Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa: MCCP01_0582
Help
Entry
MCCP01_0582 CDS
T03697
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase, DEAD-DEAH box family
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mcac
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
MCCP01_0582
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mcac03009
]
MCCP01_0582
Enzymes [BR:
mcac01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MCCP01_0582
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MCCP01_0582
Ribosome biogenesis [BR:
mcac03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MCCP01_0582
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
PhoH
AAA_19
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ18369
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(616833..618194)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLDQIEFIAPTSIQQKAIPLLKKHQNVIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLKLEENNNYVQAVIISPTRELGLQIYQNTKLFLKNNPLINCNLFIGGEDISKNIEQLE
KKQPHIVIGTPTRLKELYDLNKLRLTTTSYFIIDECDMIFDLGFIEDVDYLISKINQNVT
IGIFSATISQQLSAFCKKYIKNAHFIDDSQNKISTSNVKHILIDTKNKELEQSLIQIINS
INPFLCIIFVNQKDEISKIVEILHKNNIKQVAELHGNLQPRLRLSMLKKIQNNEFKYLVA
TDVASRGVDIKGVSHIISINLPSDLTYYIHRSGRTGRNNSTGYSYIIYNLKNKTQIEELI
KKEIEFETKKLIDNQLVDIKTNYKKVKVFKELDAESKQVINKYKNKKVKPNYKKKRKQEL
DKIKQKIRRKHIKENIEKIKKAKYQKRRSELFD
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttactgattttggttttaaaaagtatattaatgatactttagatcaaattgaa
tttatagctcctacttcaattcaacaaaaagcaattcctttattaaaaaaacatcaaaat
gttattgctttagcacatactggaacaggtaaaactcatagttttttattacctatttta
aataacttaaaattagaagaaaataataattacgttcaagcagtaattattagtccaact
agagaacttggtttacaaatttatcaaaacactaaactatttttaaaaaataatccttta
attaattgtaatttatttattggtggagaagatattagtaaaaatattgagcaactagaa
aaaaaacaaccacatattgtaattggaacaccaactagattaaaagaactttatgattta
aataaactaagactaacaactacaagttattttattattgatgaatgtgatatgattttt
gatctgggtttcattgaagatgttgattatttaatttctaaaattaatcaaaatgttaca
attggaatatttagcgcaactatttctcaacaacttagtgcattttgtaaaaaatatatt
aaaaatgctcattttattgatgatagtcaaaataaaatttcaacaagtaatgttaaacat
attttaattgatactaaaaacaaagaactagagcaaagtttaatacaaattattaattca
attaatccttttttatgtattatttttgttaaccaaaaagatgaaattagtaaaatagtt
gaaattttacataaaaataatattaaacaagttgctgaattacatggtaatctacaacca
agattaagattatcaatgttaaaaaaaattcaaaataatgagtttaaatatttagttgca
actgatgttgcttctagaggtgttgatattaaaggtgtaagtcacattatttcaattaat
ttaccaagtgatttaacttattatatacatagatctggaagaactggaagaaataattca
actggatatagttatataatttataatttaaaaaataaaactcaaattgaagaactaatt
aaaaaagagattgaatttgaaactaaaaaacttattgataaccaattagttgacataaaa
actaattataaaaaagttaaagtttttaaagagttagatgctgaatcaaaacaagttata
aataaatataaaaataaaaaagtaaaaccaaattataagaaaaaaagaaaacaagagctt
gataaaattaaacaaaaaataagacgtaaacatattaaagaaaatattgaaaaaattaaa
aaggcaaaatatcaaaaaagaagatcagagctatttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
