Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_02585
Help
Entry
CO229_02585 CDS
T06002
Name
(GenBank) RNase J family beta-CASP ribonuclease
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mboh
Mycoplasmopsis bovirhinis
Pathway
mboh03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mboh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
CO229_02585
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mboh03019
]
CO229_02585
Messenger RNA biogenesis [BR:
mboh03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
CO229_02585
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
Lactamase_B_2
RMMBL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO30986
LinkDB
All DBs
Position
complement(624133..626016)
Genome browser
AA seq
627 aa
AA seq
DB search
MKKKASLPTRIIPLGGVQEIGKSTLLVEHDNHIFIIDSGIKFADTYNTGIKGIIPNYDYL
NLPNKIIEGLFITHGHEDHIGGVVYLVKQTKLNKIFAPRIAIQYLKLKFDEHNIKSKIEF
IEIQKDDIYHFNGDCKVDFWTSQHSIPDSFGVRITTPNGSIMCTGDFRFDYTPIGNYTDF
ARLDEIGKQGLTALLSDSTNAMRPDHSPSESDILTDIERHMKDAKKKIIITAFASNLTRI
KVIIELAQKLGKKVITFGRSMIQGIKIGKKLGHINVADNVLIDKKAAQNYKDSDLVILTT
GSQGEQLAALSRMSYGKHATIKITKGDMIIFSSSPIPGNRMVIELLINRLYKLGAIIKEN
GVDGYLHTSGHAYKSEHDKIFQLTKPKYFLPYHGEFRMSVAHGQSAIENGVNPKNVIIIQ
KGVVYEMLNQNIKASQELIDFGPIYIDGNTVLNFSGKIIKERAQLKDSGFMSLVFLLNKE
ANQIIGRPQVLTKGTFFVKTSKALIEECKRISHGAILYHIKNNPNWTVEDLEKLIIERIS
ALLHKEKRRNPVIVPTILFTNDPADPDLLARPIKFGNTKNEKVEKYESDKKPKTHKTKLI
AQKLKELEELSLSMVDSDYEIDEDDEV
NT seq
1884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaagctagccttcccactcgaattatcccgcttggcggggtacaagaaatt
ggtaaatcaactttattagttgaacatgataatcatatctttattattgattcaggaatt
aaatttgctgacacttataatacaggaattaaaggaataattcctaactatgactattta
aatttacccaataaaattattgaaggtttatttattacccacggtcatgaggatcatatt
ggcggtgttgtttacttagttaaacaaacaaagttaaacaaaatctttgcaccgagaata
gctattcaatatttaaaattaaaatttgatgaacataatattaaatctaaaattgaattt
attgaaattcaaaaagatgatatttatcattttaacggtgattgcaaagttgatttttga
acttcgcaacattcaattccagattcatttggtgtaaggattactactccaaatggaagt
attatgtgtactggtgattttaggtttgattatactccaattggtaactatactgatttt
gctcgtttagatgaaattggaaaacaaggcttgacagccttgttatctgattcaactaat
gcaatgcgcccagatcactcaccttctgaaagtgatattttaactgacattgaaaggcac
atgaaagatgctaagaagaaaattattattactgcttttgcatcaaatttaaccagaatt
aaagtaattattgaattagcgcaaaaacttggtaaaaaagttattacatttggtcgctca
atgattcaaggaattaagattggtaaaaaactaggtcatattaatgttgctgataatgtt
ttaatcgataaaaaagcagcacaaaattataaagattcagacttagtaattttaactact
ggctcacaaggagaacaacttgccgctttatcaagaatgagttatggaaaacatgccaca
attaaaataactaaaggtgatatgatcatcttttcatcaagtccaattcctggaaaccgc
atggttattgaattgctaattaatagactctataaattgggtgctattattaaagaaaat
ggtgttgatggatatttacatacttcgggacatgcatataaatctgaacatgataaaatt
tttcagttaactaaacctaaatattttttaccatatcacggtgaatttaggatgagcgta
gctcatggacaaagcgcaattgaaaatggagttaatcctaaaaatgtaattataatccaa
aaaggtgtagtttatgagatgcttaatcaaaatatcaaagcttcacaagaacttattgat
tttggacctatatatattgatggaaatacagttttaaatttttccggtaaaattattaaa
gagcgagcccaactcaaagactcaggttttatgagtttagtttttttacttaataaagaa
gctaaccaaattattggtcgtccacaagttttaacaaaagggacattctttgttaaaact
tctaaagctttaattgaagaatgtaagagaatttcccatggagctatactttatcatatt
aaaaataatccaaactgaacagttgaagacttagaaaaactaattattgaacgaattagt
gcactattacataaggaaaaacgtcgcaacccagttattgtgccaactattttatttact
aatgatccagcggatccagatttattagctaggccaattaaatttggtaatactaaaaat
gaaaaagtagaaaaatacgaaagtgacaaaaaacctaaaacccataaaactaaattaata
gctcaaaaattaaaagaattagaagaactttcattaagcatggttgattctgattatgaa
atagacgaggatgatgaggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
