KEGG   Mycoplasmopsis bovis Hubei-1: MMB_0610
Entry
MMB_0610          CDS       T01568                                 
Symbol
hsdR
Name
(GenBank) Type I restriction-modification system endonuclease subunit
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
mbh  Mycoplasmopsis bovis Hubei-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mbh00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:mbh02048]
    MMB_0610 (hsdR)
Enzymes [BR:mbh01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     MMB_0610 (hsdR)
Prokaryotic defense system [BR:mbh02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   MMB_0610 (hsdR)
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 T1R_D3-like ResIII HSDR_N DEAD AAA_22 DUF7383 DUF4376 EHN
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEI90322
LinkDB
Position
complement(721440..724637)
AA seq 1065 aa
MQYKREKDFEDDVVNCLREYGWKGFPDKSNPSKQYNVILGNVTEKDLIENWKNILYENNK
DILNGIELSNDEMNQVIQKVQNCQNFVDTNTLINSEYIGITRTNKLDSKMLNKEIQLKIF
KRRDINVGESIYQIARQVKTNLLDDEKERRSDVILLINGMPLIHIELKNSGENILKAITQ
IKNYSKIGFYKNGIFKLIQVVVAMKPNEMMYMPSTNNYEHIVAERFLKWTDQDNKLISDW
KKIIENVFRIPNAHRMIADFTIADVADHTLKVLRSYQIHAVNKVQNKFFANDFFKNTPSK
RSHKGGYVWHATGSGKTLTSFKLATLLLEWNQADIVVFVVDRIELGTQTKDAFKNFNSSG
QIEVSEAANTNDLIKQLSTTSESIKYKLIITTINKQANIDKDFYDRQLAEIAKKRVVFIF
DEAHRSTHGDMFKYIIESNPNAVVFGFTGTPIFDKNLKAGLTTEANFGPLLHKYTMKSGI
EDKKVLGFNCEYKFLDKVLLPAIKKLDKSEGSICSDNANAEIKLNSLKNLINVKDDELLK
FEENIYRKIKDDDLYKEQVVNEILKDWKRKNIDNDFSAIFATSSIKDAIRYYEIFSQKIS
ETGSSVKFTALFDSSTDISKDANNPSKGLIKDEKIKQIIARYNQDFNTKFDENNPNSHAN
FKVDIQNRLARKYNHKNLSKDLKLDILIVVEQLLTGYDSKYINTVYFDKTMAFENLIQAI
SRTNRNYNANLKPYGNVVFFKQPGRMKWNMQEALAEYADFDPGMAMPKSLEYFYTKINES
FLNIQNIFSKWGFVNFESVPEVSDINETDPETLANLKAFLSNFQKIRRNLTSAQILGFDW
DDNKNDIVLTKDQYELIWARIKDIDFSKFKIATENEEEMFLILELADVDNSTFNITVNND
YLNALLFEIKKSRISKSNDELHYEKSDSWSELEQKYIRKYPMEYQYLARECINEVLANND
SFNEFDLNSCVCEKISKKYNDDIENFAQQMNIDSVKLRKIINSNDPINVNGRLNDLCDDK
LEENVKLIIANELGKANANDIKQGQYRKHIKDFIIKLRNSKYRVI
NT seq 3198 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaatataaaagagaaaaagattttgaagatgatgtggttaattgcttgcgcgagtat
ggttgaaaaggttttcctgataagtctaatccatctaaacaatataatgttattttgggt
aatgttactgaaaaagacttaattgagaactgaaaaaatatattgtatgagaacaataag
gacatcttaaacggtattgaattgtcaaatgacgaaatgaatcaagtaattcaaaaggtg
caaaattgtcaaaattttgtagatactaacacacttattaatagcgaatacattggcatt
actagaactaataaacttgattcaaaaatgttgaacaaggagattcaactcaaaatattt
aaaaggcgtgatattaatgtaggtgaaagcatttatcaaattgcaaggcaagttaaaacc
aatttattagatgatgaaaaagaaagaagaagtgatgtaattcttcttattaatggtatg
ccattaatccatatagagcttaaaaacagtggcgaaaatatacttaaggccataacccaa
attaaaaattactctaagattggcttttataaaaatggcattttcaagttaatacaagtt
gtagtagcaatgaagcctaatgaaatgatgtatatgcccagcacaaacaattatgaacat
attgttgctgagagatttttgaaatgaactgatcaagacaataagttaattagtgattga
aagaaaataattgagaatgtatttagaattccaaatgctcacaggatgatagcagatttt
acaattgccgatgttgcagatcacaccttaaaagttttaagaagctatcaaattcacgct
gttaataaagttcaaaacaagttttttgctaatgattttttcaaaaatacaccaagcaaa
agaagtcataaaggcggttatgtttgacatgcaactggttctggtaaaacattaactagt
ttcaaactagcaacattattattggaatgaaatcaagctgatattgtagtttttgtagta
gatagaattgaactaggcacacaaacaaaagatgcttttaaaaactttaattcatcagga
caaattgaagtttctgaagctgctaatacaaatgatttaataaaacaattatcaacaaca
tctgaatcaataaaatacaagctaataattacaacaattaataaacaagcaaatattgat
aaagatttttatgataggcaattagctgaaattgctaaaaaaagagttgtatttatcttt
gatgaagctcacagatcaactcatggagatatgtttaaatacataatagaaagtaatcca
aatgcagttgtttttggctttacaggaaccccaatttttgataaaaatttaaaagcagga
ttaacaacagaagctaacttcggtccacttttgcataaatatacaatgaaaagtggtatt
gaggataagaaagttttaggttttaactgtgagtataagtttcttgacaaggttttactc
cctgcaattaaaaaattagataaatctgaaggcagtatatgcagtgataatgcaaatgca
gaaattaagctcaatagtcttaaaaatttaattaatgttaaagatgatgaattattaaaa
tttgaagaaaatatttatagaaaaattaaagatgatgatttgtataaagagcaggttgta
aatgaaattttaaaagattgaaaaagaaaaaatattgataatgactttagtgctattttt
gcaacaagtagcatcaaagatgctattaggtattatgaaattttttcccaaaaaatcagt
gaaacaggctcatcagtaaaatttacagctctttttgattcttcaaccgatatttctaaa
gatgccaataatccttctaaaggattaattaaagatgaaaagataaagcaaataattgct
agatacaaccaagactttaatactaaatttgatgaaaataaccctaatagtcacgctaat
tttaaagtagatattcaaaatagattagctagaaaatataaccacaaaaatttaagcaaa
gatcttaaattagacatattaattgttgttgaacaattattaactggttatgattcaaaa
tacattaacacagtttattttgataagacaatggcttttgaaaacttaatacaagctatt
tctagaacaaatagaaactataatgcaaatttgaaaccatatggcaatgttgtgttcttt
aagcagccaggaagaatgaaatgaaatatgcaggaagcattagctgaatatgcagatttt
gaccctggcatggccatgcctaaaagtttagaatacttctatacaaaaattaatgaatca
tttttaaatatacaaaatatatttagcaaatgaggttttgttaactttgaatcagtgccg
gaggtatctgatatcaatgaaacagatcccgaaactttagctaatttaaaagcgttttta
tctaattttcaaaaaattagaagaaatttaacatcagcacaaattttaggttttgactga
gatgataacaaaaatgatattgttttaacaaaagatcaatatgagctaatttgggcaaga
attaaggatattgacttttctaaatttaaaatagctactgaaaatgaagaggagatgttt
ttaattttagaattagctgatgttgataattctacatttaatattactgttaataacgat
tatttaaatgcgttgctatttgaaattaaaaaaagccgcatcagcaagtctaatgatgag
ttgcattatgaaaaatctgattcctgaagtgaattagagcaaaagtacattcgcaagtat
cctatggaatatcaatatctagctagagaatgcataaatgaagttcttgcaaataacgat
tcattcaatgaatttgaccttaatagttgtgtatgtgaaaagatttcaaaaaagtacaat
gatgatattgaaaattttgcacaacaaatgaatatagattcagttaagttaagaaaaata
ataaactctaatgatccaattaatgttaatggcagattaaatgatttatgtgatgataaa
ttagaagaaaatgttaagttaatcattgccaatgaattagggaaagccaatgctaatgac
atcaagcaaggccaatatagaaaacatattaaggactttattataaaactgagaaattct
aaatatagagttatataa

DBGET integrated database retrieval system