Labilibaculum antarcticum: ALGA_4262
Help
Entry
ALGA_4262 CDS
T05376
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
mbas
Labilibaculum antarcticum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mbas00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mbas02000
]
ALGA_4262
Transporters [BR:
mbas02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
ALGA_4262
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAX82553
UniProt:
A0A1Y1CRD9
LinkDB
All DBs
Position
complement(5472398..5473762)
Genome browser
AA seq
454 aa
AA seq
DB search
MDRNSKNVRELESASIKSLLWKYFLPAFTGVVINSLYNVVDRIFIGQGVGAIALSGLSAV
FPIMLIMMAFGMLIGIGAGVRVSINLGKKDFGRAEWVLGNSFVLMIIVSVIITVIGFSIK
DPLLRMFGVGDDTMSVANEYLNIILYGAIFSVVGFSLNNLIRSEGNAKIAMYSMLISAGT
NVILDPIFIFVLDMGVAGAAYATIISQFILCIWVIRHFLGPKSIIKLRLVNFKLNWQIVF
YILTIGFAPFTMQLAGSFVQALFNIQLVEYSNDIAIAAMGIINSIAMLIVMTVVALNMAA
QPIFGFNYGAQNYARVKECLILCMKAATGIVIVGFLGVQLFPELIVKAFNNSNAELLQVG
SHGLRIILLALPIVGFQVVVGNYFQSIGKAGISVMLTLMRQVILLIPILFILPTYFGLNG
VWFASPISDVGSAIVSGAFLIRELRKLNRKIELQ
NT seq
1365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataggaatagtaaaaatgtgcgggaattggagagtgcgagtatcaagagcttgctg
tggaagtattttttacctgcttttaccggggtcgttattaattccttgtacaatgttgtc
gatcgaatttttattggtcaaggggttggggcaatagccttatcaggcctaagtgctgtg
tttccgataatgctcatcatgatggcatttggaatgcttattgggattggtgcaggagtc
cgggtctctattaatcttgggaaaaaagattttggaagagccgaatgggttttgggaaat
tcatttgttctcatgattattgtttctgttattattactgtaattggattttcaataaag
gatcccttacttaggatgtttggagtgggagatgataccatgtctgtagccaatgaatat
ctgaatatcattctttacggagcaatttttagtgtggttggtttttcactcaacaacctg
atccgttccgaaggaaacgccaaaatagcgatgtattctatgctgattagtgcgggtaca
aacgtcatattagatcccatctttattttcgttttggacatgggggttgccggagcagct
tatgctactatcatctcacagtttattctttgtatatgggtaattcgccattttttagga
cccaaatccataattaagcttcgattggtaaattttaaattgaattggcagattgttttt
tacattttaacaattggcttcgctccatttaccatgcaattggcaggtagttttgttcag
gcattatttaatattcagttggttgagtatagcaacgatatcgccatagctgcaatgggt
ataattaactctattgccatgctgattgtaatgactgtggtggctttgaatatggcggca
cagcccattttcggctttaattatggggcgcaaaattacgccagagttaaagaatgtttg
atactttgcatgaaagcggctacaggaatcgtgattgttggttttcttggggtgcagtta
tttccggaattaattgtgaaggctttcaataattccaatgcagaactattacaggttgga
tctcacggtttacggattatattgcttgctctgcctattgtaggttttcaagtagttgtt
ggaaattattttcaatccatcggaaaagcaggcatttcagttatgctaacattaatgcgt
caggttattttgttaatcccaatcctttttattcttcccacttattttggtttaaatggt
gtttggtttgcgagtccgatatctgatgttggttcagccattgtgtcgggtgcatttctg
ataagagaattaagaaagttaaatcggaaaattgaacttcaataa
DBGET
integrated database retrieval system