Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa: MCCP01_0716
Help
Entry
MCCP01_0716 CDS
T03697
Symbol
rnjA
Name
(GenBank) Putative ribonuclease J 1
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcac
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa
Pathway
mcac03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcac00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCCP01_0716 (rnjA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
MCCP01_0716 (rnjA)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcac03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCCP01_0716 (rnjA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
RMMBL
Lactamase_B_2
Sacchrp_dh_C
Lactamase_B_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ18503
LinkDB
All DBs
Position
I:751484..753325
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MSNKDNKKNLEINDTENENQINSYDDDGDQLNISIDEKEFKPYVFKQKEVKRQYQKTNIP
TKIFALGGLEEVGKNTYCIEYDNELIMIDAGVKFPESTMLGVSAVIPDYSYLVENQKKIK
ALFITHGHEDHIGGIQYLVQQVKIPVIYAPKLAAMLIRDRLKEYKIEDKTIVKEYDADDV
WKTKNFKVSYAALNHSIPDAFGILVQTPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELTKLASMGEN
GVELLMADSTNSEVEGYTQGEKSIISNIDKLFLQAKGRIFLTTFASNVHRIQHIIETAHK
YNRKIVILGRSFERIIKIIRQIGHLKISEKEFIKSTDIDKYKPEELMILTTGGQGEPMAA
LSRIANNKHLSINIIPGDTVVFSSSPIPGNRADVEKLVNKLTRVGAKVIENTSDNKIHTS
GHASQEEQKLLFSLIRPKYFMPMHGEYRMLKKHVETGESVNLEKGNGFIMANGDVLELLQ
GKAKIGKRVEADAVYVDGKDMTGKASNVIREREILSKDGLIAVVISLDSQTNRLIAQPRI
ISRGSFYVKDAGSIISDSIQIITNAVNEVLMSSKPTFAAIKKAIKSSLSPYIFRVKRRSP
LIIPVILNKKLNR
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaacaaagataataaaaaaaatctagaaataaatgacacagaaaacgaaaaccaa
attaatagttatgatgatgatggtgaccaattaaatattagtattgatgaaaaagaattt
aaaccatatgtatttaagcaaaaagaagttaaaagacaatatcaaaaaacaaatatacct
actaaaatttttgctttaggtggattagaagaagttggaaaaaatacttattgtattgaa
tatgataatgaattaattatgattgatgcaggagtaaaatttcctgaatcaactatgcta
ggagtaagtgctgttattccagattattcttatttagttgaaaatcaaaaaaagattaaa
gctttatttattactcatggtcatgaagatcatattggtggaattcaatatttagttcaa
caagtaaaaattcctgtaatttatgctccaaaattagctgctatgttaattagagataga
ttaaaagaatataaaattgaagataaaactattgttaaagaatatgatgctgatgatgta
tgaaaaactaaaaactttaaagttagttatgctgcattaaaccactctattcctgatgca
tttggaattttagttcaaactcctaatggtaatattttttcaacaggagattataaattt
gactgatcaccactaggacattttgctgaacttacaaaattagcttcaatgggtgaaaat
ggggttgaattattaatggcagattcaactaatagtgaagttgaaggatatacacaaggc
gaaaaaagtattatttcaaatattgataaattgtttttacaagctaaaggaagaatcttt
ttaaccacttttgcttcaaatgttcatagaattcaacacattatagaaacagctcacaaa
tataatagaaaaattgttattttaggtagatcatttgaaagaattattaaaatcattcgt
caaattggtcatttaaaaattagtgaaaaagaatttattaaatcaactgatattgacaaa
tataaaccagaagaattaatgattttaacaacaggtggtcaaggcgaaccaatggctgct
ttatctagaattgctaataataaacatttatcaataaatattattcctggtgatacagtt
gtattttcatcttcaccaattccaggaaatagagctgatgttgaaaagttagttaataag
ttaactagagttggagctaaagttattgaaaatacttcagataataaaatacatacttca
ggtcacgctagtcaagaagaacaaaaattattatttagtttaatcagaccaaaatatttc
atgccaatgcatggtgaataccgtatgttaaaaaaacatgttgaaactggtgaaagtgtt
aatttagaaaaaggtaatggttttataatggctaatggtgatgtattagaactattgcaa
ggtaaagctaaaattggaaaacgtgttgaagctgatgcggtttatgttgatggaaaagat
atgactggaaaagcaagtaatgttattagagaaagagaaattctttcaaaagatggatta
attgctgttgtaatttcattagattcacaaactaatagattaatagctcaacctagaatt
atttctcgtggtagtttttatgtaaaagatgctggttcaataattagtgattcaattcaa
attattactaatgcagttaatgaagtattaatgtcatcaaaaccaacttttgcagctatt
aaaaaagctattaagtcttctttaagtccatacatttttagagtaaaaagaagaagtccg
ttaattattccagtgattttaaataaaaaacttaatagataa
DBGET
integrated database retrieval system