Labilibaculum antarcticum: ALGA_0089
Help
Entry
ALGA_0089 CDS
T05376
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mbas
Labilibaculum antarcticum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mbas00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mbas02000
]
ALGA_0089
Transporters [BR:
mbas02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ALGA_0089
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
DUF2969
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAX78484
UniProt:
A0A1Y1CDS5
LinkDB
All DBs
Position
complement(127058..130099)
Genome browser
AA seq
1013 aa
AA seq
DB search
MLMLTFDMYGQEIQVQGKVVSIEDNLSIPGASVVVKGTTIGTITDIDGYYSIKANKGEIL
IFSFMGMEALEKTISGAKLDVALQPQLYNLNEVIAIGYGTQRKKEISGAVVQVKAEELGK
ISTSDLGSALQGVVAGVSVQASSGAPGAASNIQIRGVSSINGQNSPLFVVDGIPQESDPR
LGNSEIETVDILKDAASCAIYGTRGAAGVILITTKQGKAGEMKISLNSYYGIQKITSGIE
LLNFEDYLYQFVTSKTHLDPATSTDKIWTSLENSTDNFTNNTSIVNTIENDNATIQNHSL
NISGGKQGLTYNVVGSLFKQEGTLINSNYERANVRANTSYKKGKWTIRTGLGFRVEEQAY
ASWNLLYEAYKYKPYQAPLDPNAVSFSGAGTLGNDQQQLGTIMAKLKQTDVRNGEQFNGN
ININLEVTEGLNLTASGSVLYGNNTRVLTNPLFKVYDDDGVLILNPNTRSGVKNTSDRNT
SFTWDAGANYEKRFGDHQIKLLAMGSAEKYTFTSFWASGQDITSNEVQNLGQTTAEPSVG
IGNGYNQNRTNSLVGLLARFQYDYKGRYLLSVSARHDGSSRFGEDYRWGTFPSASVGWNV
SDENFWQGLSSTVNSFKLRGSVGTTGNQSFQDYSNAATISSGYDYPFGTDANPTMALGGV
QTGFANPDVQWETSFQKNIGVDLGLFDNKLTVSADYYDTSKKDLLFPLLIPTAAGAGQNQ
SVILNVGDMTNKGVELAVGYRKHGKFTWAVNATYSKNVNEVTKMTGSNPIAYFSNGNPVN
ISGNSDKITVIREGYEAGAYMVMETNGLANTEEKLAAYQKINSGAEMGDLIYVDQDGNNV
IDEADRVYGGSGTPEFEIGLNFNCDYKGIDFSMQWFGSFGQEVINGSKIFAYTAGTHKDL
LYQWTEANPYGVIASNRGGSHDNYRAWADTWIEDGSFVRLRNVTIGYTMPKNVINKIGVS
KLRFYIAADNPLTLTKYTGYDPEVGNDGLATRGLDKGNYPISSQYRAGIQLDF
NT seq
3042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaatgttgacctttgatatgtatggtcaagaaattcaagtccaagggaaggtggtt
tctattgaagacaacctgtctattcctggtgcaagtgtcgtagttaaaggtacaactata
ggtacaattactgacattgatggatattacagtattaaagctaataaaggagaaattctt
atttttagttttatgggaatggaagcgttggaaaaaacgatttctggtgctaaacttgat
gttgccttgcaacctcaattatataacttgaatgaagttattgcaattggttatggaact
caaaggaaaaaagagatttctggtgctgtagttcaggtaaaggctgaggagttggggaaa
atttcaacctccgatttaggttctgctttacaaggagtggttgccggggtaagtgtacag
gcaagttctggtgcgccaggtgctgcttcaaacattcagattcgtggtgttagttctatc
aatggacaaaattcaccactttttgttgtggatggaattcctcaggagagtgatccaagg
ttgggtaatagtgaaatcgaaacagtggatatcctaaaagatgctgcgtcttgtgcgatt
tatggtactcgtggtgctgctggtgttattttaataacaaccaaacaaggtaaggctgga
gaaatgaaaatttccttaaatagttattatgggattcagaaaattacttcaggtattgaa
ttacttaattttgaagattatctttatcaatttgtgactagcaaaactcatttagatccg
gctacctcaactgataagatttggacttcattggaaaattctacagataactttacaaat
aacacaagtattgttaatacgatagaaaatgacaatgctacaattcaaaatcacagtctt
aatatttctggtggtaagcagggtttaacttataatgtagttggatctttgtttaagcaa
gagggtacgttaattaattcaaattatgaacgtgcaaatgttagagccaatacttcttat
aaaaagggtaaatggacgattagaacaggtttgggttttagagttgaagaacaagcttac
gcttcgtggaatttgctttacgaagcatacaagtataagccttatcaagcccctttagat
ccaaatgcagtttctttctctggtgcaggaacattaggtaatgaccagcaacagttggga
actattatggctaagttaaaacaaactgatgttcgtaacggagagcagtttaatggtaat
ataaacattaatttggaggtaacggaaggattaaatctgactgcttcaggaagtgtttta
tatggtaataatacaagggtgttaacaaatcctttgtttaaggtttatgatgatgatgga
gttttaattttgaatccaaacacacgttctggtgttaaaaatacaagtgaccgcaataca
agttttacttgggatgcaggagctaattacgagaagaggttcggagatcatcaaatcaaa
ttattggccatgggttcagccgaaaaatatactttcacaagtttttgggcttcaggacaa
gatataaccagtaacgaagttcaaaatttgggtcaaacaacagctgagccatcagtagga
attggaaatggttataatcagaatagaacaaattcacttgtcggattattagctcgtttt
cagtacgattataaggggcgttatttattaagtgttagtgctcgtcatgatggatcatca
cgatttggtgaggattatcgttggggaacttttccttcagcatctgtaggatggaatgtt
tcagatgaaaatttctggcaaggtttaagctcaacagttaattcatttaagcttagaggt
agtgtcggtacaacaggtaatcagagtttccaagattacagtaatgccgctacaattagt
tctggatatgattatccatttggtactgatgctaatcctactatggcattaggtggcgtg
caaacaggttttgctaaccctgatgtacaatgggaaacttcttttcagaagaatatagga
gttgatttaggattgtttgataataaattgacagtgtctgctgattattacgatacaagt
aaaaaggacttgttatttccattgttgattccgacagcagcaggagctggtcaaaatcag
agtgtgatccttaatgttggtgatatgactaataaaggagttgaattagcagtaggttac
agaaaacatggaaaatttacttgggctgtaaatgcaacttattctaaaaatgtgaatgag
gttaccaagatgacaggatcaaatccgatcgcgtatttttcaaatggtaaccctgttaat
ataagtggtaacagcgataaaattactgtaatacgagaaggttatgaagctggagcgtat
atggtaatggaaaccaatggtttagccaataccgaggagaaattagcagcctatcaaaaa
attaattctggtgctgaaatgggtgatctgatttatgtggatcaggatggtaataatgta
attgatgaagccgatcgtgtttacgggggtagtggtactcctgaattcgagataggttta
aactttaactgcgattataaaggaattgacttctcgatgcagtggtttggatcttttgga
caagaggttataaatggatcgaaaatatttgcttacacagcaggtacacacaaagatctt
ttataccaatggactgaagctaatccttatggtgttatagcgtcaaacagaggtggtagt
catgataactatcgtgcttgggctgatacttggatagaggatggatcttttgttcgttta
cgtaacgttactatcggatatactatgcctaagaatgtcattaataaaataggtgtatcg
aaattaagattttatatagctgctgataatcctttgactttgacgaaatatacaggatac
gatccagaagttggtaatgatggattggctaccagaggtttggataaaggtaactatcct
attagttctcaatacagagcaggtattcagcttgatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system