Mycoplasma cavipharyngis: MCAV_07270
Help
Entry
MCAV_07270 CDS
T10838
Name
(GenBank) Ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcag Mycoplasma cavipharyngis
Pathway
mcag03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCAV_07270
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcag03019
]
MCAV_07270
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcag03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCAV_07270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
Lactamase_B
RNase_J_C
RMMBL
Lactamase_B_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBA51527
LinkDB
All DBs
Position
905105..907297
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MNFKKAEKLSNKNSNQTKNEPTLVEQSTVKEPSENHDDQSFVNQNQKPLNPNEHLRRNSF
NKNRKKSHSNKKTKSQPNNLTSPSSSKNETTFARNFLGSENFVETSRIPKMKLSGLEHLE
NDHKRKARFQKNRSKPCSIPTKIYVLGGIEEIGKNMYCIEHHDEIIIIDCGIKFANKRDL
PGISGIIPSFAYLKENEKKIKALIVTHGHEDHIGGVPYLLKQINVPVVYAPVIASELILR
KVNEHKNAILHKMEVYTDESVFQTKYLTIDFYRVNHSIPDSFGVAVRTPNGNIASSGDFR
FDFSSDADKTDIIKISAIAHRKIDVLLCESTNAENEGFNESENHVLKEINNLISSCHGKI
LITSFASNLGRIEEIIRIGIKRNRKIIVVGRSMVNNIAVSRKVGYLKLDDSLMIQARDIN
KYPDNEIMIICTGSQGEETAALNTIAKGRHAWIKLKPTDTVILSSNAIPGNFVSVDELIN
TISKSGCKVYYNSANLKIHSSGHGAKMEQQLLISLINPKYLVPIHGEYKMLRKLQQSANE
LGIAKENVFIISNGQVLDLFNHVLTHSTANPVDASEVYIDAHHATLEGSKIINDRLRMSE
NGVIFSQIYLDLKQKLIVYVAPVAAAGSFYSYDSLALFKKIMYQIHSELNKILAEPKVLS
IDKMEKFIAAKLSSLIWHEKNKRPVIVVKIKNINKAKFWDHAIKLVPKKNKKLDQEDKQT
TDLNRDLVQE
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactttaaaaaagctgaaaaattatcaaataaaaattctaatcaaactaaaaatgaa
ccaactttagttgaacaatcaacagtaaaagaaccatctgaaaatcatgatgatcaatct
tttgttaatcaaaatcaaaaaccattaaatccaaatgaacatttaagaagaaattctttt
aataaaaatagaaaaaaatcacattctaataaaaaaactaaatcccaaccaaataattta
actagtccatcatcatcaaaaaatgaaacaacatttgctcgtaactttcttggtagtgaa
aattttgttgaaacatctagaattcctaaaatgaaattatctggtttagaacatttagaa
aatgatcataaaagaaaggctcgatttcaaaaaaatcggtctaaaccttgttcaattcca
actaaaatttatgttttaggtgggattgaagaaattggtaaaaacatgtactgcattgaa
catcatgatgaaattatcattattgattgtggtattaagtttgctaataaaagagatttg
cctggtatttcaggaattattccctcatttgcttatttaaaagaaaatgaaaaaaaaatt
aaagccttaattgtcactcatggtcatgaagatcatattggtggtgtaccatatttacta
aaacaaattaatgttcctgttgtttatgcacctgtaattgcttcagaattaattttacgt
aaagtcaatgaacataaaaatgctattttacataaaatggaagtttatacagatgaatca
gtttttcaaactaaatacttaacaattgatttttatcgggttaatcactcaattcctgat
tcatttggtgtagcagtaagaacaccaaatggtaatattgcttcatcaggtgattttcgc
tttgattttagtagtgatgctgataagactgatattattaaaatttcagcaattgctcat
agaaaaattgatgtgcttttatgtgaatcaactaatgctgaaaatgaaggatttaatgag
agtgaaaatcatgttttaaaagaaattaataacttaattagttcgtgtcatggcaagatt
ttaattacatcgtttgcttctaatttaggtcgaattgaagaaattattcgcattggcatt
aaacgtaatcgcaaaattattgttgtaggacgttctatggttaataatattgctgtttca
cgcaaagttggctatttgaaattagatgattcactaatgattcaagcacgtgatattaat
aaatatcctgataatgaaattatgattatttgtacaggatcacaaggtgaagaaacagcg
gcattaaacacaattgctaaaggcagacatgcttgaattaaattaaaaccaactgataca
gttattttatcttctaatgctattcctggtaattttgttagtgttgatgaactaattaat
acaattagtaaatcaggttgtaaagtttattataattctgctaacttaaaaattcactct
tctggtcatggtgctaaaatggaacaacaacttttaattagtttaattaatccaaaatat
ttagtgccaattcatggtgaatataaaatgttacgaaaattacaacagagtgctaatgaa
ttagggattgctaaagaaaatgtttttattattagtaatggtcaagttttagacttattt
aatcatgtattaactcactcaacagcaaatccagttgatgcttctgaagtttatattgat
gctcatcatgctactcttgaaggtagtaaaatcattaatgatcgattaagaatgagtgaa
aacggggttatttttagtcaaatttatttagacttaaaacaaaaactaattgtctatgtt
gcaccagtagctgctgcaggttcattttattcatatgattcattagcattatttaaaaaa
attatgtatcaaattcatagtgaacttaataaaattttagctgaaccaaaagttttatca
atagacaaaatggaaaaatttattgctgctaaattgtcatcattaatttgacatgaaaaa
aataaaagacctgtaattgttgttaaaatcaaaaacattaataaggcaaaattttgagat
catgccattaaattagtgccaaagaaaaataaaaaacttgatcaagaagataaacaaaca
acagacttaaatcgtgatttagtgcaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
