Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_06360
Help
Entry
MCAV_06360 CDS
T10838
Name
(GenBank) Ribonuclease J, C-terminal domain-containing protein
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCAV_06360
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcag03019
]
MCAV_06360
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcag03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCAV_06360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51441
LinkDB
All DBs
Position
complement(791094..792794)
Genome browser
AA seq
566 aa
AA seq
DB search
MMKNYSKNIKYFALGGQDEKAKYSGVLEIDDQIFILNTGIGDDITNQFGISKVIPDLNFL
KENKKRIKGIFLGTPEFLNIGSLPFFLETLEDVPIFTSKIGKTIITSWFSRKSKSENFRK
KYAQIKVCRPLKTITVGNVEVTPFKVYNSMPDSFGWAFKTTKGSIVFIDQFILANSKKPG
FESQIHYLPRITQNSVLALIVGLQNVGKNLGYAVPNYQNYGFLKRIIANSTNRILIACYD
HDFMTVLNAVEIARNYGLKVMIYSNTWTKIFNQMVKMGYVNIDHLVFIDSKKVPNDQDLI
VIITGNQDRLYHKMHKILTGEDQNISFNSQDLFVLNTITQSGIELREARLLDEISRKDVA
TEKIKRTIHAPIAGNEDHKFLVNLLNPKWIFPIIGYHKDFNAYLEAVSSVINPHIVRFLD
NGEVAILDQKSLPKTFHYPIYEQYVDFNGVVDIKTSALLERQNMYTYGLVNINFIYCKEK
KCFSEPEISSIGLISSDHDKNSDLDQLIIKMVKNELLKNLALAENRDLDLKALKLQLKKI
IQRLIDRQLQKKPLVLITIGQFNVTP
NT seq
1701 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaattattcaaaaaacattaaatattttgctcttggtggtcaagatgagaaa
gcaaaatattcaggcgtacttgaaattgatgatcaaatttttattttaaatacgggaatt
ggtgatgatattaccaaccaatttggtatttctaaagttattccagatctaaattttcta
aaagagaataaaaaacggattaaaggaatctttttaggtacacctgaatttttaaacatt
ggttctttaccattttttcttgaaacattagaagatgtaccaatttttacttctaaaatt
ggtaaaacaattattactagttggttttcaagaaaaagtaaatcagaaaattttcgtaaa
aagtatgcccaaattaaagtttgtcgaccactaaaaacaattactgttggtaatgttgaa
gttactccctttaaagtttataatagtatgcctgattcatttggttgagcctttaaaaca
actaaaggatcaattgtttttattgaccaatttattttagccaacagtaaaaaaccaggt
tttgaatcacaaattcattatttgcctagaattactcaaaattctgttttagctttaatt
gtgggtttacaaaatgttggtaaaaatttaggttatgctgttcctaattatcaaaattat
ggttttttaaaaagaattattgctaatagtactaatcgtattttaattgcttgttatgat
catgactttatgacagtattaaatgcagtggaaattgctcgtaattatggtttaaaagta
atgatttattctaatacgtgaaccaaaatttttaatcaaatggtgaaaatgggttatgtt
aatattgatcatttagtttttattgatagtaaaaaagtacctaatgatcaagatttaatt
gtcattattactggcaatcaagatcgtttgtatcataaaatgcataaaattttaactgga
gaagatcaaaatattagttttaattctcaagatttatttgttttaaataccattacccaa
tcaggaattgaattacgtgaagcgcgattattagatgaaatatcacgcaaagatgttgct
acagaaaaaattaagcgaacgattcatgcaccaattgctggcaatgaagatcataagttt
ttagttaatcttttaaatcctaaatgaatttttccaattattggttatcataaagatttt
aatgcttatctagaagcagttagttcagtcattaatcctcatattgtgcgttttttagat
aatggtgaagtagcaattttagatcagaaatcattaccaaaaacgtttcattatccaata
tatgaacaatatgttgattttaatggtgttgttgatattaaaacttcagccttactagaa
aggcaaaatatgtacacttatggtttagtgaacattaattttatttattgcaaagaaaaa
aaatgttttagtgagcctgaaattagtagtattggtttaatttcttctgatcatgataaa
aattctgatcttgatcaattaattattaaaatggttaaaaatgaattattaaaaaattta
gctttagcagaaaatcgtgatttagatttaaaagcattaaaattacaattaaaaaaaatt
atccaacgtttaattgatcgtcaattacaaaaaaaaccattagttttaattactattggt
caatttaacgttactccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
