Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_07240
Help
Entry
MCAV_07240 CDS
T10838
Name
(GenBank) Sigma-70 RNA polymerase sigma factor
KO
K03086
RNA polymerase primary sigma factor
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
02040 Flagellar assembly
MCAV_07240
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mcag03021
]
MCAV_07240
Transcription machinery [BR:
mcag03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Sigma factors
MCAV_07240
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma70_r2
Sigma70_r3
Sigma70_r1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51524
LinkDB
All DBs
Position
901402..903711
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MTKKNPNTTKTKKVILKKVDQTTINAELNQVTTKKKVTKKNTEKIDLQPTEVVSENIDAN
NQLKTNTKATIKQKATKKTVTKKKSNKKVVEKVDDNLLTENSEKNTEKIDLQPTEVVSEN
VNNNQLKTNTKQKATKKSASKSTAKTKTAKKKSDKNNAENLNAASLTESSEKISKKVATK
KKTTVKNLATSVDIEALTKKFAKKTKAKTTIIKNQAVSDKIKKHKVKKNIKTDLNFSADK
EHKINLIARSEFAKNKRDHVITTKAKRELNKNKNISNKTKAVKLTHIIKDGVVKTKKVRK
ISLKAITGIDETYKELMKVKQIIETRIAHQEELKNTTNSIALEQQLFEINHKKYRLDSKK
INRSLEPLITQAHGVKKGKNKLSHEIVALYLEDYVPIADDKWKIIAKKFAQNKIKITTLT
PEELQEHSDFEIGNVFEASKGFGQASVGEKIHDSNKALLSKLGHSKMLTKDQETELAKLM
LNPETREYATHQLITSNLRLIVSIAKKYLNRGLNLEDLVQEGSLGLIKAIQKFNYKLENK
FSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMVETINKVSKTERYLTQILGHEPTAEEISKE
LAKTDSTYTPKRVTEIRKLNVDLVSLDKPIAHDEDSNFSDFVQDVEMDNPEEAAEKEFKS
KVLLEFLENTLEQDELEIMMMRFGLEPYKNAMNLDLITKCLLKTNKYKIVRNNKDDSLLL
PNHNKNRDYTQEEWKIVFDWVRKKEAQAMRKLKQPSKNGKYRNILLGSG
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccaaaaaaaatccaaatactactaaaactaaaaaagttattttaaaaaaagttgat
caaacaacgatcaatgctgaattaaatcaagttactaccaagaaaaaagtaactaaaaaa
aacactgaaaagattgatctacaaccaactgaagttgttagtgaaaacattgatgctaat
aatcaattaaaaacaaatactaaagcaactattaaacaaaaagcaactaaaaaaactgtt
actaagaaaaaaagtaataaaaaagttgttgaaaaagttgatgataatttattaactgaa
aattctgaaaaaaacactgaaaagattgatctacaaccaactgaagttgttagtgaaaat
gttaataataatcaattaaaaacaaatactaaacaaaaagcaactaaaaaatctgctagt
aaatcaacagcaaaaactaaaacagctaagaaaaaaagcgataaaaataatgctgaaaac
cttaatgctgcttcattaactgaaagttctgaaaaaattagtaaaaaagttgctactaag
aaaaaaacaacagtaaaaaatttagcaacttcagttgatattgaagccttaactaaaaaa
tttgctaaaaaaacaaaagcaaaaactaccattattaaaaatcaggctgtttctgataaa
atcaaaaaacataaagttaaaaagaacattaaaactgatttaaatttcagtgctgataaa
gaacataaaattaatttaattgcacgttctgagtttgctaaaaataaacgtgatcatgtg
attacaactaaagcaaaacgtgagttaaataaaaacaaaaatatttctaataaaacaaaa
gcagtgaaattaactcacatcattaaagatggggttgttaaaactaaaaaagttagaaaa
attagtttaaaagcaattactgggattgatgaaacctataaagagttaatgaaagtcaaa
caaattattgagactcgaattgctcatcaagaagagttgaaaaatactactaatagtatt
gctttagaacaacaattatttgaaattaaccataaaaaatatcgcttggattctaaaaaa
attaaccgttctttagaaccattaattactcaagctcatggggttaaaaaaggtaaaaat
aaattaagccatgaaattgtggcactttatttagaagattatgtaccaattgctgatgat
aaatgaaaaatcattgctaaaaaatttgctcaaaacaaaattaaaattactactttaact
cctgaagaattacaagaacatagtgattttgaaattggtaatgtttttgaagcctcaaaa
ggttttggtcaagctagtgttggtgaaaaaattcatgattctaataaggctttattgtct
aaattaggtcattctaaaatgttgactaaagatcaagaaactgaattagcaaaattaatg
cttaatcctgaaacacgtgaatatgcaactcaccagttaattacttctaatttacgttta
attgtctcgattgctaaaaaatacttaaatcgtggtttaaatttagaagacttagttcaa
gaaggttcattaggcttaattaaagcgattcaaaaatttaattacaaactagaaaataaa
ttttctacatatgctacttgatggattcgtcaagcaattactcgttcgattgctgatcaa
gcacgaacaattcgaattcctgtgcatatggttgaaacaattaataaagtttcaaaaacc
gaacgttatttaacacaaattttaggacatgagccaactgctgaagaaatttctaaagaa
ttagctaaaactgattcgacctatactcctaaaagagttactgaaattcgcaaattaaat
gttgatttagtttcattagacaaaccaattgctcatgatgaagattctaatttttctgat
tttgtccaagatgttgaaatggataatcctgaagaagctgctgaaaaagaattcaaatca
aaagtgcttttagaatttttagaaaacactttagaacaagatgaattagaaattatgatg
atgcggtttggtttagaaccatataaaaacgccatgaatcttgatttaattaccaaatgt
ttactaaaaactaataaatataaaattgttcgtaataataaagatgatagtttattatta
cctaatcataataaaaatcgtgattatactcaagaagagtgaaaaatagtttttgattga
gtgcgaaaaaaagaagcccaagcaatgcgaaaactaaaacaaccatcaaaaaatggtaag
tatcgtaacattcttttaggatcaggataa
DBGET
integrated database retrieval system
