Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_01270
Help
Entry
MCAV_01270 CDS
T10838
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Brite
Enzymes [BR:
mcag01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MCAV_01270
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcag03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MCAV_01270
Ribosome biogenesis [BR:
mcag03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MCAV_01270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA50969
LinkDB
All DBs
Position
162408..163763
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MNDQKQWKLHHQIIIDQLLAQKYLAPNSLQEAMLLNLSQKGNHILVAPTGMGKTLGLTIY
LVDFLLSHPNLQAFFVFPTKELIQQVFRICKQLSFNQLIEISQLNHKIKINNLLNKQLIL
TTPKQLQDFGLMMQKEPTKSKMILVLDEVDTLIEAGFLNDIQTFMQINKSLIIKKIAASA
TIRKGLMQQLKIWFKTYHSLIFNSKKITNSQHYYLITRKEKKNQDFLTVLNYAKNLTGTI
VFFNNQEELVSTYQYLITNSEIRPIVLYGKMSHRERTKAMNLIHQRDLVIIFATDLLARG
ISIKHVQTVINYSLPKDQIWYLHRSGRTGRYQQPGKIINLITDQEFIKINQLTKKSLKFF
EVKILANNLVFKDRSYQKKSLNPQLSQQIKQIIAQADKRVKPNYKKKLKNKIKAAKNKVK
RQQIEAQVKQKLINKWKQESIIKKNKQINDH
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgatcaaaaacaatgaaaattgcatcatcaaattattattgatcaattattagca
caaaaatatttggctcctaattctttacaagaagcaatgttgcttaatttatcacagaaa
ggcaatcatattttagttgctcctactggtatgggtaaaacattaggtttaacaatttat
ttagttgattttttattatctcaccctaatttacaagccttttttgtttttcctactaaa
gaattaattcaacaagttttcagaatttgcaaacagttatcatttaatcaactaattgaa
attagtcaattaaatcataaaattaaaattaataatttattaaataagcaattaatttta
acaactccaaaacaattacaagattttggattaatgatgcaaaaagagccaacaaaatct
aaaatgattttagtgcttgatgaagttgatactttaattgaagcaggttttttaaatgac
attcaaacttttatgcaaattaataaaagtcttattattaaaaaaattgctgcttcagca
acaattcgtaaaggtttaatgcaacagttaaaaatttgattcaaaacgtatcattcctta
atttttaatagtaaaaaaattactaatagccagcattattatttaattacacgcaaagaa
aagaaaaatcaagattttcttacagtattaaattatgctaaaaatttaactggaacaatt
gttttttttaataatcaagaagaattagtatctacttatcaatatttaattactaattca
gagattagaccaattgttttatatggcaaaatgagtcatcgcgaacgtactaaagcaatg
aatttaattcatcaacgtgatttagtaatcatttttgctactgatcttttagcacgagga
atttcaattaaacatgtgcaaacagtaattaattatagtttaccaaaagatcaaatttga
tatttacaccgttcaggtcggactggaagatatcagcaaccaggaaaaattattaattta
attactgatcaagaatttatcaaaattaaccagttaactaaaaaaagtttaaaatttttt
gaagtaaaaattttagctaataatcttgtatttaaagatcgatcttatcaaaaaaaatca
cttaatccacaattatcacaacaaattaaacaaattattgctcaagcagataaacgagtt
aaaccaaattataaaaagaaattaaagaataaaattaaggctgctaaaaataaagtaaag
cgacaacaaattgaagctcaagtaaaacaaaagttaattaataaatgaaaacaagagtca
ataattaaaaaaaataagcaaatcaacgatcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
