KEGG   Metamycoplasma canadense: MCAN360_0134
Entry
MCAN360_0134      CDS       T03615                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mcan  Metamycoplasma canadense
Pathway
mcan03030  DNA replication
mcan03430  Mismatch repair
mcan03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcan00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MCAN360_0134 (polC)
   03430 Mismatch repair
    MCAN360_0134 (polC)
   03440 Homologous recombination
    MCAN360_0134 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mcan03032]
    MCAN360_0134 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcan03400]
    MCAN360_0134 (polC)
Enzymes [BR:mcan01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MCAN360_0134 (polC)
DNA replication proteins [BR:mcan03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAN360_0134 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcan03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAN360_0134 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon DNA_pol_A_exo1 HHH_3 RNase_H_2 DUF3945 T2SSK DNA_pol3_a_NI
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAP39396
UniProt: A0A077L6G3
LinkDB
Position
complement(108290..112603)
AA seq 1437 aa
MDESFKVLCKESKFEPSEVFYGAKLLSVQPPIKGIKNWIFDIQLPEHIDILEYKKFKSAV
DKKFPNCIINLIIQNTILDKKNISDYLKYVIETKFLELKTILGFINEEKIELSDNQIIFL
IETKSVYEKFKSFDVQIKKALFKIGYEFLNPIYKLLEPKKVLNNGKNVVKTLIDSFEKIT
KDSYANHQNNNNNNFTKSNSWNKNQFKAIEMDIETALLTFEQVRVLIKGEIYFLEWKNTK
NNKRILNLRISDYKEAINVKFIQNEQDEKPNLKEGDTVYIEGMLSDDIYTKSKYILASGK
NWYTPTEPFIYLNDDNEIEKRIDLAIRTNMSAQDGISSPEDYLKAVKKYGHEAIAITDLD
NVQSFPTFYNSLKKDKTIKPIYGATISTISKENKIFLGYKEFNFKDAEYVVFDLETTGLS
PRFDDIIEFGASIIKNGVQVEKIQFFLKTKKELTQKIKELTNINEKMLEDGLEQEDGILR
IYNILNNRIAVAHNASFDMGMCFQKFKEANLDTSNLVCIDTLQLSYFLDTEDTLHKLEKV
CKRHNINYDVIDAHRADYDANVLAQVWLKMILRLNIEKNVTNSKQLFNVDTNLWAKRRRS
SEIRVLAKNQKGLKELFTILSNSLTNDYANGPKFFIENKNKYENLFFGSATNQSLLWDKV
LFGTDDSIIELIKKFDYVEIPPISSFIYQINLEEITYENLKWAYKDLIEKCRILNKKCVA
TSDARYVYDYQKLIHSIYINAPSLGGGNHWLKNKKQPNFKYLTTREMLDEFLFLEDEKLI
KEIVIYNPREIANSIEEIQVIKDNLYVPTFDNSPTNLRNLVYENLHKIYGKNPDPKIIER
IEKELNPIIKYGYSVIYWISHKLVKKSNEDGYLVGSRGSVGSSIVANLSGISEVNPLEPH
YLCLKCKYFEWNNNSNIYSGWDLEDKKCPVCSEKLSKDGHNIPFETFLGFEANKVPDIDL
NFSGEYQPIIHNLVKELFGEDHSFRAGTISKIASKTAFGFCEKYMHEVRNQEIPWSKTFL
DFLSSKAAGVKRTTGQHPGGIIIIPKEFDVEDFTPVNYPANDISSTWKTTHFNFESIHDN
VLKLDLLGHDDPTTIKMLEDLTNVKVKEIPKFDPEVMKLFYTTESLKISPNMIDGETTGA
YGLPEFGTNFVRNMLKEAQPRTFNDLILLSGLSHGTNVWAGNAEELVKNGFKLKDCVCCR
DDIMQELIKKNIEPLKAFEIMEKVRKGKGLSKEQEELLISNNIPSWYINSLKKIEYMFPK
AHATAYVIMAWRIGWYKLYYPLEFYASYFSIRPDAIDIETMSNGYNKVSQLLFEYKRRKN
DRSNPLSTKEAALITTFEITKEMFARGYKIQNVSLELSEAKNWIIDKKNKSLIPPFNVVD
GLGDVVAEAIVKARNESPFLSIQDLIERAKVNSKICSELKKLGILNELSETNQVELF
NT seq 4314 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatgaaagttttaaggttttatgtaaagagtctaagtttgaaccatcagaagttttt
tatggagctaaacttttatccgttcaaccaccaatcaaaggaataaaaaactggattttt
gatattcaattaccagaacatattgatattttagaatataaaaaatttaaaagtgcggtt
gataaaaaatttcctaattgtattataaatttaataattcaaaatactattttagataaa
aaaaatattagtgattatttaaaatacgtcattgaaacaaagtttttagaacttaagaca
atattaggttttataaatgaagaaaaaattgaactttctgataatcaaattattttttta
attgaaacaaaatctgtatatgagaaatttaagtctttcgatgtccaaattaaaaaagca
ttatttaaaataggttatgaatttttgaacccaatttataaactattagaacctaaaaaa
gtattaaataatggaaaaaatgttgttaaaacattaatagattcttttgaaaaaataacg
aaagattcttatgcaaatcatcaaaacaataataacaataattttactaagtctaattct
tgaaataaaaatcaatttaaagcaattgaaatggatattgaaacagctttattaactttt
gaacaagtaagagttttaattaagggtgaaatttattttctagaatgaaaaaatactaaa
aacaataaacgaattttaaatttacgtatttctgattataaagaagctataaatgtgaaa
tttattcaaaatgaacaagatgaaaaacctaatttaaaagaaggcgatacggtttatatt
gaaggaatgctaagcgacgatatttatactaaatcaaaatatatacttgcatcaggcaaa
aattgatatacaccaaccgaaccgtttatatatttaaatgatgataatgaaattgaaaaa
agaatagatttggctataagaactaatatgagtgctcaagacggaatatcaagtcctgaa
gattatttaaaggcagttaaaaaatatgggcatgaagctattgcaataactgatttagat
aacgttcaaagctttcctactttttataatagtttaaaaaaagataaaacaattaagcct
atatatggagcaacaatttcaactatttcaaaagaaaataaaatatttttaggttataaa
gaatttaattttaaagatgctgaatatgttgtgtttgaccttgaaacaacgggattgtct
ccaagatttgatgatattattgagtttggagcatcaattattaaaaatggagttcaagtt
gaaaaaattcaattctttttaaaaacaaaaaaagaattaacacaaaagattaaagaacta
accaatattaatgaaaaaatgcttgaagatggtcttgaacaagaagacggaattttaaga
atttataatattttgaataatcgtattgctgtagctcataatgcttcttttgatatggga
atgtgctttcaaaaatttaaggaagctaatttagatacttcaaatttagtttgtatcgat
acactacaattatcttattttttagatacagaagatacattgcataaacttgaaaaagta
tgtaaaagacacaatattaattatgatgttattgacgcccatagagcagattatgatgct
aatgttttagcacaagtttggttaaaaatgatattaagattaaatattgaaaaaaatgta
actaattcaaaacaactttttaatgttgatacaaatttatgagcaaaaagaagaagatca
tcagaaataagagtattggctaaaaatcaaaaaggactaaaggaattgtttactattttg
tcaaattcattaaccaatgattatgctaacggtcctaagttttttattgagaataaaaac
aaatacgaaaatctattttttggttcagcaactaatcaatccttattatgagataaagtt
ttatttggtacggatgatagcattattgaattaattaaaaagtttgattatgttgaaata
cctccaatttcttcatttatttatcaaattaatttagaagaaataacatatgaaaattta
aaatgagcatataaagatttaatagaaaaatgccgaattttaaataaaaaatgtgttgca
acgtctgatgctagatatgtttatgattatcaaaaactaattcactcaatatatattaat
gctccttcactaggtggtggcaatcattgactaaaaaataaaaaacaacctaattttaaa
tatttaactactagggaaatgttagacgagtttctatttttagaagatgaaaaattaatt
aaagaaatagttatttataatcctcgtgaaattgcaaattcaattgaagaaatacaagtt
ataaaagataatctttatgttccaacgtttgataattctcctacaaatttaagaaattta
gtttatgaaaacttgcataaaatttatggaaaaaatcctgatcctaaaattattgaaaga
attgaaaaagaactaaatccaattataaaatatggttattcagttatttattgaattagt
cataaactagttaaaaaatcaaatgaagatggttatttggttggtagtcgtggttctgtt
ggatcatcaattgttgctaatttatcaggtatttcagaagttaatccacttgaaccacat
tatttatgtttaaaatgtaaatattttgaatgaaataataacagtaatatttattcaggt
tgagatttagaagacaagaaatgtcctgtttgttctgaaaaattatcaaaagatggacat
aatataccatttgaaacatttttaggttttgaagcaaataaagttcctgatatcgatttg
aattttagtggtgaatatcaacctattattcataatttagttaaagagttatttggtgag
gatcattcatttagagctggaactatatctaaaattgcttcaaaaacggcttttggtttt
tgtgaaaaatatatgcatgaagtaagaaatcaagaaataccatgaagtaaaacattttta
gattttttatcatcaaaagctgccggagtaaaaagaacaacaggacagcatcctggaggg
attataatcatccctaaggaatttgatgttgaggattttacaccagttaactatccggct
aatgatataagtagcacatggaaaacaacccattttaattttgaatctattcatgataat
gttcttaaattggatttattgggccacgatgatccaacaacaataaaaatgcttgaagat
ttaacaaatgtaaaagttaaagaaattcctaaatttgatcctgaagttatgaaattattt
tatacaacagaatcgcttaaaattagtcctaatatgattgatggagaaacaacaggtgct
tacggccttcctgaatttggtacaaactttgtccgtaatatgttgaaagaagcacaacca
agaacatttaacgatttaatattattaagtggtttgagtcatggaactaatgtgtgggcc
ggaaacgctgaggaacttgtaaaaaatggttttaaattaaaagattgtgtttgttgtcgt
gatgatattatgcaggaattaattaaaaaaaatattgaacctttaaaagcttttgaaatt
atggaaaaagttcgtaaaggaaaaggactatcaaaagagcaagaagaactgttgatttct
aataatatcccatcatggtatataaattcattaaaaaagattgaatatatgttcccaaaa
gcgcatgctacggcatatgttattatggcttgaagaataggttggtataaactttattat
cctttagaattttatgcttcatatttttcaataagaccagatgcaattgatattgaaaca
atgtcaaacggttataacaaagtaagtcaattattatttgaatacaaaagaagaaaaaac
gatagatctaatcctctttcaactaaggaagcagcattaattacaacatttgaaataact
aaagaaatgtttgcacgtggatataaaatccaaaatgtttctttagaattatcagaagct
aaaaactgaataattgacaaaaaaaacaaatcactaataccaccttttaatgttgttgat
ggtcttggagatgttgttgctgaagcaatagttaaagctagaaatgaatctccgttttta
tcaatacaggatttaattgagcgagctaaggttaattctaaaatttgttctgaattaaaa
aaattaggcattttaaatgaactaagcgaaactaatcaagttgaattattttaa

DBGET integrated database retrieval system