Methanosarcina barkeri MS: MSBRM_1736
Help
Entry
MSBRM_1736 CDS
T03838
Name
(GenBank) transporter, RND superfamily
KO
K07003
uncharacterized protein
Organism
mby
Methanosarcina barkeri MS
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mby00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
MSBRM_1736
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMPL
ACR_tran
Patched
SecD_SecF_C
Sterol-sensing
DUF6968
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB54734
UniProt:
A0A0E3QUC8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2275340..2277574)
Genome browser
AA seq
744 aa
AA seq
DB search
MESGTETFVSKDSKLYQDYDHLYSNIFGTNSIIVMVEGNDVESADIMKSVDRLEHQLEST
EGIVGVTSPASIIKEMNYQNTGRSQVPDTDAEIKEIIDGNPATFGTLIPDHTHMVIYLTM
AGSSTDNKQKEIITETEEAVKFSDFPPSYNLIVTGDPAYKIEMSEAMSTGMGPLLGLAAV
FMVIVLSLVFRHVRWCLLPLPVVLLGIVYTFGAMGFLGIPLSMVSMSAFPVLIGLGIDYA
IQFHNRIEEELHKEGNKSKAIISTIKHTGPAVLIALTMTALGFFSLFTSTVPMIQDFGKL
LTIGILMCYLAAMFVGVVTVYIFDDFSKNLKSKKGKNEPKPTETNADHVSSGKPKNNLVK
HFLEKINNFSIKNNLLILGIATLLCIGGIYADESVGAQTDTTSFAPRDLPALMDLNHMKD
ITGGTDTLNLIIKVKDNADPEVLEWIDRFSEHETQRQHIESTLSIVPLIKEYNGGTIPET
RDEIEAIYNEIPESQKNRYVYGRNMLLLNLNIGNAVSDIETTGIEELTGIIDKDIQWMQV
PPGVTVTITGNPVVYIEVLGALTDGRILMTYLGLFLVLGGLLVVYRDWLKALAAIIPMFI
VTGWSGLVMKFLGILYTPMTATMGALIIGIGCEYSVLMMERYFEEKDHGADPLQAIHRTS
ENIGAALLASGSTVIGGFAALTISPFPLIGDFGTVTVIDIVLVLIATFMVFPPFIVLMDT
WREKRRGIQASQAKANNVKGADTQ
NT seq
2235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcaggaacggaaacctttgtaagcaaagattcgaaactgtatcaggattatgat
cacctttactcaaacatatttggaaccaactccattatagtgatggtagaagggaacgat
gtagagtctgcagacataatgaaatctgtagaccggcttgaacaccaactagagtcaaca
gaaggaattgttggggtcacaagtccggcttctattataaaggaaatgaattatcagaat
acagggaggtcccaggttcccgataccgacgcggagatcaaggaaattattgatggaaat
ccggctacatttggaacattaattcctgatcatacacatatggtgatctatttaacgatg
gccgggtccagcacagataataagcaaaaagaaataataacggaaaccgaagaagctgtc
aaattttctgattttcctccttcttacaatctcatagtaacaggtgatccagcctataag
attgaaatgagcgaggcgatgagcaccggtatgggaccattgctgggacttgctgccgtt
tttatggtaattgtattaagtcttgttttccggcatgttcgctggtgcctccttccttta
ccagtggttctactaggcattgtttatacttttggagctatgggctttctgggaattccc
ctatcaatggtttccatgtcagctttcccggtactaatagggcttggtattgattatgct
attcagttccataacagaattgaagaagagctgcataaagaaggaaacaagtcaaaggcc
attatatcaacaataaaacacacaggacctgctgtactcatagctcttaccatgaccgct
ctgggatttttctccctttttacgtctactgtaccaatgatccaggattttggcaaactt
ctcacgatcggtatattaatgtgctacttagcagccatgtttgtcggggtagtcacagtt
tatatttttgacgatttctcaaaaaatctcaagtcaaaaaaaggaaaaaacgaaccaaaa
ccaacagaaacaaatgcagaccatgtttcttccgggaagccaaaaaacaatctggtaaaa
cactttcttgaaaagattaataatttttcaataaagaataatttattgatactcgggata
gctactctgctctgtatcggaggtatatatgccgatgagtcagtgggtgcccagacggat
acaacatcttttgctccccgggatctgccagcccttatggacctgaaccatatgaaagat
attacggggggaactgatacacttaacctcataataaaagtaaaggataatgctgatcct
gaagttctggagtggattgacaggttcagtgaacatgaaactcaaaggcagcatattgaa
agcactttaagcattgtgcctctcataaaagagtataatggaggtacaatcccggaaacc
cgagacgaaatagaggcaatatacaatgaaattccggaatcccaaaagaaccgctatgtg
tatggcagaaatatgcttctcttaaatttaaacattggaaatgccgtgtccgacatagag
actacaggtattgaagagttaaccggaataatagacaaggatatccagtggatgcaggtt
cctccaggcgtcacagttacgatcacaggtaacccggtggtttacattgaagttctgggt
gcgcttacagatggaagaattctaatgacctaccttgggctgttccttgttctgggagga
cttctggtagtttacagagactggctaaaagctctcgctgctattattccaatgtttatc
gtaactggctggtcagggctagtaatgaagtttcttggaattctatacacccctatgact
gcaactatgggggcactgatcattggaataggttgtgagtactcagtcctcatgatggaa
agatattttgaagaaaaggatcatggagcagatcctctgcaagctatacacaggacgagt
gaaaacatcggtgctgcactcctcgcttcaggatcgacggttattggtgggtttgcagct
ctgacaatatctccttttcctttaataggtgactttggaacagtgacagttattgatatc
gtacttgtccttattgcaaccttcatggtatttccgccttttattgtattgatggatacc
tggagggaaaagaggagaggaatacaggcttcacaagcaaaagcaaataatgtcaagggg
gccgatacccaatga
DBGET
integrated database retrieval system