Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_04250
Help
Entry
MCAV_04250 CDS
T10838
Name
(GenBank) Valyl-tRNA synthetase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
MCAV_04250
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mcag01007
]
MCAV_04250
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mcag03016
]
MCAV_04250
Enzymes [BR:
mcag01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
MCAV_04250
Amino acid related enzymes [BR:
mcag01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
MCAV_04250
Transfer RNA biogenesis [BR:
mcag03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
MCAV_04250
Prokaryotic type
MCAV_04250
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
Val_tRNA-synt_C
DUF7357
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51246
LinkDB
All DBs
Position
complement(513507..516095)
Genome browser
AA seq
862 aa
AA seq
DB search
MNKTNAYQPQIIEANIPTSWKDLAIGKIDSNDQKFFSIVLPPPNVTGILHLGHAWDGTLQ
DMLIRYHKLNDYQVAWFSGMDHAGIATQTKFEKELKSKKIDKNCLSRNQFNDMIWQWKDS
HANTIREQWAKMGFCLSTNYERFTLDQHSIEVVLDSFRVLFQKNLIYQAERLVNWDPQLQ
TAISDIEIVYKQVDSYIYYVDYLCASDPTIKLTVATTRPETMFADVCLVINPNDQRYLSY
LNLEFINPANQEKLKLIVDSYVDPNFATGVMKCTPAHDFNDYQIGLKHHLPLIKCIGLDN
KMLENCQEFAGIDKNECRIKLIEKLQKKNLVQIKPYVNNIGYSDRTDVVVEPMLSKQWFL
KTSIIAQQTQDLLKQNRQQLQFIPNNYLKQILHYLNNMEDWCISRQLTWGIQIPIFYHKI
TKEVVNSTIPPDDSGNWVQDLDVLDTWYSSGLWPLITTETYKNENSKLKSFFPTSVLVTG
VDILFFWVSRMMMFASVFSQKMPFKKVYLHGLVRDQFNKKMSKSLNNGIDPQQLITKYGA
DALRLFFIQNTNSGEDLIYHEDKLKNASVFINKFWNAFNFLKHKKIDLTKFDFDLNQLNW
SEKWIYSQISELNQKIEHHYQELQFNLISKKITDFVWNDFCNWFIEFIKFIHPKILSNNS
QKFIAYIWNYILVLLNPLLPFITEAIYDQIHQSNNQFYCQKIIKPQFYQLKHQWFFELIQ
TVRNIRNQLKNPNTVWKFSIKATDHKQLVTEIAAVADLFAMIKIEHLTDQVDNKITKNKI
AFAIKQYTVEIYCDAHECQSYQSFLKMKINKLEYEVSRSKRILANNDFLNKATSEKISLE
KNKLEQYSQELEQFKLILANQE
NT seq
2589 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaactaatgcctatcaaccccaaattattgaagctaatattccaacttcctga
aaagatttagcaataggaaagattgattcaaacgatcaaaaatttttctctattgtttta
ccaccacctaatgtaacaggaattttacatttaggtcatgcttgagatggcacattacaa
gatatgttaattcgctatcacaagttaaatgattatcaagttgcatgattttctggtatg
gatcatgctggaattgctactcaaacaaaatttgaaaaagaattaaaaagcaaaaaaatt
gataaaaactgtttaagtcgtaatcaatttaatgacatgatttgacaatgaaaagatagt
catgctaatactattcgtgaacaatgagcaaaaatgggcttttgtcttagtactaattat
gaacgttttactttagatcaacattctatagaagtagttttagattcttttagagtttta
tttcaaaaaaacttaatttatcaagctgaaagattagttaattgagatccacaattgcaa
acagccatttctgatattgaaattgtttacaaacaagttgatagttatatttattatgtt
gattatttatgtgcttcagatccaacgattaaattaactgtagcaacaacaagacctgaa
actatgtttgctgatgtttgtttagtaattaatcctaatgatcaacgctatctatcttat
cttaacttagaatttattaatcctgctaatcaagaaaaactaaaattaattgttgattca
tatgttgatcctaattttgctacaggagtaatgaaatgcactcctgctcatgattttaat
gattatcaaattggtttaaaacatcatttaccattaattaaatgtattggtcttgataat
aaaatgttagaaaattgtcaagaatttgctggaattgataaaaatgaatgtcgtattaaa
ttaattgaaaaattacaaaagaaaaatctagttcaaattaaaccatatgttaataatatt
ggttattcagatcgaactgatgttgtagttgaaccaatgttatcaaaacaatggtttcta
aaaacttctattattgctcaacaaacacaagatttattaaaacaaaaccgtcaacaattg
caatttattcctaataattatttaaaacaaattttacattatttaaataatatggaagat
tgatgtatttcgcgacaattaacatgaggtattcaaattccgattttttatcataaaata
acaaaagaagttgttaatagtacaattccacctgatgattctggtaattgagttcaagat
ttagatgttcttgatacatgatattcttcaggactatggccattaattacaacagaaact
tataaaaatgaaaattcaaaattaaaatcattttttccaacatcagttttagttactgga
gttgacattttatttttttgagtttcaagaatgatgatgtttgctagtgtttttagtcaa
aaaatgccttttaaaaaagtttatttacatggtttagtgcgtgatcaatttaataaaaaa
atgtctaaatcattaaataatggaattgatccacagcaattaattactaaatatggtgct
gatgcattgcgattatttttcattcaaaatactaatagtggtgaagatttaatttatcat
gaagataaattaaaaaatgcttcagtttttattaataaattttgaaatgcttttaatttc
ttaaaacataaaaaaattgatttaactaaatttgattttgatcttaatcaattaaattga
tctgagaaatgaatttatagtcaaattagtgaattaaatcaaaaaatagaacatcattat
caagaattacaatttaatttaattagtaaaaaaattactgattttgtttgaaacgatttt
tgtaattggtttattgaatttattaaattcattcatcctaaaatattaagtaataatagt
caaaaatttattgcttatatttgaaactatattttagtgttactaaatccattattacct
tttattactgaagcaatttatgatcaaattcatcaatcaaataatcagttttattgtcaa
aaaattattaaaccacaattttatcaactaaaacatcaatgattttttgaattaattcaa
acagttagaaacattcgcaatcaattaaaaaatcctaatacggtgtgaaaatttagtatt
aaagcaactgatcataaacaattagttactgaaattgcagctgtagcagatttatttgct
atgattaaaattgaacatttaactgatcaagttgataataaaataactaaaaataaaatt
gcttttgcaattaaacaatatactgtggaaatttattgtgatgctcatgagtgccaatct
tatcaaagttttttaaaaatgaaaattaataaattagaatatgaagtaagtcgttctaaa
agaattttagctaataatgattttttaaataaagcaactagtgaaaagattagtttagaa
aaaaataaattagaacaatatagtcaagaattagaacaattcaaattaattttagctaat
caagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
