Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_01975
Help
Entry
CO229_01975 CDS
T06002
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mboh
Mycoplasmopsis bovirhinis
Pathway
mboh03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mboh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
CO229_01975
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mboh03021
]
CO229_01975
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
CO229_01975
Enzymes [BR:
mboh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
CO229_01975
Transcription machinery [BR:
mboh03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
CO229_01975
DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
CO229_01975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
IFN-gamma
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO30874
LinkDB
All DBs
Position
472709..477139
Genome browser
AA seq
1476 aa
AA seq
DB search
MNNTPGKQKYNKEKVRRIILSLATKEDVLKWSHGEVTKAETINYKTYKPERDGLFDELIF
GPTIDFKCPICGTKYKKSDANTICSKTQQCKRYNPEILPKISRRSRMGHIHLHTPVVHFW
YFKIDHSVISNLLGLRIEDKGEKQVVSKSDLEKLIYYKSHIVLESGSLKSLKKNTIIDIN
RAATIYEAALEELKELNKDDEEASEVILESLYELREYAQSQDGKDFGIDFYQYNDIIKEY
SDAMIGTGSQAIEYLLTNFDIHKEQKLVQEQIDRINADIAKQRDVSSSKYQQRQKLYKRL
NIISSFIRSGQKPTDMLIYELPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNSRVGK
WHDTDAPMLIRQNEYRMVQEAVDALIDNARKKPTPVSSRDNHPLKSISDSLTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSARSVIVAGPSLKMYQVGMPRDIAAKIFEPYVIKSLIEKEDGITSIKTAKK
LIDNLDPRIWPYVNEAIKGRPVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLIRSKAIKLHPLVTTAFNA
DFDGDQMAIHVPLSEKAVREAQELMLASKNILGPKDGEPIINPSQDIVLGIYYLTLEKSG
EQVKGEGNYYHNYEEMIRAYERNDITLHTRVVLPIEALNKPQLLKQTNKPYIFSTVGKFI
YNQALPEDFEFIFGKYLETIYKKLSSGEIKTFTKEKIHTSVHDLDRYTLDYGDNFREIIA
NTQLNLALSKKDTAKIIHQIYKEYVSVITIEDLASVLNNVNKINYKDQIDALTNLIDYKG
NYLPLVHAKLINGFIAQEFDKYYFVNSNKDQLEWTLPEYTKALENVWFRYSNYVAEILDN
IKELGFHYSTISGITISMSDVKTADSTPEFIKEGDEYVAELKKYFDCGYLTDDERYKLTV
EKWSRVKDNVEKSLKEVANSDLDNPLFMMMSSGARGNASNFTQLAGMRGLMSNNTKTLKA
DAENERVVRSTIEIPVKSSFLNGLSAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLIDV
AQSIVVREEDCGSDFGFAVKAIKDTKTDIVIETLLERIEGRYTNKAIFDYDGQLVIGANQ
LITPEIADKLVNELKLETIDIRSVLSCHTKNGVCKVCYGKDLATNRVVNIGEAVGIVAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDNPWGKTAEISKVHGIITNIE
QIINKDTKRVSDFTQVTIKTKDELGNEVNEFVTGSTSQRLRVKIGDRVIPGQKIFEGPIV
LHQLLNTTDVRTVQNYLLKEIQRLYRMQGITISDKYIEIIISQMLSKILIIDPGDSRLHS
GALVDTYVYQTENAKLLARGLKPAYGRPKISGAKQIPLLSTSFLAAASFQETAKILVNSS
IGKRIDSLEGLKENIILGQKIPAGTNSNYELKGKYDIRSFNSYFPNKLDPSKPIIQEELK
TGFEDFNLDDIVDTDDNEETYDFDLDYDELYDLEDN
NT seq
4431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaataatacacctggaaaacaaaaatataataaagaaaaagttcgtagaattatttta
tctttagcaactaaagaggatgtgcttaaatgatcacatggtgaggtaactaaagctgaa
acaattaactataaaacatacaaacctgaacgtgatgggttatttgatgaactcattttt
ggtcctacaattgactttaaatgtccaatttgtggaactaaatataaaaaaagtgatgca
aataccatttgttcaaaaactcaacaatgtaaaagatataatccagaaattttacctaaa
atttcgcgccgtagccggatgggtcatattcatttacatactccagtagtgcacttttga
tactttaaaattgaccattcagttatttctaatttacttggtttaagaattgaagataaa
ggtgaaaaacaagttgtttcaaaatcagatttagaaaaattaatttactataaatctcat
atcgtgcttgagagtggatcacttaaatcacttaagaaaaacactattatcgatattaac
cgagctgctactatttatgaagcagctttagaagaattaaaagaattaaataaagatgac
gaagaagcttcagaagtaattttagaatctttatacgagctacgtgaatatgcacagtca
caagatggtaaggattttggaattgatttttatcaatataatgatattattaaagaatat
tcagatgcaatgattggaactggttcacaagctattgaatatttattaactaattttgat
atccataaagagcaaaaattagtgcaagaacaaattgacagaattaatgctgatatagca
aagcaaagagatgtctcaagttcaaaatatcaacaacgtcaaaaactttataaacgttta
aatattatttcttcatttattcgctcaggacaaaaacctactgatatgttaatttatgaa
ttacctgtaattccagctgatcttcgtcccttagtgcaactagatggagggagacattca
actagcgatataaatgaactataccgtagaattattatccgtaattcgcgtgttggaaaa
tgacatgatactgatgctccaatgcttattagacaaaatgaatatcggatggtccaagaa
gcagttgatgctttaattgataacgctcgtaaaaaacctactcctgtatcatcaagggat
aaccacccgcttaaatcaatttcggatagtttaactggtaaaaaaggacgttttcgtcaa
aatcttcttggaaaacgtgttgattattcagcacgtagcgttatagttgctggcccttct
ttaaaaatgtaccaagttggaatgcctcgtgatattgctgctaaaatctttgaaccatac
gtgattaaatcattaattgaaaaagaagatggtattacaagtattaaaacggctaaaaaa
ttaattgataatttagatccacgaatttgaccttatgttaatgaagctattaaaggtcgt
cctgtacttttaaaccgtgcgccaaccttgcaccgtttatcaattcaagcttttgaacct
gttttaattcgctctaaagctattaaattacacccacttgttactacagcatttaacgct
gacttcgatggggaccaaatggcaattcacgtacctttatcagaaaaagcagtacgtgaa
gctcaagaattaatgcttgcttcaaaaaacattttaggtcctaaagatggtgagccaatt
attaacccttcacaagatattgtgcttggaatttactatttaactttagaaaaatcaggt
gaacaagttaaaggtgaaggtaattattaccataattatgaagaaatgattcgagcatat
gaaagaaatgatattaccctccatactagagtagttttaccaattgaagctttaaataag
ccacaattattaaaacaaactaacaaaccttatattttctctaccgttggtaaatttatt
tacaaccaagcacttcctgaagattttgaatttatttttggtaaataccttgaaactatt
tataaaaaattatctagtggtgaaattaaaacatttacaaaagaaaaaattcatacttcg
gttcatgatttagatcgttataccttagattatggggataatttccgtgaaattattgct
aatactcaactaaacttagctttatcaaaaaaagataccgctaaaattattcaccaaatt
tacaaagaatatgtttcagttattaccatagaagatttagcttctgttttaaataacgta
aacaaaatcaactataaagatcaaattgatgctttaacaaatttaattgactataaagga
aattatttaccacttgttcatgctaaattaattaatggttttattgctcaagaatttgat
aaatattattttgttaattcaaataaagaccaattagaatgaaccttgcctgaatatacc
aaagctttagaaaatgtctgatttagatattctaattacgttgctgagattttagataat
attaaagaactaggcttccactattcaactatttcaggaattaccatttcgatgagcgat
gttaaaaccgctgattcaacacctgaatttattaaagaaggtgatgagtatgttgctgag
cttaaaaaatattttgattgtggctacttaacagatgatgaacgttataaactaactgtg
gaaaaatgatctagagttaaagataatgttgaaaaatcacttaaagaagttgctaactct
gatttagataatccattatttatgatgatgtcatcaggggctcgtggtaatgcttctaac
tttacccaacttgctgggatgcgtggactaatgtcaaataacactaaaaccttaaaagcc
gatgctgaaaatgaacgtgttgttcgttcaacaatcgaaattccagttaaatcatcattc
ttaaatggtcttagtgcatatgaattttattcttcaactcatggtgcacgtaaaggttta
actgatactgctcttaacaccgctaaatctggatacttaacacgtagattaattgacgta
gcacaaagcattgtggtacgtgaagaagattgtggttcagactttggatttgctgttaag
gcaattaaagatactaaaacagatatcgttattgaaactttgcttgaaagaattgaggga
agatataccaataaagcaatttttgattatgatggtcaattagtaattggagcaaaccaa
ctaattactcctgaaattgcagataaattagttaatgagttaaaacttgaaactattgac
attcgctctgttttatcatgtcacactaaaaatggagtatgtaaggtttgttacggtaaa
gatttagcaacaaatcgtgttgtaaatattggtgaagctgtaggaatcgtcgcagctcaa
tcaattggtgagcctggaacgcagcttactatgcgtactttccataccgggggggttgct
ggtgttgaagatattactggtggatttggccggttaattgaattaattgatgcttatgat
aacccatgaggtaaaacagctgaaatttcaaaagtacatggaatcattactaatattgag
caaattattaataaagacacaaaacgtgtttcagattttacacaagtaactataaaaaca
aaagatgaacttggtaacgaagttaatgaatttgttacaggaagcacttcgcaaagactc
agggttaaaattggtgatcgtgttatccctgggcaaaaaatctttgaaggtccaattgtc
ttacaccaacttttaaataccaccgacgttagaactgtgcaaaattacttacttaaagaa
attcaaagattataccgtatgcaaggaattactatttcagataagtatattgaaattatt
atctcacaaatgttgtcaaaaatcttaattattgatccaggagattcaagattacatagc
ggagcactagtcgatacttatgtttaccaaactgaaaatgctaaattattagcaagaggt
cttaaaccagcttacggtaggccaaaaatttcaggagcaaagcaaattccacttctatct
acttcgtttttagcagctgcttctttccaagaaacagctaaaatcttagttaattcttca
attggtaagcgaattgattcactagaaggattaaaagaaaatattattttaggtcaaaaa
attcctgctggaaccaactcaaattatgaattaaaaggtaaatatgatattcgcagcttt
aactcatatttccctaataaacttgatccaagtaaaccaattattcaagaagaattaaaa
actggttttgaagatttcaatcttgatgatattgttgatactgatgataacgaagaaacc
tatgactttgacttagattatgatgaattatacgatttagaagataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
