KEGG   Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_02135
Entry
CO229_02135       CDS       T06002                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
mboh  Mycoplasmopsis bovirhinis
Pathway
mboh03030  DNA replication
mboh03430  Mismatch repair
mboh03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mboh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    CO229_02135
   03430 Mismatch repair
    CO229_02135
   03440 Homologous recombination
    CO229_02135
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mboh03032]
    CO229_02135
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mboh03400]
    CO229_02135
Enzymes [BR:mboh01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     CO229_02135
DNA replication proteins [BR:mboh03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CO229_02135
DNA repair and recombination proteins [BR:mboh03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CO229_02135
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger HHH_6 PHP Caud_bapl16_4th
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATO30904
LinkDB
Position
complement(514422..517355)
AA seq 977 aa
MKDIIYLHTNTEYSFLNSTIRLDELFNLAKSKKVKYLTLTDFENFHALQFYWNFQNEYDF
KLILGLELNLKEGFKIIALAKNDQGFLKLKELVLAKSNNLPVSYYDLNDPNLYLIDHFEE
GFKAKNLELDKLFNNFYLNDKKMQAHQTVYAPTKKILYFDDNELLPILNNIGNLSYQKKL
YSEYYEPGEFDNVDEGVYQNILNIVQSINLSKPSSDLKLPKYSENSKEDLQKLINNHAYQ
ELIKKYDKDLVDNRIKLEYQVIKKLGFIDYFLIIQDVIKYAKQNNILIGPGRGSASGSLI
SYLIGITSVNPLEFDLLFERFLNLERIGLPDIDIDIQDNKRDELFWYLANKYGFDKVAFI
STFQTLASKNSLRDVGRYLGISKAEIDEISASISSHDASLLEAYEKNKKYALYAKKYPQL
HLLASRIEGLPRQLGIHAAGFIISNISLINLVPIQVSNFKLNQLQMTMNNLEQYGLIKID
FLGLKNLTFINELEQEIPKELHFEQIINDSISLFNDKPTFDLLNSTLTDGIFQLESPGMR
NAIKEVVIDKFDDIYAVLSLFRPGPSKYIKTYAKNKANPLFIEKVHPLYDNIVKHTYGII
VYQEQIMQIVQDVANMSFSKADLFRRAISKKKEGELKLYRDEFFAGGLKNGFNETTLQKI
YSNIEKFADYGFNKSHAVAYGIISYKLAYYKARFPMIFYKVLLSNIAVDQNTIKMYAEEA
ALFNIKVKIPNINLSTEHATLNNKEIYLSFALIKGIGQAAIDKILTERNRAGKFTSFISS
WLRLKASGLGESILETLIKAGSFNNFANLATLLSSLDICQDFYELFKFETKNHQEPLEYL
DTFIKKHNLGDHLLNLKDHDKTLEDQWEIKLLGNKYTNEVWSSDARSNQNLNKICLASLQ
EKAQYLKVEILSVTKGAKDNQLKFKLQDESKVVTASSWSGKFLPWLNVVLPQKVRVLALK
KGNFYNIKDIMELIDEE
NT seq 2934 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagatattatttacttacatactaatactgaatattcttttttgaattcaactata
agattagatgaactttttaatttagctaaatctaaaaaagttaaatatttaactttaaca
gattttgaaaatttccacgctttacaattttattgaaattttcaaaatgaatatgatttt
aaattaattttaggtttagaactgaatttgaaagaaggttttaaaattattgctttagct
aaaaatgatcaaggttttttaaaacttaaagaactagttttagctaaaagtaataattta
ccagtatcatactatgatttaaatgatccaaatttatacttaattgatcattttgaagag
ggtttcaaagctaaaaatcttgagcttgataaattatttaataatttttatttaaatgat
aaaaaaatgcaagcacaccaaactgtatatgcacccaccaaaaagatcttatattttgat
gataacgaacttttacctattttaaataatattggtaatttgtcttatcaaaaaaaatta
tatagtgaatattatgaaccaggtgaatttgataatgttgatgaaggtgtttatcaaaat
attttaaatattgttcaaagcattaatttatcaaaaccttctagtgatttaaaattaccg
aaatatagtgagaattctaaagaagatttgcaaaaattaatcaataatcatgcttaccaa
gaactaattaaaaaatatgataaagacttagttgataaccgtattaaacttgaataccaa
gttataaaaaaacttggctttatcgattattttttaattattcaagatgtaattaaatac
gcaaaacaaaataatattttaattggcccaggtcgaggatcagcttctggatcattaatt
tcttatttaattgggataacaagtgttaatccacttgaatttgatttactatttgaaagg
ttcttgaatttagaaagaattggccttccagatattgacattgatattcaagacaacaaa
cgtgatgaattattttgatacttagctaataaatatggctttgataaagttgcatttatt
tctacttttcaaactttagcttcaaaaaattcattgagagatgttggaagatatttaggt
atttcaaaagcagaaattgatgaaatttcggcatcaatttcatcacatgatgcttcgctt
ttagaagcatatgagaaaaataaaaaatatgctttatatgctaaaaagtatccccagcta
catttacttgcttcaagaattgaaggtttaccaagacaactaggaatacatgctgcagga
tttattattagcaatatatctttaattaatttagtaccaattcaagtaagtaattttaaa
ttaaaccaattacaaatgacaatgaataatttagaacaatatggattaatcaagatagat
tttttaggattaaaaaatcttacatttatcaacgaattagaacaagaaattcctaaagaa
ttgcattttgagcaaattattaatgattcaatttctttatttaatgataaacccaccttt
gatttattaaattcaactttaactgatggaattttccaacttgaatcaccagggatgcga
aatgctattaaagaagttgtgatagataaatttgatgacatatacgcagttttatcttta
tttagaccagggccaagtaaatatataaaaacttatgctaaaaataaagctaatccttta
tttattgagaaagtgcatcctttgtatgataatattgttaaacacacttatgggattatc
gtctaccaagagcaaatcatgcaaatagtccaagatgttgctaatatgtctttttcaaaa
gcagatttatttagaagagcaatttctaagaaaaaagaaggcgaattaaaattatataga
gatgaattttttgctggagggcttaaaaatggatttaatgaaactactttgcaaaaaatt
tacagtaatattgaaaaatttgcggattatggttttaataaatcgcacgcagtagcttac
ggaataattagttataaactagcttattataaagctaggtttccaatgatattttataaa
gtattattatctaatatagcagtggatcaaaatactattaaaatgtatgctgaagaagca
gctctttttaacattaaagttaaaattcctaatattaatttatcaactgaacatgccact
ttaaataataaagaaatatatttaagctttgctttaattaagggtattgggcaggctgca
attgataagattttaacagaaagaaatagagctggaaaatttactagttttatctcatca
tgacttagactaaaagctagtggcttaggagaaagtattttagaaactttaattaaggca
ggttcttttaataattttgcaaatcttgcaaccttgctttcaagtttagatatttgccaa
gatttttatgaactttttaaatttgaaacaaaaaatcatcaagaacccttagaatattta
gatacttttataaaaaaacataatttaggtgatcatttactaaatttaaaagatcatgat
aaaaccttagaagaccagtgagaaataaaacttttaggcaataaatatacgaatgaggtt
tgatctagtgatgctagatcaaatcaaaatttaaataaaatttgcttagcatcattgcaa
gagaaggctcaatatttaaaagttgaaattttgagtgttactaaaggagctaaagataac
caattaaaatttaagttgcaagatgaatctaaagtagttactgcatcaagttgaagcgga
aagttcttgccatgattaaatgtagttttacctcaaaaagttagagtcttagctctaaaa
aaaggaaatttctataacattaaagatattatggagttaatagatgaagaataa

DBGET integrated database retrieval system