Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_04290
Help
Entry
MCAV_04290 CDS
T10838
Name
(GenBank) Small ribosomal subunit biogenesis GTPase
KO
K06948
30S ribosome assembly GTPase
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mcag03009
]
MCAV_04290
Ribosome biogenesis [BR:
mcag03009
]
Prokaryotic type
GTPases
MCAV_04290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RsgA_GTPase
MMR_HSR1
YqeH-like_C
AAA_7
AAA_16
NB-ARC
RNA_helicase
FeoB_N
AAA
NTPase_1
SRPRB
NACHT
Roc
AAA_17
AAA_33
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51250
LinkDB
All DBs
Position
complement(518217..519347)
Genome browser
AA seq
376 aa
AA seq
DB search
MKFSNAKINDNIKKCKGCGSYLNNNQDSLGYTPKKITEINLCQSCYRLKHYQKPSAIDPL
ADQDFLKKWTNFKLALRKSKKFLTVIVSDIYNLAVLDNLEKFLISSKILICLNKIELLDF
WQKKALEFAWITTLKKFNCQFEIIFLSAKNKVGINQLLAIANKYFQICFVGMSGVGKSLI
VNQVMKKLGHNSLNSVGSFLNTTKGFLVNKIKQQKLIDSPGFKRDQGIFNWLDHQTIKLL
QESSWNKRIFQIDRSRVYFWENYLVVELMIETNDDNVDQKMSLVFYGPNCLKISHIKSNK
FQLEQLNNFPNHKKYCPNNDQAVKWIKHQFKISEKTHFVIDDLGWIDFNPKQLITINFYL
PETVKINQFINRKPLN
NT seq
1131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattttctaatgctaaaattaatgacaatattaaaaaatgtaagggttgtggtagt
tatttaaataataatcaagacagtttgggttatactcctaagaaaattactgaaattaat
ttatgtcaaagttgttatcgtctaaaacattatcaaaaacctagtgcaattgatccttta
gcagatcaggattttttaaaaaaatgaactaattttaaattagctcttagaaaatcaaaa
aaatttctcactgttattgttagtgatatttataatttagcagtattagataatctagaa
aaatttttaatttcttctaaaattttaatttgtcttaataaaattgaattgttagatttt
tgacaaaaaaaggcactggaatttgcttgaattacaactttaaaaaaatttaattgtcag
tttgaaattatttttttatcagcgaaaaataaagttggtatcaatcaattattagcaatt
gcaaataaatattttcaaatttgttttgttgggatgtctggagttggtaaatctttaatt
gtcaatcaagtaatgaaaaaattaggtcataattccttaaattctgttggtagtttttta
aatacaaccaaaggttttttagttaataaaatcaagcaacaaaaattaatcgattcgcct
ggttttaaacgtgatcaagggatttttaattgattagatcatcaaacaattaaattatta
caagaaagctcatgaaacaaaagaatttttcaaattgatcgatcacgagtttatttttga
gaaaattatttagttgtggaattaatgattgaaactaatgatgataatgttgatcaaaaa
atgagtttagtcttttatggccctaattgtttaaaaattagtcacattaaaagtaataaa
tttcaattagaacaactaaataattttcctaatcataaaaaatattgcccaaataatgat
caagcagtaaaatgaattaagcatcaatttaaaattagtgaaaaaacccattttgttatt
gatgatttaggatgaattgattttaatcctaagcaattaattacaattaatttttattta
ccagaaacagttaaaattaatcaatttattaatagaaaaccattaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
