KEGG   Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_03515
Entry
CO229_03515       CDS       T06002                                 
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
  KO
K03581  exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mboh  Mycoplasmopsis bovirhinis
Pathway
mboh03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mboh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    CO229_03515
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mboh03400]
    CO229_03515
Enzymes [BR:mboh01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     CO229_03515
DNA repair and recombination proteins [BR:mboh03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     CO229_03515
SSDB
Motif
Pfam: AAA_19 AAA_30 SH3_13 Viral_helicase1 UvrD_C_2 AAA_11 AAA_22 nSTAND3 PIF1 SLFN-g3_helicase HHH_RecD2 DUF815 NTPase_1 NACHT NPHP3_N AAA_16 AAA_28 RNA_helicase AAA_5 RsgA_GTPase AAA_18 Zeta_toxin UvrD-helicase
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATO31139
LinkDB
Position
complement(845481..847802)
AA seq 773 aa
MEKYQLNTGEELISAKPIKLLKGGYDLNWCLLMCETDKKERIVVYATKNIPKLYKFYDLI
VTKSTKPQSTNNYVLVNFYTKQKTLDRELELYFYLKQTPKVGFVAIDKIKSKFSFINFYS
EVKNNNLFKEGFATFLSKIQKDNIQNIYLENKVKIDSLIDEREEINEDLFFFELNKIQSL
YEKLKNINHGENDLLSYYKLNNPYKLYLEHRLNLADIDIFALALGYQTNSFERLEAYLNY
SMVNLEEGNSTFWPTNLVVEMLQKTSNVFDLVIIEEFLKDMINKNKLLNVNGLLCRKLIF
DKEKMVTFWLNKIKEANPLKLNHLTKKDLAYLSDKQKEAYYESINNNICIITGAPGTGKS
NIIKHLHDTLKKSKLKLGTDFMILGPTGRVCANLSKKYGFTSKTIHSFLSVPTDDERVTK
SIEDFSKIKCLIIDEFSMVNLNIFYLLLSVCQNLQKLIILGDVNQLAAIGPGNILFDLID
SQKITTIYLEENFRSESQEIIDYINFINSIGDFKNLNYNQDFQDYLSNIEKLKINNLEAN
IEERIYSNFCDWYGNKLKKQNIELNIYNNYLSDLSDLFLTKVENFGIHNTIIICPMYKGP
YGIDKINEEIQKHYNKDSDVIYKYKINEYEYKFKLNDKVIQLVNRYDDGVSNGDIGYITK
FEKSSFDNKEKIHVQFDDKTIIYTKDEFKTEIKLAYAVTAHKFQGSEINCCIFVVNPNHA
KMLYKKLVYTATSRAIKELVIFSNTNKIYSTIFLKEFLKPRNIITNLSWMLKE
NT seq 2322 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaaatatcagttaaacacaggtgaagaattaattagtgcaaagccaattaaatta
ctaaaaggcggttatgatttaaattggtgcttgttaatgtgcgaaacagacaaaaaagag
cgaattgttgtttatgcaactaaaaatattcctaaactttacaaattttatgacttaatt
gttactaagtcaacaaaacctcaaagcactaataattatgtattagttaatttttatact
aagcaaaaaactttagatcgcgaactagaactttatttttatttaaaacaaactccaaaa
gttggttttgttgcaattgataaaattaaatcgaaattctcttttattaatttttattca
gaagtaaaaaataataatttattcaaagaaggttttgcaaccttcttatcaaaaattcaa
aaagataatattcaaaatatatatctagaaaacaaagtaaaaattgatagtttaatcgat
gaacgagaagaaattaatgaagatttatttttttttgaattaaataaaattcaaagttta
tacgagaaactcaaaaatataaatcatggcgaaaatgatctattaagttactacaaatta
aataatccttataaactatacttagaacatagactaaatttagcagatattgatattttt
gcattagctttaggatatcaaactaattcatttgaaagattagaagcatatttgaactat
tctatggtgaatttagaagaaggtaattcaacgttttgaccaactaacttagttgttgaa
atgttgcaaaaaacttctaatgtttttgatttagtaattattgaagaattcttaaaagat
atgattaataaaaataagttactaaatgttaatggacttttatgtaggaaattaattttt
gataaagaaaaaatggtaacattttgattaaacaaaattaaagaagcaaatccactaaaa
ttaaaccacttaacaaagaaagatttagcctatttatcagataagcaaaaagaagcatat
tatgaatcaattaataataatatttgtattataactggagctcctggaactggtaaaagt
aatattattaaacatcttcatgataccttaaaaaaatctaaactaaaattaggaactgat
tttatgattcttgggccaactggcagggtgtgtgctaatttatcgaaaaagtatggattt
acttcaaaaacaatacatagttttttaagtgtaccgactgatgatgaaagagtaaccaaa
agcattgaagattttagcaaaattaaatgcttaatcattgatgaatttagtatggttaat
ttaaatattttttacttgcttttatcggtttgtcaaaatttacaaaaattaataatttta
ggagatgttaaccaattagctgctattggccctggtaatattctttttgatttaattgat
tcacaaaagataaccacaatttatttagaagaaaattttcgttcagaaagtcaagaaatt
attgattatataaactttataaattcaattggtgatttcaaaaatttaaattataaccaa
gactttcaagattatttatcaaatattgaaaaactaaaaattaataatttagaggctaat
atagaagaaaggatttattctaacttttgtgattgatatggtaataaacttaaaaaacaa
aatattgaattaaatatttacaacaattatttaagtgatttgagtgatttatttttaact
aaagtagagaattttggaattcataatactattattatctgcccgatgtataaaggacct
tatggtattgataaaattaatgaggaaatccaaaaacactacaacaaagattcagatgtt
atttataaatacaaaataaatgaatatgaatataaatttaaattgaatgacaaagtaatt
caacttgttaataggtatgatgatggtgtttcaaatggagatatcggttatattactaaa
tttgaaaaaagttcttttgataacaaagaaaaaattcacgtacaatttgatgacaaaaca
attatttatactaaagatgaatttaaaacagaaattaaattagcttatgcggtaactgcc
cataaatttcaaggaagcgaaataaattgttgtatttttgttgttaatccaaatcatgca
aaaatgctgtataaaaaacttgtttatacagcaacatcacgtgctataaaagaattagta
atttttagtaatactaacaaaatatattcaacaattttcttaaaagagtttttaaaacca
agaaatattatcacaaatttaagttgaatgttaaaggagtaa

DBGET integrated database retrieval system