KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38: MCCPF38_00744
Entry
MCCPF38_00744     CDS       T03703                                 
Symbol
polA_2
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
mcap  Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38
Pathway
mcap03030  DNA replication
mcap03410  Base excision repair
mcap03420  Nucleotide excision repair
mcap03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcap00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MCCPF38_00744 (polA_2)
   03410 Base excision repair
    MCCPF38_00744 (polA_2)
   03420 Nucleotide excision repair
    MCCPF38_00744 (polA_2)
   03440 Homologous recombination
    MCCPF38_00744 (polA_2)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mcap03032]
    MCCPF38_00744 (polA_2)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcap03400]
    MCCPF38_00744 (polA_2)
Enzymes [BR:mcap01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MCCPF38_00744 (polA_2)
DNA replication proteins [BR:mcap03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     MCCPF38_00744 (polA_2)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcap03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     MCCPF38_00744 (polA_2)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     MCCPF38_00744 (polA_2)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N 5_3_exonuc DNA_polI_exo1 DUF3626 HHH_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEA12101
LinkDB
Position
1:complement(767537..770272)
AA seq 911 aa
MKTKILVVDGNSLIFRAFYATAYSPNTSLLKTKSGVLTNAVYSFINMLLSVIHQRGPYDH
ILIAFDKGKKTFRHDLLSDYKANRIKTPNELVEQFSIVREFLTKANIQWFEQENIEADDI
VGSICKYAEKQFDDLQAEILSSDKDMYQLITNKAICLNPVQGVNELEEVDTNKLFEKWQI
SPNQVPDYKAIVGDSSDNLKGVNGIGQKGAIKLIQQYESLENIYNNLEQLKGAIKTKLEQ
DKKMAFLCKDLATIKTDVTLENFSFKKLDFNVDNIYEFLNKYEMYSLKKRFTNILNLDFN
PYQNKKQNLDVKIINSWSKDYEDSINYLYVESLEEDYHKDKIIGIGISNNKGNFYLDFKN
KAQQLSFFEDTTLSSTDSLFEEFLNNPNLKKYTYDIKKTTYLLKNHKYNVLASNFDFDFM
VACYSLNANVVSDLSNQIKLVDNLIELETIDQIFGKGVKKNPDIDLYIKSKYISKKAYLL
KKYSDQLIEQLKQTNTYDLYLKIDHPLIEVLYDIEVQGILIDKEQLKLQTQQILKKINHI
EWQMKILVAEEIDNNFNFSSPKQIQELLFDKLKLPNLEKGTTSKEVLEKLITYHPIINLL
LEHRKYTKLYTTYLKGFEKFIFDDNKVHTIFNHTLTNTGRLSSSYPNIQNISIRDNEQKE
VRKIFITNNNKTFLSYDYSQIELRVLAQMSKERNLINAFNQNADIHLQAAKLIFNLSDDQ
ITSEQRRIAKVFNFGILYGLTDFGLASDLNMNVNQAKQMIKDYYSAFPSLLDFKEKQVEI
ATNQGYITTLSNRRRYINELNSTNHNIRQFGKRIAVNTPIQGTASDILKVAMISIYKKLK
EQNLDAKIICQIHDEIILEVDDNQLEQTKKIVVSELENALEKLFLDLNIKEQVVVKLKVG
ESVGKTWFDLK
NT seq 2736 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaactaaaattttagtagtagatggtaattctttgatttttagagctttttatgca
actgcttattcaccaaatactagtttattaaaaacaaaaagcggtgttttaacaaatgca
gtttattcttttattaatatgttattatctgtaattcatcaaagaggaccttatgatcat
attttaatagcatttgataaaggtaaaaaaacttttagacacgatttattaagcgattat
aaagctaatagaattaaaactcctaatgaattagttgaacaatttagtattgttagagaa
tttttaacaaaagcaaacattcaatgatttgaacaagaaaacattgaagctgatgatatt
gttggatcaatttgtaaatatgctgaaaaacaatttgatgatttacaagctgaaatttta
agcagtgataaagatatgtatcaactaattacaaataaagcaatttgtttaaacccagtt
caaggagttaatgaacttgaagaagttgatactaataaattgtttgaaaaatgacaaatt
tcaccaaaccaagttccagattataaagcaatagttggcgattcttcagataatttaaaa
ggagttaatggaattgggcaaaaaggagctattaaattaattcaacaatatgaaagttta
gaaaatatttataataatttagaacaattaaaaggtgcgattaagactaaattagaacaa
gataaaaaaatggcttttttatgtaaagatttagcaacaattaaaactgatgtaacttta
gaaaatttttcttttaaaaaattagattttaatgttgataatatttatgagtttttaaat
aaatatgaaatgtattctttaaaaaaacgctttacaaatattttaaatcttgattttaat
ccttatcaaaataagaagcaaaatttagatgttaaaataattaattcttgatcaaaagat
tatgaagattctataaattatttgtatgttgaatcattagaagaagattatcataaagat
aaaattattggaattggtatttcaaataataaaggtaatttttatttagattttaaaaat
aaagctcaacagttatctttttttgaagatacaacactaagttcaactgatagtttgttt
gaagaatttttaaataatcctaatttaaaaaaatatacttatgatattaaaaaaactact
tatttattaaaaaatcacaagtataatgttttagcaagtaattttgattttgattttatg
gttgcttgttattctttaaatgctaatgttgtttctgatttatctaatcaaattaaatta
gttgataatttgattgaattagaaactattgatcaaatttttggaaaaggtgttaaaaaa
aatccagatatagatctttatattaaatctaaatatattagtaaaaaagcttatttgtta
aaaaaatattctgatcaattaattgaacaattaaaacaaactaatacttatgatttatat
ttaaaaattgatcatcctttaattgaggttttatatgatattgaagttcaaggaatttta
atagataaagaacaattaaaactacaaacccaacaaatattaaaaaagattaatcatatt
gaatgacaaatgaaaattttagtcgctgaagaaattgataataattttaatttttcttca
ccaaagcaaattcaagaattattatttgataaattaaaattacctaatttagaaaaaggt
actactagtaaagaagttttagaaaaattaataacttatcatccaataatcaatttatta
ttagaacatagaaaatatactaagttatatacaacttatttaaaaggttttgaaaaattt
atttttgatgataataaagttcatactatttttaatcatactttaacaaatactggtaga
ttaagttcttcttatccaaatattcaaaatatttctattagagataatgaacaaaaagaa
gttagaaaaatttttattacaaataataataagacttttttaagttatgattattctcaa
attgaactaagagttttagcacaaatgtctaaagaaagaaatttaattaatgcatttaat
caaaatgctgatattcacttacaagctgctaaattaatttttaatcttagtgatgatcaa
attacaagtgaacaaagaagaatagctaaagtttttaattttggaattttatatggttta
actgattttggtttagcaagtgatttaaatatgaatgttaatcaagcaaaacaaatgatt
aaagattattattctgcttttccaagtttattagattttaaagaaaaacaagtagaaata
gcaacaaatcaaggttatattacaactttatcaaatagaagaagatatattaatgaatta
aattcaacaaatcataacattagacaatttggaaaaagaatagcagtaaatacaccaatt
caaggaactgcttcagatattttaaaagtagctatgataagtatttataaaaagttaaaa
gagcaaaatttagatgctaaaattatttgtcaaattcatgatgaaattattttagaagtt
gatgataatcaattagaacaaactaaaaaaatagttgttagtgagttagaaaatgcttta
gaaaaactatttttagatttaaatataaaagaacaagtagttgttaaattaaaagttgga
gaatcagttggtaaaacttgatttgatttaaaatag

DBGET integrated database retrieval system