Methanococcoides burtonii: Mbur_0728
Help
Entry
Mbur_0728 CDS
T00341
Name
(GenBank) Serine-rich surface protein (adhesin) with putative Ig domain, two dockerin type 1 domains and a cohesin domain
Organism
mbu
Methanococcoides burtonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
Big_9
Dockerin_1
PKD
Cadherin_5
Bact_surface_Ig-like
Big_7
InlK_D3
PKD_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABE51693
UniProt:
Q12XY3
LinkDB
All DBs
Position
755888..759268
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MKKVTKLFFLLGLLLATIDIGSASISYNSDYNQILVKDEVSINLTDIYDALYPTYGDQLI
SNAGNGIWYLNKTLLVDRSTVYITSPEVTELRVSGSTGVHLHGTSTGSDGKGYIIENVTI
VGWLKDFNMPDNTVSKKSINIDKGHVSNSVFKNVSTLKLYNVYDTDINNIEMESTSGSLE
IADGNNSTVHEIALYNTSGFYTYDLENFIFHNITVKDVHSIGTIRFTRTSHSLFYDFVIE
RIGSYLKPGSGGGLYWYDSSYNTGSDFYINDTGWSSFAPGNNYGNWSDLTILNSGHNGID
LHNIKNTIINNVHVYDSVSNNILLTAGLSDSPSTENITITNVYSKNSGIVSQQNVSDIYL
ANIYQEGDRDGMGISVQNFTLINATFASLNSDAQVSIYDSFGFENTNCNLIDTSFYHLNV
VADRRINLINSEYQTTYHKNHVTHYYSDLFVTYSNDIPAAGATIAVENTVDSSHSSLNGF
GNDKSMFLTTSNGHTELPNENRSESPAMPEYYKSSAGTQTFSHTATITTQDGQTLTLPNI
TPDSSWYRPDPNTPTYSITAIMPDESAGPHLTGFAPSESNPFNIGNTKKFQVWSDEDMTS
MKWIVDGETKQSTSLEYAWTVPDENGHTIIFEGTNANGIITKTWDINGGSGSVLPAITGA
FPGTSSRSQELGSSTDFSVTADQSMTSMVWYKNDAVIADGVMSTTVDWNEPGTYNIRFTA
SNDNGEVSRSWEVVSNEGAPILSDDLSVNNAPVITTFGPANNTVFQEGNVINIGVIASDA
DGDELTYLLKVDGATVSTTSGYVWTTDSSNIGAHTIGVVVSDGVEQVTDQHTIIVQNIVD
VGVTPVVMSSSAQIVSPGQPFSIGISIDPSEPVSGAQLDLLFDEQLVSAEGTIEGDLFNL
NGASTLFNSGTIGDSGVITDIYCSIIGAAPVSSKGTMATIAFTAGNTAGVAEFSLSDVVI
SNARSEGTPYTVTDTMVVIDTAPVLNSIGDKTVDEENALTFVTSASDADGDSLTYSATGL
PVGASFDTASGAFSWTPSEGQEGTYAIAFEVSDSYLTDSETISIAVKSHPRWDINRDCAV
NILDITLVSQKIGTDGAGTDQDVNQDGVVNIQDLTLVAQHFGETVE
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaggttacaaaattattctttttattagggttgttattagctacgattgatatt
ggttctgcatcgatttcgtataattctgattataatcaaattttagtcaaagacgaagtg
tctattaatttaacagatatttatgatgctttgtatccaacatatggtgatcagcttatt
tcaaatgctggaaatgggatttggtacttaaataagacactacttgttgataggtctacg
gtctatattacttctccagaagtgactgaattaagggtaagtgggtctacaggagtacat
ttgcatggaacttctactggtagtgatggtaaagggtatattattgaaaatgttactatt
gttggttggctaaaagattttaatatgcctgacaacacggtttcaaaaaaatcgattaat
attgacaaaggtcatgtttcaaattcggtttttaagaatgtgtctacactaaaactttac
aatgtatatgatactgatataaataatattgaaatggaatctacttcgggttcacttgaa
atcgcagacggtaacaatagtacagttcatgagattgcactttataatacttcgggattt
tacacttatgatcttgaaaattttatttttcataatattacagtaaaggacgtgcactct
attggaaccattaggttcacaagaacaagccacagcttattctatgattttgtaatcgaa
agaataggcagttatttgaagcctggctcaggtgggggattatattggtatgactcgtcc
tacaacactggatctgatttttatataaatgatactgggtggagtagttttgcaccagga
aacaattatggtaattggtcggatttaactatacttaattctggacacaatggtatcgat
ttgcacaacatcaaaaatacgataataaataatgtacatgtttatgatagtgttagtaat
aatatcctattaaccgcgggtctttcagatagtccttcaactgaaaatatcacaattaca
aatgtttattcaaaaaattcgggtattgtctctcagcaaaatgtttcggatatttattta
gctaatatatatcaggaaggtgatagagatggtatgggaatctctgttcaaaattttaca
ctaattaatgcaacttttgcatctcttaatagtgatgctcaagtaagtatttatgattca
tttggatttgaaaatacaaattgtaatttaattgatacatcattttatcacttaaatgta
gttgcggatagaaggattaatttgataaattctgaatatcaaaccacctatcataaaaat
catgttacacattactattctgatttatttgttacatattcaaatgatattccagcagca
ggtgcaactattgcagttgaaaatacagtagattcgtcacattcgagtttgaatggtttt
ggtaatgacaagtccatgtttttaactacatcgaatggtcatactgaattaccaaatgag
aatcgtagtgaatctcctgctatgcctgaatattataaaagttcggctggaactcagact
ttctcccacacagctaccatcactactcaagatgggcaaactctcacccttccaaatatc
actccagattcatcatggtatcgtccagatccaaacacgccaacctattccataacggca
ataatgccagatgaatctgcaggaccccacctcacagggtttgcaccaagtgaaagtaat
cctttcaacattggtaacactaaaaaattccaggtatggtctgatgaggatatgacatca
atgaaatggatcgttgatggtgaaacaaagcaatcaacttctcttgaatatgcatggaca
gtaccggatgagaatggacacactatcatatttgaaggtaccaatgcgaatggcataata
actaaaacgtgggacatcaatggcggctcaggaagtgtgttgccagccattaccggcgca
tttccgggaacttcttcacgatctcaggagcttggcagttccactgatttcagtgtaact
gctgatcaatccatgacctctatggtctggtacaagaatgatgctgtcattgcagatggt
gttatgagtactacagttgattggaatgaaccgggcacttataatatcaggtttactgct
tcaaatgataatggagaggtctctagatcatgggaagtggtttctaatgaaggtgctcct
atcctaagtgatgatctctcagtaaataacgcacctgtcattactacattcggacctgct
aacaatacggtcttccaggaaggaaacgttataaatattggtgtaatcgcttctgatgca
gatggagatgaactcacttatcttctgaaggtcgatggtgctactgtcagtacaacctct
ggttatgtgtggactactgatagttcgaacataggtgctcatacaattggagttgttgtg
agtgatggtgttgaacaggttacagaccaacatactatcattgtacagaatattgttgat
gttggagttactccagtagttatgtcctcttcagctcagatcgtttctccgggacaacct
ttcagcatcgggatctctattgacccatctgaacctgtctcaggtgctcaattagacctc
ctctttgatgaacaactggtatctgcagaaggtacaatagaaggtgacctgtttaatctg
aatggtgcatctactctgttcaatagtggtacgataggcgacagtggagtaattacagat
atctactgctctatcataggtgcagcccctgtatcatcaaaaggaactatggcaacaatt
gcttttactgcaggcaatactgccggagttgcagaatttagcttgtcagatgtagtgatc
agtaatgcaagatcagaaggaactccttatactgtcactgatacaatggtcgttatcgat
actgcacctgtcttgaattctatcggtgataagaccgtggatgaggaaaacgcactgacc
tttgtgaccagtgcctcggacgcagacggtgatagccttacatactcagctacaggtctg
cctgttggtgcaagctttgatactgcatcaggtgcattcagctggacaccttcagagggt
caggaaggtacctatgccattgcttttgaagtgagtgatagctaccttacagattcagaa
accattagtatcgctgtaaaatcacatccaaggtgggatattaacagggattgtgcagtg
aatattctggatattactctggtgagtcagaagattggaactgatggtgcaggtacagat
caggacgtaaatcaggatggtgtagtgaacatccaggatcttactctggtagcccaacac
tttggcgaaacagtagaatga
DBGET
integrated database retrieval system
