Mycoplasmopsis bovirhinis: CO229_03515
Help
Entry
CO229_03515 CDS
T06002
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
mboh
Mycoplasmopsis bovirhinis
Pathway
mboh03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mboh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
CO229_03515
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
CO229_03515
Enzymes [BR:
mboh01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
CO229_03515
DNA repair and recombination proteins [BR:
mboh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
CO229_03515
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
SH3_13
Viral_helicase1
UvrD_C_2
AAA_11
AAA_22
nSTAND3
PIF1
SLFN-g3_helicase
HHH_RecD2
DUF815
NTPase_1
NACHT
NPHP3_N
AAA_16
AAA_28
RNA_helicase
AAA_5
RsgA_GTPase
AAA_18
Zeta_toxin
UvrD-helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO31139
LinkDB
All DBs
Position
complement(845481..847802)
Genome browser
AA seq
773 aa
AA seq
DB search
MEKYQLNTGEELISAKPIKLLKGGYDLNWCLLMCETDKKERIVVYATKNIPKLYKFYDLI
VTKSTKPQSTNNYVLVNFYTKQKTLDRELELYFYLKQTPKVGFVAIDKIKSKFSFINFYS
EVKNNNLFKEGFATFLSKIQKDNIQNIYLENKVKIDSLIDEREEINEDLFFFELNKIQSL
YEKLKNINHGENDLLSYYKLNNPYKLYLEHRLNLADIDIFALALGYQTNSFERLEAYLNY
SMVNLEEGNSTFWPTNLVVEMLQKTSNVFDLVIIEEFLKDMINKNKLLNVNGLLCRKLIF
DKEKMVTFWLNKIKEANPLKLNHLTKKDLAYLSDKQKEAYYESINNNICIITGAPGTGKS
NIIKHLHDTLKKSKLKLGTDFMILGPTGRVCANLSKKYGFTSKTIHSFLSVPTDDERVTK
SIEDFSKIKCLIIDEFSMVNLNIFYLLLSVCQNLQKLIILGDVNQLAAIGPGNILFDLID
SQKITTIYLEENFRSESQEIIDYINFINSIGDFKNLNYNQDFQDYLSNIEKLKINNLEAN
IEERIYSNFCDWYGNKLKKQNIELNIYNNYLSDLSDLFLTKVENFGIHNTIIICPMYKGP
YGIDKINEEIQKHYNKDSDVIYKYKINEYEYKFKLNDKVIQLVNRYDDGVSNGDIGYITK
FEKSSFDNKEKIHVQFDDKTIIYTKDEFKTEIKLAYAVTAHKFQGSEINCCIFVVNPNHA
KMLYKKLVYTATSRAIKELVIFSNTNKIYSTIFLKEFLKPRNIITNLSWMLKE
NT seq
2322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaatatcagttaaacacaggtgaagaattaattagtgcaaagccaattaaatta
ctaaaaggcggttatgatttaaattggtgcttgttaatgtgcgaaacagacaaaaaagag
cgaattgttgtttatgcaactaaaaatattcctaaactttacaaattttatgacttaatt
gttactaagtcaacaaaacctcaaagcactaataattatgtattagttaatttttatact
aagcaaaaaactttagatcgcgaactagaactttatttttatttaaaacaaactccaaaa
gttggttttgttgcaattgataaaattaaatcgaaattctcttttattaatttttattca
gaagtaaaaaataataatttattcaaagaaggttttgcaaccttcttatcaaaaattcaa
aaagataatattcaaaatatatatctagaaaacaaagtaaaaattgatagtttaatcgat
gaacgagaagaaattaatgaagatttatttttttttgaattaaataaaattcaaagttta
tacgagaaactcaaaaatataaatcatggcgaaaatgatctattaagttactacaaatta
aataatccttataaactatacttagaacatagactaaatttagcagatattgatattttt
gcattagctttaggatatcaaactaattcatttgaaagattagaagcatatttgaactat
tctatggtgaatttagaagaaggtaattcaacgttttgaccaactaacttagttgttgaa
atgttgcaaaaaacttctaatgtttttgatttagtaattattgaagaattcttaaaagat
atgattaataaaaataagttactaaatgttaatggacttttatgtaggaaattaattttt
gataaagaaaaaatggtaacattttgattaaacaaaattaaagaagcaaatccactaaaa
ttaaaccacttaacaaagaaagatttagcctatttatcagataagcaaaaagaagcatat
tatgaatcaattaataataatatttgtattataactggagctcctggaactggtaaaagt
aatattattaaacatcttcatgataccttaaaaaaatctaaactaaaattaggaactgat
tttatgattcttgggccaactggcagggtgtgtgctaatttatcgaaaaagtatggattt
acttcaaaaacaatacatagttttttaagtgtaccgactgatgatgaaagagtaaccaaa
agcattgaagattttagcaaaattaaatgcttaatcattgatgaatttagtatggttaat
ttaaatattttttacttgcttttatcggtttgtcaaaatttacaaaaattaataatttta
ggagatgttaaccaattagctgctattggccctggtaatattctttttgatttaattgat
tcacaaaagataaccacaatttatttagaagaaaattttcgttcagaaagtcaagaaatt
attgattatataaactttataaattcaattggtgatttcaaaaatttaaattataaccaa
gactttcaagattatttatcaaatattgaaaaactaaaaattaataatttagaggctaat
atagaagaaaggatttattctaacttttgtgattgatatggtaataaacttaaaaaacaa
aatattgaattaaatatttacaacaattatttaagtgatttgagtgatttatttttaact
aaagtagagaattttggaattcataatactattattatctgcccgatgtataaaggacct
tatggtattgataaaattaatgaggaaatccaaaaacactacaacaaagattcagatgtt
atttataaatacaaaataaatgaatatgaatataaatttaaattgaatgacaaagtaatt
caacttgttaataggtatgatgatggtgtttcaaatggagatatcggttatattactaaa
tttgaaaaaagttcttttgataacaaagaaaaaattcacgtacaatttgatgacaaaaca
attatttatactaaagatgaatttaaaacagaaattaaattagcttatgcggtaactgcc
cataaatttcaaggaagcgaaataaattgttgtatttttgttgttaatccaaatcatgca
aaaatgctgtataaaaaacttgtttatacagcaacatcacgtgctataaaagaattagta
atttttagtaatactaacaaaatatattcaacaattttcttaaaagagtttttaaaacca
agaaatattatcacaaatttaagttgaatgttaaaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system