Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38: MCCPF38_00091
Help
Entry
MCCPF38_00091 CDS
T03703
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mcap
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38
Pathway
mcap03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcap00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MCCPF38_00091 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mcap03021
]
MCCPF38_00091 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcap03400
]
MCCPF38_00091 (rpoC)
Enzymes [BR:
mcap01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MCCPF38_00091 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mcap03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MCCPF38_00091 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcap03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MCCPF38_00091 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
EF-G-binding_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA11457
LinkDB
All DBs
Position
1:100309..104076
Genome browser
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAEKDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKKCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMFKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQNHFLEKEVLDLGSSRITKTREKLQLSILDVIDQIND
PDHRDTKKANRLLEELKNTSIPFSIDEATSLISKYTNAKFGIGARAVEYLLEKVDLTKEI
EAIKIQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDSLKRSKQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHECAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKDRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKNAKGQGMIFSSLDEAFMAYNSGQIHLNSLIGIALSALPE
EKFSDKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYDFSQDIDKV
IENVQVQQPIKKNELSLIIERYFETHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKEADQKVEQITDFYNMGMLTNSEKKRRIIDVWSEVKDKIQNELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGSRGNVSNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPTKGFEVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRFTFKDIYDDDKNLVASANTLIDKNIAEKIIMSGISSVIIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVDGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEQGSSVMA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDSGDSDLLPGEIITIQNYKEVVQDCIVKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESSSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTQEVEQLAEQYHNNEY
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatttaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgttcatgatcacatggagaagttttaaaaccagaaactattaactataaaacattaaaa
gccgaaaaagatgggttatttgatgaaagaatttttggtccaactaaaaactatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagccaaccctatgaataaagggaaaaaatgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaattgttcgtagagaaagaatgggacatattgaactagaa
gaaccagttactcacatttgaatgtttaaagttgctccttatagaattgctgcaattcta
gatttaaaagcaaaagaactagaagaagtagtttactttgtttctcatattgttctagaa
caaggtaatcaaaatcattttctagaaaaagaagttttagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaattgcaactatcaattttagatgttattgatcaaattaatgat
cctgaccatagagatactaagaaggctaatagattattagaagaattaaaaaatacttct
attccattttcaatagatgaagcaactagcttaattagtaaatatactaatgcaaaattt
ggaattggagctagagctgttgaatatttattagaaaaagtagatttaactaaagaaatt
gaagcaattaaaattcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgattctttaaaacgttctaaacaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccaccagacattcgtcctattattcaattagatggt
ggtcgttttactacttctgaaattaatgatttatatagaagaatcattattagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcaccttcaattattgttaataacgaaaaacgt
atgttacaagaagctgttgatgctctatttgataatgaaagaaagccaaaaccagttcaa
ggaaaaaataaacgcccattaaaatctttaactagtgttttaaaaggaaaacaaggtcgt
tttagacaaaacttattgggaaaacgtgttgattattcagctagatcagttattgcaatt
ggaccagatctaaaaatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggcaattactttattt
aaaccatttgttattcaatgacttcaagatcatgagtgtgctgaaaatgttaaaattgct
gaaaaaatgttattgcaaaatgatccaaaagtttgagaggcactagaacaagtaattaaa
gacagacctgtattgttaaaccgtgctcctacattacaccgtttgggaattcaagcattt
gagcctaaattagttaaaggaaaagcaattcgtttacacccactagttacaactgcattc
aatgctgactttgatggtgatcaaatggcagttcacgtacctattacaaaagaagctgtt
gctgaatcaagagctttaatgttgggttcaagtgctattttaggaccaaaagatggaaaa
gctattgttactccaggtcaagatatcattttaggaaattattatttaactactgaagaa
aaaaacgccaaaggacaaggaatgattttttcaagtttagatgaagcgtttatggcttat
aatagtggtcaaattcatttaaactcattgattggaattgctttatcagctttacctgaa
gaaaaatttagtgataaaaatcaaagattaaattcttatttattaacaactgttggaaaa
ctttactttaatcaaatttttgatgataatttcccatgaattaattcaaataatatttga
aatgctaaagaagcagttaaagaattcatttatgatttttcacaagatattgataaagta
attgaaaatgttcaagttcaacaaccaattaagaaaaatgaattatcacttattattgaa
agatactttgaaactcatggagctagaaaaactgctgaaatgctagataaaatgaaagat
ctaggatttagtttttcaacaaaatcaggaaccacaatttcagctggagatgttgttgct
tttactcataaatatgacgaatttaaagaagcagatcaaaaagttgaacaaattactgat
ttttacaatatgggtatgttaactaatagtgaaaagaaacgtagaattattgatgtttga
tcagaagttaaagataaaattcaaaatgaattagcaacagtactacgtaaagatgttaaa
aatccaatttttgtaatggttgattcaggatcccgtggtaatgtttcaaactttactcaa
ttagttggtatgcgtggattaatgaacgatactaagggagatattaaagaaattcctatt
aagtcttcattccgtgagggattaactgtttcagaatatttcgtttcaactcatggagct
agaaaaggtatggctgatattgccttaaaaactgctgactcaggttatttaactagaaga
ttagttgacgttagtcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaaccaaagga
tttgaagtatcagctattattgatacaaaacatgataatgttattgttccattaaaagat
agattggttggaagattcacatttaaagacatttatgatgatgataaaaatctagttgct
tctgctaatacattaattgataaaaatattgctgaaaaaattattatgtcaggaattagt
tcagtaattattagatcagttttaacttgtgataataaacgtggtgtttgtcaaaaatgt
tatggactaaacttagctactgcttcagttgttaatattggtgaaccagtaggagttatt
gctgctcaatcaattggagaaccgggaactcaattaacaatgcgtaacttccatacagga
ggagttgctggtaatgttgatattactcaaggacttcctcgtattaaagaattattagat
gttacaactccaaaaggtgctgttgctataatttctgaagttgatggagtagttagtgaa
attgaagattataatggtgtatttgtaatcaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aaatataaaactgaatttaattcagtattacgtgttgaacaaggatcaagtgttatggcc
ggtcaaaaattgactgaaggagctattgatttacatcaattattagaatttggtggaatt
caagatgtgcaaaattacattttaaaagaagtacaaaaagtttatagattacaaggtatt
gaaatttcagacaaatatattgaaatcatcattaaacaaatgttaaacaaagtaaaaatt
actgatagtggtgattctgatttattacctggagaaattattacaattcaaaactataaa
gaagtagtacaagattgtattgttaaatcaattagaccacctttatcaaaagcacaaatt
tttggtattaaaaaagcacctctagaatcaagctcatgattatcttctgcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaattagaagga
ttaaaagaaaatattatgttaggtaatttaattccagccggtactggtttaactggaact
caagaagttgaacaactagcagaacaatatcataacaatgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
