KEGG   Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_00590
Entry
MCAV_00590        CDS       T10838                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mcag  Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag03030  DNA replication
mcag03430  Mismatch repair
mcag03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcag00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MCAV_00590
   03430 Mismatch repair
    MCAV_00590
   03440 Homologous recombination
    MCAV_00590
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mcag03032]
    MCAV_00590
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcag03400]
    MCAV_00590
Enzymes [BR:mcag01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MCAV_00590
DNA replication proteins [BR:mcag03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAV_00590
DNA repair and recombination proteins [BR:mcag03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAV_00590
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP RNase_H_2 HHH_6 HHH_3 DUF655
Other DBs
NCBI-ProteinID: XBA50904
LinkDB
Position
66349..70686
AA seq 1445 aa
MNNFWNYKDTLLSLVNYNNIIKKYLTQELCILKTSDFDDLTKVATIYFQAKKFNEIHFHL
KFDELPVYQTFKTLLMHKNHLCLDQTKICFSWNTQNLFNPKTISNILELYLLDQFPNNPL
TLSLATQKIQLENDLVTFVFDNQNSYQGFQFVHSDINKFLSLFFNKNNLNINFVCSFDQE
EKTPTTESVKLEVENEVSDVTLSIPLLKIAPLSSEKFYQVWKIETKINFNKSKNIILQIK
NDNLFYACLLANKLLTKDCFKKLKTNDWIQIKKFSVSDAKDAKSSDYLVDDFVIVDLKQT
ITKKESYPNQFANLSLHTKSSSHDGLFTYEDFLATASFYQHKALGITDWNAVTEYPLIEK
LAKKYQIKPIYGVELEILNTPIAIAINCDNKTEKISEVSYCIFDIETTGLNALFDDIIEI
AVTKFDNHIKVDSYQTFIQTNQKIKPFIQELTKISNEMLDQKGQPIDLALKQFLDFIGDS
VLVAHNGINFDLPFLNAKLIENNLKPLSNTLIDTLQVSRAIFSDERSHNLGSLCKRLEIQ
YDETVAHRADVDVEKLAEVFFKLFDFFPNYQIDLNDDFNQLNLKLQSKELIKRNFSNTIC
VYAKNQAGIRDLYYLLSLAHTEYFYRIATVNWNIINQKRDNLIVTNAVDNSELWNDVLMN
NHAAFSAKIKNYDYVFIPPPQTFAHEINRDNYTLAQVQKAIKLFYQWTIAANKKPIATAM
VKYLNPENQNQYSAIVHAKQIGSINHKLFSYQKSNEVLPDYQYRTTDLLISEMQFLNLSK
AAMDDLILKNNQSLVDQVDDQIQIIKPKLCAPNLDNDQINFINTAKNNFQKKYGKNPDPF
LVKRFNRELDAITTHNFTIIYWASYLLVKKSIEDGFLVASRGSVGSSLIAYLLNISEVNP
LPPHYYCHHCQYLEFDHHFANSGFDLEPKSCPKCQTKIYGDGHNIPFETFMGFNADKIPD
IDLNFSGLYQLKAHNFLREMFGIESCFRAGTTSSIALKTAYGFARNYYELIKTEPTVGQL
EWIVNQIIDVRRTSGQHPGGILVIPKEYSVYDFTPINFPADDLASDWKTTHLKYDYLHDS
LLKFDILGHDDPTFLRMLHTLTKIDPRTIPNHDPKVLALFTDCRVMDVYPSQILNETTGA
IGLPEFGTQFVRGMLRDANPYSFADLIRISGLSHGTDVWTNNAENLIKKNNLKLNEIISC
RDDIMIYLINQKIEPLLAFNIMESVRKGKQIPINAINTLIEHNVPQWYIDSANLIKYMFP
KAHAAAYVLMAWRLAFYKLYYPKEYYATYFSIRNDSFDIELLIKNDPELIRDKYRDIKRR
MNSKNFTERDSVKTKEKKLLTVYEVALEMLARKIYFANIDLAKSESVDFVPLNQTNKILI
PFNAIDGLGQIMANNIVEQRKIKPFISKKDLKLRTKISDTLMGVFEQLKIVDKLSDTNQI
SIFDV
NT seq 4338 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataatttttgaaattataaagacacattattatcattagttaattacaataatatt
attaaaaaatatcttactcaagaattatgtattctaaaaactagtgattttgatgattta
acaaaagttgcaacaatttattttcaagcaaaaaaatttaacgaaattcactttcattta
aagtttgatgaacttcctgtttatcaaacttttaaaactttgttaatgcataaaaatcat
ttatgtttagatcaaacaaaaatttgttttagttgaaatactcaaaacctttttaatcca
aaaacaattagcaatattttagaactatatttattagatcaatttcctaataacccttta
actttaagtttagcaactcaaaaaattcagttagaaaatgatctagtcacatttgttttt
gataatcaaaattcttatcaaggttttcaattcgttcattctgatattaataagttttta
tcattattttttaataaaaataatttaaatatcaattttgtttgttcatttgatcaagaa
gaaaaaacaccaactactgaatcagttaaactagaagttgagaatgaagtatcagatgta
acattatcaattccattattgaaaatcgcaccattatcatctgaaaaattttatcaagtt
tgaaaaattgaaactaaaattaattttaataaatccaaaaatattattttacaaattaaa
aatgataatttattttatgcatgtttactagcaaataaattattaactaaagattgtttt
aaaaaactaaaaactaatgattgaattcaaattaaaaaattttcagtaagtgatgctaaa
gatgctaaatcaagtgattatttagttgatgattttgttattgttgatcttaagcaaact
attactaaaaaagaatcatatcctaaccaatttgctaatttaagtttacataccaaatca
tcatctcatgatggtttattcacttatgaagattttttagcaactgctagtttctatcaa
cataaagctttaggaattactgattgaaatgctgtaacagaatatcctttaattgaaaaa
ctagcaaaaaaatatcaaattaaaccaatttatggtgtggaattagaaattttaaacaca
ccaattgccattgcaattaattgtgacaataaaactgaaaaaatatcagaagttagttat
tgtatttttgacattgaaacaactggtttgaatgctttgtttgatgatattattgaaatt
gctgtaactaaatttgataatcacattaaagttgatagttatcaaacttttattcaaaca
aaccaaaaaattaaacctttcattcaagaattaactaaaattagtaatgaaatgcttgat
caaaaaggtcaaccaattgatcttgctttaaaacagtttttagattttattggtgatagt
gttctagtggctcataatggtattaattttgatttaccttttttaaatgctaaattaatt
gaaaacaatttaaaaccattaagtaatactttaattgatacactacaagtatcacgggct
atttttagtgatgaaagaagtcataatttaggttctttatgtaagcgtttagagattcag
tatgatgaaactgttgctcatagagctgatgttgatgttgaaaaattagcagaagttttt
tttaaattatttgatttctttcctaattatcaaattgatttaaatgatgattttaatcaa
ttaaatcttaaattacaatcaaaagaattaattaaaagaaactttagtaatacaatttgt
gtttatgctaaaaatcaagctgggattcgtgatttatattacttattatcattagcacat
acagaatatttttatagaattgctacagttaattgaaacatcattaatcaaaaacgtgat
aatttaattgttactaatgcagttgataattcagaattatgaaatgatgttttaatgaat
aatcatgctgcttttagtgcaaaaattaaaaattatgattatgtttttattcctccacca
caaacttttgctcatgaaattaatcgtgataattacactttagcacaagtacaaaaagca
attaaattgttttatcaatgaacaattgcagctaataaaaaaccaattgctacagcaatg
gttaaatatttaaatcctgaaaatcaaaatcaatatagtgctattgttcatgctaaacaa
attggttcaattaatcacaaattatttagttatcaaaaatcaaatgaagttttacctgat
tatcagtatcgcacaactgatttactaattagtgaaatgcagtttttgaatttatcaaaa
gcagcaatggatgatttaattttaaaaaataatcaatcactagttgatcaagttgatgat
cagattcaaattattaaaccaaaattatgtgctcctaatttagataatgatcaaatcaat
tttattaatactgctaaaaataattttcaaaagaaatatggcaaaaatcctgatccattt
ttagttaaacgctttaatcgtgaattagatgcaattacaactcataatttcacaattatt
tactgagctagttatttattagtaaaaaaatcaattgaagatggttttttagttgcttca
cgtggatcagtgggttcaagtttaattgcatatttattaaatattagtgaagttaatcct
ttaccaccacattattattgtcatcattgtcagtatttagaatttgatcatcattttgct
aattctggttttgatttagaacctaaatcatgtccaaaatgtcaaactaaaatttatggg
gatggtcataatattccttttgaaactttcatgggttttaatgctgataaaattcctgat
attgacttaaatttttcaggtttataccaattaaaagctcataattttttacgcgaaatg
tttggaattgaatcatgttttcgtgctggaacaacaagttcgattgctctaaaaactgct
tatggttttgcacgtaactattatgaattaattaaaactgagccaactgttggacaatta
gaatgaattgttaatcaaattattgatgttagacgaacatcagggcaacatcctggaggc
attttagtcattcctaaagaatattcagtttatgattttacaccaattaactttccagct
gatgatttagcaagtgattgaaaaacaactcatttaaaatatgattatttacatgatagt
ttattaaaatttgatattttaggtcatgatgatcctacttttttaagaatgttacacact
ttaaccaaaattgatcctagaacaattcctaatcatgatcctaaagttttagcattattt
actgattgtcgggtgatggatgtttatcctagtcaaattttaaatgaaactacaggagca
attggtttacctgaatttggaacacaatttgtgcggggcatgttacgtgatgctaatcct
tatagttttgctgatttaattcggatttctggattaagtcatggaactgatgtttgaact
aataatgctgaaaatttaatcaaaaaaaataatttgaaattaaatgaaattattagttgt
cgtgatgacattatgatttatttaattaatcaaaaaatcgaaccattattagcatttaat
attatggaaagtgttcgtaagggtaaacaaattcctattaatgctattaatactttaatt
gaacataatgttcctcaatgatacattgattcagctaatttaattaaatacatgtttcct
aaagctcatgcagctgcatatgttttaatggcatgaagattagcattttataaactttat
tatccaaaagaatattatgcaacttattttagtattcgcaatgattcttttgatattgaa
ttattaattaaaaatgatcctgaattaattcgtgataaatatcgtgatattaaaagaaga
atgaattctaaaaatttcactgaacgtgatagtgttaaaactaaagaaaaaaaattatta
acagtttatgaagttgcacttgaaatgttagcgcgaaaaatttattttgctaacattgat
ttagcaaaatctgaaagtgttgattttgttcctttaaatcaaacaaataaaattttaatt
ccttttaatgccattgatggtttaggacaaattatggctaataacattgttgagcaaaga
aaaattaaaccatttatttctaaaaaagatttaaaattaagaactaaaatttcagatact
ttaatgggagtttttgaacaattaaaaattgttgataaattaagtgatactaatcaaatt
tcaatttttgatgtttaa

DBGET integrated database retrieval system