Candidatus Marifrigoribacter sp. Uisw_064: ABXT64_00945
Help
Entry
ABXT64_00945 CDS
T11557
Symbol
menD
Name
(GenBank) 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase
Organism
maui Candidatus Marifrigoribacter sp. Uisw_064
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPP_enzyme_N
TPP_enzyme_C
TPP_enzyme_M_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOK01934
LinkDB
All DBs
Position
complement(212455..214119)
Genome browser
AA seq
554 aa
AA seq
DB search
MKFSNKILSQTITQLCLINEVNTVVISPGSRNAPLTIGFTENTSFTNYSIVDERCAAFFA
LGLAQQSKQAVALVCSSGSALLNYFPAIAEAFYSDIPLVIISADRPSHLLEIGDGQTIQQ
ENVFGKHILYNANCREGELFQKENELEISKALQIARNKKGPVHINAPFSEPLYDTVDSLQ
IKINSSFFEKLIDPIKEDLSDYFPIWNQAKKKLVLVGVLDPNSIEQNILDQLIEDDSVIV
FTEATSNLHHKGCINSIDQLIAPFNDANFELLRPELLLTFGGMVISKKIKSFLRTYPPKH
HWHINDKRAYDTYFVLSKHFKMSPSSFLEDMLSNTQMLKSDYRDSILALKGHRLGLHKKY
IEQIPFSDFKAFSTVFNHIPSNYQLQLSNSATIRYAQLFDLDATLQVFCNRGTSGIDGCT
STAIGAAITSNKATVFITGDLSFLYDSNALWNQYIPKNFKIIVINNGGGGIFRILPGKKD
TDNFETFFETKHHLTAEKLCEMYALNYSSISDENNLEKNVSSFFENNEHPCVLEIFTPST
INDQVLLDYFKFIK
NT seq
1665 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattttcgaataaaattttatctcaaacgatcacacaattatgccttattaatgag
gtcaatactgtggtaatttctccaggttcaagaaacgcacctttaacaattggttttact
gaaaatacatcatttacaaattatagtatagttgatgaacgttgtgcagctttttttgct
ttaggtttagcacaacaatcaaaacaagcagttgctttagtttgttcttcaggttcagcc
ttattaaactattttcctgctattgcggaagctttttatagcgatattcctttagtgata
atttctgcagaccgtccaagtcatttacttgaaataggagatggacaaacgattcagcaa
gaaaacgtttttggaaaacatattttatataatgcgaactgtagggaaggagaacttttt
caaaaagaaaatgaattagaaataagtaaagctttacaaattgccagaaataaaaaaggc
cctgtacatatcaatgcaccattttcggagccgctttatgatactgtagactcattacaa
attaaaattaacagctctttttttgaaaaattaatagacccaattaaagaagacttatct
gattattttccaatttggaatcaagctaaaaagaaacttgtcttagtaggtgttttagat
ccaaatagtattgaacagaatattctagatcaattaattgaagatgatagcgttattgtg
tttacagaagccacatcaaacttacatcataaaggttgtattaattctattgatcaatta
atcgctccgtttaatgacgctaattttgaactattacgaccagaacttttattgactttt
ggaggaatggtaatttcaaaaaagataaaatcatttttacgaacctatccacccaaacat
cattggcatattaatgataagagggcttatgatacttattttgtgttatctaaacatttt
aaaatgtctccttcctcttttttagaagatatgctgtctaatacacaaatgcttaaaagt
gattatagggatagtatactggctttaaaaggacatcgtttgggccttcataaaaaatat
attgaacagattcctttttcagactttaaagctttttctacagtttttaatcatattcca
tctaactatcaattacaattaagtaatagtgctaccattagatatgcacaattatttgat
ttagatgctactttacaggttttttgcaatagaggaacaagtggaatagatggttgtact
agtacggcaattggagcggctataacttcaaataaagcgactgtttttattacaggtgac
cttagttttttatacgacagcaatgctctttggaatcaatatattccgaagaattttaaa
atcattgtaatcaataatggaggtggaggtatttttagaatattaccgggtaaaaaggac
actgataattttgaaaccttttttgagacaaagcatcaccttactgccgaaaagttatgc
gaaatgtatgccttgaattattcttcaatttcagatgaaaataatttagagaaaaatgtg
tcatcattttttgagaataatgagcatccttgtgtattagaaatattcactccaagtaca
attaatgatcaagttcttttagattactttaagttcattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system