Mytilus californianus (California mussel): 127728989
Help
Entry
127728989 CDS
T08804
Name
(RefSeq) contactin-like
Organism
mcaf
Mytilus californianus (California mussel)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_3
I-set
Ig_2
ig
fn3
V-set
Ig_5
Izumo-Ig
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127728989
NCBI-ProteinID:
XP_052092524
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MDGAALVSVNTLVEHQFVSQWLMANDPAINTWYSSGIIDEETLKMRWEGDVYEYLWSREY
SLISLPYICEISQTEAYKIVKEDRDFDFGSNFSDPAFAPKGPKFVLHQQSVVVVRTDRTL
IAEIEYIATGIPQPNYKIIQTDVEGNVTDMTTLVDSRYTVTNGKLTIQSPNEALDSGTYF
CIAQNEFGLVVSNPMVLSFGFLSEFSNVEPSPVNAYNDDRAAIDCTAPNYRPAVIYQWYK
GNYHFIRPDLHAYMFISRNGKLYFSVVSTNDAGNYRCIVKLSSNNGAAIGTNQPPSRISL
PIQLRILNAAASIWGPEIANDFPAVFPTTPKRGQNVHLECLAYGSMPISYYWTRNGLPMP
PDAYMEDHNRVLVIPTAKVEDSGNYTCHVTRQNVHGDFKHFYLSVEAEPFFLFSLKDQHI
DQGSQLTWHCAARGIPAPTYFWLKNGVRLHTIEGDITVSNNVLVIHNADPARHNGMYQCG
AENKHGISHTEGQLRVLGFKPTFIKRPVEEVVYGALGGNASFTCQPEAAPFPIFKWLKNG
AEINLVPGDTSSRIMMLTNGNLLITEINTLDAGYYTCVVENSFGIASNAGQLVITSRTVI
SVRPQPVTASLNETAFIRCQATVEQNIDLVYGWNFNGHQIDVDNDIHFTLGTSYMLSGLF
VRMAQHKHAGYYECVAKTPMDTDKAGTTLTVIGPPGEIAYVYVETGTITATSARLGWVLG
YRYQNPVLYYVVENANEPYTNWTVFIPNLPEANVIIPIEDNSKRLYQLTGLNPGVPYKFR
VRAANAFGIGPISRPSVIYRTLMAPPPKAPDNVGGGGGMVADLTISWDTLPPLHQGGPGI
GYYVYWRLKGGDTWSKEAVNGNVGVFVTQIGVNNYYLQYDVKVQPFNNLGGGPNSTISTI
YSAEDLPIVTVTGINAYRYNATAILVTWDSVNNTREVMKGKIMGYQVNYWERSDPDPIVD
SISWRTLDTYGLCIGLLPNTWYEYDVQVFNSAGVNSRGEVYFQRTTLNAPLSYPTEVAVA
SHGSDSVAVSWRGILIGPEEESLTGYIVRYWLQGDDITQATELKTDMETHAVIYGIGKGE
LYQLRLAATNRGGDGNFGNTVHFTLGGQVVIDPTLSEIRAGVNGLVPSLICIHITCLLSC
TFHLLSYF
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatggtgctgccttagtaagtgttaacacattagttgaacatcagtttgtgagtcag
tggttaatggcaaacgaccctgccataaacacttggtactctagtggtattattgacgaa
gaaacactaaaaatgagatgggagggtgatgtgtatgaatatctttggagtagagagtat
tccttaatatctttgccgtatatatgcgaaatcagccagactgaagcctacaaaatagtc
aaagaagacagagattttgattttgggtcaaatttctctgatccagcgtttgcacctaaa
ggtccaaagttcgttctccatcaacaaagtgtagttgttgttcgaactgatcgtacattg
attgctgaaatagaatatatagccactgggatacctcaaccaaattacaaaatcattcaa
acagatgttgaaggcaatgttacagacatgactacactagttgattctcgatacactgtc
actaatgggaagttgactattcagagccctaacgaagctttggattcagggacttatttc
tgcattgcacaaaacgagtttggtcttgtagtctcaaatccaatggtgctgtccttcgga
tttttgtcagagttcagtaatgttgagccatcaccagtaaatgcctataatgatgacaga
gcagcgatagactgtacagctcctaactatagaccagccgttatttaccagtggtacaag
gggaattaccattttatacgtccagatcttcatgcgtatatgtttatttcaaggaatggt
aaattgtatttttctgttgtgtctaccaacgacgccggaaattaccgatgcattgttaaa
ctgtcatctaataacggagcggccattggaacaaatcagcctccaagcaggataagtctg
ccaatacagcttcggattcttaatgcagctgcatctatttggggaccagaaattgctaac
gattttccagcagtgttcccaactactccgaagcgtggacagaatgttcatctggagtgt
ttagcgtatggatcaatgccgatatcctattactggacacgcaatgggctacccatgcca
ccagacgcctacatggaggatcacaacagggtgttagttataccaacagctaaggtagag
gatagcggaaattatacatgtcacgtgacaaggcaaaatgtacatggtgatttcaagcat
ttttatctctctgtagaagcggaaccgtttttcctgttttcactcaaagaccagcacatc
gatcaaggaagccaactaacatggcactgtgctgcacgtggaatacctgctccaacatac
ttctggttgaaaaatggcgtcagactgcatacaattgaaggggatataactgttagtaat
aatgttcttgttattcacaatgctgatcctgcccgtcataatggaatgtatcaatgtgga
gcagaaaataaacacggaataagtcacacagaaggacaattacgtgttctaggttttaaa
cccacttttataaaacgcccagtagaagaagtggtgtatggtgctctcggcggcaatgct
tcatttacatgtcaacccgaggcagctccgtttccaatattcaagtggttgaaaaatggt
gctgaaataaatttagttccgggagacacatcctccaggataatgatgctaactaatgga
aacctgttgataactgaaataaacactcttgatgcaggttactatacatgcgtagttgaa
aatagttttggaatagccagcaacgcaggacagttggtaatcacaagcagaacagtgatt
agtgtaaggcctcaacctgtaacagcttctctaaatgaaactgcttttatcagatgtcag
gcaacagttgaacaaaatatagatcttgtttatggttggaattttaatgggcatcaaatt
gatgtcgataacgacattcactttacattaggcacatcatatatgctgtcaggtttgttt
gtaagaatggcacaacacaagcatgctggatactatgaatgtgtagctaaaactccaatg
gacacagacaaagcaggcacaacattgactgtcatcggtccacctggagaaattgcatac
gtgtatgtggaaactggtacaataacagcaacttctgcacgccttggttgggttctagga
tatcgatatcaaaatccagtattatattatgtagttgagaatgctaacgaaccttataca
aactggacagtttttataccaaatctaccggaagctaatgtaatcattccgatagaagat
aacagcaaaagactttatcaattgactggacttaatcctggagttccttataaattcaga
gtaagagccgccaatgctttcggtatcggacctataagtagaccatcagttatttatcga
accctgatggcaccgccacctaaagcacctgacaatgtcggaggtggtggtgggatggta
gctgacttgacgataagctgggatacacttccacctttgcaccagggtggaccaggaatt
ggctattatgtttactggagattaaaaggaggagacacatggtcaaaggaggctgtaaat
gggaatgtgggagtgtttgttacacaaattggagtgaacaactattatctacagtatgat
gtcaaggttcaaccgttcaacaatttaggaggaggacccaattcaactatatctactatt
tactctgcagaagatttgcctatcgtaacagtaacgggtatcaacgcttatagatataat
gcaactgcaattttggtaacatgggattcagttaataacacccgagaggtaatgaaaggg
aaaatcatgggatatcaagtaaattattgggaacgaagcgatcctgatccaattgttgat
tctataagttggagaacactagacacgtatggactttgtattggactgttaccaaacaca
tggtatgagtacgatgtacaagttttcaattcagcaggagttaattccagaggagaagta
tactttcaaagaacaacactaaacgccccattatcatacccaacggaagtagctgttgct
tcacatggatctgatagtgtggcggtatcgtggagaggtattttgataggacccgaagag
gaatctctcacaggatacatagtaagatattggttacaaggagatgacataacgcaagcc
acggagttgaagacagacatggaaacgcatgctgtaatctatggtatcggtaaaggtgaa
ctttaccagttacgactagctgctacaaatcgtggcggtgatggaaacttcggaaacact
gtgcattttacactaggtggacaagtagttatagatccgaccttgtctgaaattagagct
ggagtaaatggattagttcccagtttaatatgcattcatataacttgcttattgtcgtgt
acatttcatcttttgagttatttctga
DBGET
integrated database retrieval system