Mytilus californianus (California mussel): 127702426
Help
Entry
127702426 CDS
T08804
Name
(RefSeq) macrophage mannose receptor 1-like
Organism
mcaf
Mytilus californianus (California mussel)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lectin_C
Kringle
UL45
ShK
Clec-141-158
Chordopox_A33R
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127702426
NCBI-ProteinID:
XP_052062584
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1947 aa
AA seq
DB search
MYNSLSVRMKREAFICVILAIIISANGQVCPPGWVDGPMGKKCYLFADNHQRNWFEAKYV
CNSMRAELLSIEDSLEMAWIKQELKRVKAQVTGTSEWWTSLQKNGTVWNWSSNIALDDTV
VRWGSGEPNNYQNKEHCAEICCPHFLNDINCEKRINYICELDKETNPLTCDADNGWEYHQ
GSCYKFVQKFKTWNQSALDCKDLDSNLAAVADTGPLHAVSTISSFQQYDSWVGIIRKYKT
FFYTNSSEAIGIDSYIQPSKTTDNFDPACLTINSTVKDAAKGLYPDSCTTPKPYICQKPE
GVCKPGYQQHQSMCYYLSYTEQNRTGAETLCKAMKMSVVDITSASKSSYLVSLLKQRGDI
GEIWIGLKKQSTNNWYWPSTGEVPSLKYWTYISPNSNETLYDCAYMNVGDNGKWNINFPC
NRTLRVVCEVPATTSFTTTTVAPPTTTTTPAPATTATTTSKTTNAAMTEPGVSTAVPVQE
CIMDQMGKNYRGTISQTNTGRTCQAWSLQVPHKHSYSDQLSDQKNYCRNADDEPYGPWCY
TTDVNQRWEYCDIPYCAGAVTPVIPTTTTTIAVTTTAAKTWSEKCGFFWENSPIPDVCYH
FDNRLSSWMEARTKCQTLGGKLVSITSTHEQLYLAGRLLSSNFRSMWIGANCRGADEGWR
WSDGSPFSFLHWMQDQPDGLENGEDCVSMDTKLGQWEDQECDVKQGFICRKSVAAPTLPL
IPTTSPVIGKGQTYGCPGGWVSYKSNCYLIARNKTTWNAARSICRKNGADLTSIAEEGEQ
DFITSQIPKTHCYNIHSNDTQCDLWRDQGECQKNPVWMARSCHKSCNLCIRDCKNIHYSV
ECDHWASVGECYKNPSYMLQNCPLSCGICDSAIYGGFWIGFSDTAFQMNFKWSDDSTVEY
TKWAKSEPNNWNGQTREDCVIILLKNGKWNDVPCDMANAGFICKKRKQVLDEVTQSPLAV
GCVNNTIGYDAYCYGINDEMTDWATAESGCAQVQYGHLATINNVYTQLFLASQIVGKSGH
YWIGLTQDVNPGAMVSWTSGLPVSYTAWARSHTGSIDEDAMCVAMTATHPIGLWETKNCT
LEKSYICEYPREGYTTPTTTTTTVAPVFCPPSWLGFNGYCYKTIYKSADQRTWMKSRDFC
RERGADLASIHSSEENNFLRNRMIRYRNYENIWVGLNDRDSENGFEWSDGSPVDFMMWGT
NEPNDKYQQEDCVSINRYGSGWNDDNCYKTESFICKIQKGMPLIEPNDTYTKEYCDSDWL
YFDGYCYLMKSYDRKNFKDAAKICNDKKSNLLSIHSQHESNWILEHIYRRSGMWIGLNKL
NHQYEGYRWNDNSPVDYVSWGSGKPSSPSVNKCVMIQSSSGRWTDFNCNRGVNGYICKRK
NDTDSFTTTPASSIPTVRGGCLGGFVRSTFNSKCYRFFKTKKTWSQAKATCETYGRTYGL
VTIQSELEQMFITTMLINSLEMVWIGMTDEHTFRKYYWDDSSQVSYTNWNSKEPNGYNEH
CVDLFVIKEKFGEWNDERCSSSLYFICQGLQNPLFPIETSESEYCPLGYDKYDQMCYKLL
EATNDWNTSLSKCQEDGGSLASIRNLPEKSFVSYLTYNKSSLPFWIGLNKMNSEDGITYK
WSNGWPVIYTNWNSDYLPSKPCIAVGEDFWRDKDCDTKLPALCQINKISPPKAADQSTCP
QGGYVFGDKCYYPILHNPLTWFKAKEECDNKGLTLTSIQNLDQIDYLINLIQKLAGSRLE
VWIGLNKLNRFSQSWSWVDSSSKTFENWNSGEPSTSWHSSTSDECVEMRPDGTWNDINCH
DYERPFICSGDTDRAVTPPIATTATTKAGNTVAIETTEVTNTYLPTTTTPLVAKPRDDEF
VSQKRVSGVTTGLTTGQIIGILIGILGCFVIVAAILFIIRFNRQNDSYKPKTHSFANALY
LKTSEENNEDDPNAIGSIVKICGADPL
NT seq
5844 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataacagtctatctgtgaggatgaaaagggaggcgttcatctgtgtgattctcgca
attattattagtgccaatggacaagtttgtccacctggatgggttgatggtcctatgggc
aagaagtgctacctttttgctgataaccaccaaagaaattggtttgaagctaaatatgta
tgtaattctatgcgggcagagttgttatcaattgaggactcccttgaaatggcatggatt
aaacaagaactgaagagagtaaaagcacaggtaactggtacttcagaatggtggaccagt
ctacaaaagaatggaacagtttggaactggagtagtaatattgcattagatgacactgtt
gtacgctggggttcaggtgaacccaataattatcagaacaaggaacattgcgcagaaatc
tgttgcccacatttcttaaatgatatcaattgtgaaaaaaggatcaattatatttgtgaa
cttgataaagagacaaatccattgacctgtgatgcagataatggatgggagtaccaccag
ggatcatgttataaatttgtccaaaaattcaagacgtggaatcagtcagcattagactgt
aaagatttagactctaacctggcagctgttgcagatactggtcccctacatgcagtttct
acaatatctagcttccaacagtacgattcctgggttggaattataaggaaatacaagaca
ttcttttatacaaattcctctgaagctattggaattgatagttatatacagccaagtaaa
acaacagataattttgaccctgcctgtttgactataaacagtacagttaaggatgcagca
aaaggcctgtatcctgatagctgtacaactccgaaaccatacatctgtcaaaagcctgaa
ggagtatgtaaacctggatatcaacagcatcagtcaatgtgttactatctgtcgtacaca
gaacagaacagaactggtgctgaaacactttgtaaagccatgaaaatgtcagtggtggac
attactagtgctagtaaatcatcatatctggtcagtttgttgaagcagagaggagatatt
ggtgaaatatggattggattaaaaaaacagagtactaataactggtactggcctagcaca
ggcgaagttccatcgttgaaatactggacatacatctctccaaatagcaacgaaacattg
tatgactgcgcttatatgaatgttggagataatggcaaatggaatataaacttcccatgt
aatagaacactcagagttgtatgtgaggtaccagctacaacaagttttacaactacaaca
gtggctccacctactactactacaactccagctccagcaacaacagcaacaacaacttca
aaaacaacaaatgcagctatgaccgagccaggtgtttcaactgctgtaccagtccaagag
tgcataatggatcagatgggtaagaattatagaggaactattagtcaaactaacacaggt
cgtacatgccaggcttggtcattgcaagtcccccataagcatagctatagtgatcaactc
tctgatcagaagaactactgtcgtaacgcagatgatgagccatatggtccatggtgctat
acaactgatgtaaaccaaagatgggagtattgtgatataccgtattgtgctggagcagtt
acaccagtcatccccactactactacaacaattgcagttacgacaactgctgctaagaca
tggagtgaaaaatgtgggtttttttgggaaaattcacctatccctgatgtttgttatcat
tttgataatcgtttatcaagctggatggaagcaagaacaaaatgtcaaacgttgggtgga
aagctagttagtatcacatcaactcatgaacagctttaccttgctggacggttgctaagt
agtaatttcagatcaatgtggataggtgccaattgtcggggagcagatgaaggctggaga
tggtctgatggttcgccattctcctttctacattggatgcaagatcagcctgatgggctt
gaaaatggtgaagactgtgtttctatggatactaagttaggacaatgggaagatcaagaa
tgtgatgtcaaacaaggctttatttgtagaaagtcagttgctgcaccaaccctgccacta
attccaacaacatcacctgtaattggaaaaggccaaacctatggttgtccaggtggatgg
gttagttataaatcaaactgctatttgattgctagaaacaaaaccacatggaatgctgcc
agatctatttgtaggaagaatggcgctgatttaacttcgattgcagaagaaggagaacag
gattttattacaagccaaatccctaaaactcattgctacaacatccattccaatgatact
cagtgtgatttatggagagatcaaggagaatgtcagaagaacccagtatggatggcaagg
tcgtgtcataagagctgtaacttgtgtattcgggattgtaaaaacatccattattctgtg
gagtgtgaccactgggctagtgttggtgaatgttacaaaaacccatcttatatgctacag
aattgtccattgtcatgtggaatttgtgattcagctatctatggtggattttggattgga
tttagtgatactgcattccaaatgaattttaaatggtcagatgatagcactgtcgaatat
acgaaatgggcaaaatctgagcccaacaattggaatggtcagacacgggaggattgtgtt
attattcttctgaagaatggaaaatggaatgatgttccttgtgacatggccaatgctgga
tttatttgtaagaagaggaagcaggttttagatgaagttacacagtcaccactagctgtt
ggttgtgtcaataacaccattggttacgatgcttactgttatggaatcaatgatgaaatg
acagattgggcaacagcagagagtggttgtgctcaagttcaatatggacatctggctaca
ataaacaatgtgtacacacagttgtttttagctagtcagatagttggtaaatctggacac
tattggattggtcttacccaggatgttaaccctggtgccatggtttcttggactagtggt
cttccagtatcatatacagcttgggccaggagtcatacagggagtattgatgaagatgct
atgtgtgttgccatgacagcaacccatcctattggattatgggaaaccaaaaactgtaca
ttagaaaagtcctacatttgtgaatatcctagagaaggttacactacacctacaactaca
actactacagtagcacctgtattctgtcctccatcttggttggggtttaatggttattgt
tataagactatatacaagagtgctgatcaaagaacttggatgaaaagccgtgacttctgt
cgcgagagaggagctgatttagccagtattcacagtagtgaagaaaacaactttttgaga
aacagaatgattcgttatcgtaactatgaaaacatttgggttggtttaaatgatagagat
tcagaaaatggttttgagtggtctgatggatccccagtggacttcatgatgtggggaaca
aatgaacctaacgataaatatcaacaagaggattgcgtttcgatcaatagatatggcagc
ggatggaatgatgataattgttacaagactgaatcgtttatttgcaaaattcagaaaggg
atgccattgatagaaccaaatgacacatacactaaagaatattgtgatagtgattggcta
tattttgatggctattgttacttaatgaaatcatatgacaggaaaaatttcaaagatgcg
gcaaaaatatgtaacgataaaaaatccaacttacttagcatccattctcagcatgaaagt
aattggattttagaacatatttacagacggtctggaatgtggattggtctgaataagtta
aatcatcagtatgaaggctacagatggaatgataattccccagtagactatgtatcctgg
ggttcaggcaaaccaagttctccttctgtcaacaagtgtgtcatgatacagtcgagttca
ggtcgttggactgacttcaactgtaatagaggcgtaaatggttatatttgcaagagaaag
aatgacacagatagttttacaacaaccccagcctcttctatacctacagtgagaggtgga
tgtttaggaggattcgtcagatctacattcaatagtaaatgttatagattttttaaaaca
aagaaaacttggagccaagcaaaggcaacttgtgaaacttatggaaggacttatggtttg
gtcactatacagagtgaattagaacagatgtttataaccactatgctgattaacagccta
gagatggtttggataggaatgacagatgaacatactttcaggaagtattattgggatgat
agttcacaagtttcatacactaactggaactctaaggagcctaatgggtataatgaacat
tgtgttgatctctttgtgataaaggagaagtttggagaatggaatgatgaaagatgcagt
tcatctttgtatttcatctgtcaggggttacaaaatccattattccctatagaaacttct
gaatctgagtactgtccactaggatatgacaaatatgatcaaatgtgttacaaattactt
gaagcaactaatgattggaatacttcgttgtcaaaatgtcaagaagatggaggtagctta
gcatccatacgtaatcttccagagaaaagttttgttagctatctcacgtataacaagtca
tcactaccattttggatcggcctcaacaaaatgaattctgaggatggtataacttataaa
tggagtaatggttggcctgtaatttacactaattggaattcagattatttgccaagtaag
ccttgtatagctgttggagaagatttttggagagataaagattgtgataccaaacttcca
gcattgtgtcagatcaataaaatatcaccaccgaaagcagcagatcagtccacttgcccg
caaggtggttatgtatttggggacaaatgctattatccaattctacataatcctttgaca
tggttcaaagcaaaggaagaatgtgataacaaaggattaacattgactagcatacaaaac
cttgatcaaatagattatttgattaatttgatccaaaaattggctggaagcagattggag
gtttggatcggattgaacaagctgaatagattttctcaatcctggtcttgggtagactca
tcttcaaagacatttgaaaactggaacagtggggagccttcaacatcatggcatagtagt
acatccgatgaatgtgtggaaatgagaccagatgggacatggaatgatatcaattgtcat
gattatgaaagaccatttatttgtagtggtgacacagatagagcagttacaccaccaatc
gccactacagctacaacaaaagcaggaaacactgttgccatagaaacaactgaagtaaca
aatacatatttaccaacaactacaacaccacttgtagcaaaaccaagagatgatgaattt
gtcagtcaaaaaagagtttcaggagtaaccacaggtttaacaacaggacaaataattgga
attctaattggtattttgggatgttttgtaatagtggcagccattttatttatcataaga
ttcaatagacagaatgactcatataaacctaaaacccacagttttgcaaatgccttgtat
ctaaaaacatcagaagaaaataatgaagatgatccaaatgctattggttctattgtgaaa
atatgtggggcagatcctttgtga
DBGET
integrated database retrieval system
