KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38: MCCPF38_00704
Entry
MCCPF38_00704     CDS       T03703                                 
Symbol
recD2_4
Name
(GenBank) ATP-dependent RecD-like DNA helicase
  KO
K03581  exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mcap  Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38
Pathway
mcap03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcap00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MCCPF38_00704 (recD2_4)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcap03400]
    MCCPF38_00704 (recD2_4)
Enzymes [BR:mcap01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MCCPF38_00704 (recD2_4)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcap03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     MCCPF38_00704 (recD2_4)
SSDB
Motif
Pfam: AAA_19 AAA_30 AAA_11 Viral_helicase1 PIF1 PhoH RsgA_GTPase Helicase_RecD SRP54 AAA_28 AAA_22 T2SSE
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEA12061
LinkDB
Position
1:complement(728396..730264)
AA seq 622 aa
MLKTLGYIKKFTYIKDNKWAVAEFLVLNDNKLIKISGFINDMVIGVLYQITLELIPISRN
NQNIFNCTYYKVQDMNEKIFIDYLNSDLFNKYIDNNLANIITTNYTCDYIKEILFDKDQF
LKIDLNLKSNLKNIYKKLSNIYKFTILESEFTENNLDLLLLKSLKELDKQHNHSFEELLN
ILINRILDFNYLHNIVDFEIADKIFLHFNKDRYSVIRIAYYLHYFCSKILKSKSSTYTSM
QSIKAFLIENKMLPFLEQHSSEELINNSINYAIKNKLFIIKKEKVYTYQTYTDELNIAWY
LTRKKKVKKLNHFKFKKYVNQIEQEVKKETNISNFKYDKSQVNALKKFINNRFIVITGGH
GTGKITLIKGLVKLFKKVYPNSNFRIATPTGRAAARIKESFEESNATTIHKLLQYDVETR
KFKKNKDYPLDYDLLIIDETSMVDNNLFSQFISAIGQAKKIVFVGDINQLPSVEIGNAFE
DIIKSKKITTVKLKSTHRQSNNSKIVELAYMIKDNNFDLKKLCENQTIDSQTKSDLQTIF
VDNQNQCLKEIINNYNLDDRIGFNEPYKIQIISPINDGDLGVNQINKFIQDNRLKQEKLD
QKLNRVYKQTIMYIIKKIKLCI
NT seq 1869 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaaaactttaggttatataaaaaaatttacttatataaaagacaacaaatgagca
gttgctgaattcttagttttaaatgataataaactaattaaaattagtggatttattaat
gatatggtaattggtgttttatatcagatcacactagaattaattccaatatctagaaat
aatcaaaacatatttaattgcacatattataaagttcaggatatgaatgaaaaaattttt
attgattatttaaattctgatctttttaataaatatatagataataatttagctaatata
ataactactaattatacatgtgattatataaaagaaattctttttgataaagatcaattt
ttaaagattgatcttaatttaaaatctaatttaaaaaatatttataaaaaattatccaat
atttataaattcactattttagaatcagaatttacagaaaataatcttgatttattgtta
ttaaaaagtttaaaagaactagataaacagcataatcattcttttgaagaattattaaat
atattaataaatcgtatacttgattttaattatttacataatatagttgattttgaaatt
gctgataagatctttttacattttaataaagatagatatagtgtaattagaattgcttat
tatttgcattatttttgtagtaaaattttaaaaagtaaatctagtacttatacatcaatg
caaagtattaaagcttttttaatagaaaataaaatgttaccctttttagaacaacatagt
tcagaagaacttataaataattcaataaattatgctataaaaaacaaattatttattatt
aaaaaagaaaaagtttatacatatcaaacatatactgatgaactaaatattgcatgatat
ttaactagaaagaaaaaagttaaaaaactaaatcattttaagttcaaaaaatatgtaaat
caaattgaacaagaagttaaaaaagaaacaaatataagtaattttaaatatgataaaagt
caagttaatgcattaaaaaagtttattaataatagatttattgttataactggaggacat
ggaactggtaaaataactttaataaaaggtttagtaaaattatttaaaaaagtctatcct
aattctaattttagaatagcaacaccaactggaagagcagcagctagaattaaagaaagt
tttgaagaatctaatgctacaactattcataaattattacaatatgatgtagaaactaga
aaatttaaaaaaaataaagattatccactagattatgatttattaattattgatgaaact
tctatggttgataataatttatttagtcaatttatatcagcaattggacaagctaaaaaa
atagtttttgttggtgatattaatcaattaccaagtgttgagattggtaatgcttttgaa
gatattattaaatctaaaaaaatcacaactgttaaattaaaaagtactcaccgtcaatca
aacaatagtaaaattgttgaactagcttatatgattaaagacaataattttgacttaaag
aaattatgtgaaaatcaaacaattgacagccaaactaaaagcgatttacaaactattttt
gttgataatcaaaaccagtgcttaaaagaaattattaataattataatttagatgataga
attggttttaatgaaccctataaaattcaaattatttctcctattaatgatggtgatcta
ggtgttaatcaaattaataaatttattcaagacaacagacttaaacaagaaaagttagat
caaaaactgaaccgtgtatacaaacaaacaataatgtatattatcaaaaagataaagtta
tgtatttaa

DBGET integrated database retrieval system