Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa: MCCP01_0120
Help
Entry
MCCP01_0120 CDS
T03697
Symbol
rnr
Name
(GenBank) Ribonuclease R
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
mcac
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa
Pathway
mcac03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcac00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCCP01_0120 (rnr)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
MCCP01_0120 (rnr)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mcac03016
]
MCCP01_0120 (rnr)
Enzymes [BR:
mcac01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
MCCP01_0120 (rnr)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCCP01_0120 (rnr)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mcac03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
MCCP01_0120 (rnr)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
S1
OB_RNB
CSD2
OB_RNR_1st
RNase_II_C_S1
S1CSD-TOTE-2
HTH_45
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ17910
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(131548..133662)
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MESKIIEILKTNKHKVSLNKLLTYFNALDYSLIKNYLDQLEKNNKITISLENNIYLLDQI
YKKGTIKLNPKGFGFINDINKINDEDHFIAGVDLNNSIHQDEVVYILKQEEDNRLKAIVI
DLIKRNKVYLIGEINRSFDKRFLDFIPNDKSFDSFRFVIVNKNEFKYEEFNIIKAKIISC
KERKIFIRLIRIIGNSKKASDRILAIAEEFDIKTSFDKQTLDNAKQINLSTDKLEKEFLK
RQNNSLVNKTIVTIDGIDSKDLDDAICVEKLENNNYKLFVAIADVSYFVRYKTALDKEAL
LRGNSTYLANKAIPMLPNILSDDLCSLNPNTKKLVFVCEMEFDNNANMLIKKVYESVIIS
KARLNYDEVNNYFKTKTWTHDDKTKKMLDIAYELYKKLEDLKAKKGTISFDVREPKIILD
KNLNVIDIKTKTADQAEKLIEQFMVSCNEAVAELIYQKDLPFLYRNHNKPDEDELINWYK
SLKTFGINPKLTNKQVLDPIFINHTLSQIKEQIKDETEVELLNISLLRYMDKAKYGLENI
GHFGLASDCYTHFTSPIRRYSDLLVHRYLKQYLITKDLEKTSLENNTNYVNKVSNIINDT
ETKSVECEREVIKACMCEYMLNKVDNTYTATISAVLKFGIFIQLDNLVEGLVHISNMNSD
LVYDETNRILIKPDNTYYRMGQKVKVKLINVDIKKRTIDFVLIE
NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatctaaaattattgaaattttaaaaactaacaaacataaagttagtttaaataaa
ctattgacttattttaatgctttagattattcattaattaaaaactacttagaccaatta
gaaaaaaataataaaatcactatttcattagaaaataatatttacttattagatcaaatt
tataaaaagggaactattaaactaaatccaaaaggttttggatttataaatgatattaat
aaaattaatgatgaagatcattttatagctggagttgatctaaataatagtattcaccaa
gatgaagtagtttatattttaaaacaagaagaagataatagattaaaagctatagttatt
gatctaattaaaagaaataaagtttatttaattggtgaaataaatagaagttttgataaa
agatttttagatttcattccaaacgataagtcatttgatagttttagatttgtaattgtt
aataagaacgaatttaaatatgaagaattcaatattattaaagcaaaaattataagttgt
aaagaacgtaaaatttttataagacttataagaattattggcaatagtaaaaaagcaagt
gatcgcatcttagcaatagctgaagaatttgacataaaaactagttttgataaacaaact
ctagataatgcaaaacaaattaatttatcaactgataaactagaaaaagaatttttaaaa
agacaaaataattctttagttaataaaacgatcgttacaattgatggaattgattcaaaa
gatttagatgatgcaatttgtgttgaaaaattagaaaacaataattataaactatttgtt
gctattgctgatgtttcttattttgttagatacaagaccgctttagataaagaagcttta
ttaagaggtaattcgacttatttagcaaataaagcaattccaatgttaccaaacatttta
tctgatgatttgtgttcattaaatccaaatactaaaaaattagtttttgtatgtgaaatg
gaatttgataataacgcaaacatgttaattaaaaaagtttatgaatcagtgattatttct
aaagctagattaaattatgacgaagtaaataattactttaaaactaaaacttgaactcat
gatgataaaactaaaaaaatgttagacatagcttatgaattgtataaaaaactagaagat
ctaaaagctaaaaaaggaactattagttttgatgttagagagccaaaaattattttagat
aaaaatttaaatgtaattgatattaaaacaaaaacagctgatcaagctgaaaaattaatt
gaacaatttatggtaagttgtaatgaagcagtagctgaattaatctatcaaaaagattta
ccttttttatatagaaatcataataaaccagatgaagatgaactaattaattggtataaa
tcactaaagacatttggaattaatcctaaattaactaataaacaagttttagatccaata
tttatcaatcacactttaagtcaaattaaagaacaaattaaagatgaaactgaagttgaa
ttattaaatatttctttattaagatatatggataaagctaaatatggattagaaaatatt
ggtcattttggtttagctagtgattgttatactcattttacttctccaattagaagatat
tcagatttattagttcatagatatctaaaacaatatctaattacaaaagatctagaaaaa
actagtttagaaaataatacaaattatgttaataaagtaagtaatattattaatgatact
gaaactaaaagtgttgaatgtgaaagagaagttattaaagcgtgtatgtgtgaatatatg
ctaaataaagtcgataatacttatacagcaacaatttcagcagttttaaaatttggaatt
tttattcaattagataatttagttgaaggattagttcatatttcaaatatgaatagtgat
ttagtttatgatgaaactaaccgtattttaattaaacctgataatacttattatagaatg
ggtcaaaaagtcaaagttaaactaattaatgttgatattaaaaaaagaacaattgatttt
gttttaatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
