Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_04500
Help
Entry
MCAV_04500 CDS
T10838
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunits gamma and tau
KO
K02343
DNA polymerase III subunit gamma/tau [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag03030
DNA replication
mcag03430
Mismatch repair
mcag03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MCAV_04500
03430 Mismatch repair
MCAV_04500
03440 Homologous recombination
MCAV_04500
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mcag03032
]
MCAV_04500
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcag03400
]
MCAV_04500
Enzymes [BR:
mcag01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MCAV_04500
DNA replication proteins [BR:
mcag03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MCAV_04500
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcag03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MCAV_04500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_delta2
AAA
DNAX_ATPase_lid
AAA_22
DNA_pol3_gamma3
RuvB_N
AAA_30
Rep_fac_C
DEAD
AAA_5
AAA_19
TIP49
AAA_assoc_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51271
LinkDB
All DBs
Position
complement(542621..544534)
Genome browser
AA seq
637 aa
AA seq
DB search
MKSNVNTNLYNKYRPISFNDLVGQKIVKQVLINSIKNKEISHAHIFSGPRGTGKTSCARI
FAKAVNCLEFKDDICNNCINCTKINLLQTPDLIELDGASNNGVDHIRQLVENAYYLPADL
KIKVFIIDEAHMLTTNAWNALLKIVEEPPKHVLFLFSTTEFNKIIPTIQSRCMKHYFFLM
EQKLLVSEVERICHLEKCEIELTAAKKIATLANGSLRDCLSLLSQIIIFSNRKITLSKVQ
EALFLVDQSIKLELLEYLFAADVEKALQLIENLYYEGYQLHNLINEINALLIDLWVYQST
KNVKYLINLNLTEVEKLNYQQIPLSNWINILEQAEINLKKDKNNLLFIKIALMKLFNSFN
QSNPTESLSTSKLTIKQNSQIDYDHLKVNQKNKQQQQSSLLVDLVKEENQSLELKEEKSF
NNQYVHNFDLFKTRTKFVNQKEIFNQLKNTNNDLLIKDLAIEPESMVASDQAINQNKFNS
HQNLILWTFKKADKNKTELLKEKIEQIEGSLNLDEENDVWLKEVLDHLVKNKTKVLASRT
TAMFNFENLTFSRYFNELLLDHKYINLLNNYFQTNFYWTSIHKDQFTNWAKMKNSQEPLE
VVEFRSKNGEKIYDKILKDLHIKPHIEAIIKKNKDES
NT seq
1914 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatctaatgttaatacaaatttatataacaaataccgaccaatatcttttaatgat
ttagttgggcagaaaattgttaaacaagttttaattaattcgattaaaaataaagaaatt
agtcatgctcacattttttcaggcccaagaggaactggaaaaacttcttgtgcgcggatt
tttgctaaagcagttaattgtttagaatttaaggatgatatttgcaataattgtattaat
tgtactaaaatcaatttattgcaaactcctgatttaattgaattagatggtgcatcgaat
aatggtgttgatcatattcgtcaattagtagaaaatgcttattatttaccagcagattta
aaaattaaagtttttattattgatgaagctcatatgttgactactaatgcttgaaatgca
ttattaaaaattgttgaagaacccccaaaacatgttttgtttttattttctactacagaa
tttaataaaattattccaacaattcaatcaagatgcatgaaacattatttttttctaatg
gaacagaaattacttgttagtgaagtagaaagaatatgtcatttagaaaaatgtgaaatt
gaattaactgcagcaaaaaaaattgccactttagctaatggatcattacgtgattgttta
agtttattaagtcaaattattatttttagtaatcgtaaaattactttatcaaaagttcaa
gaagctttatttttagttgatcagtcaattaaattagaacttttagaatatttatttgca
gctgatgttgaaaaagcattgcaattaattgaaaacttatattatgaaggttatcaatta
cataatttgattaatgaaattaatgccttattaattgatttatgagtttatcaatcaact
aaaaacgttaaatatttaattaatcttaatttgacagaagtagaaaaactaaattatcag
caaattcctttaagtaattgaattaacattttagagcaagcagaaattaatttaaaaaaa
gacaaaaacaatttattgttcattaaaatcgctttaatgaaattatttaatagtttcaat
caatctaatcctactgaatctctttcaacatctaaattaacaattaaacaaaattcacaa
attgattatgatcatctaaaagttaatcaaaaaaataagcaacaacaacaaagttcatta
ttagttgatttagtcaaagaagaaaatcaatcattagaattaaaagaagaaaaatcgttt
aataatcaatatgttcataattttgatttatttaaaacaagaacaaagtttgttaatcaa
aaagaaatttttaatcaattaaaaaatacaaataatgatcttttaattaaagatttagca
attgaacctgaatcaatggttgcatctgatcaagcaataaatcaaaataaatttaatagt
catcaaaatttaattttatgaacttttaaaaaagcagataaaaataaaactgaattatta
aaagaaaaaattgagcagattgaaggatcattaaatcttgatgaagaaaatgatgtgtga
ttaaaagaagttttggatcatttagttaaaaataaaactaaagttttggcttcaagaact
actgcgatgtttaattttgaaaatttaactttttcacgttactttaatgaattattatta
gatcataaatacattaatttattaaataattattttcaaactaatttttattgaactagt
attcataaagatcaatttaccaattgagcaaaaatgaaaaatagtcaagaacctttagaa
gtagttgaatttaggagcaaaaatggtgaaaaaatttacgataaaattttaaaagatttg
catattaaacctcatattgaagcaataattaaaaaaaataaagatgaaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
