Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa: MCCP01_0053
Help
Entry
MCCP01_0053 CDS
T03697
Symbol
hsdM
Name
(GenBank) Modification (Methylase) protein of type I restriction modification system HsdM
KO
K03427
type I restriction enzyme M protein [EC:
2.1.1.72
]
Organism
mcac
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02048 Prokaryotic defense system [BR:
mcac02048
]
MCCP01_0053 (hsdM)
Enzymes [BR:
mcac01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.72 site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)
MCCP01_0053 (hsdM)
Prokaryotic defense system [BR:
mcac02048
]
Restriction and modification system (R-M system)
Type I R-M system
MCCP01_0053 (hsdM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
N6_Mtase
HsdM_N
UPF0020
PIN-TPR-GreABC
Nrap_D5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ17843
LinkDB
All DBs
Position
I:65887..68580
Genome browser
AA seq
897 aa
AA seq
DB search
MGNKITKQKLGSIIWESANKLRKNLEAHEYKDYILGMLLYKFLCEKQTNWLLSNGIWKSD
LQYLDNKFDFSNFEFDNNTTLDSVEEIQEIKQSCIDANGYFIEYRNLFSSWIKNKNNFNI
QNFQEAFNDFSASINEKYNYLFNGIFSIFEKSLDKLGSNSKEQQETINNLLDTMNKIPTV
KQDYDILGFIYEYLIAQFASSAGKKAGEFYTPHEVSDLMSKIVAHHLKNRSIISVYDPTS
GSGSLLLNIGDEFKKYNKGSSPVSYYAQELKTETFNLTRMNLIMRNINPSEIHVRRGDTL
EQDWPIFENEDLSTYKRLTVDAVVSNPPYSQSWNLEKHTNDPRYVEYGIAPKTKADYAFL
LHDLYHIDPEGIMAIVLPHGVLFRGNSEKQIRQKLIEKGQIDTIIGLPSNMFFGTGIPTI
IMILKKQKPTNDILFVDASQLYIKEGKNNKFSQSQIKKIADVVNNRIEVEKFSRIVKFDE
IKENDFNLNISRYIDNFKKQEQYDLHSLMIGGISKQELDNYNNFFNVFKNIKDKLFKLNE
NNYLDLKIDQDQIRNTIYSDDDVNKYIDQFKQLSTNFLNHFKTLIPSLDDIKNINITELE
KSLTDYIFNQIDEIDLTDKYDLYQIIINNFNVIKENIELISKYYNDNDNQNETKQDIHLE
LLKDELTVTWESKKKKSEDLEVKDWNSTILEPRFIKNKYFKDIYDFLSVQQEQIEEQNSE
IENVLSLIDEEDKTDEIYDFEKEKFIIKDRIEKLAKSIKKSKQIIEQDSLEDKIVQVSNL
YEKQKEIKATFNLTNKQLINDSYNKYLSLTENEFYELLITKWLENIIKTFEQKPIDIIDS
YVSKFELLSKKYEDTLDDINNQILNSEKELLDLLKDLTGEESDMRAVNELIKILGGN
NT seq
2694 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaataaaataactaagcaaaaattaggttctattatttgagaatcagctaataaa
ttaagaaaaaatttagaagcacatgaatataaagattatattttaggtatgcttttatat
aaatttttatgtgaaaagcaaacaaattgactattatccaatggtatttgaaaaagtgat
ttacagtacttagataataaatttgatttttctaattttgaatttgataataatacaact
ttagatagtgttgaagaaattcaagaaataaagcaaagttgtatagatgcaaatggatat
tttatagagtatagaaatttatttagttcttgaataaaaaataaaaataattttaatatt
caaaattttcaagaagcgtttaatgattttagtgcaagtattaatgaaaaatacaattat
ttatttaatggaattttttctatttttgaaaaatcactagataaattaggaagtaactct
aaagaacaacaagagacaattaataatttattagatacaatgaataaaattccaacagta
aaacaagattatgatattttaggttttatttatgaatatttaattgctcaatttgcttct
agtgcaggtaaaaaagcaggagaattttatactccacatgaagtatctgatttaatgtct
aaaattgttgctcatcatttaaaaaatagatctattataagcgtttatgatccaacaagt
ggttctggttctttacttttaaatattggagatgaatttaaaaagtacaataaaggttca
tctccagttagctactatgctcaagagcttaaaacagaaacttttaacttaactagaatg
aatttaataatgagaaatattaatccttctgaaattcatgttagaagaggagatacacta
gaacaagattgacctatatttgaaaatgaagacctaagtacatataagcgtttaacagtt
gatgcagttgtatctaatcctccttattctcaatcatgaaatttagaaaaacatactaat
gatccacgttatgttgaatatggaatagctcctaaaacaaaagcagattatgctttctta
ttacatgatttataccatattgatcctgaaggtattatggctattgttttaccacacgga
gttttatttagaggtaattcagaaaaacaaattcgtcaaaaacttattgaaaaaggtcaa
attgatactattataggactaccttctaatatgttttttggaacaggaattccaacaatt
ataatgattctaaaaaaacaaaaaccaactaatgatattttatttgttgatgcttctcaa
ctttatataaaagaaggaaaaaataataaattcagtcagtcgcaaattaaaaaaattgca
gatgttgtaaacaatagaattgaagttgaaaaattctcaagaattgttaaatttgatgaa
attaaagaaaatgattttaatttaaacatttcaagatatattgataattttaaaaaacaa
gaacaatatgatcttcactcattaatgattggtggaataagtaaacaagaattagataat
tacaacaacttttttaatgtatttaaaaacattaaagataaattgtttaaattaaatgaa
aataactatttagacttaaaaattgatcaagatcaaataagaaatactatatattcagat
gatgatgtaaataaatatatagatcaattcaaacaattatcaactaactttttaaatcat
ttcaaaactttaataccatcacttgatgatattaaaaacattaatataactgaattagaa
aaatcacttactgactatatttttaaccaaatagatgaaattgatttaacagataaatat
gatctatatcaaattattattaataattttaatgttattaaagaaaacatagaattaatt
tcaaaatactataatgacaatgataatcaaaatgaaactaaacaagacatacatttagaa
ttattaaaagatgaattaacagtaacttgagaatctaaaaagaagaaatctgaggattta
gaagtaaaagactgaaattcaactattttagaacctagatttattaaaaataaatatttt
aaagatatttatgattttttaagcgttcaacaagaacaaatagaagaacaaaatagtgaa
attgaaaatgttttaagtttaatagatgaagaagataaaactgacgaaatctatgatttt
gaaaaagaaaaattcattattaaagatcgtatagaaaaattagcaaaatcaattaaaaaa
tctaaacaaattattgaacaagattctttagaagataaaatagttcaagtttctaactta
tatgaaaaacaaaaagaaattaaagcaacatttaatttaactaataaacaattaataaat
gattcatataataaatatttaagtttaactgaaaatgaattttatgagttactaataacc
aagtgacttgaaaatattattaaaacatttgaacaaaaaccaattgatataattgatagt
tatgtttctaagtttgaattattatctaaaaaatatgaagatacattagatgatattaat
aatcaaattttaaacagtgaaaaagaattattagatttattaaaagatctaacaggtgaa
gaaagtgatatgagagctgttaatgagttaattaaaattctaggaggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
