Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_07230
Help
Entry
MCAV_07230 CDS
T10838
Name
(GenBank) Excinuclease ABC subunit UvrB
KO
K03702
excinuclease ABC subunit B
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
MCAV_07230
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcag03400
]
MCAV_07230
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcag03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
MCAV_07230
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
MCAV_07230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
UvrB
UvrB_inter
ResIII
UVR
DEAD
AAA_22
AAA_7
AAA_30
AAA_19
TrwB_AAD_bind
AAA
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51523
LinkDB
All DBs
Position
899251..901251
Genome browser
AA seq
666 aa
AA seq
DB search
MEGFAFQLISDKHPKGDQPKAIAALVAALKTKKRSHVLLGATGTGKTFTIANVIDQVQKP
TLIIAHNKTLAGQLYNDLKAIFPKNRVEYFISYFDYYQPEAYLPKTDTYIEKSSVTNEII
EMMRLSTLTALTTRKDVIVVASVAAIYPASSPEDFSNFRILLKRNDAIQTIKFVINKLVQ
LNYQPNMTQLQPGTFAHKGDVIQIMLGYTNEFILRISFFDNLIEELATVNPLNQTVINKY
DSYLITPADEYILEPTRRDQAVDRIKKELKITANNFAKQNKYIEEQRIIQRTNHDLDAIC
ELGFCSGIENYAFHLELRDLNQTPFTLFDYFGNDWLLVIDESHMTIPQIRGMYNTDQSRK
TSLVEHGFRLPSALNNRPLNFEEFQNKIDQIIYVSATPNDWEIQEADNKIIEQIVRPTGL
VDPKIEVRPSIGQIDDLTVELKKQIKKKQRTFITVLTIKMAEELTEYLKQHKFKVAYLHN
ELKTLERDHVINALRAGIFDVIVGINLLREGLDVPEVSLVVIFDANKPGFFRSDKALIQT
IGRAARNIDGRVIMYADDISEAMQRAIQETRRRREIQLAYNQEHQITPKSIIKPIDVDLA
KAHLDHDLKQLVHKSKNKLKIAETIKVLEKEMLEAANNQEYERAAHIRDTIIEMQLNQKP
VKKNKR
NT seq
2001 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaaggttttgcatttcaattaattagtgataaacaccctaagggtgatcaacctaaa
gcaattgctgctttagttgcagcattaaaaaccaaaaaaagaagtcatgttttacttggt
gctactggtactggtaaaactttcacaattgctaatgtaattgatcaagtgcaaaaacca
acattaattattgctcataataaaacattagcaggacaactttataatgatctaaaagca
atttttcctaaaaatcgagtggaatattttatttcttattttgattattatcaacctgaa
gcatatttgcctaaaactgatacttacattgaaaaatcatcagttactaatgaaattatt
gaaatgatgcgactatcaactctaactgcactaacaacaagaaaagatgtaattgttgtt
gcatcagtagcagcaatttatcctgcttcaagtccagaagattttagtaattttcgaatt
ttattaaaacgtaatgatgcaattcaaacaattaagtttgtgattaataaactagtacaa
ctaaattatcaaccaaatatgactcaattgcaaccaggaacttttgctcataagggtgat
gtgatccaaattatgttaggttatactaatgaatttattttacgaatctctttttttgat
aatttaattgaagaactagcaacagttaatcctttaaatcaaactgtgatcaataaatat
gatagttatttaattacaccagctgatgaatatattttagaaccaacaagacgtgatcaa
gcagttgatcggattaaaaaagaactaaaaattactgctaataattttgctaaacaaaat
aaatacattgaagaacaaagaattattcaacgcactaatcatgatcttgatgctatttgt
gaactaggtttttgttcaggaattgaaaattatgcctttcatttagagttgcgtgattta
aatcaaacgccttttactttatttgattattttggtaatgattgattattggtaattgat
gaatcacatatgacaattccacaaattagaggaatgtataatactgaccagtcacgaaaa
acttctttagttgaacacggttttcgtctaccatcagcattaaacaatcgaccattaaat
tttgaagaatttcaaaataaaattgatcaaattatttatgtttcagcaacaccaaatgat
tgagaaatccaagaagcagacaataaaattattgaacaaattgttcgaccaactggatta
gttgatccaaaaattgaagttcgaccttcaattggacaaattgatgatttaactgttgaa
ttaaaaaaacaaattaagaaaaaacaacgcacttttattactgttttaacaattaaaatg
gctgaagaattaactgaatatttaaaacagcataagtttaaagttgcttatttacataat
gaactaaaaacattagaacgtgatcatgtgattaatgctttaagggctggaatttttgat
gtgattgtaggaattaatttattacgtgaaggattagatgttcctgaagtttctttagtt
gttatttttgatgctaataaacctggtttttttcgcagtgataaagctttaattcaaaca
attggtagggctgctagaaatattgatggacgggttattatgtatgctgatgatatttct
gaagcaatgcaacgagcaattcaagagactagaagacgacgtgagattcaattagcttat
aatcaagagcatcaaattacgccaaaatcaattattaaaccaattgatgttgatttagcc
aaagcccatttagatcatgatttaaaacaattagtgcataaatcaaaaaataaactaaaa
attgctgaaacaattaaagtattagaaaaagaaatgttagaagcagctaataaccaagaa
tatgaacgggctgctcacattcgtgatacgattattgaaatgcaattaaatcaaaaacca
gttaaaaaaaataaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
