Marinomonas sp. THO17: THO17_15230
Help
Entry
THO17_15230 CDS
T10670
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
math Marinomonas sp. THO17
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
math00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
math02000
]
THO17_15230
Transporters [BR:
math02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
THO17_15230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFM49360
LinkDB
All DBs
Position
complement(1648257..1649672)
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MPNSAKLTQGSTFKHVVTMSVTSALGLMCMFLVDLVDMLFLSMLGEKEAVAAVGFASTIM
FFTVSLSIAVSIAATALVSRAIGEHNIELAKRRAVNVLAFGILFSSAVVWFLWPKIPHLL
LFIGANGRALDLATSYLQILILGMPAVMIGMIGSGIMRALGDAKRAMYATMVGGLVNAVL
DPIFIFALGLGVDGAAIASLFARCSMVVVAYYGVVQVHKMLGEFDLMDFFKDTRSIAMIA
VPAMLTNLSSPLANAIVMEHTSSFGDDAVAAVAIIGRIIPVVFGGLFALSGAVGPILGQN
YGAGRFDRMYQTVSSAVIYALGYCVLLCWVLYVSQDWLVVVFNASSGTADLIRFFATFVS
FSFFFQSLLFIAIATFNNLGRPLNSTMLNFGRATLGTWPLIIVFSWFMGAEGILFGQAIG
SVIFGCVGFYTARKYIVELEQRYEESKSSSGTTSTREVMPSGASTGFDELI
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaattcggccaaactcacacaaggttctacctttaagcatgttgttaccatgtcg
gtgaccagtgcattgggtttgatgtgtatgtttttggtggatttagtcgacatgcttttc
ttatcaatgttaggtgagaaagaagctgttgcggcagtgggttttgctagcacaataatg
ttttttaccgtttccttaagtatcgcggtatccatagcggcgacggcattggtttctcgt
gcaataggtgaacataatattgagctggcaaagcgccgtgcggttaatgtgctggcattt
ggcattttattttcatctgctgtggtatggtttttatggcctaaaatccctcatcttctg
ctgtttattggtgctaatggacgtgctcttgatttggcaaccagctatttgcaaatccta
attttgggcatgcctgcggtcatgattggtatgattggctcaggcattatgcgtgcgtta
ggagacgctaagcgtgcaatgtatgccaccatggtgggtggtttggtaaatgcggtgctt
gaccctatttttatttttgctcttggtcttggggtggatggtgctgcaattgcatcttta
tttgctcgatgttcgatggtagttgttgcttattatggtgtggtacaagtacataagatg
ctcggtgagtttgatcttatggacttttttaaagatacccgcagcattgccatgattgct
gtgccggccatgttgaccaatttatcttcgccattagccaatgctattgtgatggaacat
acttcgtcgtttggtgatgatgcggttgctgcagtggctattattggtcgtattattcct
gttgtatttggtggtttgtttgctttgtctggtgcagttgggcctattcttgggcaaaat
tacggggcaggacgcttcgatcgtatgtatcaaacggtttcgagtgcggttatttatgca
ttaggctactgtgtactgctttgctgggtgctttatgtttcacaggactggttggtggtg
gtgtttaatgcttcctctggtacagcggatttgattcgcttcttcgccacttttgtgtcc
ttcagtttcttttttcaaagtctattgtttattgctattgcgacctttaataatctaggg
cgtccgttaaacagtactatgttgaattttgggcgggcaactttggggacttggcctctt
attattgtgttttcttggtttatgggagcagagggaattttgtttggccaagcaattggg
tcggtgatatttggctgtgtcggattttacacggcgcgaaaatatattgttgagcttgag
cagagatatgaagagagtaagtcatcttctggaacgacttcgactagagaggttatgccg
tctggtgcttcaactgggtttgatgagttaatttag
DBGET
integrated database retrieval system
