Myxocyprinus asiaticus (Chinese sucker): 127433192
Help
Entry
127433192 CDS
T08782
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
masi
Myxocyprinus asiaticus (Chinese sucker)
Pathway
masi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
masi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
127433192
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
masi00536
]
127433192
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
masi00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
127433192
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127433192
NCBI-ProteinID:
XP_051540869
LinkDB
All DBs
Position
43:complement(907371..1105915)
Genome browser
AA seq
2850 aa
AA seq
DB search
MTVPPRFSNSGNHKEEMFPGFLSSCVPSSSAPSLVFPARCLPLSNCCYQGTSKITHRPVH
PTSLHFSSNRLSTISLSSFLGQTNYGREIRQSHCSLCPVTITSLDTSPYLLPVWVLHSSL
HSCCPITQHQCLTSPRLLCLNAVCRESCGDGFCSRPNMCICSSGQIATTCATKSSVCEKI
CQNGGRCIGPNRCVCVYGFTGPQCERDYRTGPCFIQVLKRKCAGQSSGFVCSKTLCCGTV
GQAWGHLCELCPVLSSPCSRGFTPNTRTGACQDVDECKLVHDVCKGGKCINTVGSYECRC
ATGYQQHISSLKCEDVDECSSAQRVCDGGLCMNSAGSFFCVCQYGYVLSADQTRCLKQHI
GVCFASVVNGRCVREISGHFSKIQCCCDRGLCWSQHTAHEMCPVPGSDEYFRICLVGSAL
SGYSEEDPDKIPHHTSSFSPTHIDQILHPFYNNGHILPQFPQIPQIPQIPQIPVNGNGFR
PQRPVVSVNETVNRCRLFPNLCLNGRCVPVGSDYRCNCDTGYRVDNSGECSDVDECVSEP
CPNGNCINTPGSYHCRCHTGFLRIPGKQTCIDIDECLQNGMLCKNGHCLNTEGSFQCICN
AGFKLTPDGRNCVDHDEYATTNMCLNGMCINEDGSFKCVCKPGFTLNPSERYCTYMDECQ
TPGVCMNGRCVNTHGSFRCECFADLTVGIDGHTCVDTHMHSTCYGAVKRGLCLRPFQHAV
TKSQCCCANPDYAFGELCHPCPAKNSVEFQTLCPSGVGFSADGKDINECTQDADICLNGV
CENLRGSFRCVCHAGYESVKNGRNCVDIDECAVNSLLCDNGLYRNAPGSYSCTCPAGFSF
RHNTETCQDVNECASAPCINGVCKNNAGSFSCECSLGSKLDFTGLICVDNLKGSCWLTLQ
NGRCEVNINGSTLRSQCCATLGVAWGSPCEPCQTDPVCERGFARSRGVSSEDVNECEVFP
GVCYNGYCVNTRGSFKCQCPEGLTLDVTGRLCVDVRLEPCYLTYDEDMCTQLVSGRFHMD
ACCCTVGVAWGKECELCPEPGTRQYDALCPRGPGFANKGDMLTGKDVYNDINEWKVFPSI
CTHGKCRNTIGSFRCRCDSGFALDINELNCTDIDECMISPDVCAHGTCVNTLASFNCDCF
SGYESGLMMMKDCIDIDECEINPSLCHGGTCENTDGSYKCMCPPGHQLSIDSSACEDVNE
CELSATLCRNGSCVNVVGTYQCSCNSGYQTTPDRKGCTDIDECTIENGGCEVYCNNSEGS
YFCSCGKGYTLMLDQRTCADVNECEEYVDICEGGQCTNVPGEYHCLCYEGFMVSVDMRAX
IDVNECELNANICMFGECENIKGSFICHCEMGYLVKKGTSGCTDVDECDINAYNCDIHAT
CINTPGHYHCSCKDGWAGDGVKCADVDECTNGTQVCSSDAQCVNTAGSYHCICFDGFTGD
GFTCSDMDECADDVDLCENGQCLNVPGEYRCECEIGFTHTANSKTCQDIDECSFQNICVF
GTCQNMPGMFRCICDDGYEMDKTGGNCTDVDECLDPINCVNGHCENTAGSYQCNCPIDFE
LNLTGIVCVDTRAGNCFLEVAYLGHGRLTCNVEAGFGVSRSSCCCSLGRAWGKPCDLCPP
VNTSEYNTLCPGGEGFKPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCTNTFGSFQCDCPTGYHL
NIDNRICEDIDECVHSSRVCGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMQVNGGNSRMDMRKSLRYRS
YNTSNCEHQLTFNTTQRLCCCAYNMGKAWNKPCQACPTTGTGGFQSLCGSVTGFKIDIET
GKPKDIDECHEIPGICAHGVCINRIGSFRCECPTGFSYNDLLLICEDIDECSSGERVCQR
YADCINRPGGYQCECSDGYILSPNGECTDRNECVEMPNVCHHGDCVDIPGGYECVCQSGF
TATLNRRMCMDVDECSYQPCGNGTCKNSVGSYNCICHPGFELAHNNYSTDTDECSVFYSQ
LCRNGQCVNNVGSFQCLCKEGFELTLDGKNCIDINECRMIPGTCASGTCVNLDGSFRCVC
PKGYIVHNEHCADVNECSEEPGICMYGSCFNSLGSFECVCKPGFVQSEDKRRCYDTRESF
CFTLFENGKCSIPQAFNTSKAKCCCSIMAKEGWGDPCELCPKEHNAGFLDLCPFGHGIVS
GVGDTCIDLNECVENPEIYVNGRCINTDGSFRCECPTGYTLDFTETNCDDIDECSVGNPC
GNGTCSNVIGGFECLCKEGFEPGPVMSCEDVNECGQNPLLCAFRCINTFGAYECSCPPGY
TLREDRRMCQDVDECAADLHNCDSRGMECKNLIGTFMCVCLAGMIHRMNEEVCQDENECL
TQTGVCENGRCVNTVGSYTCECAVGFKLDSTATQCLDYRKGFCFTDVLHTMCQMSSSSRA
AVSRSQCCCHGGRGWGNQCELCPLPASANYKKLCPYGPGYATDGTDIDECKVIPGVCVNG
VCINIMGSYRCHCEAGYTASAAGSACVDVDECGMSPKPCNFMCKNTDGSYMCSCPRGYTL
QDDSRTCKDVDECQSRRHNCHFSCVNTIGGFNCKCPAGFSQHHTSCRDINECVSDLSVCG
LRGICHNSAGSFSCECAQGFSLDSSGLNCDDIDECASDQRCQFGCQNVAGGFRCSCPQGY
TQHQQWNQCVDENECSNPRRCGSASCFNTLGSFKCGCPSGFTFDPMSMNCAFVDECVSFE
KPCRYGCSNTQGGFMCGCPAGYNRAGHGHCVSTAGFGRVGFESTAGIRPEEDNSLSNTHQ
NKTVGRRHTSNFTLPQQFMQEVHLSSMDVNQPFKLQLNNSEVNPSAPILKLLPAVRALAQ
HVMYTITAGNHDGFFQIRQRAGSLLSDTTD
NT seq
8553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgttccaccgagattctctaactcgggaaaccataaggaggagatgttccctgga
ttcctgtctagctgtgtgccctcttcttcagccccttctctggtcttcccagctcgttgc
ttgccactctccaactgttgctatcaagggacttcaaagatcactcacaggccagttcat
ccaacctctcttcacttctcctccaacagactaagcaccatctctctgtccagtttcctt
ggacagaccaactatgggcgtgaaatccgccagtcccactgcagcctgtgcccagtcacc
atcacctcgttagacacttctccctacttgcttcctgtctgggttctccactcaagccta
catagttgttgccccatcacccaacatcagtgcctgacctcaccgaggctcttgtgtctc
aatgcagtttgccgggagagctgtggtgatggtttctgctccaggcccaacatgtgcatc
tgctctagtggccagatagccacaacctgtgccaccaaatcatcggtctgtgagaagatc
tgtcagaatggtggacgctgcattggaccaaaccgttgtgtgtgtgtgtacggcttcact
ggaccgcagtgtgagagagattaccgaacaggcccgtgcttcatccaggtgctcaaaagg
aagtgtgcaggtcagagcagtggatttgtgtgtagtaagactctgtgctgtggcacagtg
ggtcaggcgtggggtcacctgtgtgaactgtgccctgttctcagctcgccctgcagcaga
ggatttaccccaaacacccgcacgggagcctgccaagatgttgacgaatgtaaacttgtg
catgatgtgtgtaaaggaggaaagtgcatcaacacagtgggctcatatgaatgcagatgt
gcgacaggttaccagcagcacatcagttcactgaagtgtgaggatgtggatgaatgctcc
tctgctcagcgtgtgtgtgacggaggactctgcatgaattcagcaggcagtttcttttgt
gtgtgtcagtatggatacgtgctgtctgcagaccagacacgctgcctcaagcagcacata
ggtgtgtgttttgcgtccgttgtgaatgggcgctgtgttcgggagatcagtggacacttc
agtaaaattcagtgctgctgtgaccgtggactctgctggagtcaacatacagctcatgaa
atgtgtcctgtaccgggatcagatgaatacttcaggatatgtctggtgggctctgccttg
agtggctatagtgaagaggatcctgataaaatccctcatcataccagcagcttcagtcct
actcatattgaccagatactccacccattttataataatgggcatatattacctcagttt
ccccaaattccccaaatccctcaaattcctcagataccagtgaatggtaatggatttaga
ccacaacgacctgtcgttagtgtgaatgagactgtaaacagatgtcgtctgtttcctaac
ctgtgtctgaacggacgctgtgtacctgtggggtctgactaccgctgtaactgcgacact
ggatacagagtggacaacagtggagaatgctcagatgtggatgagtgtgtatctgaaccc
tgccctaatggaaactgtatcaacactcctggttcctaccactgcagatgccacacaggc
tttctcaggattccaggcaaacagacctgcattgatattgacgagtgtcttcagaatggc
atgctgtgtaagaatggccactgtctgaacacagagggcagttttcaatgcatctgtaat
gcaggattcaagctcacacctgatgggagaaactgtgtggatcatgatgaatatgccacc
acaaacatgtgtctgaatggcatgtgcatcaatgaagatggcagctttaaatgtgtgtgt
aaacctggattcacccttaaccccagcgaacgctactgtacatatatggatgagtgccag
actccaggtgtgtgtatgaatggacgctgtgtgaacactcatggttctttcaggtgtgaa
tgttttgcagatcttactgttggaatagatggacacacatgtgtagacacacacatgcac
agcacctgttatggggctgtaaagagaggcttgtgtttacggccgttccaacatgccgtt
accaaatcacagtgctgctgtgccaaccctgactatgcctttggtgagctgtgccaccct
tgccctgcaaaaaactcagttgagtttcagacattgtgtccaagtggagttggattctcc
gctgatggaaaagacattaatgagtgcacacaggatgctgatatctgtcttaatggagtg
tgtgagaatcttagagggagtttccgatgcgtctgtcacgctggatatgaaagtgtgaag
aacggcaggaactgtgtggatattgatgaatgtgcagtgaacagtcttctctgtgataat
ggactgtaccggaatgctccaggcagctacagctgcacctgccctgctggattctccttc
agacataatacagagacctgtcaggatgtgaatgagtgtgcgagcgctccgtgtattaat
ggagtgtgtaagaacaacgcaggctctttctcctgcgagtgctcactaggaagtaaactg
gacttcactggacttatatgtgttgataatttgaagggctcatgttggttaacacttcag
aatggccgctgtgaagtcaatataaatggcagtacactcaggtcacagtgttgtgctacg
cttggagtggcctggggcagtccatgtgaaccatgtcaaaccgatcctgtatgtgaacga
ggatttgctcgatcaagaggtgtttcaagtgaagatgtgaatgagtgtgaggtgtttcct
ggtgtgtgttataatggatactgtgtgaacactagagggtcttttaaatgtcagtgtcca
gagggtcttacactggatgttaccggacgtctctgtgtggacgtacgtttggagccctgt
tacctgacgtatgatgaagacatgtgcacacagctggtgtctggacggtttcatatggat
gcatgttgctgtacagtgggtgtggcctggggcaaagagtgtgagttatgcccagagcct
ggcacacgccagtatgatgctctgtgcccgagaggaccaggctttgccaacaaaggagac
atgctcaccggcaaagatgtctataatgatatcaatgagtggaaagtgttcccaagcatt
tgcactcatggaaaatgccggaacaccattggaagcttcagatgtcgctgtgacagtggc
tttgcgttggatataaatgagctgaactgcacagatattgatgagtgtatgatctctcca
gatgtgtgtgctcatggcacatgtgtgaacacactggccagttttaattgtgactgtttt
tccggctatgagagtggccttatgatgatgaaggactgcatagatattgacgagtgtgag
ataaatccctcactgtgccatggcggaacctgtgaaaacactgatggcagctataagtgt
atgtgtccacctggtcatcaactgtccatagacagtagtgcctgtgaagatgtgaatgag
tgtgagctgagtgccacattgtgtcgtaatggcagctgtgtgaatgtggtggggacctac
cagtgctcctgtaactctggttaccaaacaacacctgatagaaaagggtgcacagatata
gatgagtgcactatagagaatggaggatgtgaagtttactgtaataattcagagggcagt
tacttctgcagctgtggtaagggttacacattgatgctggaccagcggacatgtgcagat
gtgaatgaatgtgaggagtatgttgacatctgtgagggtggtcagtgcactaatgtccct
ggagaatatcattgtctgtgttatgaaggattcatggtttctgtggacatgagggcatga
atcgatgtgaatgagtgtgaactcaacgctaacatctgtatgtttggagaatgtgagaac
atcaagggttcctttatctgtcactgtgagatgggttacttggtgaagaaaggaacctct
ggctgcactgatgttgatgagtgtgatattaacgcttataactgtgacatacacgccacc
tgtatcaacacacctggacattaccactgctcctgtaaagacggatgggcaggtgatgga
gtcaaatgtgctgatgtggatgagtgcactaacgggactcaggtgtgcagctctgatgct
cagtgtgtgaatacagcaggctcttaccactgcatctgctttgacggtttcactggagat
ggattcacctgctcagatatggatgagtgtgcagatgatgtagatctgtgtgaaaatggc
cagtgtctgaatgttcctggtgaatatcgctgtgaatgtgagatcggctttacacacact
gcaaacagcaaaacctgtcaagatatagatgagtgctctttccagaacatctgtgtgttc
ggcacatgtcagaatatgccgggaatgttccggtgtatctgtgatgatggttatgaaatg
gacaagacaggagggaactgcacagatgtggacgagtgtcttgatcccatcaactgtgtt
aatggtcactgtgagaacacggccggctcttatcagtgtaactgtcccattgactttgaa
ctcaaccttactggaatcgtctgtgttgacactagagcaggaaactgttttctagaggtg
gcgtatcttggccatggtaggctgacgtgtaacgttgaggcgggatttggagttagtcgt
tcgtcctgctgttgttctctgggacgagcgtggggtaaaccttgtgacctctgccctcct
gtcaacacctcggagtataatacactatgtcctggaggagaggggttcaaacccaacccc
atcaccataatcctggaagatatcgatgaatgtcaggagctgccgggcctctgtcagggt
ggaaactgtaccaatacgtttggaagtttccagtgtgactgtcccactggatatcacctc
aacatcgacaaccgtatctgtgaggatatcgatgagtgtgtgcacagttcgcgggtttgt
ggtccaggcacctgctacaacacactgggcaactacacgtgcgtgtgcccgcaggactac
atgcaagtaaacggaggaaacagccgcatggatatgaggaaaagtctgcgttaccgtagt
tacaatacgtccaactgtgaacaccagttgacctttaacaccacacagagactgtgctgc
tgtgcctacaatatgggcaaagcctggaataaaccctgccaggcctgcccaaccactggc
acaggtggctttcaaagtctctgtggcagtgtgactggatttaagattgatattgaaaca
ggaaaaccgaaagatattgatgaatgtcatgaaatcccaggcatctgtgctcatggtgtg
tgtatcaaccgtattggcagtttccgttgcgagtgtccgaccggcttcagttataatgac
ctgctgctcatctgtgaagacattgatgagtgcagcagtggtgaacgtgtgtgtcagaga
tatgctgactgcatcaaccgtccaggcggctatcagtgtgaatgttctgatggttacata
ctctcacctaatggagaatgcactgaccgtaacgagtgtgtggagatgccaaatgtgtgt
catcatggagattgtgtggacataccaggagggtacgaatgtgtgtgtcagagcggcttt
acagcaacactaaaccgcagaatgtgcatggatgttgacgagtgctcatatcaaccatgt
gggaacggcacatgtaaaaactctgtgggctcttataactgtatctgtcatcctggattt
gagctcgcccataataactacagtacagatactgacgagtgttcagtgttttactctcag
ctctgcaggaacggccagtgtgttaataatgtgggatcctttcagtgcctgtgtaaagag
ggttttgaactcactctggatggcaagaactgtatagatattaatgagtgtagaatgatc
cctgggacatgtgcttctggaacatgtgtgaatctggatggatctttcagatgtgtgtgt
cctaaaggttatattgtccacaatgagcattgtgcagatgtgaatgagtgttcagaggag
cctggcatctgtatgtatggctcctgcttcaacagtctgggcagctttgagtgtgtgtgt
aaacctggatttgtgcagtcagaagataaacgccgctgttatgacactagagagagcttc
tgttttacactctttgaaaatggcaagtgctccataccacaggcattcaacactagcaag
gccaagtgctgttgtagtataatggctaaagagggctggggcgacccctgtgagctgtgt
cctaaagaacacaatgctggatttctggatctatgtccttttggtcatgggattgtttca
ggtgttggggacacatgcatcgatttgaatgagtgtgtggagaacccagagatatatgtg
aatggccgctgcatcaacacagatggctccttccgctgtgaatgtcccacaggctacaca
ctggacttcacagaaacaaactgtgatgatattgacgagtgttctgttggaaacccgtgt
ggaaatggcacatgctcaaatgtgattgggggatttgagtgtctctgtaaggagggattt
gagcctggaccagtgatgagctgtgaagatgtgaatgaatgtggtcagaatcctctactc
tgtgcgtttcgctgcattaatacttttggggcgtatgaatgtagctgcccacccggttac
acactgcgagaggacagacgtatgtgtcaggatgtggacgagtgtgcagcagatcttcat
aactgtgactccagaggaatggagtgtaagaacttaatcggcaccttcatgtgtgtgtgt
ctagccgggatgattcacaggatgaatgaggaggtgtgtcaagatgaaaatgaatgtcta
actcaaactggtgtttgtgagaatggccgatgtgtgaatactgtgggcagctacacgtgt
gagtgcgctgttgggtttaaactcgactctacggccacacaatgcctcgattacaggaaa
gggttctgctttactgatgttctgcacaccatgtgtcagatgtcgtccagcagtcgtgct
gctgtcagcagatctcagtgctgttgtcatggaggtcgggggtggggtaaccagtgtgag
ctatgccctctgcctgcctctgccaactacaagaaactgtgcccatacgggccgggatat
gcaactgatggaacagatatagatgagtgcaaggtgattccaggtgtttgtgtgaatggt
gtgtgtatcaatatcatgggctcttacagatgtcactgtgaagcaggatacacagcctct
gctgcaggatctgcatgtgttgatgtagatgagtgtggtatgtcccccaaaccctgtaac
ttcatgtgtaagaacacagatggcagctacatgtgctcctgtccgcggggttacacgcta
caggacgacagcaggacatgcaaagatgtggatgagtgtcagagcagacgacacaactgt
catttttcatgtgtgaacaccattggtggatttaactgcaaatgccctgcaggcttcagc
cagcaccacacttcctgtagagatatcaatgagtgtgtgtcagatttgagtgtgtgcggc
ttgcggggcatctgtcacaattcagcaggcagcttcagctgtgagtgtgcacagggcttc
agtctggactcgagtggacttaactgtgatgatatagatgagtgtgcaagtgatcagagg
tgtcagtttggttgtcagaatgttgcaggtgggttccgctgcagctgtccacagggctac
acacaacaccagcaatggaaccaatgtgtggatgagaacgagtgttcgaacccacgccgc
tgtggctctgcatcctgtttcaacacgctgggaagttttaagtgtggctgtccttctgga
ttcaccttcgaccccatgtccatgaactgtgcatttgtggacgagtgtgtgtcgtttgag
aagccctgcaggtacggctgctcgaacacacagggcggattcatgtgcggctgccccgcg
ggctataacagagcaggacatggacactgtgtatctactgctggttttggacgggttggg
tttgaatctacagctggaatcagaccagaagaagacaacagtctttcaaatactcaccag
aacaaaactgtgggaagaagacacacttcaaactttacactgccacaacagttcatgcag
gaagttcatctctccagtatggatgtgaatcagccatttaaattacagctgaacaactcc
gaagttaatcccagtgcacccatccttaagctgctgcctgccgtcagagcgctcgcacaa
catgtcatgtacaccatcaccgccggcaaccacgatggattcttccagatcagacagcgc
gcaggaagtctcctgtcagacactacagactga
DBGET
integrated database retrieval system
