QAGSTMTVTNSPTPNFNDNIASGDGGGAIYNNGGTLEVQPGNVLSNNIADGPSGSGGAIL
NATPGTLTVDDVTFTGNTANRAGGAIEIASAGGETYVFSGITLDGNFIATAAPGNGGGFH
ISGPGDITIMNSSVINNTAVEGGGLWNGSGTMTVTDTEVSNNEATGDLAEQGGGGVYNEM
GTLIVNGTSTIDGNSATGTAGSGGGILTNMGSLNVDGLTISGNTAVRAGGGIEVRSNAGD
LFEFNNVTFTNNTATGVTAPGNGGAFHISGAGDSTFTNCLVQNNTAVEGGGLWNGPGTMT
ITGFDTQMDNNEATGNDPDQGGGALFNDGGTMNIDSFADIFSNIATGTSGSGGAILSTGG
TLNTNTIFLNSNGANRAGGAIEIIDGTANLIDISIIQNYVTGNLTGGTANPGNGGGLHVT
GNSATVTISGIVFLNEAASEGGGLWNNGGTMNIEGGTFYGDTFIDQNIASGTAADNGGGG
IFNNGGTLNVASGTVITRNIADGAAGSGGGLFSTNGDVVLDGVTITENRANRAGGGIELI
DGSLMLTNSTLDNNNAGISPAVAAPGNGGGLHISGAADANILGGTVDNNVAAAEGGGLWN
GSGTMTIDATPITNNVASGNDATNGGGGVFNNGGTLDVLAGTEITNNIADGTSGSGGGIF
STAGDVTLTDVIITDNQANRAGGGIELIDGSVMLTNVTLDTNNAGVAPATAAPGNGGGLH
ISGAANATLIGGSVDSNVAALEGGGLWNGTGTMTVDGTPITNNIASGAAADDGGGGIFNN
GGTLDVLPGTNINNNLANGASGSGGGIFSTGGSVTITDAIISQNSANRAGGGIEVIEGSV
TLNNTALSINDVNGTAGSPNPGNGGGLHVSGAATTSITGGMVSANEAASEGGGLWNQVGA
TMTVTDAMININTAEGDDADNGGGGIFNNGGNLNIVNTTVQSNTVTGVSGSGGGILTTDG
TVNIIDASIDNNAANRAGGGIEIIDGTLSMANTSLNSNNVNGSSGMANPGNGGGLHVSGI
ADVSMFGGTVSLNDAAAEGGGLWNQVGSTMEVDNTIIESNTASGNDPDQGGGGIFNNGGT
LIVQNSSEIINNFADGTAGSGGGIQNVDGGSVTVNNTIISNNSANRAGGGIEDNSSVTAG
SITLFNVTLDNNEVGNAPGNGGGLHITGPGTAMITNGTVNGNVASAEGGGLWNGSGEMTI
DGTTIDGNTASGADADQGGGGIFNEGGTLSVLNATVSNNVADGASGSGGGILNNQGMLTV
TDSELSGNTSMRAGGAIEDNSVAGNVLTLENVDLMDNSTASAPGNGGGLHITGPGDSNIT
GGMASGNTASAEGGAYWNGSGVMTIDGTTIDGNTASGADADQGGGGIFNEGGTLSVLNAT
VSNNVADGASGSGGGILNNQGTLTVTDSELSGNTSMRAGGAIEDNSVAGNVLTLENVDLM
NNSTASAPGNGGGLHITGPGDSNITGGMASGNTASAEGGAYWNGSGVMTIDGTTIDGNTA
SGADADQGGGGIFNEGGTLSVLNATVSNNVADGASGSGGGILNNQGMLTVTDSELSGNTS
MRAGGGIEDNSIAGNMLTLENVNFMNNSTASAPGNGGGLHITGPGDSNITGGMASGNTAS
AEGGAYWNGSGVMTIDGTTIDGNTAEGAAADNGGGGVFNNGGTLTIINGTSIINNMATGA
AGSGGGVFSTAGDVTITDATLDSNAANRAGGAIELIDGTLTFTSSEMTNNDVNGTAGTAA
PGNGGGLHVSGNSGLITISESIVTGNEAAQEGGGLWNQSGTMMVVETTTIDSNSTFGTAM
DDGGAGIFNNGGMLEVRMSTVSNNIASGATSSGGGIHNTTGGDVSVMVSTISGNSANGSG
GGVYNNGNSFDINATTIAMNEALANGGGINGASEVFLKNTLVALNTAANGQDVSGVLTSN
DYNLIGTDDENAFAEQTNDIEEVDPMVGPLQDNGGITNTHQLLEGSLAYNGGDPADLFND
QIDQAVFDDIRDIGAYEAQDILLSIENVGDTANGIVIYPNPSSGRATVEIPQAFGSNVQI
TIIELGSGKIVNNLTTSFGATDLNLRGMANGVYIINVTSEGVTSTHRLILAN
NT seq
7539 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaaacaattactcgaaactatttattactagtttctatgttatttgtaacggca
ttgtcttttgggcaagtagttacaaataataatgatgccggtcctggatctttaagacag
gcggttattgacgctaatgcaacagctggtccagatgtgatcacgtttgatgcaaactac
acaattacacttacctcaggtcagatagttgttaatgatgatcttactataacgggtaac
ggtataggtaatactattatcgacggaagtagtaatggtacagctagacttataggtgct
agtagtatttcaaatttaactattgaaggaataacatttcaaaatgcaaacgcatctgtt
gatggcggagcagttggaattcaaaacgtaaccaatgcagccattgtagattgttcgttt
ataaacaattcaacaaatggagttaatggtgctggagcgctaggatctcaagattcaaat
ttaactgtttcaggaagtttttttgacggaaacaatgcaacaaatgctatgtctagtagc
ggtggagctattgggcaagcctctagcgggacattgacggttataaattctgaatttaca
aacaacacaaccaatcgtgccggtggtgcgattgaagtgaattcgccagatcttattaca
ataacagattcaaactttgatggaaattcagctgtaggtcctcccggaaacggaggatct
ttgcatattacagggagtgcagatgcaacaattacaggttcaacattcacaaataacgta
gctgcactagaaggaggagctttatggaatggattaggaactatgaccgtgtctaactgt
acaattgataacaacgaagcacaaggagctgctgccgatgacggtggtggtggtatcttc
aataatggaggaacacttttagtaaatacccaaacaacaataacaaataatatagcttct
ggagcttcaggttctggtggtggtatttttagtacagctggaactgttgaaattacagac
cctggtacaacagtaaacttaaacagagcaaaccgcgcaggtggaggaattgaaatagtt
gatggatcgcttacacttaccgacgtgtcattaaaccagaataatgcaggagttgcacca
gcagttgccgcacctggtaatggtggtggtattcacgtatctaatgtagcgaccgttatt
ataaatggtggtaatattcaggctaatgttgctgcaaaccaaggtggaggtctatggaac
caagccggaagtacaatgaccgttacaaactcacctacaccaaactttaacgataatatc
gctagcggtgatggtggtggagctatttacaacaatggaggtacattagaagtacaacca
ggaaatgtattaagtaataatattgcagatggaccttcaggttctggtggagcaatttta
aacgccacacccggaacattgacagttgacgatgtaacattcactggaaatacagcaaac
cgtgcaggtggagcaattgaaattgcatcagctggaggagaaacatatgttttttcagga
ataactttagatggtaactttattgcaacagcagctccaggaaatggaggtggctttcat
ataagtggccccggtgatattacaataatgaatagttctgtaataaataatactgctgta
gaaggcggtggactttggaatggatctggaacgatgactgtaacagatacagaagtttct
aacaatgaagctacaggtgaccttgccgaacaaggtggtggtggtgtttataatgaaatg
ggaacattgattgtaaatggtacttcaactatagatggtaattcagcaactggaacggca
ggttctggtggtggaattttaaccaatatgggctcattaaatgtagatggtcttacaata
tctggaaatacagcagttagagctggtggtggtattgaagtacgatcaaatgcaggagat
ttgtttgagtttaataatgtaacatttactaacaatactgctacaggagtaacagctccc
ggaaacggaggagcttttcatattagtggagcaggagattctacattcaccaactgtctg
gtgcaaaacaatacagcagtagaaggtggaggtctttggaatggacccggaacgatgaca
ataactggttttgatacacaaatggataataatgaagccactggtaacgatccagatcaa
ggtggtggagcattatttaatgatggaggaactatgaatattgattcttttgcagatata
tttagtaacatagctacaggaacatcaggttctggtggggctattttaagtaccggagga
acgcttaataccaatactattttcctaaactcaaatggagcgaatagagcaggtggagct
attgaaattattgatggtacagcaaaccttattgatatttcaattattcagaattatgtg
accggtaatcttaccggaggaactgcaaatccaggaaacggtggcggattgcacgtaaca
ggtaactctgcaactgtaaccataagtggaattgttttcttaaacgaagctgcttcagaa
ggtggtggactttggaataatggaggtacaatgaatatagaaggcggaactttctatggt
gatacatttatagatcaaaatatagcttcgggtactgctgctgacaatggtggtggtgga
atcttcaataatggaggtacacttaatgtagcaagcggaaccgtaattactagaaatatc
gcagatggagccgcaggttctggtggtggtctttttagtacaaatggagacgtagtactt
gacggagttacaattactgaaaaccgagccaatagagctggtggtggtattgaattaatt
gacggttcattaatgcttaccaattcaacattggataataataacgcaggtatttctcct
gcagttgctgctcctggaaacggtggtggacttcatatttcaggtgctgccgatgctaat
attttaggcggaacagtcgataataatgtagctgctgctgaaggtggtggtctttggaat
ggatctggaacgatgactattgatgcaacaccaattacaaataacgttgcttccggaaat
gacgctaccaatggtggtggtggagtatttaataatggaggtacgttagatgttttagca
ggcacagaaataacaaataatatagctgacggaacttctggttctggtggcggtatattt
agtactgctggagatgtaacacttacagatgtaatcataaccgataaccaagctaataga
gctggtggcggtattgaattgattgacggttcagtaatgcttaccaatgttaccttggac
actaataatgcaggagttgctcccgcaacagctgccccaggtaatggtggtggattacac
ataagcggtgctgcaaatgctacgctaattggaggttcagtagacagtaatgttgctgca
cttgaaggtggtggactatggaatgggactggaacaatgaccgttgatggaacacctata
acaaataatatagctagtggagctgctgccgatgacggaggtggcggaatcttcaataat
ggaggtacgttagatgtattaccaggaactaatattaataataacttggcaaatggagca
tcaggttctggtggaggtattttcagtactggaggttcagtaactattacagatgctata
atttcacaaaatagtgctaatcgtgctggtggaggtatagaggttattgaaggatcagta
actttaaataataccgcacttagtataaatgatgttaacggaactgcaggatctcctaac
cctggtaatggcggtgggttacacgttagtggagctgccacgacatccattactggaggt
atggtttcggctaacgaagctgctagtgaaggtggcggactctggaatcaagttggagct
acgatgacagtaacagatgctatgattaacattaacactgccgaaggcgatgatgctgat
aatggtggtggtggaatctttaataatggaggaaatcttaatattgttaatactaccgta
caaagtaataccgtaacaggagtttctggttcaggtggaggaatattaactacagatggt
actgtaaatattattgacgcaagtattgataataatgcagccaaccgtgccggaggaggt
atcgaaattatagacggtacattatcaatggcaaacacctctttaaactcaaataatgta
aatggatcatcgggtatggccaatcctggaaatggtggtggattacacgttagtggtatt
gccgatgtttcaatgtttggaggtacggtttctcttaacgacgctgctgctgaaggtggt
ggactttggaaccaagtcggaagtactatggaagtagataataccattatagaaagtaat
actgcaagtggtaatgatcctgatcaaggtggaggaggaatcttcaacaatggagggaca
ttgatagtacaaaattcttcagaaatcataaataattttgctgatggaactgcaggttct
ggtggcggaattcaaaacgtagatggagggtccgtaactgtaaataacacgataatttct
aataactcggcaaatagagccggaggaggaattgaagataattcttcagtaactgcagga
agcataacgctgtttaatgttactttagataacaatgaagtaggaaacgcacccggtaat
ggtggtggactacatatcacaggtcctggtactgctatgataaccaacggaacagtaaat
ggaaacgttgcatctgctgaaggtggtggtctttggaatggatctggagaaatgacaatt
gacggaacaaccatcgatggcaacacagcaagcggagccgatgccgatcaaggtggaggt
ggaatcttcaacgaaggtggaaccctatctgtattgaatgcaacggtaagtaacaatgtt
gctgacggagcatctggatccggtggaggaatcttgaataatcaaggtatgttaaccgta
accgattctgaattgagtggaaacacttcaatgagagctggtggtgcgatagaagataat
tcagttgctggaaatgtattgacacttgaaaatgttgatttaatggataacagtacagcg
tctgcacctggtaatggtggtggactacacataacaggccctggagactcaaacatcaca
ggcggaatggcaagtggaaacacagcatctgctgaaggtggagcctactggaatggatct
ggagttatgacaatcgacggaacaaccatcgatggtaatacagcaagtggcgccgatgcc
gatcaaggtggtggtggaatcttcaacgaaggtggaacgctatctgtattgaatgcaacg
gtaagtaacaatgttgctgacggagcatctggatccggtggaggaatcttgaataatcaa
ggaacacttaccgtaaccgattctgaattgagtggaaacacttcaatgagagctggtggt
gcgatagaagataattcagttgctggaaatgtattgacacttgaaaatgttgatttaatg
aacaacagcactgcgtctgcaccgggtaacggtggtggactacacataactggtcctgga
gactcaaacatcacaggcggaatggcaagtggaaacacagcatctgctgaaggtggagca
tattggaatggatctggagttatgacaatcgacggaacaaccatcgatggtaacacagca
agtggcgccgatgccgatcaaggtggtggtggaatcttcaatgaaggtggaacgctatct
gtattgaatgcaacggtaagtaacaatgttgctgacggagcatctggatccggtggagga
atcttgaataatcaaggtatgttaaccgtaaccgattctgaattaagtggaaacacttcc
atgagagccggaggaggtattgaagataattcaattgccggaaatatgttgactttagaa
aatgttaactttatgaacaacagcactgcatctgcaccgggtaatggaggtggattgcac
ataacaggccctggagactcaaacatcacaggcggaatggcaagtggaaacacagcatct
gctgaaggtggagcatattggaatggatctggagttatgacaatcgatggaacaaccatc
gatggtaacactgctgaaggagctgctgccgataatggcggtggaggtgtatttaataac
ggaggtacacttacaattataaacggaacatcaattattaataatatggctacaggagct
gccggttcaggtggtggagtatttagtaccgcaggtgatgtaacaattaccgatgcaacg
ctagactcaaatgctgcaaatagagcaggtggagctattgaattaattgacggtaccttg
actttcacttcttctgaaatgacaaacaacgatgtaaatggaacagcaggaaccgcagca
ccaggtaacggtggtggtctgcacgtatcaggaaatagcgggttaattactatttcagaa
agtattgttacaggtaacgaagctgctcaagaaggtggcggattatggaatcaaagcgga
actatgatggttgttgaaactactacaatagactcaaatagcacttttggtactgcgatg
gatgatggcggagccggtatttttaataacggtggtatgctagaagtaagaatgtctacc
gtttcaaataacatcgcttctggagcaactagttctggtggtggtattcataacactact
ggtggtgatgtgagcgtaatggtaagtactatttctggtaattcagctaatggatctggt
ggtggagtttacaacaacggaaacagttttgatattaatgccacaacaattgcaatgaat
gaagcattggcaaatggaggaggtattaacggagcttcggaagtttttcttaaaaatact
ttagtagctttaaatacagcagcaaatggccaagatgtttcaggagtattaacttcaaat
gattataatttaattggaacagatgatgaaaacgcttttgctgaacagacgaatgatatt
gaagaagttgatcctatggttggtccgttgcaagataatggcggtattaccaatactcat
caattacttgaaggttctttagcttacaacggaggtgatcctgcagatttatttaatgat
caaattgatcaagctgtttttgatgacatacgtgatataggagcttatgaagctcaagat
attttactttctattgagaatgtaggtgatacagccaacggaattgtaatttacccaaac
ccatctagtggtagagctactgtagaaattccacaagcgtttggaagtaacgttcaaata
actattattgaattaggttctggaaagattgtaaataatcttacaacctcatttggagcc
acagatcttaaccttcgtggaatggcaaatggtgtttatataataaatgtaacttcagaa
ggagtaacatcaacgcaccgtttaattttagcaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system