Entry |
|
Symbol |
dnaE
|
Name |
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase III (Polc)
|
KO |
|
Organism |
mcac Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 9231-Abomsa
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:mcac00001]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MCCP01_0733 (dnaE)
03430 Mismatch repair
MCCP01_0733 (dnaE)
03440 Homologous recombination
MCCP01_0733 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:mcac03032]
MCCP01_0733 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcac03400]
MCCP01_0733 (dnaE)
Enzymes [BR:mcac01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MCCP01_0733 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:mcac03032]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCP01_0733 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcac03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCP01_0733 (dnaE)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
I:complement(770813..773773)
|
AA seq |
986 aa
MNYLPLLTIKSEYNFLESLITIDSYIKFIKKNNFSYAFYNETHTMYGVAEFFKKAIDNNI
KPIIGLTLELEENKLCIYAKNRQGYQILNYLSSFLNDGFSHHDYEIKEYFLNLVNNNVVV
IGLISNLDFKISLKNQLNNDFYDVKELNLYFNQISYLDINDQRIFNILNAIKTNKTIDQI
QNINNYFYPDIDYLSKNYSLENIKKVISEINSKVDFNLFDSNEKHLVKYKNINNLSSFEY
LRQVCLLSLKKYQQKIKPNLDLKLYINRLNYELEIIKQMRFSDYFLIVSDYVNFAKKNDI
LVGPGRGSAAGSLISYLLRITDIDPLEYDLLFERFLNPDRSSLPDIDLDFQDNRREEVLE
YLFEKYGKNHVGMITTYQTIGYKMAWRDVCRVFNIDLLIVNKISKVLDQYTNFDFLEFIK
ENKLLNDYFQNDLFKEIFITMHKIVGLPRQTSTHAAGIVLTDCDLRELVPIKIGFNGINQ
TQFDMNYLDALGLIKMDILGLRNLTTIQEIKHLIYLNQNLKINLNKIDLNDKKAFELLKN
KQTSGIFQLESKGMTDLISKMQVDSIEQISIASALYRPGPQEMIPIYLENKKTNKFKIID
KSVYEILKPTYGIIVYQEQVMQMLNKVANFSYAKADIIRRAMSKKNNKVMQSMKLEFINS
AIKNNFSYNKANLIWNWIEKFSNYGFNKSHSISYSYISYWLAYFKAHFTTEFYTSLLDQN
IGNEIKTQQYIKELYDYKIKVNKPSVINSNFNYQIINKQIYMPLTCIKSIGYEVVKKINL
AKSENENMYLDIHNFILAIIKQKINVNVLQTLIKAGALDIFNYNKKTMIENLDLLISQAN
AYKQVNNILDDEKINLIIYDEYEDKILASFEKELYGFFIDQNPILKLKTNNFNLNLIDIS
KLEYNKVQVILGYILKIKEIKDKNNNKMAFVTVFDNTSELELTIFSSDYKDIYDQLIENK
AYVFKVLKTKTNNKTSIKFISLIKAI |
NT seq |
2961 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaattatttaccattattaactattaaaagtgaatataattttttagaatctttaatt
actattgatagttatattaaatttattaaaaaaaataattttagttatgctttttataat
gaaactcacactatgtatggagtagctgaattttttaaaaaagctattgataataatata
aaaccaataattggcttaacattagaacttgaagaaaataagttgtgcatttatgcaaaa
aatagacaaggttatcaaatacttaattatctttctagttttttaaatgatggatttagt
catcatgattatgaaattaaagaatattttttaaacttagttaataataatgttgttgta
attggtttaattagtaatttagattttaaaattagtttaaaaaatcaattaaataatgat
ttttatgatgttaaagaattaaatttgtattttaatcaaataagttatttagatataaat
gatcaaagaatttttaatattttaaatgctattaagactaataaaacaatagatcaaatc
caaaatattaataattatttttatccagatattgattatttatcaaaaaattattcatta
gaaaatattaaaaaagttattagtgaaattaattcaaaagttgattttaacttgtttgac
agtaatgaaaaacacttagtaaaatacaaaaatataaataacttatcttcttttgaatat
ttgcgtcaagtttgcttattatcattaaaaaaatatcaacaaaaaattaagcctaattta
gatttaaaactatatattaatagattaaattatgaattagaaattattaaacaaatgaga
tttagtgattattttttaatagttagtgattatgtgaattttgcaaaaaaaaatgatatt
ttagtaggtcctggtagaggaagtgctgctggtagtttaattagctatttattaagaatt
acagatattgatccattagaatatgatttattatttgaaaggtttttaaatccagatcgt
tctagtttaccagatattgatttagattttcaagataatagaagagaagaagttttagaa
tatttatttgaaaaatacggcaaaaatcatgttggtatgattacaacttatcaaactatt
ggttataaaatggcttgaagagatgtatgtagagtttttaatattgatttattaatcgtt
aataaaatttctaaagttttagatcaatacacaaattttgattttttagaatttattaaa
gaaaataaattattaaatgattattttcaaaatgatttgtttaaagaaatatttataaca
atgcataaaattgtaggcttaccacgtcaaacatcaacacatgcagctggaattgtatta
actgattgtgatttaagagaacttgttcctattaaaattgggtttaatggaattaatcaa
actcaatttgatatgaattatttagatgctttaggtttaattaaaatggatattttagga
ttaagaaatttaactactattcaagaaattaaacacttaatatatttaaatcaaaactta
aaaattaacttaaataaaattgatttaaatgataaaaaagcttttgaacttttaaaaaat
aaacaaacttcaggaatttttcaacttgaatcaaaaggaatgactgatctaatttcaaaa
atgcaagttgatagtattgaacaaatttcaatagcttcagctttatatcgtccaggtcct
caagaaatgattcctatttatttagaaaataaaaaaactaataagtttaaaatcattgat
aaaagtgtttatgaaattttaaaaccaacttatggaattattgtttatcaagaacaagtg
atgcaaatgcttaataaagtagctaatttttcttatgcaaaagcagatattattagaaga
gctatgagtaaaaaaaataataaagtaatgcaatcaatgaaattagaatttattaatagt
gcaattaagaataatttttcttataataaagctaatttaatttgaaattgaattgaaaag
ttttcaaattatggatttaataaatcacattctatttcttattcttatataagttattga
ttagcttattttaaagctcattttacaactgaattttatactagtttattagatcaaaat
attggtaatgaaattaaaactcaacaatatattaaagagttgtatgattataaaattaaa
gttaataaaccaagtgtaattaattctaattttaattatcaaattataaataaacaaatt
tatatgcctttaacttgtattaaatcaattggttatgaagtagttaaaaagattaattta
gctaaaagtgaaaatgaaaatatgtatttagatattcataatttcatactagctataatc
aaacaaaaaattaatgttaatgtattacaaactttaataaaagctggagctttagatatt
tttaattataataaaaaaacaatgatagaaaatctagatctattaattagtcaagctaat
gcttataaacaagttaataatattttagatgatgaaaaaattaatttaattatttatgat
gaatatgaagataagattctagcaagctttgaaaaagaattatatggtttttttattgac
caaaatcctattttaaaacttaaaactaataattttaatttaaatcttatagatatttct
aaacttgaatataataaagtgcaagtgattttaggttatattttaaaaattaaagaaatt
aaagataaaaataacaataaaatggcatttgtaacagtttttgataatactagtgaactt
gaactaacaatttttagtagtgattataaagatatttatgatcaattaatagaaaataaa
gcttatgtttttaaagtactaaagactaagacgaataataaaacttcaataaagtttatt
agtttaattaaagctatttag |