Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_01205
Help
Entry
CO229_01205 CDS
T06002
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
mboh
Mycoplasmopsis bovirhinis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mboh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mboh03032
]
CO229_01205
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
CO229_01205
Enzymes [BR:
mboh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
CO229_01205
DNA replication proteins [BR:
mboh03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
CO229_01205
DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
CO229_01205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
DUF5791
SHS2_Rpb7-N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO30737
LinkDB
All DBs
Position
274792..277404
Genome browser
AA seq
870 aa
AA seq
DB search
MQSKFDDEETKKKQLEFEYDHDEYKRVVFKDEIIDQDNSEDDEEAPQNKDDYFAEPQLIS
EPVDGLKPVVVDEEMKTSFLEYAMSVIVSRALPDARDGLKPVHRRILYDMFELGITPNSQ
HRKSARIVGDVLGKYHPHGDLSVYEAMVRMAQDFSMRYPLVDGHGNFGSIDGDQAAAMRY
TEARMTKLSNELLEGIKKDTVDFVDNYDATEQEPVVLPAKFPNLLVSGASGIAVGMATSI
PPHNLKEIINATIALAKNPEISTQELMKSVIGPDFPTGGIILGTKGILDTYKTGRGSIIV
RSKTQIVENANGKAKIIVTEIPYAIKTSTIIKKIVELVKEKIINGIADIRDETNLNGIRI
VLDIKKGFSANIILNQLFQKSDLQTSFNSNLVALVNGEPKTLSLKQALNVYLDHQKEVFT
RRLNYDLAKAQEKVHILEGLKVAILNIDEVIAIIKASKTDQIAQEKLMARFEFTERQTKA
ILDMSLRRLTALNYEKMVNEINELYLEINGYQEILSSETKLINLIIEELSIIRDKYADER
RTAIDYYGVGKINDEDLIPKKEIVITASINGYVKRINLEEYSTQRRGGVGSSSMKTYDDD
DISLILKASTHSDLLLFSNFGKAYALRGYQIPQASKQSKGQPFINVLENLNVLQGEKIIS
IINVDSFSDDLFLTTITKKGIFKKTPLSLFANVRRSGILAFKLQDNDQLVRAFIATAGDN
ILVANNHKNIALFNIDSVRALGRNSLGVKAIKLLEDQYVINASSNKDGNLIFSLGSKGFG
KITHESQYRITKRGAKGVLGINIEKSGHLVFASFVNIEDELLIITSSGNTIRIQINQIPQ
SSRNTKGVKVINLKNNDQIVAVEVLKNINN
NT seq
2613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagtcaaaatttgatgatgaagaaactaagaaaaaacaacttgaatttgaatatgat
catgacgagtacaaaagagtagtttttaaagatgaaataattgatcaagataatagtgag
gatgatgaagaagctccacaaaataaagatgattattttgctgaacctcagctaatatct
gagccagtagatggactcaaacctgttgttgttgatgaagagatgaagacatctttttta
gagtatgcaatgagtgttattgtatctcgggctcttccagatgcaagagatggactaaaa
ccagtacaccgtagaattctttatgatatgtttgaacttggaattactcctaactcacaa
caccgtaaaagcgcaagaatagttggagatgttttaggtaaataccacccacatggtgat
ttatcagtttatgaagcaatggtacgtatggcgcaagatttttcaatgcgttatccttta
gttgatggacatggtaactttggttcaattgatggtgatcaagctgcggctatgcgttat
actgaagcaaggatgactaagctttctaatgaactcttagaaggaatcaaaaaagatact
gttgactttgttgataactatgatgctactgagcaagagccagtagttttacctgctaaa
ttccctaacttattagtttcaggagcttcaggaattgcagtgggaatggctacttctatt
ccacctcataatttaaaagaaataattaatgcaacaattgcattagctaaaaaccctgag
atttcaacacaagaactaatgaaaagtgttattggtccagattttcctaccggtggaatt
atcttaggtactaaaggaattttagatacatataaaacgggtcgtggaagcattattgtt
agatctaaaacacaaattgtcgaaaatgctaatggtaaagctaagatcatcgtaactgaa
attccttatgcaattaaaactagcacaatcattaaaaaaattgttgagttagttaaagaa
aaaattattaatggaattgcagatattcgggatgaaactaatcttaatggaattagaatt
gttttagatattaaaaaaggatttagcgcaaatattattttaaatcagcttttccaaaaa
tctgacttgcaaacatcttttaactccaacttagtagctttggtaaatggtgaaccaaaa
actttaagtttaaaacaagctttaaatgtttatttggatcaccaaaaggaagttttcacc
cgtagacttaattatgatttagcaaaagcacaagaaaaagttcatatcttagaaggatta
aaagttgcaattttgaatattgatgaagttattgcaattattaaagcttcaaaaacagat
cagatagctcaagaaaaattaatggctcgctttgaatttacagagcgacaaactaaagct
attttagatatgagtcttcgtcgtttaacagccttaaactatgaaaaaatggttaatgaa
attaatgagttatatcttgaaattaatggttatcaagagattttatcatccgaaacaaaa
ctaattaatttaattattgaggaattaagtattattcgtgataaatatgccgatgagcgc
cgcactgcaattgattattatggtgttggaaaaattaatgatgaagatttaatccctaaa
aaagaaattgtcattactgcttcaattaatggatatgtaaaacgtattaaccttgaagaa
tattcaacacaaagacgtggcggagtaggttcttcaagtatgaaaacttatgatgatgat
gatatctcgttaatcttaaaagcatcaacacattcagatttattattattttctaacttt
ggtaaagcttatgcattaagaggataccaaattcctcaagcttcaaagcaaagcaaggga
caaccatttattaatgttttagaaaatttaaatgttttacaaggtgagaaaattatctca
attataaatgttgatagttttagtgatgatttatttttaactacaattactaaaaaaggt
attttcaagaaaacacccctatcattatttgctaatgtgcgccgttctggaattttagct
tttaaattgcaagataatgatcaattagtaagagcatttattgcaactgctggagacaat
attttagttgctaataaccataaaaacattgctttatttaatatagattcagtaagagct
ttaggccgtaattctttaggtgttaaagcaattaaattattagaagatcaatatgttatt
aatgcttcatctaataaagatggaaacttaattttttctttaggttcaaagggttttgga
aaaataactcatgaatcacaataccgtattactaaaagaggtgctaaaggtgttttagga
attaatattgaaaaatctggtcatttagtttttgcttcctttgttaatattgaagatgaa
ttattaattattacttcaagtggtaatactataagaattcaaattaaccaaattccacaa
agttcaagaaacacaaaaggtgtaaaagtaattaatttaaaaaataatgaccaaatagta
gctgttgaagtacttaaaaatattaataactaa
DBGET
integrated database retrieval system
