Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_02850
Help
Entry
MCAV_02850 CDS
T10838
Name
(GenBank) Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
MCAV_02850
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mcag01007
]
MCAV_02850
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mcag03016
]
MCAV_02850
Enzymes [BR:
mcag01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
MCAV_02850
Amino acid related enzymes [BR:
mcag01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
MCAV_02850
Transfer RNA biogenesis [BR:
mcag03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
MCAV_02850
Prokaryotic type
MCAV_02850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
B3_4
tRNA_bind
tRNA_synthFbeta
B5
FDX-ACB
HARP
PhetRS_B1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51115
LinkDB
All DBs
Position
359297..361687
Genome browser
AA seq
796 aa
AA seq
DB search
MLISRNLLGILNPEIKKFSFNQLENAFIKIGIEIEAFYSHQPIKEIYFGLIKKITPHPHS
QKLSVCQVELSTGVIKTIICGASNVRVNLKVIVVLEGAILPNGLKITPRQILDIWSEGMI
CSYQELSGIDKTVLSNAKDNNDGIIELDDDFDYQQPFDPSVIGLDDLVFDLSIPANRSDL
YCAFGLIVELSQKLNWSFKIIDYDQLVNQINHLSLTNDLKVFNDQQTNDAAFFIKINQVK
IASSSWKIKKLLLNNNLSPINDLVDLGNLLVLLFNQPIHFHDANKIINQTLKISFANNQK
FTDLNNREYQLSTEEIIISDDHNQVLALGGMIGSNISKITNSTTTAYLELINFNSLAILK
TNNKYQINSTSTLSNIKVKSNYLSLLALNYMIEVLGTKYCLELGFAQYQKPKRSILNFDL
NWLQNFIGYQFSPNDVLNQLIKLGYEWKNDQLITPIWRNDLITMNDLAEDIVNLLDINTI
PFDPPTLKLINNLDVDQFELWNQVRNYWISKNFFEAKTYNLQRNDEVKKFNFMKIPVYQQ
LKNFNNANRTTLRVHGLCQLIEVINQNIAKQNAYRSWFELTNIFYDQKSRLSLNVIAIPN
NIKSALNQTQLSHDFYDLKIYLSETLKFYHQKIRFVHQSFNDVVNQVFVPEATNAIINED
DEIIGYVGQLNFLFLKDLKWNLKQICYGAFVWLDLKTPKIINANSFSEYPSSFRQFSFTI
NKDQTVLLNDLIEKIKSIEYVAETTLLEKYIDQNNDINYLLSIRLNSLNETLNHQIIEKK
VKAIEAIFNSYQLKIR
NT seq
2391 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaattagtagaaatcttttaggcattcttaacccagaaattaaaaaatttagtttt
aatcaattagaaaatgcttttattaaaattggcattgaaattgaagcattttattctcat
caaccaattaaagaaatttattttggtttaattaaaaaaataacaccacatcctcattca
caaaaattatcagtttgtcaagttgaattatctacaggagtaattaaaacgattatttgt
ggtgctagtaatgttcgtgttaatttaaaagtaattgttgttttagaaggagcgatttta
cctaatggtttaaaaattacaccacgtcaaattttagatatttgatcagaaggaatgatt
tgttcatatcaagaattaagtggtattgataaaacagttttatctaatgctaaagacaat
aatgatggaattattgaattagatgatgattttgattatcaacaaccatttgatcctagt
gttattggtttagatgatttagtttttgatttatcaattccagctaatcgatctgattta
tattgtgcttttggtttaattgttgaactttcacaaaaacttaattgatcatttaaaata
attgattatgatcaattagttaatcaaattaatcatttatctttaactaatgatttaaaa
gtttttaatgatcagcaaacaaatgatgctgctttttttattaaaattaaccaagttaaa
attgcttctagttcttgaaaaattaaaaagttattattaaataataatttaagtccaatt
aatgatttagttgatttaggtaatttattagttttattatttaatcaaccaattcacttt
catgatgctaataaaattattaatcaaacattaaaaattagttttgctaataatcaaaaa
tttactgatttaaataaccgtgaatatcagttatcaactgaagaaattattattagtgat
gatcataaccaagtattagcattaggtggcatgattggttcaaatattagtaaaattact
aattcaactactactgcttatttagaattaattaattttaattctttagcaattttaaaa
actaataataaatatcaaattaatagtacttcaacattaagtaatattaaagttaaatct
aattatttaagtttattagccttaaattatatgattgaagttttaggcactaaatattgt
ttagaattaggctttgctcaatatcaaaaaccaaaaagatcgattttaaattttgattta
aattgattgcaaaattttattggttatcaatttagtcctaatgatgttttaaatcaatta
ataaaattaggttatgagtgaaaaaacgatcagttaataactccaatttgacgtaatgat
ttaattacgatgaatgatttagcagaagatattgttaatttattagatattaatacaatt
ccttttgatccacctactttaaaattaattaacaatttagatgttgatcagtttgaattg
tgaaatcaagtgcgtaattattgaatttctaaaaacttttttgaagcaaaaacatacaac
ttgcaaagaaatgatgaagttaaaaaatttaatttcatgaaaatccctgtttatcaacaa
ttgaaaaattttaataatgctaatagaacgactttaagagttcatggtttgtgtcaatta
attgaagttattaatcaaaatattgccaaacaaaatgcttatcgatcttgatttgaattg
actaatattttttatgatcaaaaatcacgattaagtttaaatgttattgctattcctaat
aatattaaatcagccttaaatcaaacgcaattaagtcatgatttttatgatttgaaaatt
tatttaagtgaaactctaaagttttatcatcaaaaaattcgttttgtacaccaatcattc
aatgatgttgttaatcaagtttttgtacctgaagcaactaatgcaatcattaatgaagat
gatgaaattattggttatgttggtcaactaaattttctatttttaaaagacttaaaatga
aatttaaaacagatttgttatggcgcttttgtttgattagatcttaaaacacctaaaata
attaatgctaactcttttagtgaatatccttcatcatttcgccaattttcatttacaatt
aataaagatcagactgttttattaaatgatttaattgaaaagattaaatcaattgaatat
gttgcagaaacaacattattagagaaatatattgatcaaaataatgatattaattatttg
ttatcaatcagactaaatagtttaaatgaaacattaaatcatcaaataattgaaaaaaag
gttaaagcaattgaagctatttttaattcttaccaattaaaaatccgataa
DBGET
integrated database retrieval system