KEGG   Metamycoplasma canadense: MCAN360_0646
Entry
MCAN360_0646      CDS       T03615                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta' chain
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mcan  Metamycoplasma canadense
Pathway
mcan03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcan00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    MCAN360_0646 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mcan03021]
    MCAN360_0646 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcan03400]
    MCAN360_0646 (rpoC)
Enzymes [BR:mcan01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     MCAN360_0646 (rpoC)
Transcription machinery [BR:mcan03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     MCAN360_0646 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcan03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      MCAN360_0646 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 DUF3912
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAP39715
UniProt: A0A077L600
LinkDB
Position
569916..574403
AA seq 1495 aa
MILNINKIEMEELNNMKNNSKYDLLDESKITKISLSLATPEDVESWSHGEVTKPETINYK
SYKPERGGLFDEIIFGPMIDYRCPVCGYKYKKINEGSYCTRTELCKQENVQILPKISRRN
HMGHIKLNSPVVHFWYFKVDHSILYKLLGLKISSDNSQETVRREELENLIYYKNHIVVED
GGLKSLPKNLIIEINDAAVIYKEALDELLTRFDPKNPDHQEAYEDITETIEQLVEKATSK
IGQEYGIDFYELNEVIEHYSDAKIMTGAKAIEYLLQKLDLAAEKAYVTKQINELNLQEAK
NQSKFATTTKQTREKLYKRLQVINAFIESKQSPTNMLIYNLPVIPADLRPLIQLDGGRHS
TSDINELYRRVIIRNNRLQQWQEKDAPTLVIQNELRMIQEAVDALIDNQRRTPNPVLSKD
NRPFKSISDALTGKKGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPNLKMHQCGIPREMAAKLFEPW
IIARLIEKQVATTVKNAKKIIEDQNPIIWPHVAEAIKGRLVLLNRAPTLHRLSIQAFEPV
LVRGKAIRLHPLVCTPFNADFDGDQMAVHVPISEQALLESRELMLANKNILGPKDGEPII
NPSQDMILGLYYLTIEEKDALGEGRVFDNLDHILRSLEAKKVSLHARVALPAEEVKNSKL
FTGFNINSQLYVISTVGKFIFNNVFPKDFPFIFDNKVTKAINLEEYKNEFNKLYVVESGT
NIANYIKELPLQEAFNKKNIAKIIRYMFDNYVSTISISNVASVIDKINDLDESDIVLEFL
KLKTYKGQNLEKEHADLLTEFVLIEKQKILREIEQKYQGVNNVPISAKEKAKMLDIVWFK
YTNIVASILDKIKQLGFDYSTTSGISISFSDILETEKKSQYIAEGDEYISKLKQYYNLGL
ITDDDRYSLTIKKWAEIKDNIQNELQTIIKNNPKNPVITMINSGARGNISNYVQLAGMRG
LMANNTKTTKADAKNDRVVRSTVEVPVKSSFIEGLTAFEFYSSTHGARKGLTDTALNTAK
SGYLTRRLVDVAQNIVVRQENCGSEYGFLAKNIVDTKTKQIIVSLKERIVGRFSNKPIYD
KNNDLICGRNVLITNKIAQKIIDSGIEQVEIRSILGCNTRNGVCKMCFGKDLATNRVVNI
GEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFTRLIELIDAHEQPWGRPAIIS
PYQGRVIDIKKNEKTENDYIVTIEILNSNKEVEFKEILVNTNEKLRVSINDEIKVGQKLS
EGPIILKELLALTDVITVQNYLLKEIQRIYRIQGIAISDKYIEIIIRQMMSKVVISEPGD
SKFFAGAIVDIFDYQEENALLLSENKKPAYGNVVIKGAKQVPLLSDSFLAAASYQETSKI
LVNAAISSRTDNLTGLKENIIVGKKIPSGTALYSFEEHSKYDIKPSIKYFTSYTDEEEYS
TNELDGENIVDIDALTQEYVEDDKNMPSFEDEENDDFFDDSTFDDNEEENEEDLE
NT seq 4488 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgatactaaatatcaacaagattgagatggaggaactgaataatatgaaaaataattca
aaatatgacttattagatgaatcaaaaattacaaaaatttctctgtctttagctacacct
gaagatgtagaaagttgatctcatggagaagtaacaaaaccagaaactattaactataaa
tcatataaacctgaaagaggtggtttatttgatgaaattatttttggtccaatgattgat
tatcgttgtccagtttgtggttataaatataaaaaaataaacgaaggatcatactgtaca
agaacagagttatgtaaacaagaaaatgttcaaattctcccaaagatttcacgtagaaat
catatggggcatattaaattaaatagccctgttgttcatttttgatatttcaaagttgat
cattcgattttatataaattattaggtttaaaaatctcaagtgataactcgcaagaaaca
gttagaagagaagaattagaaaatctaatttattacaaaaatcatattgttgttgaagat
ggcgggcttaaatcattacctaaaaatttaattattgaaatcaatgacgctgctgttatt
tataaagaagcgcttgatgaacttttaacacgttttgatcctaaaaatcctgatcatcaa
gaagcatatgaggatattactgaaaccattgaacaattagttgaaaaagcaacatcgaaa
attggtcaagaatatggtatagatttttatgaattaaatgaggttattgaacactattca
gatgcaaaaattatgactggtgcaaaagcaattgaatatttattgcaaaagttagattta
gcagctgaaaaagcttatgtaactaaacaaattaatgaattaaatttacaagaagctaaa
aaccaaagcaagtttgcaacaacaacaaaacaaacaagagaaaaactttataaaaggcta
caagttattaatgcatttatagaatcgaaacaatcaccaactaatatgttaatatataat
ttgccagttattcctgcggatttaagacctttaattcaattagatggtgggagacattca
acatctgatattaatgaattgtaccgtagagttattatcagaaataaccgtttacaacaa
tgacaagaaaaagatgctcctacattagttattcaaaatgaattgcgtatgattcaagaa
gctgttgatgctttaatagataaccaaagaagaactcctaaccctgttttatcaaaagat
aatagaccttttaaatcaatatcagatgccttaactggtaaaaaaggtcgttttagacaa
aatttacttggtaaacgtgttgattattcaggccgttcagttattgttgttggtcctaat
ttaaaaatgcatcaatgtggtattcctcgtgaaatggctgcaaaattatttgagccatga
attatcgctcgattaatcgaaaaacaagttgcaacaactgttaaaaacgcaaaaaaaatc
attgaggatcaaaatccaattatttgaccacacgtggctgaagctattaaaggaagactt
gttttattaaaccgtgctccaaccttacaccgtttatcaattcaagcctttgagccagta
ttagtaagaggaaaagctattagattgcatccattagtatgtactccttttaatgctgac
tttgacggtgatcaaatggctgttcacgttcctatttctgaacaagcattattagaaagc
cgtgaattaatgttggctaataaaaatatcttaggtcctaaagatggtgaaccaattata
aatccttcacaagatatgattttaggtctttactatttaacaatcgaagaaaaagatgca
ttaggagaaggaagagtttttgataatttagatcatattttaagaagcttagaagctaaa
aaagtttcattgcatgcaagagttgctttacctgctgaagaagttaaaaattcaaaatta
tttactggttttaatattaattctcaactttatgttatttcaacagttggtaaattcatt
tttaataatgtctttccaaaagatttcccatttatttttgataacaaagtaactaaggct
attaatttagaagaatataaaaatgaatttaataaattgtatgttgttgaatctggaact
aatattgctaattatattaaagaattacctttacaagaggcttttaataaaaagaacatt
gcaaaaataattcgttacatgttcgataattatgtatcaactattagtatttctaacgta
gcaagtgttattgataaaattaatgatttagacgaatcggatattgttttagaattttta
aaattaaaaacatataaaggtcaaaatcttgaaaaagaacatgctgacttattaacggaa
tttgttttaattgaaaaacaaaaaatattacgagaaattgagcaaaaatatcaaggtgtt
aataatgtccctatttctgcaaaagaaaaagcaaaaatgcttgatattgtttggtttaaa
tatacaaacatagttgcatcaattttggataaaattaaacaattaggttttgattattca
actacttctggaatttctatttctttctcagatattttagaaactgaaaaaaaatcacaa
tatattgctgaaggtgatgaatatatttctaaattaaaacaatattataatttaggttta
ataacagatgatgatagatattcattaacaattaaaaaatgagccgaaattaaagataat
attcaaaatgaattgcaaacaattattaaaaataatcctaaaaacccagttattacaatg
ataaactcaggtgctcgtggaaatatttctaactacgttcaattagctgggatgcgtggt
cttatggcaaataacaccaaaactactaaggcggatgcaaaaaatgatagagttgttaga
tcaactgttgaagttccagttaaatcatcatttattgaaggtctaactgcttttgaattt
tattcatcaacacacggggcaagaaaaggtttaaccgatactgctttaaataccgcaaaa
tctggttatttaactagacgtttagttgatgtggctcaaaatattgttgtaagacaagaa
aattgtggttcagaatatggttttttagcaaaaaatattgttgatactaaaactaaacaa
attattgtttcattaaaagaaagaattgttggtcgtttttcaaataaaccaatttatgat
aaaaataatgatttaatttgtggaagaaatgttttaattactaataaaatagctcaaaaa
ataatcgattctggtattgaacaagttgaaattagatcaattttaggatgtaacactcgt
aatggtgtatgtaagatgtgttttggtaaggatttagcaacaaaccgtgttgtaaatatt
ggagaagctgttggaattatagctgctcaatcaataggtgaacctggaacacaattaaca
atgcgtacattccataccggtggtgttgctggggttgaggatattaccggtggttttact
cgcttgattgaattaatagacgcacacgaacaaccatgaggtagaccagcaataatttca
ccatatcaaggtagagttattgatattaaaaagaatgaaaaaactgaaaatgattacatt
gtaactattgaaattctaaattctaataaagaagttgaatttaaagaaattttagttaat
acaaatgaaaaattaagagtatcaataaatgatgaaataaaagttggtcaaaaactttct
gaaggtccaattattttaaaagaattattagctttaactgatgttattactgttcaaaat
tatttattaaaagaaattcaaagaatttatcgtattcaaggtattgcaattagtgataag
tatattgaaattattattagacaaatgatgtcaaaagttgttattagcgaacctggtgat
tctaaattctttgcaggagcaatagttgatatatttgactatcaagaagaaaatgcttta
ttattaagtgaaaataaaaagccagcttatggtaatgttgtaattaaaggtgctaaacaa
gttcctttattgtcagattcattcttagcggctgcttcatatcaagaaacttcaaaaatt
ttagttaatgctgctatttcatcaagaactgataatttaactggtttaaaagaaaatatt
attgttggtaaaaaaattccatctggaacagctctttattcatttgaagaacattcaaaa
tatgatattaaaccatcaataaaatattttacaagttatactgacgaagaagagtattct
actaatgaattagatggcgaaaatatagtagatattgatgctttaacacaagagtatgtt
gaagatgataaaaatatgccatcatttgaagatgaagaaaatgatgacttctttgatgat
tcaacatttgatgataatgaagaagaaaacgaagaagacttagaataa

DBGET integrated database retrieval system